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      基于數(shù)據(jù)挖掘和網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的肥胖用藥規(guī)律及潛在作用分析

      2020-03-03 14:01:04呂任堯鄭曙琴
      關(guān)鍵詞:澤瀉組方茯苓

      呂任堯,鄭曙琴

      (1.遼寧中醫(yī)藥大學(xué),沈陽 110847;2.遼寧中醫(yī)藥大學(xué)附屬醫(yī)院,沈陽 110032)

      肥胖指體內(nèi)脂肪過多積累和(或)分布異常,常伴體質(zhì)量增加,是由多種因素互相作用所引起的慢性代謝性疾病[1]。中醫(yī)學(xué)中,本病最早記載于《黃帝內(nèi)經(jīng)》,屬中醫(yī)“肥滿”“膏人”“脂人”“肥人”等范疇,常伴有頭暈乏力、神疲懶言、少動氣短等癥狀。研究顯示[2],在過去30 a 中,全球肥胖率急劇增加,成年肥胖患者約有5 億之多,全世界兒童和青少年患病率也在逐漸增加。此外長期肥胖還可增加中風(fēng)、高血壓、肝膽疾病、2 型糖尿病、冠心病、腦血管病、及某些腫瘤等相關(guān)疾病的風(fēng)險,嚴重影響人類的生活質(zhì)量與身體健康[3]。因此,對于肥胖的研究與治療具有非常重要的臨床意義。然而目前肥胖的西醫(yī)治療仍充滿波折,如肥胖藥物治療的最緊迫的未解答的問題是它們在長期內(nèi)的表現(xiàn)如何,加之西醫(yī)減肥藥物缺乏大眾的廣泛接受,人們對于西醫(yī)減肥藥物安全性的擔憂仍普遍存在[4]。相比于西藥治療肥胖的種種困難,中醫(yī)在整體觀念的指導(dǎo)下,運用陰陽、五行、臟象、經(jīng)絡(luò)等學(xué)說對肥胖患者進行辨證論治的個體化治療,為臨床治療肥胖做出了重要的貢獻。今為求更加系統(tǒng),更加直接的總結(jié)中醫(yī)藥對于肥胖治療的用藥規(guī)律以及高頻的藥物作用機制,本文通過數(shù)據(jù)挖掘的方式對中藥治療肥胖用藥規(guī)律進行總結(jié),并對高頻藥物進行進行KEGG 通路分析,通過網(wǎng)絡(luò)分析篩選出關(guān)鍵靶點,探索其發(fā)揮藥效的可能機制,為臨床中藥治療肥胖提供依據(jù)。

      1 資料與方法

      1.1 數(shù)據(jù)來源及檢索方式 以計算機與人工相結(jié)合的方式進行檢索,應(yīng)用計算機以“中醫(yī)藥”或“中藥”或“中醫(yī)”與“肥胖”“肥滿”“脂人”“肥人”“膏人”“單純性肥胖”“肥胖癥”等關(guān)鍵詞與自由詞相組合檢索中國知識資源總庫(CNKI)、萬方數(shù)據(jù)資源系統(tǒng)、中國生物醫(yī)學(xué)文獻數(shù)據(jù)庫(CBMdisc)、中文科技期刊全文數(shù)據(jù)庫(VIP)關(guān)于中醫(yī)藥治療肥胖的相關(guān)文獻,檢索時間:1999 年1 月—2018 年12 月。將檢索到的文獻逐篇下載,以人工篩查的方式收錄其中符合本文排除與納入標準的期刊文獻共143 篇及其中符合排除與納入標準的中藥組方148 首。

      1.2 納入標準 1)文獻第一診斷均為單純性肥胖。2)文獻中所使用的中藥組方具有明確的藥物組成。3)文獻中認定此組方服之結(jié)局良好。4)收錄組方均為中醫(yī)內(nèi)服湯藥。5)多篇文獻中同一組方只納入1 篇,藥物組成僅選取主方(基本方)。

