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      溫度對我國近期H7N9型禽流感傳播影響的數(shù)學(xué)分析

      2018-12-11 03:31:58張琬婧湯琳瑜陶益婷林支桂
      關(guān)鍵詞:第一波原始數(shù)據(jù)環(huán)境溫度

      張琬婧, 湯琳瑜, 陶益婷, 林支桂

      (揚州大學(xué) 數(shù)學(xué)科學(xué)學(xué)院,江蘇 揚州 225002)

      2013年3月底開始,在上海和安徽兩地出現(xiàn)了禽流感疫情,引起疫情的H7N9型禽流感病毒是首次發(fā)現(xiàn)的新亞型流感病毒,當(dāng)時尚未納入我國法定傳染病監(jiān)測報告系統(tǒng),目前也無有效的疫苗進行及時防控。并且初期感染者均出現(xiàn)發(fā)熱、咳嗽、頭痛、肌肉酸痛和全身不適等特征,重癥感染者甚至導(dǎo)致死亡,且死亡率高達35%[1]。目前尚未證實此類病毒是否具有人傳染人的特性。

      由于氣候異常等多種因素的影響,全球禽流感疫情呈高發(fā)態(tài)勢,我國的H7N9型禽流感在2013年春季爆發(fā)過后,又出現(xiàn)幾波較為明顯的疫情,整體均呈現(xiàn)出分布廣、病例多、傳播快等特點,且主要在經(jīng)濟發(fā)達的南方地區(qū)爆發(fā)大規(guī)模疫情,進而對我國經(jīng)濟發(fā)展和人民生活造成了較大影響。

      本文以2013年至2015年爆發(fā)的三波禽流感疫情的病例數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),建立模型進行理論分析,利用軟件進行模擬,為未來禽流感疫情發(fā)展趨勢的預(yù)測和防控提供定量分析工具[2-6]。

      1 經(jīng)典的Logistic模型

      世界衛(wèi)生組織(WHO)發(fā)布了2013年3月27日至2015年3月28日期間中國(包括香港在內(nèi))累計確診H7N9型禽流感病例人數(shù)(見:http://www.who.int/mediacentre/factsheets/avian_influenza/zh/),下面給出三波病例發(fā)展趨勢圖。第一波:2013年3月31日至2013年5月10日(圖1按天統(tǒng)計);第二波:2013年12月19日至2014年3月19日(圖2按天統(tǒng)計);第三波:2014年12月14日至2015年3月28日(圖3按周統(tǒng)計)。

      圖1 第一波禽流感累計發(fā)病人數(shù)(按天)

      圖2 第二波禽流感累計發(fā)病人數(shù)(按天)

      圖3 第三波禽流感累計發(fā)病人數(shù)(按周)Fig.3 The cumulative number of total avian influenza infected cases in China(by week)

      首先考慮經(jīng)典的Logistic增長模型[7-9]

      (1)

      其中,r為禽流感發(fā)病率,k為預(yù)防效果指數(shù),N為累計發(fā)病人數(shù)。對(1)式求解得到

      (2)

      根據(jù)已知的2013年3月27日至2015年3月28日累計發(fā)病人數(shù),可以用Matlab軟件進行擬合,求出模型的系數(shù),得到擬合曲線,如圖4所示。

      第一波:k=0.001815,r=0.2336,N0=3,

      第二波:k=0.0007038,r=0.16,N0=1,如圖5所示。

      圖4 經(jīng)典的Logistic曲線;原始數(shù)據(jù)

      圖5 經(jīng)典的Logistic曲線;原始數(shù)據(jù)

      第三波:k=0.003121,r=0.6335,N0=1,如圖6所示。

      圖6 經(jīng)典的Logistic曲線;原始數(shù)據(jù)Fig.6 The classical Logistic curve;Raw data.

      顯然,經(jīng)典的Logistic模型與實際數(shù)據(jù)有較大的誤差,不能很好地擬合。

      2 具溫度的Logistic模型

      為達到更好的擬合效果,我們將經(jīng)典的Logistic模型進行改進。由于病毒活性受到溫度影響,而當(dāng)日禽流感發(fā)病率的變化與“前幾天溫度”有關(guān),上述的“前幾天”即為傳染病的潛伏期。根據(jù)世界衛(wèi)生組織(WHO)的資料,本文視禽流感的潛伏期為7天左右,并且取當(dāng)日前7天疫情主要地區(qū)的平均氣溫作為禽流感的潛伏期溫度。圖7,8和9表示了疫情當(dāng)日前7天的平均溫度變化情況(見天氣網(wǎng):http://lishi.tianqi.com/)。

      考察潛伏期溫度θ(t)對發(fā)病增長速率r的影響,改進后的Logistic模型為

      (3)

