2016-2017年,抗原性差異或高致病性甲型流感(H7N9)病毒的出現(xiàn)和流行的大幅上升,引起了人們對這些病毒可能引起人獸共患病的關(guān)注。通過分析現(xiàn)有資料和廣東省2015-2017年分離到的新發(fā)H7N9病毒序列,我們研究了H7N9病毒的進(jìn)化和適應(yīng)性。系統(tǒng)發(fā)育分析表明,流行的H7N9病毒隸屬空間分布不同的多個(gè)譜系。通過血凝抑制試驗(yàn)從感染這些病毒的患者血清標(biāo)本中檢測出3類16種病毒株。采用遺傳序列重建來識別多個(gè)不同譜系的平行氨基酸變化。推測血凝素的突變主要發(fā)生在與受體識別或抗原性有關(guān)的部位。研究結(jié)果表明,高致病性病毒株可能源自2016年3月間廣東省東部流行病毒株,并且與高適應(yīng)分子進(jìn)化率有關(guān)。
通過對美國加利福尼亞州5個(gè)醫(yī)療區(qū)的視頻直接觀察治療(VDOT)監(jiān)測結(jié)核病治療效果進(jìn)行評價(jià),我們比較了174例視頻直接觀察治療患者與159例直接觀察治療(DOT)患者的依從性。多變量線性回歸分析發(fā)現(xiàn)了參與者的依從性與其社會(huì)人口統(tǒng)計(jì)記錄、危險(xiǎn)行為及治療經(jīng)驗(yàn)相關(guān)。參與者的中位年齡為44歲(范圍18-87歲),其中61%為男性。觀察到的視頻直接觀察治療患者預(yù)期中位劑量(FEDO)[93.0%(四分間距IQR)83.4%~97.1%]高于直接觀察治療患者[66.4%(IQR 55.1%~89.3%)]。大多數(shù)參與者(96%)會(huì)向其他人推薦視頻直接觀察治療;90%的人更喜歡視頻直接觀察治療而不是直接觀察治療。低預(yù)期中位劑量的獨(dú)立相關(guān)因素包括美國或墨西哥出生、視頻直接觀察治療持續(xù)時(shí)間較短、不會(huì)使用視頻直接觀察治療、經(jīng)常不在家服藥以及錄像故障有關(guān)(P<0.05)。視頻直接觀察治療的成本比直接觀察治療低32%(范圍6%~46%)。視頻直接觀察治療可行、可接受,依從性高,而且費(fèi)用低于直接觀察治療。
世界衛(wèi)生組織每半年調(diào)整一次流感疫苗組分來應(yīng)對溫帶地區(qū)的流感發(fā)病高峰。在熱帶和亞熱帶地區(qū),流感病毒呈季節(jié)性變化,流感流行全年均可發(fā)生,因此疫苗組分難以抉擇。17年的分子流行病學(xué)調(diào)查顯示,大多數(shù)甲型流感(H3N2)(9/11)和乙型(6/7)疫苗株被納入疫苗前已經(jīng)在東亞流行了一年多。在34個(gè)季節(jié)中,北半球疫苗株和東亞流行株有7個(gè)(20.6%) 甲型流感(H3N2)和5個(gè)(14.7%)乙型流感(B)匹配。南半球疫苗的匹配概率也很低(H3N2,14.7%;B,11.1%)。季節(jié)間病毒變異普遍(H3N2,41.2%;B,35.3%),半年接種策略(11月北半球疫苗,5月南半球疫苗)沒有改善匹配性。東亞對流感監(jiān)測貢獻(xiàn)很大,但同時(shí)期的流感疫苗和流行株經(jīng)常匹配性欠佳。
2014年底北美發(fā)現(xiàn)歐亞高致病性禽流感病毒(HPAIV)H5進(jìn)化枝 2.3.4.4,在美國的暴發(fā)流行直到2015年6月才結(jié)束,影響的家禽超過5 000萬只。我們通過對268個(gè)全基因組序列和疫情調(diào)查數(shù)據(jù)進(jìn)行基因組比對,研究了與該病毒傳播相關(guān)的潛在生態(tài)和流行病學(xué)過程。波及家禽養(yǎng)殖場的多起流感暴發(fā)之前,重組高致病性禽流感病毒H5N2已經(jīng)在太平洋遷徙路線的野生鳥類中傳播。分析表明,在2015年3月至6月期間,在中西部各州發(fā)生了超過3次的重組高致病性禽流感病毒H5N2輸入;太平洋野生鳥類向中西部家禽養(yǎng)殖場的傳播發(fā)生后1.7-2.4個(gè)月才檢出。該病毒一旦感染家禽,就會(huì)在鄰近州的火雞和肉雞養(yǎng)殖場之間迅速傳播。應(yīng)加強(qiáng)生物安保,以防止重組高致病性禽流感病毒在整個(gè)家禽行業(yè)的輸入和傳播。
