楊苗苗,周勇志,曹 杰,龔海燕,張厚雙,周金林
(1.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院上海獸醫(yī)研究所,上海 200241;2.上海師范大學(xué)生命與環(huán)境科學(xué)學(xué)院,上海200234)
蜱和蜱傳播疾病一直是影響公眾健康的重大問題[1]。目前,伴隨常規(guī)滅蜱方法而出現(xiàn)的環(huán)境污染、食品安全和蜱的抗藥性等問題日益彰顯。因此,篩選可行的抗原候選分子,開發(fā)針對(duì)它們的疫苗,已成為控制蜱的重要途徑[2]。蜱的消化與生長(zhǎng)發(fā)育及其繁殖密切相關(guān),而糞便蛋白成分則是反映蜱消化的重要指標(biāo)。本研究旨在通過LC-MS/MS蛋白組學(xué)方法,分析鐮形扇頭蜱不同吸血時(shí)段糞便中的蛋白質(zhì)成份,進(jìn)一步了解蜱的血液消化特征,篩選可用于蜱疫苗研發(fā)的潛在蛋白質(zhì)抗原[3-5]。
1.1 蜱的飼養(yǎng)和糞便的收集將鐮形扇頭蜱成蜱分為3組,每組雌蜱60只、雄蜱30只,分別接種到3只家兔的耳部。接種前將耳朵的兔毛剃掉,并將耳袋套在兔子耳朵上,耳朵的一端與兔耳基部用縫線固定。將蜱放入固定好的耳袋迅速用膠帶封口。兔子常規(guī)飼養(yǎng),每日檢查耳袋中蜱的吸血情況,采用真空抽吸泵分別收集蜱吸血d4、d8 的糞便,去除兔子皮屑、兔毛及其他雜物,轉(zhuǎn)移至EP管中備用,并做好標(biāo)記。d4 分別標(biāo)記為F4.1、F4.2、F4.3;d8分別標(biāo)記為F8.1、F8.2、F8.3。
1.2 蛋白質(zhì)的定量取適量糞便樣品,分別加入200 μL SDT裂解液,振蕩器勻漿,沸水浴10 min。超聲破碎(100 W,10 次,每次10 s),沸水浴15 min。14 000×g離心 30 min,取上清。BCA 法進(jìn)行蛋白質(zhì)定量。
1.3 蛋白質(zhì)的 SDS-PAGE分析每組各取20 μg樣品,5∶1 的體積比加入 5×上樣緩沖液,沸水浴 8 min,14 000×g離心 10 min,取上清,進(jìn)行12%SDS-PAGE電泳。電泳條件:恒流,15 mA,電泳時(shí)間60 min。
1.4 蛋白質(zhì)的FASP( filter-aided sumple preparation,F(xiàn)ASP)酶解分別從每份樣品中稱取150 μg,加入DTT至終濃度為100 mmol/L,沸水浴5 min,冷卻至室溫。加入 200 μL 尿素緩沖液(8 mol/L尿素,150 mmmol/L Tris-HCl,pH8.0)混勻,轉(zhuǎn)入30 kd超濾離心管,12 000×g離心15 min。加入200 μL尿素緩沖液,14 000×g離心15 min,棄濾液。加入100 μL吲哚-3-乙酸溶液(50 mmol/L吲哚-3-乙酸溶液加入到尿素緩沖液中),600 r/min 振蕩1 min,避光室溫30 min,12 000×g離心10 min。加入100 μL尿素緩沖液,12 000×g離心10 min,重復(fù)2次。加入100 μLNH4HCO3緩沖液,12 000×g離心10 min,重復(fù)2次。加入40 μLTrypsin 緩沖液(3 μgTrypsin 加入到4 μLNH4HCO3緩沖液),600 r/min 振蕩1 min,37℃放置16~18 h。換新收集管,12 000×g離心10 min,收集濾液,濾液C18-SD Extraction Disk Cartridge 脫鹽處理,OD280定量。
