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      CRISPR基因編輯技術的應用、爭議和未來

      2018-07-12 11:34:20
      科學中國人 2018年10期
      關鍵詞:細菌病毒基因

      想象一下未來,父母可以定制寶寶的樣子,選擇未出世孩子的身高和眼睛顏色。所有特質(zhì)都可以根據(jù)個人喜好定制:家養(yǎng)寵物的大小,植物的壽命等。這聽起來像是反烏托邦科幻小說,但其實這并不是遙不可及。

      2012年,科學家們首次發(fā)現(xiàn)CRISPR,并對CRISPR(也稱為Cas9或CRISPR-Cas9)的應用感到驚訝。CRISPR可能會徹底改變我們應對一些問題的方法,如癌癥,食物短缺和器官移植。在最近的報告中,CRISPR甚至可以被用作診斷疾病的工具。但是,與任何新技術一樣,它也可能會導致意想不到的問題。

      不斷變化的DNA將不可避免地導致一系列難以預想的后果。社會和各行業(yè)如果不了解CRISPR的基礎知識,就無法應用這項技術。接下來,讓我們從其定義,應用和局限性深入了解CRISPR。

      什么是CRISPR?

      CRISPR是細菌遺傳密碼及其免疫系統(tǒng)的一個定義性特征,是細菌用來保護自己免受病毒攻擊的防御系統(tǒng)。它也存在于古生物界(單細胞微生物)中的生物體中。首字母縮寫詞“CRISPR”——Clustered Regularly Interspaced Short Pal indromic Repeats。實質(zhì)上,它是一系列重復的DNA序列,并且這些DNA之間存在“spacers”。

      簡而言之,細菌利用這些基因序列來“記住”攻擊它們的每種病毒。

      CRISPR將會影響的行業(yè)包括醫(yī)藥、食品、農(nóng)業(yè)和工業(yè)生物技術。

      細菌會將病毒的DNA整合到自己的細菌基因組中。這種病毒DNA最終成為CRISPR序列中的“spacers”。這種防御系統(tǒng)可以在同種病毒再次發(fā)起攻擊時給予細菌保護或免疫力。

      總是位于CRISPR附近的基因,稱為Cas(CRISPR相關)基因。一旦激活,這些基因就會產(chǎn)生特殊的蛋白質(zhì),這些蛋白質(zhì)是與CRISPR共同進化的酶。這些Cas酶能夠充當切割DNA的“分子剪刀”。

      回顧一下,實際上,當病毒侵入細菌時,其獨特的DNA會被整合到細菌基因組中的CRISPR序列中。這意味著下一次病毒攻擊時,細菌會記住它并發(fā)送RNA和Cas來定位和破壞病毒。

      雖然細菌中還有其他Cas酶在病毒攻擊自己時會截斷病毒,但Cas9是動物體內(nèi)執(zhí)行這種任務的最佳酶。大眾所熟知的術語CRISPR-Cas9是指切割動物(和人類)DNA的Cas酶的種類。

      為了更好的應用這項技術,研究人員增加了一個新的步驟:在CRISPRCas9切割DNA后,攜帶“固定”基因的新DNA序列可以嵌入到新的間隔中?;蛘?,切割可以同時“敲除”不需要的基因,例如,導致疾病的基因。

      換個更加形象的說法,CRISPRCas9類似于Word中的“查找和替換”功能:CRISPR-Cas9想要查找并更正遺傳數(shù)據(jù)(或“單詞”),用新材料替換它?;蛘?,正如CRISPR的先驅(qū)Jennifer Doudna在其A Crack In Creation:Gene Editing and the Unthinkable Power to Control Evolution一書中所提到的那樣,CRISPR就像一把瑞士軍刀,我們的使用方式不同,它發(fā)揮的功能也不同。

      CRISPR研究的飛速發(fā)展,已經(jīng)超越了基礎DNA編輯。2017年12月,Salk研究所設計了CRISPR-Cas9系統(tǒng)的不成熟版本,能夠在沒有編輯基因組的情況下激活或關閉目標基因。展望未來,這種技術可以解決基因編輯永久性的問題。

      CRISPR的應用

      每個行業(yè)都可以利用CRISPR:它可以為人類疾病創(chuàng)造新的藥物,幫助農(nóng)民種植抗病作物,創(chuàng)造新的動植物物種,甚至讓滅絕的物種起死回生。

      CRISPR研究的飛速發(fā)展,已經(jīng)超越了基礎DNA編輯。

      動物研究

      自最初發(fā)現(xiàn)CRISPR以來,其應用的領域迅速擴大。雖然還處于早期階段,但“動物模型”(即實驗室動物)已經(jīng)向我們展示了如何操縱CRISPR技術。