先天性寨卡病毒綜合征包括嬰兒宮內(nèi)感染寨卡病毒后出現(xiàn)的一系列神經(jīng)異常。但有些兒童宮內(nèi)感染寨卡病毒后未出現(xiàn)出生缺陷,我們對他們神經(jīng)認(rèn)知發(fā)育所受影響知之甚少。我們對一系列先天性缺陷與寨卡病毒感染的時(shí)間關(guān)聯(lián)進(jìn)行了病例對照研究。原研究中對照組的兒童出生時(shí)未發(fā)現(xiàn)出生缺陷,我們在嵌套研究中對這些兒童的早期發(fā)育情況也進(jìn)行了評估。發(fā)現(xiàn)先天性缺陷與孕婦寨卡病毒血清陽性率(感染時(shí)間未知)和孕期癥狀性寨卡病毒感染有關(guān)。盡管兒童早期發(fā)育評估未發(fā)現(xiàn)因母親的寨卡病毒感染引起的發(fā)育延遲,但還需要進(jìn)行更多、更長期的研究。
我們評估了布基納法索首都瓦加杜古市基于社區(qū)的干預(yù)措施對登革熱病毒媒介的控制效果。我們隨機(jī)抽取了干預(yù)區(qū)287戶和對照區(qū)289戶家庭,收集了干預(yù)前(2015年10月)和干預(yù)后(2016年10月)的調(diào)查結(jié)果。干預(yù)措施減少了居民被登革熱病媒叮咬的幾率(媒介唾液中生物標(biāo)志物差異-0.08,[95%CI0.11-0.04])。干預(yù)區(qū)蛹指數(shù)(pupae index)從162.14下降到99.03,而對照區(qū)蛹指數(shù)Ouédraogo,從218.72上升到255.67。干預(yù)社區(qū)居民不太可能混淆登革熱與瘧疾(風(fēng)險(xiǎn)比0.70[95%CI0.58-0.84])(風(fēng)險(xiǎn)比0.70[95%CI0.58-0.84]),已經(jīng)提高了對登革熱癥狀的認(rèn)識(風(fēng)險(xiǎn)比1.44[95%CI1.22-1.69])。我們的研究表明,在資源有限的非洲城市,控制登革熱媒介暴露的有計(jì)劃、有證據(jù)的/基于社區(qū)的干預(yù)措施是可行和有效的。
在日本,肺炎支原體對大環(huán)內(nèi)酯的耐藥性很高。為了比較敏感和耐藥菌株的序列類型,我們對2002-2016年日本的417個(gè)分離株進(jìn)行了多位點(diǎn)序列分型(ST)。最普遍的序列類型是ST3,ST 19對大環(huán)內(nèi)酯耐藥,ST 14和ST7對大環(huán)內(nèi)酯敏感。
圖1 2002-2016年日本232個(gè)大環(huán)內(nèi)酯敏感株和185個(gè)大環(huán)內(nèi)酯耐藥肺炎支原體的多位點(diǎn)序列分型結(jié)果發(fā)現(xiàn):10種大環(huán)內(nèi)酯易感的序列類型和12種為大環(huán)內(nèi)酯耐藥肺炎分枝桿菌序列類型。
近期發(fā)現(xiàn)的高致病性甲型流感(H7N9)病毒變異給人類帶來了巨大的風(fēng)險(xiǎn)。我們發(fā)現(xiàn)接種了低致病性H7N9病毒疫苗的雪貂在感染抗原變異的高致病性H7N9病毒后未出現(xiàn)嚴(yán)重的癥狀。這些結(jié)果證明了H7N9疫苗的保護(hù)作用。
我們通過實(shí)時(shí)PCR檢測和測序,對美國家牛呼吸道疾病樣本中的丙型流感病毒(ICV)進(jìn)行了鑒定。牛丙型流感病毒分離株具有較高的核苷酸同源性(≈98%),與人丙型流感病毒株(≈95%)密切相關(guān)。需要進(jìn)一步的研究,以確定牛丙型流感病毒導(dǎo)致人獸共患病的可能性。
根據(jù)結(jié)核病基因分型的結(jié)果,我們評估了美國潛伏性結(jié)核病感染的流行情況。估計(jì)美國1 981個(gè)縣的患病率低于1%,785個(gè)縣的患病率為1%~3%,377個(gè)縣的患病率不低于3%。這種流行率的估計(jì)方法可適用于任何有結(jié)核病監(jiān)測系統(tǒng)的管轄區(qū)。