1.5 酶解產(chǎn)物的 LC-MS/MS分析按照定量結(jié)果各取2 μg酶解后產(chǎn)物進(jìn)行LC-MS/MS分析,每個(gè)樣品進(jìn)樣1次。采用納升流速 HPLC 液相系統(tǒng) EASY-nLC1000 進(jìn)行分離。液相A液為0.1%甲酸乙腈水溶液(乙腈為 2%),B液為0.1%甲酸乙腈水溶液(乙腈為84%)。色譜柱Thermo EASY column SC200 150 μm*100 mm(RP-C 18)以100%的 A液平衡。樣品由自動(dòng)進(jìn)樣器上樣到經(jīng)色譜柱進(jìn)行分離,流速為400 nL/min。相關(guān)液相梯度如下:0~100 min,B液線性梯度從0%到45%;100~108 min,B液線性梯度從45%到100%;108~120 min,B 液維持在100%。酶解產(chǎn)物經(jīng)毛細(xì)管高效液相色譜分離后用 Q-Exactive 質(zhì)譜儀(Thermo Finnigan)進(jìn)行質(zhì)譜分析。分析時(shí)長(zhǎng):120 min,檢測(cè)方式:正離子,母離子掃描范圍:300~1800 m/z,多肽和多肽的碎片的質(zhì)量電荷比按照下列方法采集:每次全掃描(full scan)后采集20個(gè)碎片圖譜(MS2 scan,HCD)。MS1在M/Z 200時(shí)分辨率為70 000,MS2在M/Z200時(shí)分辨率為17 500。
1.6 Maxquant的非標(biāo)記分6個(gè)LC-MS/MS原始文件導(dǎo)入Maxquant 軟件(版本號(hào) 1.3.0.5)進(jìn)行查庫(kù),數(shù)據(jù)庫(kù)是肩突硬蜱的基因組和Ixodidae硬蜱屬的所有蛋白(http://www.uniprot.org/),并進(jìn)行非標(biāo)定量分析。
1.7 Perseus 的統(tǒng)計(jì)學(xué)和生物信息學(xué)分析Maxquant所得的查庫(kù)文件使用 Perseus 軟件(1、3、0、4)進(jìn)行分析,并對(duì)吸血d4和d8糞便進(jìn)行差異蛋白分析。
2.1 蛋白質(zhì)濃度測(cè)定采用BCA 法對(duì)樣本蛋白質(zhì)進(jìn)行定量,結(jié)果顯示,每組樣品的蛋白濃度為0.622~1.006 μg/μL(表1)。
表1 樣品蛋白質(zhì)濃度信息Table 1 Information of sample protein concentration
2.2 SDS-PAGE分析電泳結(jié)果顯示,樣品條帶分離清晰,蛋白提取效果良好。糞便中存在一組復(fù)雜的蛋白質(zhì),分子量主要集中于20~150 kDa,在略大于25 kDa、50~75 kDa、75 ~100 kDa之間各有一明顯條帶(圖1)。
圖1 吸血后成蜱糞便樣品的SDS-PAGE電泳結(jié)果Fig.1 SDS-PAGE of samples from tick after sucking blood
2.3 肽段 OD280測(cè)定經(jīng)吸光值OD280測(cè)定計(jì)算,樣品肽段濃度范圍為1.8 ~2.8 μg/mL,具體見表2.