      1.3 排除標準 1)非單純中藥治療文獻。2)動物實驗、文獻綜述、文獻評價、Meta 分析等非臨床試驗。3)同一數(shù)據(jù)在不同期刊中重復(fù)報道的文獻。4)治療結(jié)局不明確文獻。5)組方藥物不完整文獻。

      1.4 數(shù)據(jù)標準化與錄入

      1.4.1 數(shù)據(jù)標準化 參照人民衛(wèi)生出版社第3 版《中藥學(xué)》及2015 版《中華人民共和國藥典》對組方中的中藥名稱進行規(guī)范,如“仙靈脾”統(tǒng)一規(guī)范為“淫羊藿”;“生地黃”統(tǒng)一規(guī)范為“地黃”。

      1.4.2 數(shù)據(jù)錄入 根據(jù)納入與排除標準對收錄文獻進行嚴格篩選,提取符合標準中藥組方的藥物信息,錄入Microsoft Excel 2016 軟件,以無序分類變量二項分類的方式,雙人錄入,橫坐標為藥物名稱,縱坐標為組方ID,將單個組方中出現(xiàn)的藥物在相應(yīng)單元格記為“1”,否則記為“0”,建立“中藥治療肥胖數(shù)據(jù)庫”。

      1.5 統(tǒng)計方法 利用Excel 2016 對整理的方劑進行數(shù)據(jù)錄入。關(guān)聯(lián)規(guī)則分析采用Apriori 算法,最低支持度設(shè)為0.1,最低置信度設(shè)為0.8,分別取支持度、置信度、提升度排序前6 的規(guī)則進行整理。聚類分析采用K-means 和層次聚類的方法,其中聚類數(shù)目通過Gap 統(tǒng)計量確定,距離度量采用歐式距離。主成分分析通過變量的協(xié)方差矩陣找出方差最大化的新線性組合,作為原始變量的主成分以最大限度解釋原始變量,分別取貢獻度最大的前20 個主成分作為用藥的主要規(guī)律進行分析。本研究所有數(shù)據(jù)挖掘分析基于R3.5.2。

      1.6 網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析 使用BATMAN-TCM 系統(tǒng)預(yù)測高頻藥物所含化學(xué)成分,并獲取對應(yīng)靶點;把這些靶點與Genecard 數(shù)據(jù)庫中檢索到的肥胖相關(guān)靶點相映射并取交集,將其作為治療肥胖的潛在作用靶點;將上述靶點導(dǎo)入STRING 11.0 數(shù)據(jù)庫中,構(gòu)建PPI 網(wǎng)絡(luò),對其進行網(wǎng)絡(luò)拓撲分析,篩選出高頻藥物治療肥胖病的核心靶點,并上傳至DAVID 6.8數(shù)據(jù)庫進行KEGG 通路分析,通過數(shù)據(jù)庫檢索、文獻驗證,獲取高頻藥物治療肥胖病的重要通路。

      2 結(jié)果

      2.1 中藥頻次統(tǒng)計 在錄入的148 個中藥組方中,共涉及中藥172 味。結(jié)果顯示,使用頻率≥10%的藥物共21 種,依次為茯苓(56.75%),澤瀉(50%),白術(shù)(43.93%),山楂(39.86%),半夏(27.03%),大黃(27.03%),決明子(26.35%),甘草(25.68%),荷葉(25%),陳皮(24.32%),蒼術(shù)(23.65%),黃芪(21.62%),枳實(16.89%),丹參(16.89%),厚樸(14.86%),薏苡仁(13.51%),山藥(12.84%),柴胡(12.16%),黨參(11.49%),桂枝(10.81%),防己(10.81%)。見圖1。