      小鼠是研究CRISPR治療潛力的實驗對象。擁有超過人類90%的基因,小鼠是哺乳動物中理想的實驗對象。小鼠實驗表明,CRISPR可以消除與假肥大性肌營養(yǎng)不良(DMD)相關的缺陷基因,抑制神經(jīng)性舞蹈病蛋白質(zhì)的形成并消除HIV感染。

      2015年,中國科學家通過去肌肉生長抑制素基因基因創(chuàng)造了兩個超級肌肉小獵犬。在沒有該基因的情況下,小獵犬表現(xiàn)出“肌肉肥大”,明顯比未經(jīng)基因改造的犬更強壯。

      其他CRISPR動物試驗包括將長絨山羊用于高產(chǎn)羊絨和繁殖無角奶牛。

      人類研究

      與動物研究相比,編輯人類DNA的CRISPR實驗發(fā)展較緩慢,主要是由于倫理和監(jiān)管問題。鑒于改變?nèi)祟惢蚪M的永久性,F(xiàn)DA對于CRISPR的態(tài)度是謹慎的。一些科學家甚至提出應該暫停CRISPR試驗,直到我們獲得更多有關該技術對人類潛在影響的信息。

      2018年,美國和歐洲進行了CRISPR人體試驗。

      截至2018年2月,賓夕法尼亞大學正在等待F D A對于一項研究的最終批準。該研究旨在評估應用CRISPR治療多發(fā)性骨髓瘤,黑色素瘤和肉瘤患者的安全性。

      歐洲也可能會在2018年首次進行人體CRISPR研究。CRISPR Therapeutics的研究集中在一種稱為β-地中海貧血的血液疾病上,這種疾病會導致血紅蛋白的成分改變。

      雖然涉及患者參與的臨床試驗仍在等待監(jiān)管機構的批準,但CRISPR已經(jīng)應用于活體和非活體人類胚胎實驗中。

      例如,2017年8月,由俄勒岡州健康和科學大學的生殖生物學家Shoukhrat Mitalipov領導的一個小組獲得了私人贊助,使用CRISPR-Cas9識別了導致心肌增厚的胚胎突變。突變的胚胎在實驗室將突變率恢復到了72%(高于普通50%的遺傳率)。

      一些批評人士說,胚胎的基因編輯是不道德的,即使編輯過的胚胎不用于移植。目前這種類型的測試無法獲得聯(lián)邦資助,都是依靠私人贊助。

      涉及的行業(yè)

      CRISPR將會影響的行業(yè)包括醫(yī)藥、食品、農(nóng)業(yè)和工業(yè)生物技術。由于CRISPR-Cas9基因編輯系統(tǒng)非常容易建立和使用,各個領域的研究人員都可以利用這項技術。

      制藥和生物技術

      未來的醫(yī)學將用CRISPR編寫。

      目前的藥物的研發(fā)需要花很長時間,因為需要確保藥物的安全性,還需徹底了解藥物的副作用。而且,目前的美國監(jiān)管政策往往導致研發(fā)進程長達數(shù)十年。然而,應用CRISPR的團隊可以將定制療法更快地推向市場,加速了傳統(tǒng)的藥物研發(fā)過程。

      CRISPR更加便宜和靈活,它能快速地識別潛在的目標基因,進行高效的臨床前實驗。因為它可以用來“敲除”不同的基因,CRISPR為研究人員提供了一種更快,更實惠地研究成千上萬個基因的方式,方便查看哪些基因受特定疾病的影響。

      當然,隨著藥物研發(fā)過程更加簡便,CRISPR提供了治療患者的新方法。

      例如,單基因疾病-由單一基因突變引起的疾病—可以進行CRISPR試驗。這些疾病的性質(zhì)為治療提供了確切的目標:單個基因的突變。

      基于血液的單基因疾病如β-地中海貧血或鐮狀細胞也是CRISPR治療的理想對象,因為這些疾病能夠在體外進行治療(稱為離體治療)?;颊叩难毎梢员蝗〕觯肅RISPR技術治療,然后放回到體內(nèi)。

      糧食和農(nóng)業(yè)

      早在20世紀20年代,酸奶公司Danisco就開創(chuàng)了CRISPR的早期應用,當時科學家們使用早期版本的CRISPR來對抗牛奶和酸奶中的主要細菌(嗜熱鏈球菌),該細菌總是被病毒感染。那時候,CRISPR技術仍不成熟。

      由于氣候變化的影響,我們急需使用CRISPR保護糧食和農(nóng)產(chǎn)品免受新細菌的侵害。例如,隨著種植區(qū)域變得越來越熱和干燥,可可的種植變得越來越難。這種環(huán)境變化將進一步加劇病原體造成的損害。

