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      面向計(jì)算機(jī)顯微視覺系統(tǒng)的白細(xì)胞識(shí)別

      2020-01-16 06:44:08張從鵬熊國順
      激光技術(shù) 2020年1期
      關(guān)鍵詞:細(xì)胞核白細(xì)胞灰度

      張從鵬,馬 巖,毛 潭,熊國順

      (北方工業(yè)大學(xué) 機(jī)械與材料工程學(xué)院,北京 100144)

      引 言

      血涂片白細(xì)胞顯微視覺檢驗(yàn)是臨床醫(yī)學(xué)中的重要檢驗(yàn)項(xiàng)目。利用計(jì)算機(jī)視覺技術(shù)實(shí)現(xiàn)白細(xì)胞檢驗(yàn)的自動(dòng)化和智能化是當(dāng)前的熱點(diǎn)和發(fā)展趨勢(shì)。國內(nèi)外很多學(xué)者針對(duì)如何更好地分割和識(shí)別白細(xì)胞提出了很多方法。CSEKE[1]基于Otsu算法,通過遞歸方法最大化圖像中黑色、灰色和白色區(qū)域之間的類內(nèi)方差并自動(dòng)篩選出分割閾值,實(shí)現(xiàn)白細(xì)胞的分割,但該方法無法將細(xì)胞漿分割出來。2012年,MOHAPATRA等人[2]基于范函鏈接型網(wǎng)絡(luò)對(duì)白細(xì)胞分割,根據(jù)各區(qū)域像素按顏色分類,將白細(xì)胞分割為細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)兩部分。HUANGA等人[3]利用共生矩陣和形態(tài)信息提取85個(gè)紋理和形態(tài)特征,采用主成分分析(principal component analysis,PCA)進(jìn)行特征降維、K均值進(jìn)行五分類,該方法對(duì)于嗜中性粒細(xì)胞的分類準(zhǔn)確率比較低。REZATOFIGHI等人[4]首先利用Gram-Schmidt正交化增強(qiáng)白細(xì)胞區(qū)域顏色向量,由灰度直方圖確定分割閾值并分割出白細(xì)胞核,然后采用snake分割細(xì)胞漿。WANG等人[5]利用梯度矢量流輪廓法實(shí)現(xiàn)白細(xì)胞和細(xì)胞核的提取,并根據(jù)白細(xì)胞形態(tài)學(xué)等特征利用支持向量機(jī)(support vector machine,SVM)對(duì)白細(xì)胞進(jìn)行分類,但在分類精度上還有待提高。LI等人[6]基于mean-shift聚類算法在細(xì)胞圖像上得到可視化紋理的區(qū)域塊,并根據(jù)區(qū)域塊的特征參量利用人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行白細(xì)胞識(shí)別。LIU等人[7]基于C-Y顏色空間和形態(tài)學(xué)運(yùn)算得到白細(xì)胞圖像,并閾值分割對(duì)比度拉伸的G圖像,完成細(xì)胞核的提取。HUAI等人[8]將細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)的旋轉(zhuǎn)不變共生局部二值模式特征和常規(guī)形態(tài)學(xué)特征進(jìn)行歸一化處理,并利用隨機(jī)森林分類器完成白細(xì)胞分類。上述分割和分類算法雖側(cè)重角度不同,但都是為了提高白細(xì)胞的分類識(shí)別率。

      本文中搭建了面向顯微視覺檢測(cè)系統(tǒng),研究血涂片自動(dòng)檢驗(yàn)中的關(guān)鍵技術(shù)問題,擬采用高效圖像提取方法和分類識(shí)別算法,提高檢測(cè)系統(tǒng)的檢測(cè)效率和精度,滿足顯微視覺平臺(tái)對(duì)白細(xì)胞臨床形態(tài)學(xué)自動(dòng)檢驗(yàn)的需求。

      1 顯微視覺系統(tǒng)

      顯微形態(tài)學(xué)檢驗(yàn)平臺(tái)由顯微光學(xué)成像系統(tǒng)、計(jì)算機(jī)視覺系統(tǒng)、自動(dòng)控制系統(tǒng)等組成[9]。光學(xué)成像系統(tǒng)選用奧林巴斯光學(xué)顯微鏡,搭配UPLFLN100X02油鏡。利用230萬像素的彩色CCD工業(yè)相機(jī)對(duì)血涂片顯微圖像進(jìn)行采集。圖1所示的玻片為血細(xì)胞涂片。

