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    貝萊斯芽胞桿菌(Bacillus velezensis)分類學(xué)及功能研究進(jìn)展

    2019-10-09 03:07:38張彩文程坤張欣劉波都海渤姚粟
    食品與發(fā)酵工業(yè) 2019年17期
    關(guān)鍵詞:芽胞萊斯菌種

    張彩文,程坤,張欣,劉波,都海渤,姚粟

    (中國食品發(fā)酵工業(yè)研究院有限公司,中國工業(yè)微生物菌種保藏管理中心,北京,100015)

    貝萊斯芽胞桿菌(Bacillusvelezensis)最早是由RUIZ-GARCA等[1]在西班牙馬拉加市的貝萊斯河中發(fā)現(xiàn)的。該菌種屬于革蘭氏陽性菌(G+),菌體呈桿狀,大小為0.5 μm×(1.5~3.5)μm,常見單個或成對排列,有時也呈短鏈排列。芽胞呈橢圓狀,位于非腫脹胞囊的中間或末端,不產(chǎn)生伴胞晶體和β-羥基丁酸,可通過鞭毛運動[2],普遍存在于自然界中,如河水[3]、海洋[4]、土壤[5]、植物組織[6]等。目前在NCBI的Taxonomy數(shù)據(jù)庫中顯示,貝萊斯芽胞桿菌屬于枯草芽胞桿菌群(Bacillussubtilisgroup)分類單元中的解淀粉芽胞桿菌亞群(Bacillusamyloliquefaciensgroup),同時是解淀粉芽胞桿菌植物亞種(Bacillusamyloliquefacienssubsp.plantarum)、甲基營養(yǎng)型芽胞桿菌(Bacillusmethylotrophicus)、“Bacillusoryzicola”的同物異名。在芽胞桿菌屬中,“同物異名”現(xiàn)象比較常見,因為早期細(xì)菌分類學(xué)鑒定技術(shù)存在一定的局限,往往缺乏可靠性,特別是枯草芽胞桿菌群和蠟樣芽胞桿菌群中的近源菌種不僅在表型上相似,而且在16S rDNA序列上也具有相當(dāng)高的同源性,因此這些近源菌種之間常出現(xiàn)名稱的誤用。隨著微生物分類鑒定技術(shù)的逐漸成熟,一些芽胞桿菌屬的菌種也逐步得以正名,其中就包括貝萊斯芽胞桿菌分類學(xué)地位的變遷及確定。

    芽胞桿菌屬(Bacillussp.)包含了許多有特殊功能的菌種,它們在生物農(nóng)藥、生物肥料、生物保鮮、生物降污、食品加工等領(lǐng)域具有特殊的重要性[7]。目前市場上的微生物肥料和飼料中菌種添加劑主要以枯草芽胞桿菌(Bacillussubtilis)為主;蘇云金芽胞桿菌(Bacillusthuringiensis)及其伴胞晶體是世界上產(chǎn)量最大的農(nóng)業(yè)微生物殺蟲劑,主要防治鱗翅目、雙翅目、鞘翅目、螨類等害蟲幼蟲[8];國家衛(wèi)生部在2016版《可食用菌種名單》中將能夠進(jìn)行乳酸發(fā)酵的凝結(jié)芽胞桿菌(Bacilluscoagulans)列入其中。貝萊斯芽胞桿菌是芽胞桿菌屬中一種新興的功能性菌種,已經(jīng)有很多研究證明,貝萊斯芽胞桿菌在植物促生功能和抗植物病原菌方面能夠發(fā)揮重要作用。另外,由于其具有將外界一氧化碳物轉(zhuǎn)化為自身營養(yǎng)物質(zhì)這一特性,甲基營養(yǎng)型芽胞桿菌(即貝萊斯芽胞桿菌)被廣泛應(yīng)用于食品發(fā)酵領(lǐng)域,同時在環(huán)境保護(hù)、工業(yè)應(yīng)用、養(yǎng)殖及醫(yī)藥等領(lǐng)域都具有相應(yīng)的功能研究[9]。本文對貝萊斯芽胞桿菌的系統(tǒng)分類學(xué)地位和功能性研究進(jìn)展進(jìn)行概述,以期為進(jìn)一步研究貝萊斯芽胞桿菌提供參考。