表 2 肽段 OD280 值Table 2 OD280 values of peptide
2.4 蛋白質(zhì)鑒定及定量結(jié)果對(duì)吸血d4、d8蜱糞便蛋白進(jìn)行LC-MS/MS 質(zhì)譜鑒定,發(fā)現(xiàn)存在蜱源肽段數(shù)628個(gè)、蛋白質(zhì)總數(shù)196個(gè);兔源肽段數(shù)6173個(gè)、蛋白質(zhì)總數(shù)659個(gè)。吸血d4、d8的蜱糞便中均被檢測(cè)到的蜱源蛋白189種,僅存在于吸血d4蜱源蛋白1種,僅存在于吸血d8蜱源蛋白6種。吸血d4、d8的蜱糞便中均檢測(cè)到的兔源蛋白626種,僅存在于d4兔源蛋白10種,僅存在于d8兔源蛋白23種。
2.5 蛋白質(zhì)顯著性分析將F8組與F4組分別進(jìn)行表達(dá)差異 T test分析,P<0.05為差異具有顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
蛋白質(zhì)鑒定及定量、LC-MS/MS 質(zhì)譜鑒定結(jié)果顯示,共鑒定蜱源蛋白196種、兔源蛋白659種[6]。其中吸血d4與吸血d8相對(duì)比,發(fā)現(xiàn)蜱源差異蛋白(篩選標(biāo)準(zhǔn)Ratio> +/-1.2)17種:13種蛋白表達(dá)上調(diào),4種蛋白表達(dá)下調(diào)。在蜱源蛋白生物學(xué)進(jìn)程分析結(jié)果中,經(jīng)蛋白質(zhì)定量分析最終得到具有統(tǒng)計(jì)意義的蛋白質(zhì)11個(gè),其中表達(dá)上調(diào)的蛋白質(zhì)10個(gè),表達(dá)下調(diào)的蛋白質(zhì)1個(gè)(表3)。差異表達(dá)蛋白質(zhì)主要參與物質(zhì)的合成及運(yùn)輸,有機(jī)物的代謝,應(yīng)激反應(yīng),生物過程的調(diào)節(jié),細(xì)胞發(fā)育,分化細(xì)胞組分的合成,基因表達(dá)等主要過程。
發(fā)現(xiàn)兔源差異蛋白49種:32種蛋白表達(dá)上調(diào),17種蛋白表達(dá)下調(diào)。對(duì)兔源蛋白生物學(xué)進(jìn)程分析結(jié)果中,經(jīng)蛋白質(zhì)定量分析最終得到具有統(tǒng)計(jì)意義的蛋白質(zhì)16個(gè),其中表達(dá)上調(diào)的蛋白質(zhì)11個(gè),表達(dá)下調(diào)的蛋白質(zhì)5個(gè)(表4)。差異表達(dá)蛋白質(zhì)主要參與組成細(xì)胞的結(jié)構(gòu)成分,核酸的轉(zhuǎn)錄翻譯,物質(zhì)的合成、運(yùn)輸及有機(jī)物的代謝,能量的代謝,抗凝血等主要過程以及作為具有調(diào)節(jié)功能的激素[7]。
對(duì)蜱源差異蛋白分析發(fā)現(xiàn)參與生物過程的差異蛋白有6種:6-磷酸葡萄糖酸脫氫酶、?;?CoA合成酶(片段)、無腦回畸形-1同源物、肌動(dòng)蛋白相關(guān)蛋白2 / 3復(fù)合體亞基2, 34 kDa、Rab GDP解離抑制劑、甘油醛-3-磷酸脫氫酶。甘油醛-3-磷酸脫氫酶、6-磷酸葡萄糖酸脫氫酶、?;?CoA合成酶(片段)、ATP-檸檬酸裂解酶、磷脂酶A2等參與到有機(jī)物代謝過程;無腦回畸形-1同源物、雌性特異性組胺結(jié)合蛋白2在應(yīng)激反應(yīng)方面發(fā)揮重要作用,?;?CoA合成酶(片段)、ATP-檸檬酸裂解酶在生物合成上有重要的作用,肌動(dòng)蛋白相關(guān)蛋白2 / 3復(fù)合體亞基 2.3 kDa、踝蛋白等蛋白是細(xì)胞骨架的基本組成部分。
對(duì)兔源差異蛋白分析發(fā)現(xiàn)細(xì)胞結(jié)構(gòu)成分有6種:兔內(nèi)質(zhì)蛋白、角蛋白、I型細(xì)胞骨架17、Na(+)/H(+)交換調(diào)節(jié)因子NHE-RF1、兔膠原蛋白α-2(I)鏈、兔脂多糖結(jié)合蛋白。兔延伸因子1-2、腺苷酸合成酶同工酶2、兔核心異型組蛋白H2A、兔酪蛋白激酶II的α亞基等參與到核酸的轉(zhuǎn)錄翻譯過程;兔蘋果酸脫氫酶、兔內(nèi)質(zhì)蛋白、皮質(zhì)類固醇結(jié)合球蛋白在物質(zhì)的合成、運(yùn)輸及有機(jī)物的代謝方面發(fā)揮重要作用;PAPS合酶1、兔組蛋白H2A、腺苷酸合成酶同工酶2、S-(羥甲基)谷胱甘肽脫氫酶、磷酸甘油酸變位酶在能量的代謝中有重要的作用;血小板活化因子乙酰水解酶IB亞基α參與抗凝血過程。