      其中,α,β為參數(shù),θ(t)為當(dāng)時前6,7,8天的平均溫度,即潛伏期溫度。(3)式化為

      N(t+1)-N(t)=(β-αθ(t))N(t)-kN2(t)。

      (4)

      (4)式為多元線性方程,通過數(shù)學(xué)軟件Matlab的擬合功能可以得出α,β,k的參數(shù)估計值,

      第一波:α=0.001957,β=0.2353,k=0.001541,如圖10所示。

      第二波:α=0.00047,β=0.11,k=0.0004,如圖11所示。

      第三波:α=0.01753,β=0.6521,k=0.002418,如圖12所示。

      而已了解到病毒會在一個特定的溫度下活性最強,該溫度我們稱之為最適環(huán)境溫度,最后考慮具最適溫度的Logistic模型:

      圖7

      圖8

      圖9 主要地區(qū)疫情爆發(fā)當(dāng)日前7天平均溫度變化圖(按周)

      圖10 第一波具潛伏期溫度的Logistic曲線;原始數(shù)據(jù);經(jīng)典的Logistic曲線

      圖11 第二波具潛伏期溫度的Logistic曲線;原始數(shù)據(jù);經(jīng)典的Logistic曲線

      (5)

      其中參數(shù)θ*為病毒活性最強時的最適環(huán)境溫度。將(5)式化為

      N(t+1)-N(t)=[β-α(θ(t)-θ*)2]N(t)-kN2(t),

      并運用數(shù)學(xué)軟件Matlab的擬合工具箱,得到參數(shù)估計值為

      第一波:α=0.0002127,β=0.2121,k=0.001604,θ*=15.0132,如圖13所示。

      第三波:α=0.002343,β=0.543,k=0.002581,θ*=6.624,如圖15所示。

      圖13是最適溫度為15.0132℃的第一波疫情的擬合曲線,圖14是最適溫度為8.517℃的第二波疫情的擬合曲線,圖15是最適溫度為6.624℃的第三波疫情擬合曲線,第一波及第二波擬合曲線與原始數(shù)據(jù)比較幾乎完全接近,而第三波具最適溫度的擬合曲線與原始數(shù)具有一定的偏差,誤差原因可能在于第三波疫情由于數(shù)據(jù)量較少,數(shù)據(jù)之間間隔較大,故擬合曲線難以完美吻合。

      但根據(jù)圖13和圖14可見,考慮了潛伏期溫度得到的擬合曲線模擬效果很好,這說明:溫度對H7N9型禽流感傳播影響較大,在研究禽流感疫情控制時,溫度是不可忽視的重要因素。

      圖12 第三波具潛伏期溫度的Logistic曲線;原始數(shù)據(jù);經(jīng)典的Logistic曲線

      圖13 最適環(huán)境溫度的Logistic曲線與原始數(shù)據(jù)的對比

      第二波:α=0.0000481,β=0.1012,k=0.0004199,θ*=8.517,如圖14所示。

      圖14 最適環(huán)境溫度的Logistic曲線與原始數(shù)據(jù)的對比

      圖15 最適環(huán)境溫度的Logistic曲線與原始數(shù)據(jù)的對比

      3 結(jié) 論

      從上述分析和模擬的結(jié)果得出,經(jīng)典Logistic模型具有一定的貼合性,但與實際病例有一定的偏差,改進后的溫度模型將潛伏期溫度和最適溫度納入考慮范圍,進而能夠較好地與實際數(shù)據(jù)相貼合,并且我們得到的三波疫情的最適溫度分別為15.0132℃[10]、8.517℃、6.624℃。

      從中我們可以發(fā)現(xiàn),H7N9型禽流感爆發(fā)高峰期主要為冬春兩季,集中在12月至次年5月期間。并且由結(jié)果表明春季禽流感的最適溫度為15℃左右[11],與實驗所得數(shù)據(jù)基本吻合,而冬季禽流感的最適溫度范圍在6-9℃之間。此結(jié)果有助于引導(dǎo)大眾在不同季節(jié)下做好防范措施,同時也盡量減少接觸活禽的幾率,避免交叉感染。另外,對于日后我國H7N9型禽流感的預(yù)防、控制工作提供了理論基礎(chǔ),更好地完善禽間病毒傳播防控的長效體系。

      此外,本文只著重考慮了溫度對疫情傳播的影響,未考慮政府干預(yù)[12]等其他影響因素。因此,在同時考慮這兩種因素下,政府應(yīng)在疫情高發(fā)季節(jié)結(jié)合所得到的最適溫度對活禽加大監(jiān)管力度,必要時關(guān)閉活禽市場,并且對人們進行大力宣傳,科普防范措施,從而控制疫情規(guī)模。

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