劉 攀 劉小乖 彭曉康 李瑞娜 雷玲俠 李亞絨
男,5月7 d,因“發(fā)現(xiàn)皮膚黃染1月余,發(fā)熱1 d”于2017年3月16日就診于陜西省西安市兒童醫(yī)院(我院)。1月余前家長發(fā)現(xiàn)患兒皮膚黃染,初為顏面部,漸加重,波及全身,伴尿色加深,精神反應(yīng)可,家長未予重視。8 d前患兒皮膚黃染加重,就診于當(dāng)?shù)蒯t(yī)院,查巨細(xì)胞病毒抗體IgM弱陽性,診斷“嬰兒肝炎綜合征”,予“頭孢曲松、肌苷×7 d,更昔洛韋×6 d”輸液治療,家長觀察皮膚黃染明顯減輕。1 d前患兒發(fā)熱,體溫最高39.2℃,予常規(guī)量對乙酰氨基酚口服后體溫可緩慢降至正常,來我院門診,以“膽汁淤積性肝炎、巨細(xì)胞病毒感染、運動發(fā)育遲滯”收入院?;純翰『缶瘛⒎磻?yīng)及納乳可,糞便正常,尿液色黃,尿布黃染。
既往史:G1P1,孕40+2周,因“羊水少”行剖宮產(chǎn),無產(chǎn)傷、窒息史。出生體重1.51 kg,生后即因“足月小樣兒、新生兒低血糖”入住外院新生兒科,住院治療10 d(具體治療不詳)后好轉(zhuǎn)出院。母孕期體健,生后母乳喂養(yǎng)至今,尚未添加輔食。生長發(fā)育史:4月會抬頭,尚不能翻身,追光、追物、循聲可。
家族史:父母均體健,非近親結(jié)婚,家族中無遺傳性疾病史。
入院體格檢查:體重4.5 kg,貧血貌,神志清楚,精神可,全身皮膚及面色重度黃染,無皮疹、出血點。咽充血,雙肺呼吸音粗,可聞及散在痰鳴音。心音有力,律齊,心前區(qū)可聞及2/6級收縮期雜音,無傳導(dǎo)。腹壁靜脈顯露,腹膨隆,肝肋下可觸及4.0 cm,劍下可觸及2.0 cm,質(zhì)韌緣鈍,表面光滑,脾肋下未觸及。移動性濁音陰性。神經(jīng)系統(tǒng)查體未見異常。
入院后實驗室檢查顯示肝酶升高、低蛋白血癥,凝血功能顯著異常,達(dá)肝衰竭診斷,伴小細(xì)胞低色素性貧血;血串聯(lián)質(zhì)譜遺傳代謝病篩查提示甲硫氨酸、酪氨酸等多種氨基酸含量升高,各?;鈮A未見明顯異常;尿有機酸氣相質(zhì)譜分析顯示辛二酸、己二酸、葵二酸、4-羥基苯乳酸和4-羥基苯丙酮酸較參考值略有升高,疑似代謝異常。因患兒急性肝衰竭原因不明,考慮遺傳代謝性肝病,建議完善肝臟穿刺術(shù)及二代測序基因檢測,家長拒絕肝臟穿刺,接受基因檢測?;純杭覍俸炇鹬橥鈺?,抽取患兒及其父母外周靜脈肝素抗凝血3 mL,送至北京邁基諾基因科技有限責(zé)任公司檢測。本研究獲得我院倫理委員會批準(zhǔn)(編號:倫20190005)。
初步診斷考慮:①膽汁淤積癥;②肝功能衰竭;③支氣管炎;④貧血(中度);⑤運動發(fā)育遲滯;⑥先天性心臟病:房間隔缺損、動脈導(dǎo)管未閉;⑦卵圓孔未閉。入院后予抗感染、保肝利膽、補充脂溶性維生素,輸注血漿改善凝血功能,輸注白細(xì)胞懸液糾正貧血等治療。經(jīng)治療后患兒復(fù)查肝功能及凝血功能較前改善,貧血糾正,遂帶藥出院。
隨訪:出院后皮膚黃染逐漸消退,轉(zhuǎn)氨酶逐漸下降,約8月齡時黃疸消失。14月齡時因再次發(fā)熱而第2次入我院,轉(zhuǎn)氨酶顯著升高,伴GGT升高,凝血功能大致正常,經(jīng)住院治療后肝功能好轉(zhuǎn)。25月齡時復(fù)查肝功能正?!,F(xiàn)隨訪至3歲,生長發(fā)育較前追趕(年齡別體質(zhì)量的z值:-1.38;年齡別升高的z值:-0.7),血生化指標(biāo)正常。
患兒臨床表現(xiàn)、檢查及治療的時間軸圖見圖1。
從送檢的靜脈血中提取基因組DNA,并建立與代謝性肝病相關(guān)目標(biāo)基因(SLC25A13、JAG1、GALT、ATP8B1、LARS等共249個基因)的全基因組文庫。利用液相捕獲試劑盒捕獲目標(biāo)基因后進(jìn)行高通量測序,通過生物信息學(xué)分析找出相關(guān)基因的突變信息。根據(jù)獲得的突變結(jié)果對患兒及其父母進(jìn)行Sanger測序驗證。
