田 霄 汪 威田云霞 童江云
(昆明市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院,云南昆明650000)
金耳(Tremella aurantialba),也稱腦型銀耳、金銀耳,隸屬擔(dān)子菌門(Basidiomycota)銀耳科(Tremella)銀耳屬(Tremella),是一種珍貴的食藥同源真菌。金耳子實(shí)體外觀呈腦狀,色澤金黃,富含膠質(zhì),食用口感爽滑;臨床研究發(fā)現(xiàn)金耳多糖具有降低血糖、血脂,增強(qiáng)免疫力[1],抗凝血[2]和抗腫瘤[3]等效果。金耳是食用菌中珍品,也是保健美容佳品,有著廣闊的發(fā)展前景。
早在1982―1996年,劉正南等[4]成功引種馴化了野生金耳,并進(jìn)行大面積推廣,取得了良好的經(jīng)濟(jì)和社會(huì)效益。由于金耳自身特殊的生理特性和制種特性,金耳菌種尚不穩(wěn)定。代料栽培金耳在原基形成初期容易遭到雜菌感染,導(dǎo)致爛耳和出耳不整齊,嚴(yán)重影響金耳產(chǎn)量和生物轉(zhuǎn)化率[5],阻礙了代料栽培金耳的大規(guī)模推廣。研究金耳出耳期的病害發(fā)生原因,是降低金耳污染率,提高金耳產(chǎn)量和經(jīng)濟(jì)效益的重要環(huán)節(jié)。
真菌的ITS基因相比18SrRNA基因(其進(jìn)化速率為18SrDNA的10倍)或28SrRNA基因而言整體的變異性更強(qiáng),因而物種間的序列差異會(huì)更大,分類信息會(huì)更加詳盡,具有高通量、高精度、極佳重現(xiàn)性和測(cè)序成本低等特點(diǎn),被廣泛應(yīng)用于微生物生態(tài)學(xué)研究[6]。ITS包含ITS1和ITS2兩個(gè)區(qū)域。ITS1位于真核生物18S和5.8S基因之間,ITS2位于真核生物5.8S和28S基因之間,其序列更長(zhǎng)且包含信息更多。筆者選取代料栽培金耳出耳期受感染部位,進(jìn)行ITS2高通量測(cè)序和菌種分離,分析其主要的真菌群落,為代料栽培金耳出耳期雜菌防控提供理論依據(jù)。
(1)供試菌種:從云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院引進(jìn)金耳與毛韌革菌混合菌種。將混合菌種擴(kuò)繁,待出耳且耳塊長(zhǎng)至5 cm左右后置于-4℃冰箱保存。(2)供試配方:栽培料配方為粗木屑79%,麩皮15%,硫酸鈣1%,碳酸鈣1%。(3)主要試劑和儀器。PCR采用KOD-401B:TOYOBO KOD-Plus-Neo DNA Polymerase;PCR 儀 :Applied Biosystems?Gene Amp?PCR System 9700。
1.2.1 代料培養(yǎng)
按配方制備栽培袋(121℃高壓滅菌3 h)。將保藏的菌種從冰箱取出置于室溫下,在無(wú)菌條件下,在栽培袋側(cè)面部位打孔(直徑約2 cm,深度約2 cm),挑取子實(shí)體1~2 cm和子實(shí)體下方少許混合菌絲接入栽培袋孔內(nèi),用透氣密封條密封口,放置溫度20~23℃,黑暗環(huán)境中培養(yǎng)30 d左右,至袋內(nèi)長(zhǎng)滿白色粗壯的菌絲。此后10 d左右,接種塊附近出現(xiàn)黃色分泌物,逐漸形成腦狀原基。
1.2.2 取材
在原基形成后10 d內(nèi),選取受到雜菌感染的菌包,分別挑取三個(gè)樣本:被感染的接種部位的培養(yǎng)料、菌包中間和底部的培養(yǎng)料,編號(hào)為TA-ZJ、TA1和TA2(圖1)。每個(gè)樣本5重復(fù)。
圖1 金耳正常出耳、污染狀態(tài)及采樣處
1.2.3 樣本DNA的提取與純化
利用DNA提取試劑盒(Zymo Research BIOMICS DNA Microprep Kit D4301)對(duì)3個(gè)樣本進(jìn)行基因組DNA抽提。0.8%瓊脂糖凝膠電泳對(duì)所提DNA進(jìn)行檢測(cè)。
1.2.4 ITS片段高通量測(cè)序鑒定
