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      基于改進(jìn)空間模糊聚類的DTI圖像分割算法

      2018-09-03 06:12:58劉絮雨張相芬李傳江楊燕勤
      關(guān)鍵詞:胼胝空間信息人腦

      劉絮雨 張相芬 馬 燕 李傳江 楊燕勤

      上海師范大學(xué)信息與機(jī)電工程學(xué)院,上海 200234)

      引言

      擴(kuò)散張量成像(diffusion tensor imaging,DTI)[1-2]借助提取磁共振成像(magnetic resonance imaging,MRI)圖像中體素彌散的各向異性特征,使圖像特征既包含方向信息又包含位置信息,是目前僅有的通過(guò)非入侵方式對(duì)腦白質(zhì)纖維束進(jìn)行三維追蹤的方法。胼胝體是重要的人腦白質(zhì)組織,也是人腦組織中最大的纖維束聯(lián)合體。普通MRI只能呈現(xiàn)胼胝體的大致外觀,而DTI可以通過(guò)生物組織中水分子擴(kuò)散的各向異性特征描述胼胝體連通的纖維結(jié)構(gòu)以及微小細(xì)節(jié)結(jié)構(gòu)的信息。在腦白質(zhì)組織相關(guān)疾病的研究中,將胼胝體從DTI圖像中分割出來(lái)具有決定性的作用。

      DTI圖像分割[3-6]的主流方式是將張量信息轉(zhuǎn)化為標(biāo)量信息,之后使用成熟的標(biāo)量圖形的分割算法對(duì)DTI圖像進(jìn)行分割。聚類是模式識(shí)別中最普遍使用的方法之一,當(dāng)下采用聚類方法對(duì)醫(yī)學(xué)圖像進(jìn)行分割已經(jīng)十分普遍[7-14]。Krinidis等[10]提出一種魯棒模糊局部信息C均值聚類圖像分割算法,在MRI圖像分割過(guò)程中具有良好的抗噪能力,因其將模糊G因子引入FCM目標(biāo)函數(shù),解決了圖像分割過(guò)程中的參數(shù)定義問(wèn)題;但當(dāng)聚類中心為噪聲點(diǎn)時(shí),該點(diǎn)雖歸于噪聲類,但為了使目標(biāo)函數(shù)最小化,鄰域像素會(huì)強(qiáng)制將其分為一類,使得圖像分割效果不理想。Ji等[11]提出了基于FCM加權(quán)圖像塊圖像分割算法分割人腦DTI圖像,該算法使用圖像塊代替像素點(diǎn),基于鄰域像素方差將權(quán)重分配給每個(gè)像素塊,并且使每個(gè)像素塊具有各向異性權(quán)重,可以有效地處理噪聲干擾,但由于對(duì)每個(gè)像素點(diǎn)要額外計(jì)算像素塊權(quán)重,導(dǎo)致計(jì)算量增大,時(shí)間消耗量大。Vamvakas等[12]使用曲率分析方法,鑒別人腦中多形性膠質(zhì)母細(xì)胞瘤和單轉(zhuǎn)發(fā)瘤,首先使用無(wú)監(jiān)督的k-medians算法對(duì)人腦DTI各向同性和各向異性的參數(shù)圖像進(jìn)行分類分割,與T1成像對(duì)比后確定腫瘤邊界,之后使用基于曲率分析的四階統(tǒng)計(jì)鑒別形態(tài)分化。k-medians算法含有非確定多項(xiàng)式,復(fù)雜度較高,容易產(chǎn)生NP難問(wèn)題;并且聚類初始點(diǎn)是隨機(jī)選取的,容易陷入局部極值,影響分割效果。Chuang等[13]提出,聯(lián)合空間信息的隸屬度函數(shù)的FCM均值算法對(duì)醫(yī)學(xué)圖像分割,在一定程度上減少了噪聲點(diǎn)的干擾,但受初始聚類中心的影響,分割算法對(duì)細(xì)節(jié)處理不夠,目標(biāo)區(qū)域分割不夠準(zhǔn)確。He等[14]在FCM目標(biāo)函數(shù)中引入空間約束項(xiàng),保證鄰域像素的連續(xù)性,設(shè)置懲罰因子配比空間信息權(quán)重,并在隸屬度函數(shù)中加權(quán)隸屬度函數(shù)鄰域均值濾波,可以有效地抑制噪聲干擾,同時(shí)結(jié)合DTI的多通道特征,對(duì)人腦DTI圖像進(jìn)行分割,可以更好地分割腦組織。但目標(biāo)函數(shù)中懲罰因子的設(shè)定基于經(jīng)驗(yàn)值,較難調(diào)控。