      圖1 中藥治療肥胖主要藥物統(tǒng)計

      2.2 關(guān)聯(lián)規(guī)則分析 關(guān)聯(lián)規(guī)則結(jié)果顯示,以支持度由高到低排序的藥對依次為白術(shù)與茯苓,半夏與茯苓,陳皮與茯苓,蒼術(shù)與茯苓,澤瀉、白術(shù)與茯苓,山楂、白術(shù)與茯苓,見表1。以置信度由高到低排序的藥對依次為甘草、半夏與茯苓,半夏、白術(shù)與茯苓,半夏、陳皮與茯苓,半夏、澤瀉與茯苓,蒼術(shù)、白術(shù)與茯苓,陳皮、白術(shù)與茯苓,見表2。以提升度由高到低序的藥對依次為陳皮、茯苓與半夏,澤瀉、丹參與山楂,丹參與山楂,茯苓、澤瀉、丹參與白術(shù),甘草、半夏與茯苓,半夏、白術(shù)與茯苓,見表3。關(guān)聯(lián)規(guī)則分析網(wǎng)絡(luò)化展示見圖2。

      表1 中藥治療肥胖的藥物關(guān)聯(lián)度分析(支持度)

      2.3 聚類分析 采用K-means 和層次聚類的方法,其中聚類數(shù)目通過Gap 統(tǒng)計量確定,距離度量采用歐式距離。對所有藥物進行聚類分析,兩種聚類方法得出結(jié)果幾乎一致,結(jié)果見圖3。其中以層次聚類的方法對藥物進行聚類,形成2 個聚類藥物群:第1 組包含的藥物有:澤瀉、茯苓、白術(shù)、山楂、荷葉、丹參、半夏、陳皮、蒼術(shù)、厚樸、薏苡仁、黃芪、甘草。第2 組藥物較為繁雜,其又分為兩組,其中有代表性的一組主要包含的藥物有:大黃、枳實、柴胡、白芍、生姜、大棗、黃芩、黃連。

      表2 中藥治療肥胖的藥物關(guān)聯(lián)度分析(置信度)

      表3 中藥治療肥胖的藥物關(guān)聯(lián)度分析(提升度)

      圖2 中藥治療肥胖關(guān)聯(lián)規(guī)則分析網(wǎng)絡(luò)化展示

      圖3 中藥治療肥胖聚類分析結(jié)果展示圖

      2.4 主成分分析 前4 個維度主成分貢獻圖如圖4,分別取主成分中高于評價貢獻的中藥變量作為此維度的代表用藥,其中維度1 方差貢獻率為8.5%,主要包含的藥物有:茯苓、白術(shù)、大黃、蒼術(shù)、半夏、澤瀉、等維度2 方差貢獻率為7%,主要包含的藥物有:山楂、決明子、荷葉、澤瀉、丹參等,維度3 方差貢獻率為5.2%,主要包含的藥物有:半夏、陳皮、黃芪、山楂、枳實、防己、厚樸等,維度4 方差貢獻率為4.5%,主要包含的藥物有:白術(shù)、澤瀉、甘草、蒼術(shù)、山楂、丹參、決明子等。前4 個維度中藥和方劑間關(guān)系的雙標圖見圖5。

      2.5 基于BATMAN-TCM 分析高頻藥物茯苓治療肥胖的潛在作用機制

      2.5.1 高頻藥物茯苓靶點預(yù)測 在BATMAN-TCM數(shù)據(jù)庫(http://bionet.ncpsb.org/batman-tcm/)中以“Fu Ling”為關(guān)鍵詞,“Score cutoff”設(shè)置為30,“Adjusted P-value”設(shè)置為0.05,檢索出茯苓中所含化合物17 種,包括Choline、Dehydroeburicoicacid、Ergosterol、Pachymic Acid、Beta -Amyrin Acetate、P -Hydroxybenzyl Alcohol 等,同時獲取這些化合物對應(yīng)靶點230 個。

      2.5.2 肥胖相關(guān)靶點檢索 以“obesity”為關(guān)鍵詞,在Genecard 數(shù)據(jù)庫(http://www.genecards.org/)中檢索obesity 相關(guān)靶點,與BATMAN-TCM 數(shù)據(jù)庫預(yù)測靶點相映射并取交集,共獲得茯苓治療治療肥胖病的靶點90 個。

