卜冬云 吳中飛 陸美萍 錢俊俊 程雷,2,3
變應(yīng)性鼻炎(allergic rhinitis,AR)是一種鼻黏膜慢性炎癥性疾病,不僅具有典型的鼻部癥狀,如鼻癢、鼻塞、噴嚏及清水樣涕,同時(shí)常伴隨諸多合并癥,如哮喘、濕疹、特應(yīng)性皮炎、變應(yīng)性結(jié)膜炎、睡眠呼吸障礙等[1-3],成為全球性健康問題,中國人群患病率亦呈明顯上升趨勢[4],不僅影響患者的生活和工作,也給家庭及社會帶來巨大的疾病負(fù)擔(dān)[5,6]。AR發(fā)病機(jī)制尚不十分清楚,目前認(rèn)為遺傳和環(huán)境因素在疾病發(fā)生發(fā)展中起共同調(diào)節(jié)作用[7-9]。其中,多基因遺傳因素占據(jù)著重要地位[10-14]。近來一項(xiàng)基于歐美哮喘兒童的全基因組研究和功能分析顯示,腺苷酸環(huán)化酶 2(adenylate cyclase 2,ADCY2)基因的單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)與空氣污染存在交互作用[15]。AR與哮喘被認(rèn)為“同一氣道,同一疾病”,二者具有相似的遺傳背景和免疫學(xué)機(jī)制,為此本研究旨在探討ADCY2基因多態(tài)性與中國漢族人群持續(xù)性變應(yīng)性鼻炎(persistent allergic rhinitis,PER)的遺傳關(guān)聯(lián)性。
本研究采用病例-對照的方法,病例組為2008年5月~2017年12月就診于南京醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院耳鼻咽喉科的蘇皖地區(qū)漢族人群,根據(jù)“變應(yīng)性鼻炎及其對哮喘的影響2008年更新版”(ARIA 2008 update)[16]診斷為屋塵螨和/或粉塵螨致敏的PER患者571例,其中男性353例,女性218例;年齡 3~69 歲,中位數(shù)及四分位數(shù)(M[P25,P75],以下同)為21[13,35]歲。對照組來自蘇皖地區(qū)的健康體檢人群,均為漢族,共677例,其中男性395例,女性282例;年齡2~64歲,中位數(shù)及四分位數(shù)為26[15,33]歲。健康對照人群的納入標(biāo)準(zhǔn)為:①排除AR、哮喘、濕疹及特應(yīng)性皮炎等變態(tài)反應(yīng)疾病,且無上述疾病既往史;②排除AR、哮喘、濕疹及特應(yīng)性皮炎等變態(tài)反應(yīng)疾病的家族史;③血清特異性IgE檢測陰性(Phadiatop<0.35 kUA/L)。本課題研究方案經(jīng)南京醫(yī)科大學(xué)倫理委員會審核通過,所有受試者均在??漆t(yī)師指導(dǎo)下填寫調(diào)查問卷表,并簽署知情同意書,受試者總體參與率≥95%。
2.1 樣本采集
每位受試者均抽取靜脈血2ml,室溫條件下離心,轉(zhuǎn)速3500rpm×10/min,分離出血清,采用Immuno CAP100過敏原檢測系統(tǒng)(Phadia,瑞典)進(jìn)行血清總IgE和特異性IgE測定。同時(shí)抽取5ml外周靜脈血于EDTA抗凝管,室溫下離心,轉(zhuǎn)速3500rpm×10/min,置于-70°C 冰箱,凍存,待提取 DNA。
2.2 基因組DNA提取
酚抽提法提取全血基因組DNA,母液濃度≥100ng/μL,純度為 1.8~2.0,并使用 1%瓊脂糖凝膠電泳質(zhì)檢。最終將DNA母液稀釋至10ng/μL,作為使用液,共100μL,制備工作液置96孔板。
2.3 SNP位點(diǎn)選擇
將ADCY2基因包含其上游2kb和下游1kb序列納入分析,利用基因變異服務(wù)器(Genome Variation Server, 簡 稱 GVS;http://gvs.gs.washington.edu/GVS147/)篩選出中國漢族人群(Han Chinese in Beijing,CHB)的少見等位基因頻率(minor allele frequency,MAF)≥5%的標(biāo)簽單核苷酸多態(tài)性(tagSNP)。運(yùn)用美國國立衛(wèi)生研究院網(wǎng)站(http://snpinfo.niehs.nih.gov/)和RegulomeDB對每個(gè)tagSNP代表的子集中所有SNPs進(jìn)行生物信息學(xué)功能預(yù)測分析,盡可能選擇預(yù)測有功能的位點(diǎn)如外顯子、啟動子起始位點(diǎn)及轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)(TF bindings sites)等,然后把預(yù)測有功能、較為重要的SNPs選入。