      在上述DTI圖像分割算法中,一般存在算法實(shí)現(xiàn)復(fù)雜、參數(shù)調(diào)整困難、分割對(duì)象形狀受限等缺點(diǎn)。FCM聚類方法是一種使用最為廣泛的聚類算法,但是傳統(tǒng)的FCM對(duì)初始值十分敏感,若初始值選取不當(dāng),迭代容易陷入局部極小點(diǎn),難以獲取全局最優(yōu)解;此外,對(duì)于迭加了噪聲的低信噪比人腦DTI圖像,使用FCM分割時(shí)容易造成偏差。針對(duì)上述問(wèn)題,本研究提出一種新的空間模糊聚類算法分割人腦DTI圖像。首先,考慮距離和密度兩個(gè)因素,選取合適的點(diǎn)作為初始聚類中心,可解決FCM聚類中存在的因聚類初始點(diǎn)隨機(jī)選定而導(dǎo)致的局部極值問(wèn)題,并且可以降低目標(biāo)函數(shù)的迭代次數(shù);其次,基于圖像正態(tài)分布提出一種新的空間信息函數(shù)與FCM結(jié)合,可有效地削弱噪聲等中間形態(tài)對(duì)聚類結(jié)果的影響。

      1 方法

      1.1 擴(kuò)散張量及其各向異性參數(shù)計(jì)算

      1.1.1擴(kuò)散張量

      在生物體組織完全均質(zhì)的溶質(zhì)中,分子各方向的運(yùn)動(dòng)是相同的,此種彌散方式為各向同性,其向量分布軌跡呈球形,而另一種彌散是在非均質(zhì)中,分子向各方向運(yùn)動(dòng)具有依靠性,分子向各方向彌散的距離不相等,稱為各向異性(anisotropic),其向量分布軌跡呈橢圓形。大腦白質(zhì)分子的彌散為各向異性,分子沿白質(zhì)纖維通道方向的彌散速度快于垂直方向的彌散速度。為了描述分子沿每個(gè)方向的運(yùn)動(dòng)和在這些方向間的相關(guān)性,在各向異性情況下,使用單一的標(biāo)量系數(shù)無(wú)法描述擴(kuò)散效應(yīng),則需要引入一個(gè)張量D,有

      (1)

      式中,對(duì)角元素Dxx、Dyy和Dzz分別表示沿x、y和z方向的擴(kuò)散系數(shù),非對(duì)角元素Dij=Dji(i,j=x,y,z為擴(kuò)散張量矩陣的元素)。

      擴(kuò)散張量的確定至少需獲取6個(gè)梯度方向的擴(kuò)散加權(quán)圖像。擴(kuò)散張量在三維立體布局中可以直觀化地表示為橢球體結(jié)構(gòu)[9]。λ1、λ2、λ3分別為擴(kuò)散張量的3個(gè)特征值,且v1、v2、v3為對(duì)應(yīng)的特征向量。

      1.1.2各向異性參數(shù)

      為了權(quán)衡擴(kuò)散各向異性的擴(kuò)散水平,生物體內(nèi)組織中水分子擴(kuò)散各向異性的特性可以使用標(biāo)量參數(shù)來(lái)分析,一般使用的參數(shù)有部分各向異性和相對(duì)各向異性[2]。

      部分各向異性(FA)表示擴(kuò)散張量的各向異性成分和整體組織中擴(kuò)散張量的比值,其包含了擴(kuò)散張量在三維空間中橢球體的形狀信息,有

      (2)

      (3)

      式中,最大特征值λ1表示與纖維束方向平行的擴(kuò)散系數(shù),λ2和λ3表示與纖維束方向垂直的擴(kuò)散系數(shù)。

      相對(duì)各向異性(RA)為

      (4)

      從式(2)~(4)可以看出,F(xiàn)A與RA通過(guò)擴(kuò)散系數(shù)的大小對(duì)組織的擴(kuò)散特性進(jìn)行衡量。白質(zhì)束的方向性結(jié)構(gòu)使得平行軸向的擴(kuò)散明顯比橫切軸向的擴(kuò)散要快,故FA圖像觀察大腦白質(zhì)纖維結(jié)構(gòu)最清楚,灰白質(zhì)分界好,因此FA在腫瘤診斷等方面廣泛應(yīng)用。

      1.2 模糊C均值聚類算法

      由于磁共振圖像成像技術(shù)分辨率的限制,處于邊界的組織像素可能含有多種組織成分,因此稱這種情況為醫(yī)學(xué)圖像的部分容積效應(yīng)。部分容積效應(yīng)決定了DTI圖像的模糊性,故建立在模糊理論基礎(chǔ)上的模糊C均值算法現(xiàn)已廣泛應(yīng)用在醫(yī)學(xué)圖像分割問(wèn)題上[15-18]。經(jīng)典的FCM圖像分割算法,是指在沒(méi)有訓(xùn)練樣本條件下,僅考慮當(dāng)前像素灰度值,將體素劃分為若干個(gè)類別。經(jīng)典FCM算法的思想是:將圖像數(shù)據(jù)集X={x1,x2,…,xM}通過(guò)目標(biāo)函數(shù)迭代,求得函數(shù)最小值,從而將數(shù)據(jù)集分為c個(gè)模糊類。其中,目標(biāo)函數(shù)定義為