    1 貝萊斯芽胞桿菌的分類學(xué)地位變遷

    1.1 貝萊斯芽胞桿菌的分離和命名

    貝萊斯芽胞桿菌最早是從西班牙馬拉加市的貝萊斯河河口發(fā)現(xiàn)的,RUIZ-GARCA等[1]分別在1999年和2000年利用MY培養(yǎng)基從該河口淡鹽水中分離獲得CR-14b和CR-502T兩株菌,隨后通過表型與基因型鑒定手段發(fā)現(xiàn)它們是芽胞桿菌屬的新種,并于2005年作為一個新的分類單元在IJSEM(International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology)雜志上正式發(fā)表,確立了貝萊斯芽胞桿菌的分類地位。在表型上,他們對這2株菌以及其他17株相關(guān)芽胞桿菌進(jìn)行了122項表型測試,選擇了92個不同的表型特征進(jìn)行了聚類分析,發(fā)現(xiàn)菌株CR-14b和CR-502T二者之間的表型特征相似性高達(dá)94%,而它們與枯草芽胞桿菌枯草亞種(Bacillussubtilissubsp.subtilis)CECT 39T和解淀粉芽胞桿菌(Bacillusamyloliquefaciens)DSM 7T的相似度最高(約90%)。在分子水平上,B.velezensisCR-502T的16S rDNA序列與B.subtilissubsp.subtilisCECT-39T、B.amyloliquefaciensDSM 7T的相似度均大于99%。而B.velezensisCR-502T作為新種的主要依據(jù)在于它與相似度高于98%的相關(guān)菌種的DNA-DNA雜交(DNA-DNA hybridization,DDH)率均低于20%,其中與B.subtilissubsp.subtilisCECT-39T的雜交率為13.3%,與B.amyloliquefaciensDSM 7T的DNA-DNA雜交率為18.6%。1987年,國際系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)委員會(International Committee on Systematic Bacteriology,ISCB)發(fā)表報告指出:通常將DNA-DNA相關(guān)性≥70%作為細(xì)菌“種”的界限[10],這一標(biāo)準(zhǔn)也被認(rèn)為是細(xì)菌新種鑒定的黃金標(biāo)準(zhǔn)。

    1.2 B.velezensis、B.amyloliquefaciens subsp.plantarum、B.methylotrophicus互為同物異名

    自B.velezensis命名后的10年里,其分類學(xué)地位一直受到人們的關(guān)注。在2008年,WANG等[11]選擇B.amyloliquefaciensBCRC 11601T、BCRC 14193、BCRC 14711、BCRC 17038與B.velezensisBCRC 17467T進(jìn)行16S rDNA、gyrB基因序列系統(tǒng)發(fā)育分析和DDH相關(guān)性分析,根據(jù)學(xué)名優(yōu)先權(quán)原則,提出B.velezensis是B.amyloliquefaciens(1987年合法化發(fā)表)后期的同物異名,主要依據(jù)是B.velezensisBCRC 17467T與B.amyloliquefaciensBCRC 11601T、BCRC 14193、BCRC 14711、BCRC 17038的DNA-DNA雜交率分別為74%、89%、74%、76%。在2010年,一株分離于水稻根際土的甲基營養(yǎng)型芽胞桿菌(Bacillusmethylotrophicus)CBMB 205T以新種的名義被發(fā)表[12],文章采用16S rDNA系統(tǒng)發(fā)育分析確定了8株與CBMB 205T相似性大于98.2%的相關(guān)模式菌株,然后將8株模式菌株分別與CBMB 205T進(jìn)行DNA-DNA雜交,其中與其DNA相關(guān)性最高的菌株為B.amyloliquefaciensKACC 12067T(36.0%)。