二代基因測序結(jié)果顯示,患兒胞質(zhì)亮氨酰-tRNA合成酶基因c.1367A>G(p.D456G),c.2212+1G>T復(fù)合雜合突變,變異分別來源于父母(圖2A)。c.1367A>G(p.D456G)變異為新發(fā)現(xiàn)突變(圖2C紅色標(biāo)記所示),位于LARS編輯域中;該變異未在ExAC、1000G等數(shù)據(jù)庫中檢出;通過比對人類、黑猩猩、牛、狗、雞、馬、大鼠、小鼠和熱帶爪蟾9種真核生物物種之間的LARS同源蛋白序列,結(jié)果示D456為保守氨基酸(圖2B)。經(jīng)SIFT、PolyPhen2及Mutation_Taster均預(yù)測該變異有害,為可能致病性突變,其中PolyPhen2評分為0.996。進(jìn)行蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測,p.D456野生型選取的蛋白結(jié)構(gòu)模型為人胞質(zhì)的亮氨酰-tRNA合成酶的編校結(jié)構(gòu)域(2WFD,260-509位氨基酸),序列一致性96.4%。采用SWISS-PdbViewer 4.1.0軟件將p.D456野生型模型的第456位氨基酸由D變成G,突變后進(jìn)行模型能量最小化,并比對兩者構(gòu)象的差異。第456位氨基酸由天冬氨酸變成甘氨酸,使其附近氨基酸之間的氫鍵距離改變,同時伴有氫鍵的消失,如圖3所示。c.2212+1G>T變異為新發(fā)現(xiàn)突變;該變異在TOPMED數(shù)據(jù)庫中檢出頻率為0.000 01,未在ExAC和1000G等數(shù)據(jù)庫中檢出;經(jīng)Human Splicing Finder預(yù)測該變異影響剪切。
圖1本文病例重要臨床信息時間軸
注 TB、DB、TBA: μmol·L-1; ALT、AST、ALP、GGT:U·L-1;ALB:g·L-1
已知線粒體的結(jié)構(gòu)及功能異??梢鸲嘞到y(tǒng)損害,例如發(fā)育遲緩、神經(jīng)系統(tǒng)異常、肝病、心血管及血液系統(tǒng)異常等。為排除線粒體相關(guān)性疾病,對該患兒行線粒體全基因突變分析,未發(fā)現(xiàn)與臨床表型相關(guān)的基因變異。
結(jié)合患兒臨床表現(xiàn),診斷為嬰兒肝衰竭綜合征1型(ILFS1)。
圖2基因測序
注 A:患兒及其父母的Sanger測序圖?;純簽閏.1367A>G和c.2212+1G>T復(fù)合雜合突變;患兒母親和父親分別為c.1367A>G和c.2212+1G>T的攜帶者。B:不同物種LARS蛋白D456氨基酸序列保守性比對。C:胞質(zhì)亮氨酰-tRNA合成酶的結(jié)構(gòu)域及已發(fā)現(xiàn)嬰兒肝衰竭綜合征Ⅰ型患兒的突變位置。紅色箭頭為本例患兒突變
圖3 p.D456E突變前后空間結(jié)構(gòu)預(yù)測圖
注 A、B:野生型,C、D:突變型,突變型附近氨基酸之間的氫鍵距離改變,伴有氫鍵消失。A、C箭頭所指綠色部分以及B、D綠色棍棒結(jié)構(gòu)為相應(yīng)氨基酸,綠色虛線表示氫鍵,相應(yīng)數(shù)字表示氫鍵距離
以“infantile liver failure syndrome type I”為關(guān)鍵詞檢索PubMed數(shù)據(jù)庫,以“嬰兒肝衰竭綜合征1型”檢索中國生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫,檢索起止時間均為2000年1月1日至2019年1月10日。已有5篇文獻(xiàn)詳細(xì)報道了14例ILFS1患兒,本文病例為發(fā)現(xiàn)的第15例ILFS1患兒。
表1 15例嬰兒肝衰竭綜合征1型的臨床特征及突變基因分析
ILFS1是一種常染色體隱性遺傳病(OMIM #615438),由LARS突變引起[1,2]。
已知8個胞質(zhì)和10個線粒體的氨酰tRNA合成酶(ARS)基因的突變與人類一些疾病相關(guān),主要是代謝、神經(jīng)、線粒體和肌肉受累的疾病[2]。LARS基因定位于染色體5q32,編碼由1 176個氨基酸組成的胞質(zhì)亮氨酰-tRNA合成酶,該酶以多酶聚合體形式存在,屬于第一類氨基酰-tRNA合成酶(aaRS)。其作用是通過氨?;磻?yīng)把氨基酸共價連接到與其對應(yīng)的tRNA上,還可水解錯誤活化的氨基酰-AMP和錯配的氨基酰-tRNAs,從而確保mRNA到蛋白質(zhì)翻譯過程的高度精確性[6-8]。最近的研究表明,LARS在調(diào)節(jié)mTORC1信號通路中起著亮氨酸傳感器的作用,它在許多細(xì)胞過程中起著關(guān)鍵作用,包括自噬和細(xì)胞生長[9]。ILFS1的分子機制目前尚不清楚[10]。