      (5)

      式中:U={uij}為隸屬度矩陣,表示體素xj隸屬于第i類的程度;V={v1,v2,…,vc}表示第i類的聚類中心點(diǎn);l(l>1)為可調(diào)參數(shù),用來(lái)衡量分割結(jié)果的模糊度。

      對(duì)式(5)應(yīng)用拉格朗日乘數(shù)法,可求得隸屬度函數(shù)uij和聚類中心函數(shù)vi。隸屬度函數(shù)uij表示體素xj屬于vi類的程度,滿足如下條件:

      (6)

      FCM算法是通過(guò)反復(fù)迭代優(yōu)化目標(biāo)函數(shù)式(5)實(shí)現(xiàn)的,具體步驟如下:

      步驟1,隨機(jī)選取聚類中心V0={v1,v2,…,vc}和初始化隸屬度矩陣U0,設(shè)定c和l,設(shè)定迭代停止閾值ε>0,置迭代次數(shù)k=0。

      步驟2,將V(k)代入下式中計(jì)算隸屬度矩陣U(k),有

      (7)

      步驟3,根據(jù)下式利用U(k)更新聚類中心矩陣V(k),有

      (8)

      在FCM算法中,最關(guān)鍵的步驟是模糊隸屬度函數(shù)及聚類中心點(diǎn)的迭代過(guò)程,由算法步驟1可知,初始聚類中心點(diǎn)隨機(jī)選取,而隸屬度函數(shù)的迭代計(jì)算則是基于初始聚類中心。當(dāng)V0={v1,v2,…,vc}隨機(jī)選取時(shí),同類的多個(gè)數(shù)據(jù)可能被視為不同類別的聚類中心,這種情況下聚類將會(huì)陷入局部極值,影響分割結(jié)果。由式(7)可知,隸屬度函數(shù)的計(jì)算過(guò)程中僅考慮當(dāng)前像素點(diǎn)的隸屬度值,在DTI圖像分割過(guò)程中,相鄰的體素點(diǎn)較大概率地歸為一類,F(xiàn)CM算法未考慮到在圖像分割過(guò)程中鄰域信息相互影響的關(guān)系,在含有噪聲的圖像中突變點(diǎn)及異常點(diǎn)對(duì)圖像分割的結(jié)果也將造成一定的影響。針對(duì)FCM算法在DTI圖像分割過(guò)程中存在的問(wèn)題,本研究提出了一種新的空間模糊聚類算法分割DTI圖像。

      1.3 空間模糊聚類算法優(yōu)化

      本研究提出改進(jìn)空間模糊聚類算法,通過(guò)密度峰值選取聚類中心,并基于圖像的正態(tài)分布特性,定義一種新的空間信息函數(shù)與隸屬度函數(shù)結(jié)合對(duì)抗噪聲干擾。

      1.3.1基于CFSFDP算法的聚類中心選取

      聚類分析作為數(shù)據(jù)挖掘的一個(gè)重要方法,已廣泛應(yīng)用于圖像處理等多個(gè)領(lǐng)域[7-8,19]。為了提高聚類質(zhì)量和效率,Alex等提出一種基于密度峰值的聚類算法(clustering by fast search and find of density peaks, CFSFDP)[19],其核心在于基于密度峰值進(jìn)行初始聚類中心的選取,可以克服FCM算法初始值隨機(jī)選取的弊端。

      步驟1,計(jì)算像素點(diǎn)xi與其他像素點(diǎn)的歐式距離dij=dist(xi,xj),有

      (9)

      在灰度圖像聚類過(guò)程中,樣本點(diǎn)信息是一維的灰度值,此時(shí)歐氏距離的值即為圖像像素點(diǎn)灰度差值,在計(jì)算過(guò)程中會(huì)進(jìn)行求平方與開根號(hào)兩次無(wú)意義的操作。因此,為減少計(jì)算量,本研究引入曼哈頓距離代替歐式距離,將式(9)替換為

      dist(xi,xj)=|xi-xj| (j∈Is,j≠i)

      (10)

      步驟2,計(jì)算像素點(diǎn)xi的局部密度ρi,有

      (11)

      由式(11)可知,xi與其他像素點(diǎn)的曼哈頓距離dij=dist(xi,xj)與局部密度ρi成反比,即樣本點(diǎn)xi與其他數(shù)據(jù)點(diǎn)距離越小,越靠近數(shù)據(jù)集的中心。所以,通過(guò)局部密度函數(shù),可以有效地挑選密度大的樣本點(diǎn)。