      Fig.1 Micro-vision detection system for blood cell smears

      2 白細(xì)胞圖像分割

      2.1 白細(xì)胞圖像預(yù)處理

      白細(xì)胞圖像預(yù)處理包括:通過中值濾波器對(duì)采集到的細(xì)胞圖像進(jìn)行平滑處理,去除細(xì)胞圖像上的顆粒噪聲;采用相應(yīng)的濾波器進(jìn)行細(xì)胞圖像邊緣的銳化。

      2.2 白細(xì)胞背景剝離

      2.2.1 RGB模型與HSI模型對(duì)比 為了提高白細(xì)胞背景剝離方法的簡易性,將預(yù)處理后的血細(xì)胞圖像采用固定閾值方法分割成像素為200×200的白細(xì)胞子圖。然后將彩色細(xì)胞子圖轉(zhuǎn)換為R,G,B三通道[10]的單通道圖像。實(shí)驗(yàn)中發(fā)現(xiàn),除了G通道細(xì)胞核灰度值跟背景灰度值上有較大的差異外,R通道和B通道表現(xiàn)不明顯。因此,RGB模型不適合用來分割圖中的白細(xì)胞。

      HSI顏色模型可用作白細(xì)胞顯微圖像的分割顏色模型[11]。通過對(duì)細(xì)胞圖像的H,S,I單通道圖像灰度觀察發(fā)現(xiàn),H通道表現(xiàn)出適合白細(xì)胞背景剝離的良好性能,與參考文獻(xiàn)[12]中結(jié)論基本一致。模型灰度圖如圖2所示。

      Fig.2 Comparison of RGB model and HSI model of white blood cells

      綜上分析,本文中采用H通道圖像進(jìn)行白細(xì)胞背景剝離。

      2.2.2 區(qū)域生長法背景剝離 區(qū)域生長[13]是根據(jù)一種事先定義的準(zhǔn)則將像素或者子區(qū)域聚合成更大區(qū)域的過程。其相似性質(zhì)可包括平均灰度值、紋理、顏色等信息。區(qū)域生長算法實(shí)現(xiàn)的步驟如下:(1)對(duì)圖像目標(biāo)區(qū)域進(jìn)行掃描,令R表示整幅圖像區(qū)域,根據(jù)預(yù)設(shè)相似準(zhǔn)則,將目標(biāo)圖像區(qū)域分裂成若干不重疊的子區(qū)域Ri,i=1,2,3,…,n;(2)以Ri為中心,判斷其鄰域Rj是否滿足相似準(zhǔn)則,若滿足,則合并Ri和Rj,對(duì)任何i和j都有i≠j;(3)以合并后的Ri和Rj為中心,重復(fù)步驟(2);(4)當(dāng)無法進(jìn)行新的合并時(shí),返回步驟(1);(5)重復(fù)步驟(1)~步驟(4),當(dāng)無法進(jìn)行新的分裂時(shí),生長結(jié)束。

      那么分割可以看成將整幅圖像R劃分為n個(gè)子區(qū)域R1,R2,…,Rn的過程,并滿足以下條件:(1)U(Ri)=R;(2)Ri是一個(gè)連通區(qū)域,i=1,2,3,…,n;(3)Ri∩Rj=空集,對(duì)任何i和j都有i≠j;(4)P(Ri)=ture,i=1,2,…,n;(5)P(Ri∪Rj)=false,i≠j。)

      在血細(xì)胞H單通道圖像上,使用區(qū)域生長分割算法后,會(huì)得到很多不同的子區(qū)域[14],可以精確地將整個(gè)白細(xì)胞在圖中與其它紅細(xì)胞以及背景分割開來,如圖3所示。然后根據(jù)先驗(yàn)知識(shí),除背景區(qū)域之外,整張圖像中選取最靠近圖片中心的區(qū)域,得到白細(xì)胞圖像。

      Fig.3 Cell region growth segmentation diagram

      2.3 細(xì)胞核提取

      最大類間方差法是1979年由日本學(xué)者OTSU提出的,簡稱大津法[15],是一種自適應(yīng)閾值確定的方法。根據(jù)圖像的灰度特性,將圖像分為前景和背景兩個(gè)部分。當(dāng)取最佳閾值時(shí),前景與背景之間差別是最大的,評(píng)價(jià)差別的標(biāo)準(zhǔn)就是最大類間方差。通常細(xì)胞核與細(xì)胞質(zhì)在RGB顏色模型的B通道上灰度級(jí)別存在較大差異,在上一步進(jìn)行白細(xì)胞背景剝離的基礎(chǔ)上,擬采用細(xì)胞核與細(xì)胞漿作為白細(xì)胞背景剝離后B通道灰度圖像的前景和背景,利用大津法進(jìn)行細(xì)胞核的提取。

