我國科學(xué)家揭示香蕉亞基因組進化和功能分歧

2019年7月15 號，中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院熱帶生物技術(shù)研究所金志強、胡偉研究團隊在《Nature Plants》上在線發(fā)表了題為“Musa balbisiana genome reveals subgenome evolution and functional divergence”的研究論文。該文報道了一種高質(zhì)量的M.balbisiana 基因組裝配，為了解水果生物學(xué)提供了更多的背景，并有助于開發(fā)育種最佳香蕉品種的工具。

香蕉（Musa ssp）是一種重要的食物資源，具有重要的社會經(jīng)濟和生態(tài)作用。A 基因組香蕉的基因組測序提供了對單子葉植物進化的見解。盡管A 基因組代表了香蕉遺傳改良中的關(guān)鍵步驟，但缺乏高質(zhì)量的B 基因組序列，極大地阻礙了種質(zhì)鑒定和香蕉的分子育種。先前已報道B 基因組，但是基于通過將讀數(shù)映射到A 基因組2 的組裝和注釋顯示出低質(zhì)量。

該研究提出了一種高質(zhì)量的M.balbisiana 基因組裝配，其中430 Mb（87%）組裝成11 條染色體。研究發(fā)現(xiàn)最近的M.acuminata（A 基因組）和M.balbisiana（B 基因組）的分歧發(fā)生在譜系特異性全基因組重復(fù)之后，并且與A 相比，B 基因組可能對分餾過程更敏感。在異源多倍體中，A-和B-亞基因組之間經(jīng)常發(fā)生同源交換。祖細胞內(nèi)的基因組變異導(dǎo)致亞基因組的功能分化。全同源異構(gòu)體表達優(yōu)勢發(fā)生在異源三倍體的亞基因組之間。

（消息來源：科技部）