      步驟3,定義中心距離函數(shù)δi,有

      (12)

      中心距離函數(shù)作為選取中心的另一個(gè)指標(biāo),其目的在于挑選出同類中的局部密度最大值。由式(12)可知,當(dāng)S數(shù)據(jù)集中的樣本點(diǎn)xi具有最大局部密度時(shí),δi表示S中最大數(shù)據(jù)點(diǎn)與xi之間的距離,此時(shí)δi的值很大,可以將最大局部密度樣本點(diǎn)突顯出來(lái),否則,δi表示所有局部密度大于xi的數(shù)據(jù)中與xi最近的那個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)與xi之間的距離,目的在于給同類中的密度次優(yōu)樣本xi點(diǎn)賦δi值很低,避免在同類中選取出多個(gè)類中心的問(wèn)題。

      步驟4,對(duì)數(shù)據(jù)集S中的每一個(gè)樣本點(diǎn)xi計(jì)算(ρi,δi),i∈Is。由步驟2、3可知,同時(shí)具有較大ρi和δi值的滿足初始聚類中心條件,定義變量γi為

      γi=ρiδi(i∈Is)

      (13)

      式中,局部密度ρi指標(biāo)在于選取密度較大值,距離函數(shù)δi給每類的密度最大值一個(gè)很大的權(quán)重,而給同類中密度次優(yōu)樣本點(diǎn)一個(gè)極小值;γi為ρi和δi相乘得到的結(jié)果,其值較大的樣本點(diǎn)xi滿足初始聚類中心的條件。

      正常人腦的FA參數(shù)圖像,白質(zhì)部分灰度值較大,據(jù)此可以判斷白質(zhì)的主要走向。圖像數(shù)據(jù)較為稀疏,一般的圖像分割算法僅通過(guò)距離來(lái)判斷聚類中心初始值,容易造成過(guò)分割的問(wèn)題?;贑FSFDP算法選取的聚類中心既包含了距離因素又考慮了類中心的密度因素,選取結(jié)果更準(zhǔn)確,在分割圖像時(shí)效果更精準(zhǔn),通過(guò)該方法選取精確的模糊聚類初始值,初始點(diǎn)更逼近正確的聚類中心,可使目標(biāo)函數(shù)快速收斂,減少迭代次數(shù),提升圖像分割效率。

      1.3.2結(jié)合空間信息的隸屬度函數(shù)

      在圖像分割過(guò)程中,空間信息與鄰域像素有很強(qiáng)的關(guān)聯(lián)性。經(jīng)典的FCM圖像分割算法沒(méi)有考慮空間信息,圖像噪聲和人為因素會(huì)影響模糊聚類算法的實(shí)驗(yàn)結(jié)果,因此將空間信息引入模糊聚類中顯得尤為重要。

      Chuang等提出S-FCM算法[13],定義空間信息函數(shù)hij為

      (14)

      式中,hij將xj鄰域像素隸屬度權(quán)重累加,表示xj鄰域像素隸屬于第i類的程度。

      由于圖像鄰域像素具有一定的相似性,若鄰域中絕大多數(shù)像素隸屬于同一類,則該像素隸屬于此類的概率較大,反之隸屬于該類的概率較小。其中,N(xj)表示以xj為中心r×r的矩陣區(qū)域像素,當(dāng)r=3時(shí),N(xj)的隸屬度矩陣如圖1所示。

      圖1 鄰域矩陣Fig.1 Neighborhood matrix

      由式(14)可知,S-FCM算法的空間信息函數(shù)認(rèn)為,xj的所有鄰域像素點(diǎn)與自身的關(guān)聯(lián)性都相同。但一般DTI圖像的像素分布服從正態(tài)分布,在圖形上是一種鐘形曲線,越接近中心取值越大,越遠(yuǎn)離中心取值越小。因此,在鄰域空間中,距離中心像素點(diǎn)xj越近的像素點(diǎn)與該像素關(guān)聯(lián)越大,隸屬于同一類的概率越高。

      在計(jì)算隸屬度值時(shí),將中心點(diǎn)xj作為原點(diǎn),其他鄰域像素點(diǎn)按照其在正態(tài)曲線上的位置來(lái)分配權(quán)重?;趫D像的正態(tài)分布特性,定義一種新的空間信息函數(shù)rij為

      (15)

      式中:x、y為以xj為原點(diǎn)時(shí)鄰域像素坐標(biāo);σ為標(biāo)準(zhǔn)差,決定分布幅度。

      由式(15)可知,在鄰域空間中,不同的像素點(diǎn)根據(jù)其與xj位置的不同,所分配的權(quán)重也不相同,距離中心點(diǎn)越近,權(quán)重越大。

