殷 俊 常 嘯 程 君 周仲松 蘇 菲 葉 英 李家斌
銅綠假單胞菌(P.Aeruginos,PA)是一類革蘭染色陰性的非發(fā)酵菌,在臨床分離的病原菌中較常見,并且有逐漸上升的趨勢。有報道[1]顯示,因PA感染所致的病死率高達51%。由于PA特殊的耐藥特點(細胞膜通透障礙),以及對替加環(huán)素先天耐藥的特征,臨床治療相對困難,耐藥菌株較多,故而對PA進行耐藥監(jiān)測,統(tǒng)計其流行病學特征及研究其地區(qū)耐藥基因的分布具有重要的意義。本研究收集安徽省某三甲醫(yī)院2015年8月至2017年9月臨床分離的PA野生株,進行了藥敏分析,并對其進行了一定的分子生物學實驗,以觀測PA的耐藥特點。
1.1 標本來源 收集安徽省某三甲醫(yī)院2015年8月至2017年9月臨床分離的1 857株P(guān)A野生株,均來源于臨床確診感染患者,并篩除重復菌株,鑒定按常規(guī)操作規(guī)程鑒定到位。
1.2 方法 采用自動化藥敏板進行藥物敏感實驗鑒定,獲得臨床分離株后,按照說明書要求調(diào)整菌懸液濃度,藥敏板在機外孵育,一次性上機讀取結(jié)果,由計算機進行分析處理,并報告藥敏結(jié)果。質(zhì)控菌株為AATCC27853。應(yīng)用自動化藥敏板對1 857株P(guān)A進行了藥敏檢驗,包括阿米卡星、環(huán)丙沙星、左氧氟沙星、哌拉西林他唑巴坦、頭孢他啶、頭孢吡肟、妥布霉素、慶大霉素及亞胺培南共9種抗菌藥物。藥敏實驗結(jié)果按CLSI 2016年標準進行判讀[2],分為敏感、中介、耐藥3種結(jié)果,并用WHONET 5.3軟件進行數(shù)據(jù)分析。PCR法對耐碳青霉烯類抗菌藥物菌株進行耐藥基因的擴增,包括blaTEM、blaPER、blaVEB、blaOXA、金屬酶基因VIM、IMP、SIM、GIM及外膜蛋白OprD2基因。測序結(jié)果在GenBank上進行比對。
1.3 觀察指標 將所有菌株編號后,判讀其對不同抗菌藥物的最低抑菌濃度值,根據(jù)CLSI 2016標準進行耐藥、中介和敏感3種不同耐藥程度的劃分。耐藥基因的擴增結(jié)果測序后與GenBank進行比對,相似性>95%判定為同一基因。
2.1 菌株的時間分布特點 1 857株P(guān)A株中,發(fā)現(xiàn)分離株最少的月份為2015年9月(43株)、2016年4月(43株)、2016年5月(42株),最多的月份為2017年8月(118株),2017年9月(113株),2017年6月(98株),多數(shù)月份分離菌株數(shù)在60~80株。見圖1。
圖1 2015年8月至2017年9月臨床分離PA時間分布
2.2 菌株的臨床科室分布特點 ICU和呼吸內(nèi)科為PA分離最多的科室,其中該醫(yī)院3個不同ICU共分離489株(26.33%),其中ICU 221株(11.90%),神經(jīng)內(nèi)科ICU 164株(8.83%),急診ICU 104株(5.60%),呼吸科252株(13.57%),其次為燒傷科127株(6.84%)。最后為神經(jīng)內(nèi)科116株(6.25%),神經(jīng)外科101株(5.44%),泌尿外科92株(4.95%),心外科67株(3.61%),血液內(nèi)科60株(3.23%),內(nèi)分泌科56株(3.02%),康復科54株(2.91%)。
2.3 菌株來源分布 所有分離的菌株中,來源于痰液1 261株(67.91%),尿液122株(6.57%),分泌物115株(6.19%),血液83株(4.47%),手術(shù)切口74株(3.98%),傷口分泌物54株(2.91%),引流液31株(1.67%),膽汁29株(1.6%),支氣管肺泡灌洗液18株(0.97%),胸腔積液11株(0.59%),膿液10株(0.54%),中心靜脈導管8株(0.43%),氣管分泌物7株(0.38%),腹水6株(0.3%),外周導管5株(0.27%),咽拭子5株(0.27%),結(jié)締組織4株(0.22%),胃液2株(0.11%),關(guān)節(jié)液2株(0.11%),上呼吸道2株(0.11%),子宮分泌物2株(0.11%),骨髓1株(0.05%),腦脊液1株(0.05%),透析液1株(0.05%),其他3株(0.16%)。
2.4 PA的耐藥結(jié)果 PA碳青霉烯類抗菌藥物亞胺培南的耐藥率達到32.69%,高于其他抗菌藥物耐藥率。對妥布霉素、慶大霉素及左氧氟沙星的耐藥率較低,均小于18%。對阿米卡星的敏感率最高,達到78.08%。見表1。