    BORRISS等[13]采用16S rDNA、gyrA、cheA基因序列系統(tǒng)發(fā)育分析,結(jié)合DNA-DNA雜交技術(shù)及比較基因組分析將11株B.amyloliquefaciens分成了兩大類,其中基于基因組-基因組距離比較法(genome-to-genome distance comparison,GGDC)計算了模式菌株B.amyloliquefaciensDSM 7T和FZB 42T之間的DNA-DNA相關(guān)性大約為77%,同時利用傳統(tǒng)的DNA-DNA雜交技術(shù)獲得二者之間的雜交率為63.7%~71.2%,鑒于DNA-DNA雜交率在70%~80%范圍內(nèi)可用于區(qū)分同一種內(nèi)不同亞種的細(xì)菌,他們認(rèn)為這些結(jié)果不足以在種水平區(qū)分DSM 7T和FZB 42T,但可以將二者作為B.amyloliquefaciens的2個單獨的亞種,并由此提出了以解淀粉芽胞桿菌解淀粉亞種(Bacillusamyloliquefacienssubsp.amyloliquefaciens)DSM 7T(=BCRC 11601T=ATCC 23350T)和解淀粉芽胞桿菌植物亞種(Bacillusamyloliquefacienssubsp.plantarum)FZB 42T(=DSM 23117T)為代表的2個新分類單元。

    但在2015年,DUNLAP等[14]提出B.amyloliquefacienssubsp.plantarum應(yīng)該作為B.methylotrophicus后期的同物異名,因為2個分類單元的模式菌株(FZB 42T和KACC 13105T=CBMB 205T)無論從形態(tài)學(xué)、生理生化還是核心基因組系統(tǒng)發(fā)育分析上都高度相似,并且二者之間基于GGDC方法的DNA-DNA雜交(DNA-DNA hybridization,DDH)率高達(dá)85.1%(>70%),核心基因組的平均核苷酸一致性(average nucleotide identity,ANI)值為98.4%(>95%)。對于物種劃分而言,一般70%的DNA-DNA雜交率約對應(yīng)95%的ANI[15]。同年,分離于水稻根部的內(nèi)生細(xì)菌‘Bacillusoryzicola’YC7007與YC7010T以新種的名義在The Plant Pathology Journal雜志上有效發(fā)表[16],但該分類名稱未在IJSEM雜志上合法化發(fā)表。直到2016年,DUNLAP等[17]又進(jìn)一步對B.velezensis、B.amyloliquefaciens、B.methylotrophicus、B.amyloliquefacienssubsp.plantarum、‘B.oryzicola’的分類學(xué)地位重新進(jìn)行了討論,他們采用比較基因組學(xué)和數(shù)字DNA-DNA雜交(digital DNA-DNA hybridization,dDDH)的方法對5株菌B.velezensisNRRL B-41580T(=CR-502T=BCRC 17467T=KCTC 13102T=LMG 22478T)、‘B.oryzicola’KACC 18228T、B.methylotrophicusKACC 13105T、B.amyloliquefacienssubsp.plantarumFZB 42T、B.amyloliquefaciensDSM 7T進(jìn)行分析,結(jié)果顯示在核心基因組系統(tǒng)發(fā)育樹上DSM 7T與其他4株菌位于不同的進(jìn)化分支,且DSM 7T與NRRL B-41580T、KACC 18228T、KACC 13105T、FZB 42T之間的dDDH值分別為55.5%、55.2%、55.2%、56.2%,而后4株菌兩兩之間的dDDH值均大于84%,由此指出B.velezensis并不是B.amyloliquefaciens后期的同物異名,他們分別屬于2個單獨的種,而B.methylotrophicus、B.amyloliquefacienssubsp.plantarum、‘B.oryzicola’應(yīng)該作為B.velezensis的后期同物異名。