采用SHEsis軟件(http://analysis.bio-x.cn/myAnalysis.php)對ADCY2基因位點(diǎn)連鎖不平衡強(qiáng)度進(jìn)行分析。最終選取ADCY2基因內(nèi)含子區(qū)5個(gè)SNPs位點(diǎn):rs1864071、rs1027579、rs2892609、rs1460970和rs326149,具體生物學(xué)信息見表1。
2.4 引物和探針設(shè)計(jì)
引物和探針由南京驥驁生物技術(shù)有限公司設(shè)計(jì)合成(表2),并以粉末狀包裝運(yùn)送,實(shí)驗(yàn)前將引物和探針離心后稀釋至使用濃度,冷凍避光保存,備用。
表1 ADCY2基因選擇的SNPs位點(diǎn)及生物信息學(xué)分析
a引物及探針堿基排列方向均按照5’至3’端
2.5 基因分型
配置PCR的反應(yīng)體系(5μL):1μL DNA模板,2.5μL TaqManRUniversal PCR Master Mix,上下游引物各0.25μL,探針1和探針2各0.125μL,去離子水1.25μL。體系置于 ABI7900(Applied Biosystems,美國)進(jìn)行熒光定量PCR。反應(yīng)條件:預(yù)反應(yīng)50℃(2min),95℃(10min);PCR 擴(kuò)增 95℃(15sec),60℃(1min),45個(gè)循環(huán)。ABI7900分析軟件SDS 2.4讀取結(jié)果,數(shù)據(jù)導(dǎo)出后進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。
人群流行病學(xué)資料采用EpiData 3.0軟件(EpiData Association,丹麥)進(jìn)行錄入和管理。各研究變量分布差異的比較采用獨(dú)立樣本Student’s-t檢驗(yàn)(用于連續(xù)性變量)或雙側(cè)χ2檢驗(yàn)(用于分類變量)。對照組中各SNPs位點(diǎn)的Hardy-Weinberg平衡(Hardy-Weinberg Equilibrium,HWE) 檢 驗(yàn) 采 用Pearson χ2擬合優(yōu)度檢驗(yàn)。采用二分類Logistic回歸得到的粗比值比(odds ratio,OR)、校正OR及95%可信區(qū)間(confidence interval,CI)用以評估ADCY2多態(tài)性與塵螨致敏PER的相關(guān)性。P<0.05為差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
各研究變量在病例組與對照組中的分布見表3,兩組的年齡、性別分布差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。全體研究對象的年齡中位數(shù)及四分位數(shù)為25[14,34]歲。病例組血清總 IgE(192[74.8,404]kUA/L)明顯高于對照組(31.3[13.94,61.69]kUA/L),差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.001);病例組屋塵螨和粉塵螨特異性 IgE 分別為(11.8[0.62,52.04])kUA/L和(8.07[0.61,37.95])kUA/L。在病例組中,118 例(20.7%)合并哮喘,163例(28.5%)合并特應(yīng)性皮炎。
ADCY2基因的5個(gè)SNPs均符合HWE(P>0.05)。關(guān)聯(lián)分析結(jié)果(表4)顯示:rs1864071基因型頻數(shù)在病例組和對照組中的差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,在相加模型中,該位點(diǎn)在病例組和對照組中CC基因攜帶者較TT基因攜帶者發(fā)生PER的風(fēng)險(xiǎn)明顯增加(校正 OR=1.226,95%CI=1.045-1.439;P=0.013);在顯性模型中,TC+CC基因攜帶者相比TT基因攜帶者發(fā)生PER的風(fēng)險(xiǎn)也明顯增加(校正OR=1.343,95%CI=1.039-1.736;P=0.024)。其余 SNPs位點(diǎn)在各組中基因型和等位基因型頻數(shù)分布的差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。