      圖4 中藥治療肥胖主成分分析前4 個維度主成分貢獻圖

      圖5 中藥治療肥胖主成分分析前4 個維度中藥和方劑間關(guān)系的雙標圖

      2.5.3 蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用(PPI)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 將上述獲得的90 個潛在作用靶點導(dǎo)入STRING 11.0數(shù)據(jù)庫(https://string-db.org/),限定物種為人,設(shè)定最高置信度0.9,獲得蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)相互作用關(guān)系,結(jié)果存儲為TSV 格式,保留文件中node 1 和node 2 信息并導(dǎo)入Cytoscape 3.6.0 軟件,對其進行網(wǎng)絡(luò)拓撲分析,篩選網(wǎng)絡(luò)中連接度Degree 排名前10的靶點,作為茯苓治療肥胖病的核心靶點。見圖6,其中節(jié)點的大小表示Degree 值的大小,節(jié)點大小越大,代表Degree 值越大。邊的粗細表示Combine score,邊越粗Combine score 值越大。

      2.5.4 KEGG 通路分析 將獲得的靶點上傳至DAVID 6.8(https://david.ncifcrf.gov/summary.jsp)數(shù)據(jù)庫中,保留P<0.05 的通路,將這些通路與CTD 數(shù)據(jù)庫(http://ctdbase.org/)中obesity 相關(guān)通路進行匹配,并檢索文獻進行驗證,選取與肥胖病關(guān)系最密切的通路作為茯苓治療肥胖病的重要通路。KEGG通路分析結(jié)果得到32 條信號通路,其中與肥胖病關(guān)系密切的通路20 條。見表4。

      3 討論

      圖6 蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用(PPI)圖

      表4 KEGG 代謝通路

      歷代醫(yī)籍很早就對肥胖這一病癥的病因病機及治療進行了詳細的論述?!端貑枴ねㄔu虛實論》曰:“肥貴人,則膏粱之疾也?!睂⒁鸱逝值闹饕驓w之于飲食不節(jié)?!饵S帝內(nèi)經(jīng)》不單從病因方面對肥胖進行了討論,并且對肥胖的病位給與了明確的論述,指出肝、脾、腎三臟與肥胖的發(fā)生息息相關(guān)[5]。隨著中醫(yī)學(xué)的發(fā)展,眾多名家都對肥胖的病機提出詳細而深入的理論創(chuàng)新。包括元·朱震亨在《丹溪心法》《格致余論》,清代喻昌在《醫(yī)門法律》以及張聿青在《張聿青醫(yī)案》中對于肥胖的論述,3 位醫(yī)家均認為“肥人多痰多濕”,將肥胖的關(guān)鍵病機歸之于痰濕,總結(jié)了對于肥胖病人應(yīng)以健脾利濕化痰為治療大法[6]。誠如清·陳世鐸于《石室秘錄》中所言:“肥人多痰,乃氣虛也。虛則氣不能運行,故痰生之”,并且進一步論述了治療肥胖需補脾胃之氣,并補命門之火,指出氣虛乃肥胖之病機,氣足則痰自消矣。清·王清任所著的《醫(yī)林改錯》中載:“元氣既虛,必不能達于血管,血管無氣,必停留而淤”,闡明氣虛血瘀亦為肥胖之重要病機。國醫(yī)大師王琦[7]在前人經(jīng)驗指導(dǎo)下結(jié)合臨床實踐,強調(diào)肥胖應(yīng)從“氣虛”“痰濕”“血瘀”3 個方面綜合調(diào)治,為中藥治療肥胖提供了堅實的理論依據(jù)。

      通過對中醫(yī)藥治療肥胖組方的用藥頻次分析發(fā)現(xiàn),使用頻率較高的藥物有茯苓、澤瀉、白術(shù)、山楂、半夏、大黃、決明子、甘草、荷葉、陳皮、蒼術(shù)、黃芪、枳實、丹參、厚樸、薏苡仁等。以上藥物中茯苓、白術(shù)、陳皮、蒼術(shù)、黃芪、薏苡仁,均為燥濕健脾之常用藥。半夏、陳皮、厚樸均為燥濕化痰之要藥。澤瀉利水滲濕、泄熱、化濁降脂,甘草既可燥濕又可化痰,枳實兼具消積與化痰之功效?,F(xiàn)在研究證明[8-12],具有化瘀消脂作用的山楂、大黃、決明子、荷葉、丹參對于肥胖的治療效果較為顯著。研究結(jié)果可見,健脾利濕化痰為中藥治療肥胖主要治則,這與中醫(yī)學(xué)對于“肥人多痰濕”“肥人多氣虛”的理論相呼應(yīng)。