      將空間信息函數(shù)融合到模糊C均值算法的隸屬度函數(shù)中,得到新的模糊隸屬度函數(shù),其表達(dá)式為

      (16)

      當(dāng)圖像灰度比較均勻時(shí),受空間鄰域信息影響較小,可以適當(dāng)降低q值;當(dāng)噪聲較大、圖像相對(duì)復(fù)雜時(shí),取相對(duì)較大的q值有利于圖像分割結(jié)果。

      1.3.3結(jié)合密度峰值的空間模糊聚類圖像分割算法

      模糊C均值初始聚類中心隨機(jī)選取,在圖像分割過(guò)程中忽略空間信息,造成分割準(zhǔn)確率、效率低和對(duì)噪聲敏感的問(wèn)題,為此本研究提出一種新的DTI圖像分割算法。該算法在對(duì)圖像降采樣后,首先使用曼哈頓聚類代替歐式距離,基于CFSFDP算法選取初始聚類中心;其次,基于DTI圖像的正態(tài)分布特性,定義一種新的空間信息函數(shù)與模糊C均值的隸屬度函數(shù)融合,對(duì)DTI圖像進(jìn)行分割。該算法既可以解決FCM算法隨機(jī)選取初始聚類中心導(dǎo)致的局部極值問(wèn)題,又可以削弱噪聲等中間形態(tài)對(duì)聚類結(jié)果的影響,減少聚類過(guò)程中的迭代次數(shù),提升分割效率。

      基于提出的新算法進(jìn)行DTI圖像分割,其具體步驟如下:

      步驟1,讀入未加權(quán)DTI圖像,以及6個(gè)梯度方向的擴(kuò)散加權(quán)圖像;

      步驟2,根據(jù)式(2)及擴(kuò)散加權(quán)圖像,計(jì)算DTI圖像的FA參數(shù)圖像X={x1,x2,...,xM};

      步驟3,對(duì)圖像數(shù)據(jù)集X降采樣,得到數(shù)據(jù)集S={s1,s2,…,sN};

      步驟4,計(jì)算數(shù)據(jù)集S中樣本點(diǎn)之間的曼哈頓距離dij,并令dij=dji(i

      步驟8,對(duì)數(shù)據(jù)集X初始化聚類中心V0={v1,v2,…,vc}和隸屬度矩陣U0,設(shè)定c和l,設(shè)定迭代停止閾值ε>0,置迭代次數(shù)k=0;

      步驟9,使用定義的新的空間信息函數(shù)(見式(15))更新隸屬度矩陣,得到式(16),將Vk代入式(7)和式(16)中,計(jì)算隸屬度矩陣Uk;

      步驟13,輸出分割結(jié)果。

      1.4 評(píng)價(jià)指標(biāo)

      為了定量地評(píng)價(jià)算法的聚類結(jié)果,本研究采用分割系數(shù)(vpc)和分割熵(vpe)給出兩個(gè)評(píng)價(jià)指標(biāo),即

      式中,N為樣本總量,c表示類別數(shù),uij為模糊聚類中的隸屬度函數(shù)。

      所有模糊類集合所對(duì)應(yīng)的數(shù)據(jù)集是緊密的,有唯一的分類,當(dāng)劃分系數(shù)達(dá)到最大值時(shí),聚類效果最好,該指標(biāo)的取值范圍是[1/c,1]。指標(biāo)值越接近1,聚類就越明確;指標(biāo)值越接近1/c,聚類就越模糊。vpe為分割熵,當(dāng)其達(dá)到最小值時(shí),聚類效果最佳。

      1.5 算法驗(yàn)證

      圖2 人腦DTI圖像分割結(jié)果(第1行,軸向26層;第2行,軸向29層;第3行,軸向33層)。(a) 人腦DTI圖像;(b) FCM分割胼胝體結(jié)果;(c) S-FCM分割胼胝體結(jié)果;(d) CS-FCM分割胼胝體結(jié)果Fig.2 Segmentation result of human brain DTI images (Row 1: Axial 26 layers; Row 2: Axial 29 layers; Row 3: Axial 33 layers). (a) Human brain DTI image; (b) FCM segmented corpus callosum results; (c) S-FCM segmented corpus callosum results;(d) CS-FCM segmented corpus callosum results

      實(shí)驗(yàn)采用美國(guó)明尼蘇達(dá)大學(xué)生物醫(yī)學(xué)功能成像與神經(jīng)工程實(shí)驗(yàn)室提供的58例DTI數(shù)據(jù),3例FA參數(shù)圖像、6例疊加了噪聲的人腦DTI圖像進(jìn)行分割。該DTI數(shù)據(jù)使用德國(guó)西門子的3Tesla Trio核磁共振儀作為采集設(shè)備,采集軸向?yàn)?8層的DTI數(shù)據(jù),體元大小為2 mm×2 mm×2 mm,該DTI數(shù)據(jù)集具有完備、清晰的人腦組織信息,是DTI研究常用的數(shù)據(jù)集[22-23]。

