近日,中國科學(xué)院昆明植物研究所植物多樣性與基因組學(xué)團隊伊廷雙和李德銖研究組在國際生物系統(tǒng)學(xué)頂級期刊發(fā)表研究成果,解析豆科植物深度系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。
豆科是植物界第三大科,約有765 屬19 500 種,也是經(jīng)濟價值最大的科之一。以往的分子系統(tǒng)學(xué)研究或基于少量基因片段,或取樣代表性不足,尚未構(gòu)建豆科高分辨率和支持率的系統(tǒng)發(fā)育框架,制約了這一重要類群及相關(guān)學(xué)科領(lǐng)域的研究。
研究人員立足國家重大科學(xué)工程中國西南野生生物種質(zhì)資源庫,選取代表豆科全部6 個亞科和97%族,以及豆目其它3 個科的187 種(其中151 種為新獲?。┑馁|(zhì)體基因組數(shù)據(jù)進行全面分析,獲得了該科具有強統(tǒng)計支持且基本一致的系統(tǒng)樹。研究人員提出,有些植物類群的質(zhì)體基因組可能存在雙親遺傳和復(fù)雜的進化模式,若將整個質(zhì)體基因組作為獨立的進化單元可能造成錯誤的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系推論,分析沖突位點的系統(tǒng)發(fā)育信號是質(zhì)體系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)研究中的必要環(huán)節(jié)。該研究重建的具強統(tǒng)計支持的系統(tǒng)發(fā)育框架為豆科植物的分類、進化及多樣化研究奠定了較為堅實的基礎(chǔ)。