      關(guān)聯(lián)規(guī)則結(jié)果顯示,白術(shù)與茯苓,半夏與茯苓的支持度最高,分別為0.35 和0.23,反映了這兩對藥物在治療肥胖的組方中出現(xiàn)的概率最大。顯示這兩藥對在臨床治療肥胖中最為常用。其中白術(shù)與茯苓配伍,白術(shù)健脾益氣,燥濕利水,茯苓利水滲濕健脾,兩者共奏健脾化濕之功。半夏燥濕化痰,降逆止嘔,消痞散結(jié),與茯苓相配伍,茯苓長于健脾滲濕,半夏長于燥濕化痰,兩藥合用標本兼治,顯示兩藥對在臨床的治療肥胖中最為常用。按置信度的排序,甘草、半夏與茯苓,半夏、白術(shù)與茯苓為最高,均為1。從置信度反映的前項后項藥物同時出現(xiàn)的次數(shù)占前項藥物出現(xiàn)次數(shù)的比例來看,臨床上中藥治療肥胖,甘草、半夏與半夏、白術(shù)兩組藥對常與茯苓同時使用。以提升度來分析,陳皮、茯苓與半夏的正相關(guān)性為最高(提升度為3),說明半夏在應(yīng)用陳皮、茯苓這對藥物治療肥胖的組方中的使用頻率提升2 倍。不難發(fā)現(xiàn)上述3 組結(jié)果同樣體現(xiàn)了燥濕健脾化痰這一治則在治療肥胖過程中的重要性,因痰由濕生,濕責之于脾,從而理氣健脾以袪痰,標本兼邪而不傷正。提示臨床中治療肥胖多以具有益氣健脾,燥濕化痰功效的藥物互相配伍使用。

      基于以層次聚類的方法對藥物進行聚類,結(jié)果顯示,第1 組以健脾滲濕藥和燥濕化痰藥加之具有祛瘀消脂作用的山楂、丹參、荷葉為主。從病機角度對肥胖進行探究,本病的病機往往相互影響相互轉(zhuǎn)化,脾虛日久,脾不升清,運化失司,水谷精微失于輸布,則易聚濕生痰,故而肥胖。脾氣虧虛,氣虛推動無力,血行不暢而瘀滯,氣不為用則氣郁,或痰濕內(nèi)停,阻礙氣血運行均可致氣滯血瘀,進而發(fā)為肥胖。以第1 組藥物之功效進行總結(jié)分析,益氣健脾,燥濕化痰,祛瘀消脂為肥胖的常用治法,為大多數(shù)肥胖患者治療所共用。第2 組藥物由于個體差異的不同,藥物加減亦不同,藥物較為繁雜,故選取較為有代表性的一組進行討論,選出的藥物組為大柴胡湯的基礎(chǔ)組方。仝小林教授[13]古方今用,應(yīng)用大柴胡湯治療肥胖取得了顯著療效,佐證了以大柴胡湯為基礎(chǔ)方,運用消膏降濁、消積導(dǎo)滯、化痰通腑之法,對于治療肥胖的肯定意義,對臨床治療肥胖用藥具有一定的參考作用。采用K-means 聚類的方法與以層次聚類的方法對藥物進行聚類的結(jié)果幾乎相同,在此不再贅述。