    2 貝萊斯芽胞桿菌的分類現(xiàn)狀

    2017年,F(xiàn)AN等[18]就B.amyloliquefaciens、B.velezensis、B.siamensis提出了一個全新的概念“operational groupB.amyloliquefaciens”:他們首先對芽胞桿菌屬(Bacillussp.)中的23株代表性模式菌株的核心基因組進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析,從中確定了4個與B.amyloliquefaciensDSM 7T高度相似并具有有效命名的菌種,分別是B.siamensis、B.velezensis、B.methylotrophicus、B.amyloliquefacienssubsp.plantarum;其次在NCBI數(shù)據(jù)庫中獲取這4個菌種和B.amyloliquefaciens系列內(nèi)的66株細(xì)菌的全基因組序列進(jìn)行比較基因組分析,包括rpoB基因系統(tǒng)發(fā)育分析、四核苷酸(tetra-nucleotide signatures,TETRA)回歸系數(shù)、ANI、平均氨基酸一致性(average amino acid identity,AAI)、dDDH、GC mol%、16S rDNA序列相似性分析、核心基因組系統(tǒng)發(fā)育分析,其中從rpoB基因以及核心基因組系統(tǒng)發(fā)育樹上可以清楚地將B.amyloliquefaciens、B.siamensis、B.velezensis/B.methylotrophicus/B.amyloliquefacienssubsp.plantarum分成3組,而且57株B.velezensis/B.methylotrophicus/B.amyloliquefacienssubsp.plantarum系列菌株與DSM 7T的ANI值均在93%左右,而dDDH值均在55%左右,這也進(jìn)一步證實了之前DUNLAP等[17]的結(jié)論;然后他們還分別選擇了7株來自于“operational group ‘B.subtilis’”和6株來自于“operational group ‘B.amyloliquefaciens’”的模式菌種,基于它們的ANI和TETRA的中值構(gòu)建系統(tǒng)樹圖,結(jié)果顯示6株“operational group ‘B.amyloliquefaciens’”的模式菌種之間是密切相關(guān)的;綜上,他們建議將“operational group ‘B.amyloliquefaciens’”作為枯草芽胞桿菌群(Bacillussubtilisgroup)分類等級下的一個新分類單元。另外,部分菌株在分類學(xué)命名上存在長期的誤用,如芽胞桿菌中的生物防控菌株GB03[19]和QST713[20]經(jīng)常被當(dāng)作B.subtilis,但實際上他們是B.velezensis,同時也是“operational groupB.amyloliquefaciens”這一分類單元的成員[18];張欣等[21]采用微生物多相分類鑒定技術(shù)對中性蛋白酶生產(chǎn)菌種AS1.398枯草芽胞桿菌(B.subtilis)CICC 10888進(jìn)行了復(fù)核鑒定,發(fā)現(xiàn)其分類學(xué)地位為解淀粉芽胞桿菌植物亞種(B.amyloliquefacienssubsp.plantarum)。

    貝萊斯芽胞桿菌屬于枯草芽胞桿菌群,與其近源菌種在表型和16S rDNA序列上難以鑒別,然而隨著分子生物學(xué)的迅速發(fā)展和新技術(shù)在微生物分類鑒定中的應(yīng)用,貝萊斯芽胞桿菌的分類學(xué)地位幾經(jīng)波折后終于得以確立。目前“operational groupB.amyloliquefaciens”分類單元中包括B.amyloliquefaciens、B.siamensis、B.velezensis/B.methylotrophicus/B.amyloliquefacienssubsp.plantarum,而根據(jù)學(xué)名優(yōu)先權(quán)原則,B.methylotrophicus、B.amyloliquefacienssubsp.plantarum、‘B.oryzicola’的當(dāng)前科學(xué)命名應(yīng)為B.velezensis。