      本研究選取腦組織區(qū)域較為明顯的第26、30、33層人腦DTI數(shù)據(jù)計(jì)算FA參數(shù)圖像進(jìn)行分割實(shí)驗(yàn),并對(duì)此3層數(shù)據(jù)手動(dòng)疊加噪聲干擾驗(yàn)證算法的抗噪性。對(duì)FA參數(shù)圖像使用的擴(kuò)散張量的7個(gè)梯度方向的擴(kuò)散加權(quán)圖像,計(jì)算其梯度脈沖的方向分別為:(0 0 0)、(0.707 0 0.707)、(-0.707 0 0.707)、(0 0.707 0.707)、(0 0.707 -0.707)、(0.707 0.707 0)、(-0.707 0.707 0)。

      在實(shí)驗(yàn)中,對(duì)于同一圖像,不同算法設(shè)置的迭代停止條件相同,即相鄰兩次迭代得到的聚類中心的差值小于0.001或最大迭代次數(shù)超過(guò)100時(shí)分類結(jié)束。實(shí)驗(yàn)環(huán)境是基于Matlab R2012a編程環(huán)境,在配置為Windows10操作系統(tǒng)、2.60 GHz的CPU、8GB內(nèi)存的Intel(R) Core(TM)i7處理器的Lenovo PC上仿真實(shí)現(xiàn)。

      2 結(jié)果

      實(shí)驗(yàn)1是基于FCM算法、S-FCM算法與本研究提出CS-FCM算法對(duì)第26、30、33層人腦DTI原始圖像進(jìn)行的分割實(shí)驗(yàn),聚類數(shù)目c=4,l=2,空間函數(shù)中σ=1,p=1,q=1。實(shí)驗(yàn)結(jié)果如圖2所示,使用傳統(tǒng)的模糊C均值對(duì)其進(jìn)行分割,會(huì)出現(xiàn)胼胝體邊緣不準(zhǔn)確、圖像過(guò)分割等現(xiàn)象。加入空間信息的S-FCM算法考慮相鄰像素間的位置關(guān)系,可對(duì)具有復(fù)雜結(jié)構(gòu)的人腦分割出胼胝體大體的輪廓,但輪廓相對(duì)粗糙;使用本研究提出的CS-FCM算法選定合適的初始聚類中心,能夠得到更精確的分割效果;基于圖像的正態(tài)分布特性定義的一種新的空間信息函數(shù)可更合理地分配鄰域信息權(quán)重,分割結(jié)果圖像更加清晰,圖像具有更好的對(duì)比度。

      為定量評(píng)價(jià)上述3種圖像分割算法對(duì)人腦原始圖像的分割效果,計(jì)算了分割系數(shù)vpc和分割熵vpe,以及目標(biāo)函數(shù)的迭代次數(shù),其結(jié)果如表1所示,CS-FCM算法vpc比FCM平均提升0.092 2,vpe平均下降0.090 1,迭代次數(shù)平均降低22次;本算法比S-FCM算法vpc平均提升0.003 5,vpe平均下降0.002 4,迭代次數(shù)平均降低26次。在各個(gè)軸層,本算法得到的vpc最高,vpe最小,說(shuō)明其聚類效果最好。

      表1 人腦DTI圖像分割聚類劃分指標(biāo)Tab.1 Clustering index of human brain DTI image segmentation

      圖3 FA參數(shù)圖像分割結(jié)果(第1行,軸向26層;第2行,軸向29層;第3行,軸向33層)。(a) 人腦DTI圖像;(b) FCM分割胼胝體結(jié)果;(c) S-FCM分割胼胝體結(jié)果;(d) CS-FCM分割胼胝體結(jié)果Fig.3 Segmentation result of FA parameters image (Row 1: Axial 26 layers; Row 2: Axial 29 layers; Row 3: Axial 33 layers). (a) Human brain DTI image; (b) FCM segmented corpus callosum results; (c) S-FCM segmented corpus callosum results;(d) CS-FCM segmented corpus callosum results