表3 研究對象的一般資料
表4 ADCY2基因多態(tài)性與塵螨致敏的持續(xù)性變應(yīng)性鼻炎的關(guān)聯(lián)分析
變態(tài)反應(yīng)疾病的發(fā)生受到遺傳-環(huán)境的共同影響,二者都發(fā)揮著重要作用。隨著流行病學(xué)研究的大量開展,多基因遺傳因素已不足以解釋其患病率的顯著增加,空氣污染所導(dǎo)致的表觀遺傳學(xué)變化在疾病發(fā)生發(fā)展中的作用越來越受到關(guān)注,且空氣污染與外周血細(xì)胞DNA甲基化相關(guān)已得到證實(shí)[17]。同時(shí)有研究表明,SNPs與DNA甲基化密切相關(guān)。一方面,人類基因組甲基化的CpG位點(diǎn)本身具有較高的突變頻率,且當(dāng)突變超越機(jī)體修復(fù)能力時(shí),便形成新的SNPs位點(diǎn)[18];另一方面,SNPs可影響啟動子活性,從而形成新的DNA甲基化位點(diǎn)[19]。
ADCY2為腺苷酸環(huán)化酶家族成員,是一種膜相關(guān)蛋白,主要分布在人體腦組織、骨骼肌、睪丸中,也分布在肝臟、腎臟及腸道中[20],能夠催化第二信使環(huán)磷酸腺苷(cyclic adenosine monophosphate,cAMP)的形成,并參與G蛋白偶聯(lián)受體(G protein-coupled receptor,GPR)信號通路[21]。已知 GPR154 基因多態(tài)性與哮喘、氣道高反應(yīng)性及血清總IgE有明顯關(guān)聯(lián)[22,23]。屋塵螨的主要變應(yīng)原Der p1可活化肥大細(xì)胞相關(guān)GPR,導(dǎo)致促炎細(xì)胞因子IL-6的釋放,這對于變應(yīng)性哮喘和AR通過神經(jīng)源性炎癥機(jī)制發(fā)病可能有臨床相關(guān)性[24]。近來有研究顯示,ADCY2基因的差異表達(dá)與空氣污染暴露水平有關(guān),且其甲基化水平降低與空氣污染短期暴露有關(guān),兒童哮喘的發(fā)病與空氣污染及ADCY2等基因存在交互作用[15]。全基因組關(guān)聯(lián)研究還表明,ADCY2基因SNPs與慢性阻塞性肺疾?。–OPD)及肺功能有關(guān)[25,26]。而COPD能夠增加AR等非感染性鼻炎的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn),提示上下氣道炎癥的相關(guān)性[27]。
大量流行病學(xué)[16,28]、病理生理學(xué)[29,30]及臨床證據(jù)[31,32]表明,AR 與哮喘是一種“整體氣道疾病”[3]。本次研究發(fā)現(xiàn),ADCY2基因內(nèi)含子區(qū)的rs1864071位點(diǎn)與蘇皖漢族人群中塵螨致敏的PER顯著相關(guān)。關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn),rs1864071位點(diǎn)在病例組和對照組中的相加模型(CC/TT)及顯性模型(TC+CC/TT)發(fā)生PER的風(fēng)險(xiǎn)明顯增高。而已有的報(bào)道表明,在所研究的歐美哮喘兒童中,ADCY基因3個(gè)SNPs與空氣污染存在交互作用,但本次研究未在我們的人群中進(jìn)行這些SNPs位點(diǎn)與PER的關(guān)聯(lián)分析,因此,ADCY2基因不同SNPs位點(diǎn)與不同人群中PER的相關(guān)性值得進(jìn)一步探討。
綜上所述,在蘇皖漢族人群中,ADCY2基因rs1864071位點(diǎn)與PER顯著關(guān)聯(lián),該基因可能影響塵螨致敏PER的遺傳易感性。當(dāng)然,本研究還存在某些不足,例如沒有探討基因與環(huán)境因素的交互作用,也未進(jìn)行基因功能分析。同時(shí)我們的研究人群包含兒童及成人(2~69歲),而文獻(xiàn)報(bào)道的研究人群為學(xué)齡兒童(7.4~11.3歲),故ADCY2基因多態(tài)性與變態(tài)反應(yīng)疾病發(fā)病年齡的相關(guān)性也有待進(jìn)一步驗(yàn)證。