表1 1 857株P(guān)A對不同抗菌藥物的耐藥結(jié)果[株(%)]
2.5 對碳青霉素類抗菌藥物耐藥的607株細菌耐藥基因擴增結(jié)果 檢出攜帶blaTEM34株,blaPER41株、blaVEB7株、blaOXA63株。檢出攜帶VIM基因121株,IMP基因125株,SPM基因65株,SIM基因0株,GIM基因0株。其中有98株攜帶兩種耐藥基因,無攜帶3種及以上產(chǎn)酶耐藥基因的菌株。測出孔蛋白基因缺失417株,占總數(shù)的68.7%。見圖2。
圖2金屬酶及外膜蛋白電泳圖
注:M為Marker;1為外膜蛋白丟失;2為SPM陽性;3為VIM陽性;4為IMP陽性
PA是廣泛存在于社區(qū)及醫(yī)院的一類致病菌,以院內(nèi)感染多見,且難以從醫(yī)院環(huán)境內(nèi)清除,對如腫瘤、血液、ICU等病房的免疫力低下患者帶來巨大潛在威脅。碳青霉烯類藥物曾為治療PA感染的重要藥物,但隨著臨床的廣泛應(yīng)用,PA對該類藥物的耐藥率也逐步上升,因此在臨床治療中存在極大的困難[3]。對院內(nèi)PA臨床分離株進行研究,總結(jié)其空間、時間、標本來源分布太特征,監(jiān)測其耐藥特點,并對耐藥機制進行分析,有助于對該院感染PA的患者及時采取相應(yīng)措施,從而在第一時間選擇有效藥物。
該醫(yī)院26個月共分離出無重復菌株的1 857株P(guān)A,且隨時間推移,在數(shù)量上有逐步上升趨勢,2017年8、9月臨床分離的菌株數(shù)高于其他月份,與國內(nèi)其他地區(qū)統(tǒng)計結(jié)論大致相仿[4]。提示今后PA可能會成為極常見的臨床分離株。PA作為條件致病菌,具有非常強的適應(yīng)能力,是醫(yī)院感染中醫(yī)院獲得性肺炎以及呼吸機相關(guān)肺炎的主要病原菌[5-6]。在本研究中,絕大部分菌株來自住院患者。來自呼吸科的PA占13.6%,而痰標本占比則達到67.91%,這可能與住院患者機體免疫力下降,呼吸道屏障相對脆弱,呼吸道分泌物增加等因素有關(guān)。且有研究[7]指出,老年P(guān)A感染患者中,肺部感染發(fā)生率最高,與本研究統(tǒng)計結(jié)果一致。除痰液之外,尿液、各處分泌物及血液也是多見的標本來源。本研究中,ICU為分離出PA最多的科室,考慮與收住患者一般狀態(tài)相關(guān),與其他研究結(jié)果大致相符[7-9]。
在本研究中,PA對于哌拉西林/他唑巴坦和亞胺培南的敏感率較低,都低于60%,故而在該醫(yī)院PA感染的治療中,不推薦以上2種抗菌藥物做為治療PA的首選藥物。阿米卡星對其敏感率較高,有78.08%的PA患者均對阿米卡星敏感,考慮到PA耐藥的復雜性,結(jié)合PA對于頭孢吡肟耐藥性較低(16.05%),可以考慮頭孢吡肟聯(lián)合阿米卡星做為該地區(qū)治療PA的首選治療。碳青霉烯類藥物為抗革蘭陰性菌感染的常用藥物,但本研究中提示,PA對亞胺培南的敏感性低于60%,耐藥率卻高達32.69%,值得進一步完善相關(guān)檢測,在本地區(qū)其他醫(yī)院相關(guān)研究中,數(shù)據(jù)與本研究類似[10]。故在此基礎(chǔ)上,甄選出全部607株對亞胺培南耐藥的PA,進行了耐藥基因及外膜蛋白OprD2基因的檢測。
本研究中共檢出攜帶VIM基因121株,IMP基因125株,此兩種檢出率最高,共占耐亞胺培南的PA中40.53%,SPM基因65株,占10.71%,SIM基因0株,GIM基因0株。blaTEM34株、blaPER41株、blaVEB7株、blaOXA63株。其中有98株攜帶2種耐藥基因,無攜帶3種及以上產(chǎn)酶耐藥基因的菌株。測出孔蛋白基因缺失417株,占總數(shù)的68.70%。此數(shù)據(jù)亦表明PA的耐藥機制多樣且復雜,而其對亞胺培南的耐藥機制更存在多種因素的參與,其中外膜蛋白OprD2缺失率接近70%,充分說明了外膜蛋白缺失為PA對亞胺培南耐藥的主要機制。但根據(jù)目前國內(nèi)其他地區(qū)報道[11],該數(shù)據(jù)存在地區(qū)及人群差異。
PA目前為醫(yī)院感染的重要致病菌,預(yù)計近期臨床PA感染會進一步增多。PA感染部位以呼吸道最為多見,泌尿系、傷口創(chuàng)面及血液或成為繼呼吸道后的重要感染部位,故推測在該醫(yī)院,泌尿系及血液的PA感染需加強警惕。外膜蛋白缺失目前仍為該醫(yī)院耐亞胺培南的PA的主要耐藥機制。根據(jù)藥敏結(jié)果,可考慮頭孢吡肟聯(lián)合阿米卡星做為一線治療方案。