      設(shè)背景剝離后的B通道白細(xì)胞圖像為I(x,y),細(xì)胞核和細(xì)胞漿的分割閾值記作T,細(xì)胞核區(qū)域像素比例為w1,平均灰度值為μ1;細(xì)胞漿區(qū)域像素比例為w2,平均灰度值為μ2。白細(xì)胞平均灰度值為μ0,類間方差為g。令圖像大小為M,細(xì)胞核像素?cái)?shù)為N1,細(xì)胞漿像素?cái)?shù)記作N2,則:

      w1=N1/M

      (1)

      w2=N2/M

      (2)

      N1+N2=M

      (3)

      w1+w2=1

      (4)

      μ0=μ1×w1+μ2×w2

      (5)

      g=w1×(μ0-μ1)2+w2×(μ0-μ2)2

      (6)

      將(5)式代入(6)式得到g的等價(jià)表達(dá)式:

      g=w1×w2×(μ1-μ2)2

      (7)

      采用遍歷的方法使類間方差最大的閾值T即為所求。通過對(duì)B通道白細(xì)胞圖像閾值為T的閾值分割,即得到細(xì)胞核圖像與細(xì)胞漿圖像。從灰度直方圖角度觀察,灰度圖橫坐標(biāo)為灰度等級(jí),取值范圍是0~255,縱坐標(biāo)為每個(gè)灰度等級(jí)相應(yīng)的像素個(gè)數(shù),最大類間方差的過程其實(shí)是在尋找前景和背景兩個(gè)灰度波峰之間的波谷值,如圖4所示。圖4b和圖4c中橫坐標(biāo)為灰度等級(jí),縱坐標(biāo)為像素個(gè)數(shù),橫縱坐標(biāo)均為無量綱物理量。

      Fig.4 Valley threshold of channel B

      圖4b為灰度圖原圖,存在較多毛刺,確定波谷值時(shí)會(huì)產(chǎn)生偏移。進(jìn)一步采用平滑的方法對(duì)原灰度圖進(jìn)行擬合,如圖4c所示。平滑后的直方圖可以清晰地找到波谷點(diǎn),從而確定分割的閾值。利用波谷點(diǎn)閾值對(duì)白細(xì)胞B通道灰度圖像進(jìn)行細(xì)胞核提取,得到細(xì)胞核和細(xì)胞漿圖像,如圖5所示。

      本文中將預(yù)處理后的圖片,在H通道上采用區(qū)域生長的方法進(jìn)行白細(xì)胞的背景剝離。并在提取出白細(xì)胞的基礎(chǔ)上,將白細(xì)胞的細(xì)胞核與細(xì)胞漿作為圖像的前景與背景,在白細(xì)胞B通道圖像上利用大津法,實(shí)現(xiàn)了細(xì)胞核的提取。圖6為白細(xì)胞完整分割流程。圖6h灰度圖中橫坐標(biāo)為灰度等級(jí),取值范圍是0~255,縱坐標(biāo)為每個(gè)灰度等級(jí)相應(yīng)的像素個(gè)數(shù)。

      Fig.5 Nucleus extraction results

      Fig.6 Leukocyte segmentation process

      3 白細(xì)胞的特征提取及分類

      3.1 BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)對(duì)白細(xì)胞分類流程

      在應(yīng)用反向傳播(back propagation,BP)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)[16]進(jìn)行分類時(shí),訓(xùn)練集數(shù)據(jù)占有重要的地位,直接影響分類器的質(zhì)量。選取具有代表性且分割效果較好的白細(xì)胞子圖作為訓(xùn)練集,可以避免因?yàn)檫^分割或欠分割造成的提取特征參量偏差,并增強(qiáng)分類器的魯棒性。然后對(duì)測(cè)試集中白細(xì)胞圖像進(jìn)行特征提取,組建特征向量,然后傳入訓(xùn)練好的BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分類器進(jìn)行分類。

      3.2 白細(xì)胞特征提取

      白細(xì)胞圖像的分割是為了提取對(duì)細(xì)胞核和細(xì)胞漿描述的特征參量[17],擬采用形態(tài)、顏色、紋理3個(gè)方面對(duì)細(xì)胞核和細(xì)胞漿進(jìn)行特征提取。

      3.2.1 形態(tài)特征 提取的細(xì)胞的形態(tài)特征[18]包括細(xì)胞核的分葉數(shù),細(xì)胞核的凸性,細(xì)胞核的偏心率,細(xì)胞核的伸長度,細(xì)胞核的圓形度,細(xì)胞的面積、周長、圓形度、核質(zhì)比,以及形狀因子。