1.2.4.1 PCR擴(kuò)增
利 用 特 異 引 物(ITS3_KYO2:5’-GATGAAGAACGYAGYRAA-3’和 ITS4:5’-TCCTCC GCTTATTGATATGC-3’)對(duì)樣本DNA的ITS2區(qū)域進(jìn)行擴(kuò)增[7]:每個(gè)樣本進(jìn)行3次PCR重復(fù)。
1.2.4.2 PCR產(chǎn)物檢測(cè)、純化和定量
利用2%瓊脂糖凝膠對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行電泳檢測(cè)。切膠回收(QIAquick Gel Extraction Kit QIAGEN)。
1.2.4.3 文庫(kù)構(gòu)建
文庫(kù)構(gòu)建用Illumina公司TruSeq DNA PCRFree Sample Prep Kit(FC-121-3001/3003)。
1.2.4.4 測(cè)序和生物信息分析及統(tǒng)計(jì)
用FLASH拼接雙端序列?;贐arcode從reads中拆分出各樣本序列。截去Barcode序列得到原始數(shù)據(jù),然后用Trimmomatic進(jìn)行質(zhì)控。得到有效數(shù)據(jù)Clean Reads。
使用UCLUST分類法與UNITE數(shù)據(jù)庫(kù)(https://unite.ut.ee/)進(jìn)行注釋分析。用MAFFT version 7的FFT-NS-2算法將代表性序列進(jìn)行多重比對(duì)。對(duì)各樣本做均一化處理,以樣本中數(shù)據(jù)量最少的為標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行重抽樣。
采用R語(yǔ)言進(jìn)行各種數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換,ggplot2構(gòu)建熱圖。
1.2.5 真菌形態(tài)學(xué)鑒定
1.2.5.1 感染真菌的分離與純化
采集的3個(gè)樣本無(wú)菌條件下放置在PDF平板上,25℃培養(yǎng)至菌落形成。挑取平板上不同菌落的邊緣部位進(jìn)行多次純化分離。
1.2.5.2 真菌的形態(tài)學(xué)鑒定
將純化的菌株接種到PDA平板上,采用插片培養(yǎng)法,在接種平板邊緣以45°斜插入3片蓋玻片,25℃培養(yǎng)至菌絲長(zhǎng)滿平板。取出蓋玻片制作成臨時(shí)片,在電子顯微鏡下做鏡檢并拍照。參照文獻(xiàn)將各真菌進(jìn)行形態(tài)學(xué)鑒定[8-10]。
根據(jù)測(cè)序結(jié)果分析,3個(gè)樣本相對(duì)豐度水平最高的菌群均為子囊菌門(Ascomycota)木霉屬(Trichoderma);同時(shí)在3個(gè)樣本中相對(duì)豐度水平較高的菌群有擔(dān)子菌門(Basidiomycota)考克娃酵母屬(Kockovaella)、子囊菌門(Ascomycota)鐮刀霉屬(Fusarium)、青霉屬(Penicillium)、曲霉屬(Aspergillus)、擬青霉 屬(Simplicillium)和 頭 束 霉 屬(Cephalotrichum)(圖2)。
3個(gè)樣本中,在TA1和TA2中發(fā)現(xiàn)的被孢霉門(Mortierellomycota)被孢霉屬(Mortierella)群落相對(duì)豐度水平比樣本TA-ZJ高,而擔(dān)子菌門(Basidiomycota)柄環(huán)菌屬(Podoscypha)、壺菌門(Chytridiomycota)小壺菌屬(Spizellomyces)在TA-ZJ樣本中未能鑒定到。
木霉屬在整個(gè)序列相對(duì)豐度水平中,樣本TA1達(dá)35%,TA2達(dá)19%,TA-ZJ高達(dá)63%。毛韌革菌所在的韌革菌屬(Stereum)占據(jù)了較高的比例,相對(duì)豐度值分別為29%、38%和10%。金耳所在的銀耳屬(Tremella)占比較低,3個(gè)樣本平均不到5%。
圖2 各樣本的感染真菌群落(屬)