    3 貝萊斯芽胞桿菌的功能研究

    3.1 農(nóng)業(yè)應(yīng)用

    B.velezensis在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)上具有廣譜的抗菌活性以及促進(jìn)植物生長的作用。如表1所示,31株B.velezensis功能性菌株分別分離于河水、農(nóng)作物土壤、魚類腸道、植物組織、野牦牛牛糞等不同的基物,其中絕大部分功能研究都與抑制植物病原菌相關(guān),而且B.velezensis常作為農(nóng)業(yè)應(yīng)用上的生物防控劑和植物生長促生劑。目前,已報道的B.velezensis的抗菌作用機(jī)理主要包括:產(chǎn)抗菌蛋白[22]、脂肽類抗生素[23]、由非核糖體多肽合成酶(NRPS)和聚酮化合物(PKS)合成的抗生素[24]、誘導(dǎo)系統(tǒng)抗性[16],同時研究表明B.velezensis具有ACC脫氨酶活性,能夠分泌IAA,在促進(jìn)植物生長的同時,可以提高植物的抗性[25]。如楊勝清等[22]提取了生防細(xì)菌B.velezensisS6的發(fā)酵液粗提物,經(jīng)過分離純化獲得抗菌蛋白,并通過菌絲生長速率法和孢子萌發(fā)法發(fā)現(xiàn)S6的拮抗蛋白對番茄早疫病菌有明顯的抑制作用。從受植物病原體侵染的甜菜土壤中分離出的菌株B.velezensisFZB42T,能夠產(chǎn)生大量的次級代謝產(chǎn)物,包括bacillibactin、bacillomycin D、bacilysin、difficidin、fengycin、macrolactin、surfactin,其全基因組序列分析表明,有9個NRPS和PKS基因簇直接與生物活性肽和聚酮化合物的合成相關(guān),其中有3個基因簇(mln、bae、dfn,基因長度共199 Kb)直接合成具有抗菌作用的聚酮類化合物:macrolactin、bacillaene、difficidin[26]。分離于水稻根際的B.velezensisCAU B946[27]能夠生成脂肽類、聚酮類化合物(PKS)、芽胞桿菌溶素等抗生素,并且在控制煙草黑脛病、水稻紋枯病、棉花枯萎病、棉花黃萎病和小麥瘡痂病等植物病害上顯示出了巨大的潛力;從小麥根際分離的YAU B9601-Y2[28]同樣能夠產(chǎn)生bacillomycin D、fengycin和difficidin;菌株B.velezensisM75分離于用于蘑菇栽培的廢棉,對植物病原真菌具有明顯的拮抗作用[24];來源于野牦牛牛糞的菌株LM2303也能夠分泌很多抗菌性次級代謝產(chǎn)物,可以有效抑制禾谷鐮刀菌的分生孢子萌發(fā)和菌絲生長[29-30]。而且,菌株LM2303、CAU B946、YAU B9601-Y2和M75的全基因組序列分析中均發(fā)現(xiàn)了與FZB42T相似的9個具有抗菌功能的NRPS和PKS基因簇,此外,在YAU B9601-Y2中發(fā)現(xiàn)了負(fù)責(zé)合成和修飾mersacidin(一種B型羊毛硫抗生素)的完整基因簇,但在與B.velezensis物種親緣關(guān)系比較近的其他菌株中未觀察到[24]。而菌株M75和LM2303含有kijanimicin(氯絲菌素)操縱子片段,使它們能夠?qū)σ恍└锾m氏陽性菌和厭氧微生物產(chǎn)生抗性[24,30]。

    表1 B.velezensis不同菌株分離源及功能特性統(tǒng)計Table 1 Habitats and functions of different B.velezensis strains

    由于不同菌株具有不同的基因組特征,因此這些菌株的抗菌活性和次級代謝產(chǎn)物也有可能不同。菌株B.velezensisSQR9(曾用名B.subtilisSQR9[31]、B.amyloliquefaciensSQR9[32])是一株分離于黃瓜根際土的廣譜性拮抗菌,常作為農(nóng)作物生產(chǎn)中的生物肥料和生物防治劑,能夠形成強健的生物膜,具有突出的根系定殖能力,有效促進(jìn)植物生長和抑制土傳病害[33]。來源于馬鈴薯疥瘡病抑菌型土壤的B.velezensisBAC03(曾用名B.amyloliquefaciensBAC03[34]),能夠有效抑制由Streptomycesscabies引起的馬鈴薯和蘿卜疥瘡病[35]。為了確定BAC03促進(jìn)植物生長的功效,MENG等[36]測試了菌株BAC03對9種類型植物(包括甜菜,胡蘿卜,黃瓜,胡椒,馬鈴薯,蘿卜,南瓜,番茄和蘿卜)的潛在促生作用,結(jié)果表明菌株BAC03具有ACC脫氨酶活性和分泌IAA的能力,對9種植物都具有一定的促生作用。