ILFS1的臨床表現(xiàn)涉及多個系統(tǒng),可累及消化道、神經(jīng)及血液系統(tǒng)等[1,2]?;純和ǔT?歲內(nèi)出現(xiàn)低出生體重、貧血、低蛋白血癥、肝功能異常和生長發(fā)育遲緩等。部分患兒可出現(xiàn)肝功能衰竭、驚厥和腦病等嚴(yán)重表現(xiàn),甚至死亡[4]。
ILFS1患兒肝功能異??杀憩F(xiàn)為血清膽紅素、轉(zhuǎn)氨酶水平升高,白蛋白降低等。肝功能異常主要出現(xiàn)在發(fā)熱時,且肝臟損害在嬰兒期最嚴(yán)重,隨著年齡增長逐漸改善。這可能與年長兒應(yīng)對感染或發(fā)熱的能力增加有關(guān),或與隨肝臟的增大其合成蛋白質(zhì)的能力增加有關(guān)[2]。本文患兒在5月齡合并感染情況下出現(xiàn)急性肝功能衰竭,遂年齡增長,14月齡再次感染僅出現(xiàn)轉(zhuǎn)氨酶波動,經(jīng)積極抗感染治療后好轉(zhuǎn),25月齡時肝功能完全正常。
對于ILFS1患兒,即使在蛋白質(zhì)攝入充足、肝功能無其他異常表現(xiàn)的情況下,嬰兒期的低白蛋白血癥是一個顯著且一致的發(fā)現(xiàn)[2]。在Casey等研究中未發(fā)現(xiàn)腸病或過量的蛋白質(zhì)丟失,故其推測在ILFS1患兒中可能存在內(nèi)源性白蛋白合成受損。白蛋白對氨基酸的耗竭非常敏感[11],而亮氨酸是白蛋白中最豐富的氨基酸之一。雖然患兒無亮氨酸缺乏證據(jù)(可能維持了體內(nèi)平衡),但不足以支持富含亮氨酸的蛋白質(zhì)如白蛋白的合成,從而導(dǎo)致低白蛋白血癥。此外,ILFS1患兒的突變多位于LARS編輯域中(圖2C),在蛋白質(zhì)合成過程中存在錯誤折疊的蛋白質(zhì)的積累,這可能導(dǎo)致內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激而上調(diào)未折疊的蛋白質(zhì)應(yīng)答,并在最大應(yīng)激水平激活凋亡。因此,減少或停止蛋白質(zhì)攝入的代謝性肝病患者的傳統(tǒng)管理對于ILFS1患兒可能不合適甚至是有害的。Casey等研究發(fā)現(xiàn),在確保腸內(nèi)或腸外不適時至少2.5 g·kg-1·d-1的蛋白質(zhì)攝入量,患兒的肝功能和整體狀況開始改善;在2歲齡后低蛋白血癥均有改善。本文患兒截止到隨訪蛋白水平及肝臟生化指標(biāo)均正常。
ILFS1的長期預(yù)后很難預(yù)測,已報道的病例中有2例患兒年齡分別為28歲和35歲,且沒有慢性肝病的實驗室或臨床證據(jù);另有2例患兒已經(jīng)發(fā)展為肝結(jié)節(jié),伴有代償期肝硬化;有2例死亡患兒,最終疾病主要是由呼吸道感染引發(fā)的腦病。因此,ILFS1患兒即使有輕微病毒感染,也應(yīng)建議立即住院,以預(yù)防肝病和腦病發(fā)作[2]。ILFS1為罕見病,目前病例數(shù)有限,其長期預(yù)后仍有待進(jìn)一步研究觀察。
隨著二代基因測序的快速發(fā)展及普及,越來越多的遺傳代謝性疾病被逐漸認(rèn)識。本文病例存在的不足是基因檢測的目標(biāo)基因數(shù)量有限,雖后期補充完善了線粒體基因組檢測,但未能充分排除其他未檢測到的基因疾病;p.D456G的致病性分析,依靠預(yù)測和保守性分析,尚存在一定局限性及風(fēng)險。ILFS1患兒缺乏特征性的臨床表現(xiàn),對于新發(fā)現(xiàn)的突變基因,驗證其導(dǎo)致ILFS1,尚需要更多遺傳學(xué)證據(jù)等級較高的病例的證實。
對于臨床醫(yī)生而言,ILFS1的診斷仍然存在很多挑戰(zhàn)。推薦對于不明原因嬰兒急性肝衰竭、低蛋白血癥、復(fù)發(fā)性肝功能不全、持續(xù)小細(xì)胞性貧血及發(fā)育遲滯的患兒,高度警惕ILFS1并檢測LARS基因。對于確診患兒,建議在并發(fā)感染時早期入院、積極干預(yù)和維持膳食蛋白質(zhì)攝入量可能有助于減少肝衰竭、腦病或死亡的可能性。