      3.2.2 顏色特征 顏色特征[19]選取細(xì)胞,細(xì)胞核以及細(xì)胞漿在R,G,B這3個(gè)通道上的灰度均值,方差以及偏斜率。

      3.2.3 紋理特征 紋理特征選取細(xì)胞、細(xì)胞核和細(xì)胞漿像素的灰度共生矩陣[20],求取其能量、對(duì)比度、逆差矩、熵、相關(guān)性。

      3.3 白細(xì)胞BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分類器設(shè)計(jì)

      BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的工作原理是將樣本數(shù)據(jù)通過輸入層、經(jīng)隱含層向網(wǎng)絡(luò)輸出層進(jìn)行正向傳遞,傳遞過程稱為正向傳播。樣本數(shù)據(jù)經(jīng)過多層網(wǎng)絡(luò)計(jì)算,將得到的結(jié)果與標(biāo)注的分類標(biāo)簽進(jìn)行比較,通過損失函數(shù)計(jì)算誤差,然后再由輸出層向輸入層進(jìn)行反饋調(diào)節(jié),這種反饋調(diào)節(jié)機(jī)制稱為反向傳播。通過反饋信號(hào),每層神經(jīng)元進(jìn)行自我更新,逐層反饋到輸入層。其中,反饋誤差信號(hào)就是各個(gè)神經(jīng)元更新權(quán)值的依據(jù)。本文中擬采用3層網(wǎng)絡(luò)架構(gòu),選取sigmoid函數(shù)作為激活函數(shù)。

      (1)確定網(wǎng)絡(luò)節(jié)點(diǎn)數(shù)。在白細(xì)胞的形態(tài)特征、顏色特征、紋理特征中選取了17種特征作為輸入層節(jié)點(diǎn)數(shù),即m=17,輸出層節(jié)點(diǎn)數(shù)對(duì)應(yīng)白細(xì)胞的常規(guī)分類種數(shù),即n=5,隱含層節(jié)點(diǎn)數(shù)l的確定參考如下公式:

      (8)

      式中,a取0~10的常數(shù),通過實(shí)驗(yàn)方法確定節(jié)點(diǎn)數(shù)l=12。

      (2)特征參量歸一化。將白細(xì)胞特征參量進(jìn)行歸一化操作,避免數(shù)據(jù)量級(jí)差別帶來的計(jì)算偏差。

      (3)網(wǎng)絡(luò)初始化和算法選擇。初始化階段,給予權(quán)重系數(shù)W一個(gè)隨機(jī)數(shù)(-1.0~1.0),學(xué)習(xí)速率為0.1,迭代次數(shù)為500次。然后采用梯度修正法和反向錯(cuò)誤傳播算法。

      3.4 實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析

      在圖1所示的顯微視覺平臺(tái)上,完成了1075幅高質(zhì)量白細(xì)胞圖像采集,其中訓(xùn)練集數(shù)據(jù)是508幅,567幅作為測(cè)試集數(shù)據(jù)。實(shí)驗(yàn)結(jié)果如表1所示。

      由實(shí)驗(yàn)結(jié)果可以看出,對(duì)5類常見白細(xì)胞的識(shí)別

      Table 1 Experimental results of leukocyte recognition

      率為88.2%~98.2%, 由于嗜堿性粒細(xì)胞其表面顆粒度復(fù)雜,在細(xì)胞核提取過程中容易造成過分割和欠分割的現(xiàn)象,導(dǎo)致分割方法失效。故分類過程中取得了較低的識(shí)別率。

      良好的分割是識(shí)別的前提,精確的分割結(jié)果可以得到白細(xì)胞的高識(shí)別率。如表1所示,白細(xì)胞樣本綜合識(shí)別率為95.6%,在臨床應(yīng)用中取得預(yù)期效果。

      4 結(jié) 論

      面向血細(xì)胞形態(tài)學(xué)臨床檢驗(yàn)應(yīng)用需求,研究了白細(xì)胞的顯微視覺圖像人工智能識(shí)別算法。通過實(shí)驗(yàn)篩選,白細(xì)胞圖像顏色模型采用的背景分割方法具有較高的效率和精度;并在背景剝離的基礎(chǔ)上,利用大津法實(shí)現(xiàn)了白細(xì)胞細(xì)胞核和細(xì)胞漿的有效提??;設(shè)計(jì)了白細(xì)胞BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分類器,并完成了特征向量庫訓(xùn)練,實(shí)現(xiàn)了對(duì)白細(xì)胞的自動(dòng)識(shí)別,大樣本識(shí)別準(zhǔn)確率達(dá)到95.6%,為白細(xì)胞形態(tài)學(xué)識(shí)別的自動(dòng)化和智能化奠定了基礎(chǔ)。

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