    3.2 工業(yè)應(yīng)用

    甲基營養(yǎng)型芽胞桿菌(即貝萊斯芽胞桿菌)C412的胞外分泌物具有絮凝作用,對高嶺土懸濁液的絮凝活性高達(dá)98.27%,微生物絮凝劑的產(chǎn)率約為4.25 g/L,該微生物絮凝劑的主要組分是多糖和極性官能團(tuán),具有較好的耐熱性和耐酸堿性,具有潛在的工業(yè)應(yīng)用價值[9]。另外,由于甲基營養(yǎng)型芽胞桿菌具有將外界一氧化碳物轉(zhuǎn)化為自身營養(yǎng)物質(zhì)這一特性,被廣泛應(yīng)用于食品發(fā)酵領(lǐng)域[9]:從自然發(fā)酵的豆豉中分離獲得的甲基營養(yǎng)型芽胞桿菌B-1具有較高的酶活性,接種于豆粕中進(jìn)行固態(tài)發(fā)酵時能夠高效分解豆粕中的大分子蛋白質(zhì)[52];從醬香型大曲中分離獲得的甲基營養(yǎng)型芽胞桿菌FBKL 1.0190產(chǎn)中性蛋白酶、糖化酶、纖維素酶和脂肪酶的能力非常突出,對提高醬香型大曲的品質(zhì)具有良好的應(yīng)用前景[53]。從土壤中分離的甲基營養(yǎng)型芽胞桿菌SK19.001能夠不依賴谷氨酸發(fā)酵生產(chǎn)無毒的γ-聚谷氨酸,可直接應(yīng)用于食品工業(yè)等領(lǐng)域[54]。

    3.3 環(huán)境保護(hù)應(yīng)用

    在環(huán)境保護(hù)方面,貝萊斯芽胞桿菌也發(fā)揮著一定的作用,然而絕大數(shù)相關(guān)研究同樣是以甲基營養(yǎng)型芽胞桿菌的命名展開的。最初,RUIZ-GARCA等是為了篩選出產(chǎn)表面活性劑的新菌種而分離到了貝萊斯芽胞桿菌CR-14b和CR-502T,而事實也證明了這2株菌具有作為生物表面活性劑的潛力。目前的生物表面活性劑在污水處理[55]、生物修復(fù)、重金屬提取以及油泥預(yù)處理等方面都有廣泛的應(yīng)用[56]。如從復(fù)合重金屬污染場地分離的甲基營養(yǎng)型芽胞桿菌JY-04能夠高效吸附水體環(huán)境中的重金屬,而且能夠在土壤中強化植物提取重金屬的能力[57];譚澤文等[58]從土壤中篩選出的一株甲基營養(yǎng)型芽胞桿菌RF2具有餐廚垃圾防蠅產(chǎn)蛆效果,這可能與該菌在生長繁殖階段分泌出大量的抗生素類或抗菌肽類物質(zhì)有關(guān)。榮璐閣等[59]通過使用表面活性劑吐溫80(Tween80)和鼠李糖脂(RL)強化了甲基營養(yǎng)型芽胞桿菌對柴油土壤的修復(fù)效果。

    此外,貝萊斯芽胞桿菌還可以作為飼用微生物菌劑,同時有望在醫(yī)療保健方面發(fā)揮更重要的作用[9]。同一種不同株B.velezensis在功能上存在著差異,因此還需要進(jìn)一步發(fā)掘自然界中B.velezensis的新菌株資源,以開發(fā)利用新功能菌株。