      實(shí)驗(yàn)2是用來(lái)評(píng)估FCM算法、S-FCM算法與本研究提出CS-FCM算法對(duì)人腦FA參數(shù)圖像的分割結(jié)果,聚類數(shù)目c=4,l=2,空間函數(shù)中σ=1,p=1,q=2。實(shí)驗(yàn)結(jié)果如圖3所示,對(duì)原始大腦圖像計(jì)算部分各向異性參數(shù)圖像,可以提高胼胝體與白質(zhì)的對(duì)比度,但是由于FA參數(shù)依據(jù)水分子在不同組織中擴(kuò)散各向異性特性的不同進(jìn)行計(jì)算,故還存在邊緣區(qū)域不同組織間的干擾。使用傳統(tǒng)的FCM算法對(duì)FA圖像進(jìn)行聚類,分割結(jié)果比較粗糙,胼胝體內(nèi)邊緣輪廓分割出較多細(xì)小區(qū)域,無(wú)法準(zhǔn)確地劃分邊緣。S-FCM算法可以大致分離出胼胝體輪廓,但纖維束彎曲走向所引起的水分子擴(kuò)散系數(shù)變化較大,對(duì)于細(xì)節(jié)部位的分割不理想。本算法可以有效地將同類區(qū)域聚類,分離開不同的類別,結(jié)果顯示胼胝體輪廓清晰,目標(biāo)區(qū)域與背景組織分離并且細(xì)節(jié)明顯,可以較為理想地獲取胼胝體信息。

      由表2可見,在人腦FA參數(shù)圖像分割過(guò)程中,CS-FCM算法比FCM算法vpc平均提升0.094 0,vpe平均下降0.078 7,迭代次數(shù)平均降低24次;本算法比S-FCM算法vpc平均提升0.001 3,vpe平均下降0.001 0,迭代次數(shù)平均降低54次;雖然S-FCM在一定程度上可以達(dá)到較高的vpc,具有較好的聚類效果,但是迭代次數(shù)太高,運(yùn)行效率低,而本研究提出的CS-FCM算法在各個(gè)軸層均可得到最大的vpc和最小的vpe,且迭代次數(shù)很小,聚類效果最好,效率最高。

      實(shí)驗(yàn)3是用來(lái)評(píng)估FCM算法、S-FCM算法與本研究提出的CS-FCM算法對(duì)含有噪聲的人腦DTI圖像的分割結(jié)果,聚類數(shù)目c=4,l=2,空間函數(shù)中σ=1,p=1,q=5。實(shí)驗(yàn)結(jié)果如圖4所示,在對(duì)含有噪聲干擾的圖像中,傳統(tǒng)FCM算法對(duì)噪聲十分敏感,分割結(jié)果受噪聲干擾較大,無(wú)法消除突變點(diǎn)的干擾。S-FCM算法在一定程度上減輕了噪聲干擾,但依然會(huì)受到噪聲的影響。本研究提出的CS-FCM算法可以很好地去除噪聲干擾,并且保留圖像細(xì)節(jié)。

      表2 人腦FA參數(shù)圖像分割聚類劃分指標(biāo)Tab.2 Clustering index of FA parameters image segmentation

      圖4 含有噪聲的人腦DTI圖像分割結(jié)果(第1行,軸向26層;第2行,軸向29層;第3行,軸向33層)。(a) 人腦DTI圖像;(b) FCM分割胼胝體結(jié)果;(c) S-FCM分割胼胝體結(jié)果;(d) CS-FCM分割胼胝體結(jié)果Fig.4 Segmentation result of human brain DTI image with noise (Row 1: Axial 26 layers; Row 2: Axial 29 layers; Row 3: Axial 33 layers). (a) Human brain DTI image; (b) FCM segmented corpus callosum results; (c) S-FCM segmented corpus callosum results;(d) CS-FCM segmented corpus callosum results

      由表3可以看出,在含有噪聲圖像的分割過(guò)程中,CS-FCM算法比FCM算法vpc平均提升0.156 9,vpe平均下降0.136 7,迭代次數(shù)平均降低25次;本算法比S-FCM算法vpe平均提升0.004 4,vpe平均下降0.003 4,迭代次數(shù)平均降低34次;本研究提出的CS-FCM算法在定量指標(biāo)vpc和vpe上依舊表現(xiàn)最優(yōu),具有較好的聚類分割效果,且迭代次數(shù)最小。

      表3 含有噪聲的人腦DTI圖像聚類分割指標(biāo)Tab.3 Clustering index of human brain DTI image with noise segmentation

      本研究對(duì)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)中的全58層人腦DTI原圖像數(shù)據(jù)進(jìn)行分割,得到的聚類驗(yàn)證指標(biāo)如圖5所示,橫坐標(biāo)表示軸向?qū)訑?shù),(a)~(c)縱坐標(biāo)分別為vpe、vpc和迭代次數(shù)的值。其中,圓點(diǎn)折線表示FCM算法分割結(jié)果,方塊折線表示S-FCM算法分割結(jié)果,三角折線表示CS-FCM算法分割結(jié)果。由實(shí)驗(yàn)結(jié)果可知,在該數(shù)據(jù)集中,CS-FCM算法在vpe、vpc和迭代次數(shù)上較S-FCM、FCM算法均表現(xiàn)最優(yōu),故本算法更適用于人腦DTI分割。

