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      擬南芥CAX 1基因克隆及表達載體的構建

      2018-08-14 13:04:02,,,,
      種子 2018年7期
      關鍵詞:電泳擬南芥菌落

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      (1.四川理工學院生物工程學院, 四川 自貢 643000; 2.貴州省農(nóng)業(yè)科學院油菜研究所, 貴陽 550008)

      作為第二信使的Ca2+,其濃度在植物細胞內受到嚴格的控制。正常處于靜息態(tài)的細胞內鈣離子濃度處于極低的水平,受到逆境脅迫如鹽脅迫、干旱脅迫和病菌感染時鈣離子濃度開始上升,之后又恢復至低水平。鈣離子通道存在于細胞的不同部位,包括細胞膜、線粒體膜、高爾基體、液泡膜、葉綠體膜和細胞核上[1]。鈣離子通道很多,可能參與不止一條植物的生理途徑,即使是參與同一個途徑,作用與調控機制也可能不相同。研究表明,鈣離子通道參與高鹽、防御干旱等逆境脅迫和抗細菌感染,但對于單個鈣離子的運輸通道研究并不全面[2]。研究單個鈣離子通道與植物抗逆的關系對了解Ca2+在不同時空上的特異性調控是非常有意義的,比如擾亂擬南芥液泡Ca2+的ATP酶誘導了SA介導的細胞程序性死亡[3]。而CAXs家族與ACAs(Ca2+-ATPase)同樣能將胞質內Ca2+轉運至細胞器內或細胞外,從而降低胞質內Ca2+的濃度,與ACAs家族成員相比,CAX 1對Ca2+的轉運能力強但是親和力弱[4]。轉運蛋白 (Ca2+/H+Cation Exchanger 1,CAX 1),定位于液泡膜,利用H+濃度梯度產(chǎn)生ATP把Ca2+泵入液泡膜內,H+泵入細胞質,從而去除細胞質中多余的Ca2+[5]。根據(jù)研究表明,CAX 1對維持細胞內Ca2+濃度平衡,控制植物正常的生長發(fā)育[6],以及調節(jié)植物對逆境脅迫的抗逆如鹽脅迫和低溫脅迫至關重要[7-8]。CAX 1能調節(jié)擬南芥葉片氣孔的大小而影響氣體交換,改變不同離子組分的平衡[9],通過改變原質體pH變化調節(jié)生長素的吸收。該基因包含1 428個堿基和475個氨基酸。該課題通過利用 PCR技術從擬南芥植物中的cDNA擴增出基因CAX1與pMD 18-T載體連接得到重組質粒,再連接在一種常用的植物遺傳轉化雙元質粒pBI 121質粒的 CaMV 35 S啟動子和 NOS終止子之間[10],并進行菌落PCR驗證和酶切鑒定,以期為研究轉運蛋白CAX 1構建過量表達株系是否影響植物抗病提供參考。

      1 材料與方法

      1.1 實驗材料

      1.1.1 植物材料

      擬南芥哥倫比亞野生型Col-0幼嫩葉片。

      1.1.2 菌種和質粒

      受體菌大腸桿菌DH 5 α,pBI 121質粒和pMD 18-T載體由四川理工學院實驗室提供。

      1.1.3 實驗試劑和試劑盒

      PCR相關試劑,限制性內切酶,DNA分子量標準(DL 2000)和cDNA第一鏈合成試劑盒購于大連寶生物Takara公司;快速質粒小提取試劑盒和RNA提取試劑Trizon購于康為世紀生物技術有限公司;低熔點瓊脂糖和抗生素卡那購自sigma公司;其他常規(guī)試劑均為國產(chǎn)分析純。

      1.2 實驗方法

      1.2.1 擬南芥RNA提取和cDNA的合成

      于液氮中收取4周左右的擬南芥嫩葉50 mg,并在液氮中迅速充分研磨成粉末,加入1 mL Trizon提取液,反復吹打混勻;室溫放置5 min,加入0.2 mL氯仿,劇烈震蕩后放置3 min,低溫離心15 min,將上清取至一新的RNase-Free EP管中,加入等體積異丙醇,混勻,放置10 min,離心棄上清,再用1 mL 75%乙醇洗滌沉淀,離心去上清,室溫晾干,加入40μL無RNase的水溶解RNA。并且電泳檢測RNA質量。然后取1μg RNA按照Takara公司試劑盒說明書以Oligo(dT)為引物,反轉錄成cDNA第一條鏈。

      反轉錄反應體系(20 μL):

      混合體系的成分反應體積5×RT-Buffer4μLdNTP Mixture(每10mM)2μLSuper-RI0.5μLRT-Enhancer0.5μLOligo (dT) primer(0.5μg/μL)1μLReverstranscriptase1μLRNA2μLRNase Free dH2O9μL

      反轉錄反應程序: 42 ℃,40 min,99 ℃,5 min,保存在4 ℃。

      1.2.2 引物和擴增CAX 1基因

      CAX1基因序列號為AT 2 G 38170,開放閱讀框序列在TAIR(http://www.arabidopsis.org/)上查得CDS序列,并根據(jù)其序列設計引物:F 1:5’ATGGCGGGAATCGTGACA 3’;R 1:5’ACCCGTTTTAACTTTATTTGATG 3’;以合成的第一鏈cDNA為模板,配制20μL PCR擴增體系后進行電泳檢測。再參照T載體的酶切位點,設計出在基因兩端增添酶切位點的長引物:TM:59.8,F(xiàn) 2:5’TGCT↓CTAGAATGGCGGGAATCGTGACA 3’含XbaI酶切位點;R 2:5’CG↓AGCTCTTAAGCGTAATCTGGAACATCGTATGGGTAACCCGTTTTAACTTTATTTGATG 3’含SacI酶切位點,PCR擴增體系電泳檢測后得到正確片段后進行膠回收。