    4 展望

    近年來,由于微生物分類鑒定技術(shù)的迅速發(fā)展,微生物分類系統(tǒng)的更新速度也不斷加快,不僅新種的數(shù)量不斷增長,一些微生物的分類學(xué)地位也發(fā)生了變化,貝萊斯芽胞桿菌所屬的枯草芽胞桿菌群即是分類變化快速的典型代表[60]。隨著分子生物學(xué)的迅猛發(fā)展,特別是對基因組學(xué)研究的興起,進(jìn)一步完善了微生物的分類鑒定方法和標(biāo)準(zhǔn)。貝萊斯芽胞桿菌分類學(xué)地位的變遷及確立經(jīng)歷了一個相對曲折的過程,其后期的同物異名菌種出現(xiàn)的原因在于:一方面是所采用的細(xì)菌分類鑒定方法存在局限性;另一方面是已報道的同物異名現(xiàn)象對后期相關(guān)菌種的研究存在一定程度上的制約性。因此未來對于微生物新種的發(fā)表,建議在多項分類技術(shù)的基礎(chǔ)上,與基因組學(xué)方法相結(jié)合,互為補充和驗證,從而讓菌種鑒定獲得更科學(xué)、更準(zhǔn)確的結(jié)論。

    貝萊斯芽胞桿菌在農(nóng)業(yè)、工業(yè)、環(huán)境保護(hù)、養(yǎng)殖等眾多領(lǐng)域都有相應(yīng)的功能研究,其中在農(nóng)業(yè)推廣上的運用最多,主要體現(xiàn)在其對多種植物病原微生物的廣譜抗性以及促生作用。在過去幾個世紀(jì),化肥和農(nóng)藥在提高作物質(zhì)量和產(chǎn)量方面發(fā)揮了非常重要的作用,但同時對地球環(huán)境、人類健康及生態(tài)系統(tǒng)的穩(wěn)定性都構(gòu)成了潛在的威脅,因此使用生物控制劑防治植物病原菌不失為一種更安全且可持續(xù)的戰(zhàn)略措施[61]。目前,芽胞桿菌Bacillusspp.已經(jīng)成為農(nóng)業(yè)應(yīng)用上非常廣泛的一類生防細(xì)菌,它們能夠產(chǎn)生芽胞,具有種群龐大、繁殖力強、抗逆性強、理化性質(zhì)穩(wěn)定、產(chǎn)物豐富等特點[62-63]。本文中已報道的貝萊斯芽胞桿菌(B.velezensis)來源于不同的生境,說明其在自然界中廣泛存在,而且可以通過產(chǎn)抗菌性次級代謝產(chǎn)物、誘導(dǎo)抗性、分泌IAA等方式對多種植物病原微生物產(chǎn)生廣譜抗性,促進(jìn)植物生長。因此,開發(fā)利用貝萊斯芽胞桿菌(B.velezensis)作為生防制劑具有良好的農(nóng)業(yè)應(yīng)用前景。為了更好地利用貝萊斯芽胞桿菌控制植物病害,需重視特殊生境中的B.velezensis優(yōu)良菌株的篩選,加強菌劑研發(fā)工作;利用分子生物學(xué)、基因組學(xué)和蛋白組學(xué)等方法明確生防相關(guān)基因在植物、病原微生物、貝萊斯芽胞桿菌三者之間發(fā)揮作用的機(jī)制;可考慮改良B.velezensis的功能基因,提高其抗菌活性、誘導(dǎo)抗性,增強抑菌廣譜性等,以期盡早實現(xiàn)貝萊斯芽胞桿菌菌劑的商品化、規(guī)?;a(chǎn)。另外,同物異名甲基營養(yǎng)型芽胞桿菌(B.methylotrophicus)在食品加工、工業(yè)等方面的應(yīng)用已經(jīng)有相對成熟的研究,這為今后進(jìn)一步開發(fā)B.velezensis在其他領(lǐng)域的功能提供了新的思路。

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