      圖5 DTI數(shù)據(jù)集分割指標(biāo)。 (a)分割熵;(b)分割系數(shù);(c)迭代次數(shù)Fig.5 Segmentation index of DTI data. (a) Segmentation entropy; (b) Segmentation coefficients; (c) Iteration times

      3 討論

      在人腦組織的研究過(guò)程中,DTI分割是后續(xù)纖維追蹤以及三維重建的前提,準(zhǔn)確地將目標(biāo)區(qū)域分割出來(lái)對(duì)后續(xù)研究至關(guān)重要。針對(duì)醫(yī)學(xué)圖像的部分容積性,F(xiàn)CM算法適合此類圖像分割。但FCM算法同時(shí)存在一些缺點(diǎn),如抗噪性較差、隨機(jī)選取初始值造成迭代次數(shù)較多、容易陷入局部最小值等,因此本研究對(duì)其進(jìn)行了改進(jìn)。針對(duì)初始點(diǎn)的選取,傳統(tǒng)的算法選取類中心點(diǎn)大多單考慮距離或密度因素[24-25],本研究改進(jìn)空間模糊聚類算法,首先對(duì)圖像降采樣處理,再選取聚類中心,選點(diǎn)時(shí)充分考慮圖像數(shù)據(jù)點(diǎn)的密度以及距離因素,更加滿足聚類中心點(diǎn)所需的密度大、中心點(diǎn)之間距離遠(yuǎn)的特點(diǎn);分割過(guò)程中不僅有效地避免了局部極值的出現(xiàn),也加速了目標(biāo)函數(shù)的收斂,提升了算法效率。其次,針對(duì)噪聲干擾,現(xiàn)有的FCM改進(jìn)算法大多通過(guò)在目標(biāo)函數(shù)中引入鄰域約束項(xiàng)來(lái)進(jìn)行去除[26],如何選取合適的鄰域信息并將其與算法結(jié)合起來(lái)是本研究的重要內(nèi)容。針對(duì)DTI圖像正態(tài)分布的特點(diǎn),本研究提出更為合理的正態(tài)分布鄰域信息與隸屬度函數(shù)結(jié)合,對(duì)鄰域像素點(diǎn)進(jìn)行加權(quán)處理,更符合圖像分布特征,充分反映了鄰域灰度信息和鄰域空間信息的共同作用,減輕了噪聲等突變點(diǎn)對(duì)分類準(zhǔn)確性的影響,提高了對(duì)組織邊緣像素的歸類能力。

      本研究提出的CS-FCM算法分割DTI圖像有較高的精準(zhǔn)度,雖然比其他分割算法效率有所提升,但由于添加了空間鄰域信息,會(huì)增加計(jì)算量和算法運(yùn)行時(shí)間,還不太能夠滿足臨床應(yīng)用中的實(shí)時(shí)處理。后續(xù)研究可以從提升算法效率著手,在盡量保持精準(zhǔn)度的同時(shí)提升算法效率,提升算法的魯棒性。該問(wèn)題也是實(shí)際應(yīng)用中不可忽視的重要因素。同時(shí),DTI數(shù)據(jù)包含了三維信息的立體結(jié)構(gòu),對(duì)標(biāo)量圖像的分割研究只是后續(xù)研究的基礎(chǔ),如何基于標(biāo)量圖的分割進(jìn)行三維重建以及纖維追蹤,也是后續(xù)需要著手研究的重要內(nèi)容。

      4 結(jié)論

      針對(duì)DTI人腦圖像分割問(wèn)題,本研究提出一種基于空間模糊聚類的DTI圖像分割算法。首先,基于CFSFDP算法,在對(duì)圖像降采樣后,使用曼哈頓聚類代替歐式距離選取密度峰值點(diǎn),作為初始聚類中心;其次,定義一種新的空間信息函數(shù)與模糊C均值的隸屬度函數(shù)融合,對(duì)DTI圖像進(jìn)行分割,有效地對(duì)抗噪聲干擾,處理組織邊緣像素歸類問(wèn)題。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,該算法分割系數(shù)最高可達(dá)到0.984 1;在同一圖像中,本算法在劃分系數(shù)上比FCM最高提升了20.2%,并且在劃分熵上比SFCM最高下降19.8%;該算法目標(biāo)函數(shù)平均迭代次數(shù)為32,較FCM的52次與空間FCM的76次有明顯降低。因此,在人腦DTI數(shù)據(jù)集中,本算法在分割精度、分割效率上均表現(xiàn)良好,且對(duì)噪聲不敏感。因此,本算法是一種較為良好的DTI圖像分割算法,可以應(yīng)用在實(shí)際的人腦DTI圖像分割。

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