表3 具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義蜱源差異蛋白Table 3 Statistically significant difference tick-derived proteins
表4 具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義兔源差異蛋白Table 4 Statistically significant difference rabbit-derived proteins
鐮形扇頭蜱雌性成蜱在宿主內(nèi)寄生時(shí),一般前期為慢速吸血期,6 d后進(jìn)入快速吸血期。根據(jù)蛋白組學(xué)結(jié)果顯示,F(xiàn)8組雌性特異性組胺結(jié)合蛋白2表達(dá)下調(diào),該蛋白在逃避或抵抗宿主防御反應(yīng)方面發(fā)揮重大作用[8],這與蜱叮咬誘發(fā)宿主免疫反應(yīng)時(shí),蜱會(huì)分泌相應(yīng)物質(zhì)來干擾宿主反應(yīng)這一現(xiàn)象符合。6-磷酸葡萄糖酸脫氫酶、?;?CoA合成酶(片段)、ATP-檸檬酸裂解酶、磷脂酶A2、甘油醛-3-磷酸脫氫酶等與能量產(chǎn)生相關(guān)的酶在F8組中上調(diào)[9],表明快速飽血期蜱的消化活動(dòng)明顯增強(qiáng)。血紅素脂蛋白具有轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白活性,脂質(zhì)通過一些物質(zhì)如轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白或孔隙定向運(yùn)動(dòng)進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)[10-11]。Rab-GDP解離抑制劑作為囊泡運(yùn)輸重要參與者,特異性促進(jìn)囊泡與靶膜上的對(duì)接,進(jìn)而參與細(xì)胞內(nèi)物質(zhì)運(yùn)輸途徑[12]。以上三類蛋白在蜱吸血d8糞便中的排出量明顯上升,可能為蜱卵細(xì)胞的形成提供物質(zhì)基礎(chǔ)。
飽血雌蜱比吸血雌蜱大幾十倍甚至上百倍,蜱進(jìn)入快速飽血期開始快速大量吸取宿主血液,并暫時(shí)存儲(chǔ)于蜱中腸組織。蜱作為一種寄生性節(jié)肢動(dòng)物,宿主血液以胞吞的方式進(jìn)入到蜱消化細(xì)胞進(jìn)行消化分解[13],在蜱糞便中檢測(cè)到的蛋白是未消化的成分,所以,糞便中某種蛋白含量的上調(diào)從某種程度上意味著蜱對(duì)該蛋白的消化吸收減少。由于蜱吸血d8中腸內(nèi)血液含量遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于d8,因此一些蛋白消化不完全隨糞便排出。對(duì)下調(diào)蛋白分析可以發(fā)現(xiàn),兔脂多糖結(jié)合蛋白、兔皮質(zhì)類固醇結(jié)合球蛋白、S-(羥甲基)谷胱甘肽脫氫酶、膠原蛋白α-2(I)鏈、兔磷酸甘油酸變位酶有明顯下調(diào),表明蜱在該階段對(duì)其吸收率增高??紤]到是因?yàn)榇乞缥笃诖罅柯训纳?,這些蛋白在進(jìn)入蜱體內(nèi)可能一部分被消化吸收重新合成為自身營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)供機(jī)體利用(如兔脂多糖結(jié)合蛋白),另一部分直接轉(zhuǎn)化為自身成分發(fā)揮其功能。具體機(jī)制仍待進(jìn)一步探究。
本研究提取蜱不同吸血時(shí)段糞便中存在的蛋白,并對(duì)差異蛋白進(jìn)行了生物學(xué)分析。盡管獲取的數(shù)據(jù)還遠(yuǎn)遠(yuǎn)不足,但是這些蛋白的探究無疑為蜱消化方面的研究豐富了數(shù)據(jù),同時(shí)對(duì)雌蜱而言,消化的最重要意義在于繁殖產(chǎn)卵,差異蛋白的功能,為抗蜱研究提供了一個(gè)思路。