      反應體系(20 μL):

      反應體系反應體積模版cDNA2μLR21μLF21μLddH2O12.3μL10×buffer(Mg2+)2μLdNTP1.5μLTaq酶0.2μL

      PCR程序:

      95 ℃ 3 min

      72 ℃ 10 min

      8 ℃ 1 h

      (起始密碼子和終止密碼子用黑體表示,1 428個堿基)圖3 CAX 1基因的核苷酸序列

      1.2.3 CAX 1的克隆和基因測序

      配制連接體系(10μL):經(jīng)過PCR擴增后并回收的CAX1片段1.5μL,pMD 18-T載體1μL,ddH2O 2.5μL,連接buffer 5μL;置于16 ℃恒溫水浴鍋中連接反應2 h,并立即轉化DH 5 α,并將重組質粒送到華大基因測序中心檢測驗證序列是否正確。

      1.2.4 表達載體的構建策略

      按照康為質粒小抽質粒提取試劑盒說明書,從大腸桿菌DH 5 α中提得PBI 121質粒,電泳檢測。在pBI 121的多克隆位點中,本試驗選擇使用XbaⅠ和SacⅠ雙酶切消化pBI 121并且膠回收大片段,并且消化CAX1連接在pMD 18-T載體上并測序正確的序列,用粘性末端連接策略,將CAX1連接在pBI 121的CaMV 35 S啟動子和NOS終止子之間[11],從而構建CAX1的植物pBI 121表達載體,并轉化受體菌大腸桿菌DH 5 α。

      1.2.5 單菌落PCR檢測轉化結果

      將轉化后的大腸桿菌接種在含有卡那抗生素的LB固體培養(yǎng)基,于37 ℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24 h,挑取單菌落于10μL無菌水中,取混勻后的菌懸液1μL作為模版,配制20μL的PCR體系,PCR擴增后進行電泳檢測結果[12]。

      2 結果與分析

      2.1 CAX 1開放閱讀框的克隆及測序

      以擬南芥cDNA為模板擴增,按照實

      驗方法1.2.1和1.2.2進行PCR反應擴增出的基因CAX1開放閱讀框,PCR反應程序結束后用10μL PCR產(chǎn)物進行電泳檢測,獲得了一條亮較濃的1 400 bp左右的DNA片段,如圖1所示,與查得的CAX1基因片段大小一致。

      將此片段按照實驗方法1.2.2和1.2.3繼續(xù)進行PCR擴增,并且酶切進行回收,連接在pMD 18-T載體上,轉化入感受態(tài)大腸桿菌,用引物F 1和R 1挑取單克隆做菌落PCR擴增后,用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測結果(圖2)。圖2中從左至右分別是單菌落1-3、空白、DL 2000 marker、單菌落4-6、DL 2000 marker;樣5和樣6兩條帶明顯,說明質粒已經(jīng)成功轉化。菌落PCR得出正確條帶的菌落繼續(xù)擴大培養(yǎng),提取質粒送出做測序,所得cDNA序列和預期序列一致(圖3)。

      圖1 cDNA PCR擴增后CAX 1基因電泳檢測結果

      圖2 菌落PCR驗證CAX 1片段

      2.2 CAX 1在表達載體上pBI 121的構建

      用限制性內切酶XbaⅠ和SacⅠ雙酶切消化測序正確的pMD 18-T載體,切下CAX1片段并且做PCR產(chǎn)物回收,按照實驗方法1.2.4構建pBI 121的CaMV 35 S啟動子和NOS終止子之間[13]。pBI 121是從結瘤農(nóng)桿菌雙元質粒帶有GUS基因,能同時轉化大腸桿菌和農(nóng)桿菌,并且能通過農(nóng)桿菌介導構建擬南芥穩(wěn)定轉化植株。本試驗用SacⅠ和XbaⅠ酶切消化pBI 121,切除GUS基因,保留了CaMV 35 S啟動子,然后連接CAX1 cDNA序列。

      2.3 重組質粒酶切驗證

      將連接了CAX1 cDNA序列的重組質粒pBI 121用限制性內切酶XbaⅠ和SacⅠ進行雙酶切驗證,電泳檢測結果。從左至右分別是marker、未酶切的重組質粒pBI 121和酶切的pBI 121(圖4),雙酶切獲得一大小在1 400 bp左右條帶,驗證了重組表達質粒pBI 121被成功構建。

      圖4 pBI 121載體重組質粒酶切后電泳檢測

      3 討 論

      研究表明,CAX 1對維持細胞內Ca2+濃度平衡,控制植物正常的生長發(fā)育,以及調節(jié)植物對逆境脅迫的抗逆如鹽脅迫和低溫脅迫至關重要[14]。因此,研究植物中CAX 1如何調控鈣離子運輸從而控制相關抗逆反應,影響植物乃至農(nóng)作物的產(chǎn)量有非常重大的意義。35 S啟動子是一種來自于煙草花葉病毒(TMV)強啟動子且表達非常穩(wěn)定,常用來驅動外源基因表達[15]。

      本實驗成功的構建了pBI 121以35 S啟動子驅動的CAX1基因的穩(wěn)定表達載體,接著將會導入到擬南芥cax1的突變體中構建互補系,與突變體cax1進行比較,是否影響植物抗病。

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