      主成分分析中,從雙標圖分析得到,茯苓、白術(shù)、澤瀉、山楂、半夏、陳皮、荷葉、決明子、蒼術(shù)、大黃、丹參、黃芪等藥物在中藥治療肥胖的組方用藥中更為重要。由主成分貢獻圖中分析得到,維度1 包含的藥物以健脾利水為主要功效。維度2 包含藥物中山楂、荷葉、澤瀉、丹參均有化瘀的功效。維度3 包含的藥物以化痰為主要共性。維度4 包含的藥物中白術(shù)、甘草、蒼術(shù)均可益氣健脾,澤瀉、山楂、丹參,均可化瘀。有研究結(jié)果表明[14],肥胖主要病機為痰濕、血瘀、氣虛等證。上述結(jié)果亦與國醫(yī)大師王琦提出的肥胖應(yīng)從“氣虛”“痰濕”“血瘀”3 個方面綜合調(diào)治這一理論相符合。

      通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法分析高頻藥物茯苓治療肥胖的潛在作用機制,結(jié)果發(fā)現(xiàn)茯苓治療肥胖涉及多通路、多靶點。其中篩選出的靶點排名較高的有ANXA1,HTR1A,CXCR4,ADRA2B,CNR1,ADRA2A,HTR1B,PTGER3,DRD2 等,提示這些靶點可能是茯苓發(fā)揮治療肥胖作用的核心靶點。如AnxA1 水平與BMI,腰圍和腰臀比呈正相關(guān),與急性期蛋白,C-反應(yīng)蛋白(CRP)和脂肪細胞因子瘦素的血漿濃度呈負相關(guān),且通過實驗得出ANXA1 是小鼠肥胖的重要調(diào)節(jié)因子,可能是通過調(diào)節(jié)脂解和(或)糖皮質(zhì)激素水平這一機制來進行[15-16]。DAVID 6.8 數(shù)據(jù)庫進行通過KEGG 通路分析結(jié)果得到32 條信號通路,其中與肥胖病關(guān)系密切的通路20 條,涉及5-羥色胺能突觸、TRP 通道的炎癥介質(zhì)調(diào)節(jié)、脂肪細胞因子信號通路、胰島素抵抗、胰島素信號通路等。如中樞神經(jīng)遞質(zhì)5-羥色胺通過交感神經(jīng)/副交感神經(jīng)系統(tǒng)調(diào)節(jié)食欲并控制代謝器官,外周神經(jīng)遞質(zhì)5-羥色胺以自分泌/旁分泌或內(nèi)分泌方式調(diào)節(jié)葡萄糖代謝,胰島素抗性和能量消耗來調(diào)節(jié)肥胖[17]。大量證據(jù)表明[18],脂肪細胞因子在健康受試者的代謝穩(wěn)態(tài)中起著關(guān)鍵作用,而這些因素的缺陷,由肥胖和脂肪細胞功能障礙引起,是肥胖周圍疾病群發(fā)病機制中的一個核心組成部分。如代謝調(diào)節(jié)中最有效的脂肪細胞因子之一的瘦素通過向其他器官,尤其是下丘腦,發(fā)送營養(yǎng)狀況信號,經(jīng)下丘腦產(chǎn)生調(diào)節(jié)食物攝入和能量消耗的神經(jīng)肽和神經(jīng)遞質(zhì)來調(diào)節(jié)體質(zhì)量[19]。上述結(jié)果均表明茯苓對治療肥胖具有潛在的研究價值,為進一步深入研究其作用機制提供參考與方向。

      綜上所述,本研究采用數(shù)據(jù)挖掘和網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的方法對中藥治療肥胖的用藥規(guī)律及高頻藥物茯苓治療肥胖的潛在作用機制進行了多角度的探析,為臨床中藥治療肥胖提供了可靠的用藥參考,也為更深一步的探究中藥治療肥胖的作用機制提供了新的方向與數(shù)據(jù)支撐。由于數(shù)據(jù)庫和數(shù)據(jù)庫之間內(nèi)在的復(fù)雜性與信息的不完善以及化合物之間的相互作用的不確定性,故研究預(yù)測的結(jié)果具有一定的局限性,需要構(gòu)建復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)進行進一步的深入挖掘及驗證。

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