圖3 感染真菌純化菌株及其顯微結(jié)構(gòu)
經(jīng)多次分離純化后總共獲得了100個(gè)菌株,形態(tài)學(xué)分析主要屬于木霉屬(分離菌株數(shù)75個(gè))、鐮刀霉屬(分離菌株數(shù)7個(gè))和青霉屬(分離菌株數(shù)8個(gè))其他菌株10個(gè)(圖3A、B、C),經(jīng)顯微結(jié)構(gòu)鑒定進(jìn)一步證明其確實(shí)屬于木霉屬(圖3A)、鐮刀霉屬(圖3E)和青霉屬(圖3F)真菌。
食用菌病害根據(jù)病害發(fā)生的原因分為三種類型:侵染性病害、競(jìng)爭(zhēng)性病害和生理性病害。侵染性病害主要是病原菌侵染食用菌本身,導(dǎo)致菌絲死亡或者子實(shí)體出現(xiàn)斑點(diǎn)、畸形甚至腐爛;競(jìng)爭(zhēng)性病害則是病原菌侵染栽培基質(zhì),與菌絲體爭(zhēng)奪養(yǎng)分和生存空間導(dǎo)致食用菌凋亡[11]。金耳子實(shí)體是由金耳和毛韌革菌組成的異質(zhì)復(fù)合體[12],兩者的關(guān)系目前還不夠清晰[13],關(guān)于金耳的主要病害研究目前鮮有報(bào)道。金耳出耳期發(fā)生病害的原因:接種栽培場(chǎng)地和栽培料因素,環(huán)境因素、水源因素,料袋滅菌因素,袋的質(zhì)量因素,出耳期的濕度和通風(fēng)管理因素等。金耳生長(zhǎng)前期以毛韌革菌菌絲生長(zhǎng)為主,到一定程度后金耳菌絲才開始生長(zhǎng)[14],兩者比例失調(diào)會(huì)導(dǎo)致出耳率下降[15],金耳幼耳本身抗病性差,且對(duì)不良環(huán)境敏感[1],在開袋后容易受到來(lái)自外界空氣和水中廣泛存在的木霉、青霉等真菌病原菌的侵染而發(fā)生病害。
ITS2高通量測(cè)序結(jié)果表明,取樣點(diǎn)主要感染菌群落屬于子囊菌門木霉屬,按豐度水平依次為孢霉屬、鐮刀霉屬、考克娃酵母屬、曲霉屬、青霉屬、擬青霉屬和頭束霉屬。金耳出耳初期容易分泌黃水[5],開袋后與外界空氣接觸,容易受到雜菌侵染。試驗(yàn)出菇房曾多年栽培香菇和平菇等菇類,雜菌孢子基數(shù)高,而金耳出耳期需要較高的空氣相對(duì)濕度,若通風(fēng)控制不當(dāng),易造成木霉感染。試驗(yàn)取樣的菌袋前期菌絲生長(zhǎng)正常,開袋出耳后出現(xiàn)感染,因此病原菌來(lái)自袋外可能性較高。形態(tài)學(xué)分析僅鑒定到三種真菌:木霉屬、鐮刀霉屬和青霉屬,其中分離木霉屬菌株數(shù)最高,這一結(jié)果與高通量測(cè)序結(jié)果一致。另外從高通量測(cè)序結(jié)果可以看出,除了木霉屬,其余雜菌屬相對(duì)豐度水平都很低。肉眼觀測(cè)取樣的菌袋大部分為綠色木霉污染(圖1),因受試驗(yàn)方法限制,僅能分離和提純得到少量的屬種。
自然界中各種微生物的種類和數(shù)量非常多,而木霉是感染食用菌培養(yǎng)料和子實(shí)體最嚴(yán)重的一種雜菌,筆者試驗(yàn)得出同樣結(jié)果。為此,筆者對(duì)金耳出耳期的管理提出幾點(diǎn)建議:首先,控制病原菌。木霉孢子及菌絲體廣泛分布在自然界中,木霉等多數(shù)雜菌生長(zhǎng)適溫為22~28℃,與金耳菌絲生長(zhǎng)適溫相近,木霉菌絲很容易在金耳菌絲生長(zhǎng)期大量繁殖,出耳期爆發(fā)。預(yù)防原則:一是源頭把控,降低環(huán)境中雜菌基數(shù)、用水潔凈,培養(yǎng)料滅菌徹底;其次,優(yōu)化管理。木霉、青霉等雜菌喜歡高濕環(huán)境,其菌絲較耐二氧化碳,而金耳子實(shí)體的展開和轉(zhuǎn)色也需要一定的氧氣量,因此要協(xié)調(diào)好金耳出耳期的濕度與通氣,保持空氣相對(duì)濕度在85%~95%,隨時(shí)監(jiān)測(cè)出菇房?jī)?nèi)二氧化碳濃度,做到每天定時(shí)通風(fēng)換氣;第三,選擇優(yōu)良的金耳菌種及適宜代料配方,培養(yǎng)出高質(zhì)量金耳出菇菌袋[11,16]。