      為了解決這個問題,加州大學伯克利分校的創(chuàng)新基因組學研究所(IGI)正在應用CRISPR來制造抗病可可。領先的巧克力供應商MARS Inc.也在支持這項研究。

      基因編輯可以使種植更加高效。它可以緩解馬鈴薯和西紅柿等主要作物的全球糧食短缺,也可以創(chuàng)造出不受干旱和其他環(huán)境影響的作物。

      監(jiān)管機構對基因編輯作物幾乎沒有任何抵觸情緒,美國農(nóng)業(yè)部(USDA)也沒有管理這一領域。這主要是因為當CRISPR應用于農(nóng)作物時,不會帶來任何外源DNA:CRISPR僅用于編輯作物自身的遺傳信息,選擇理想的性狀。

      2018年1月,某生物技術公司獲得CRISPR植物亞麻籽油(假亞麻)的批準,該亞麻籽油增強了ω-3油,用于制造植物油和動物飼料。

      這些跡象表明,新品種的農(nóng)作物比以前想象的更快地進入市場。這會影響我們吃的食物,因為食物被編輯以后,有可能以攜帶更多的營養(yǎng)物質(zhì)或可以在雜貨架上保存更長時間。

      工業(yè)生物技術

      另一個不太明顯的領域是工業(yè)生物技術。使用CRISPR重新設計微生物,研究人員可以創(chuàng)建新材料。

      這與整個社會有什么關系?從工業(yè)角度來看,這對改造和創(chuàng)造新的化學產(chǎn)品來說非常重要。我們可以改變微生物以增加多樣性,創(chuàng)造新的生物材料,并制造更高效的生物燃料。從香水中的活性化學物質(zhì)到工業(yè)洗潔精中的活性化學物質(zhì),CRISPR會對創(chuàng)造新的更高效的生物材料產(chǎn)生巨大影響。

      CRISPR的爭議

      當技術可以改變生命法則時,其影響是深遠的,它的爭議也是如此。下面將列出一些關于CRISPR的主要爭議。

      設計你自己的寶寶?

      如果我們知道某個基因的位置在哪里,可以利用CRISPR以多種方式操縱它。按照這種邏輯,寵物主人可以用特定的毛色和尺寸設計他們想要的狗。更重要的是,父母還可以修改控制身高或眼睛顏色的基因來“設計”自己的孩子。如果我們能夠分離出與智力相關的基因,那孩子的智商也可以被操縱。

      雖然批評人士說這種技術只能用于治療需求,但CRISPR的快速發(fā)展似乎不會減慢,基因編輯技術的已經(jīng)被用于非治療目的手術中。

      讓滅絕動物復活

      最后一只長毛的猛犸象出現(xiàn)在3600年前。如果我們能夠讓這些古代生物起死回生,我們應該這么做嗎?目的是什么?無論是出于好奇還是為了有效的科學實驗,這個領域都頗具爭議。

      簡而言之,滅絕物種復活是為了讓滅絕的動物起死回生。首先我們需要找到滅絕動物最近的活體親屬的胚胎,并使用CRISPR-Cas9在其基因中插入已滅絕物種的DNA,這樣一只已滅絕的動物可以再次漫游這個星球。

      滅絕物種復活的倡導者們也表示,人類直接導致許多物種滅絕,因此,我們應該共同努力扭轉這一趨勢。

      批評者擔心,像這樣操縱自然可能會帶來更多的傷害而不是積極影響,可能會創(chuàng)造出威脅人類崛起或現(xiàn)在環(huán)境的物種。

      遺傳中的不可逆遺傳變異

      利用CRISPR進行“生殖細胞改造”引發(fā)科學界的擔憂。

      改造體細胞,如皮膚,大腦,肌肉和心臟細胞不會傳遞給后代。然而,生殖細胞改造修改的是卵子或精子細胞中的基因,因此這樣的改造將遺傳給后代。

      生殖細胞改造引發(fā)了一個問題:從道德層面上,我們是否可以選擇我們想要遺傳給后代的基因?

      盡管圍繞這個問題存在爭議,但顯然,改造生殖細胞的好處是可以阻止或防止疾病表現(xiàn)為個體發(fā)育。生殖細胞療法也可以保證患者體內(nèi)的每個細胞都接受治療。即使一個成年人天生就是易得癌癥的體質(zhì),通過CRISPR編輯生殖細胞基因,他也可以痊愈,就像從沒從未患過癌癥一樣。

      基因驅(qū)動可能會導致進化混亂

      一個沒有蚊子的未來也是一個沒有瘧疾的未來,也就不會有寨卡病毒,基孔肯雅病毒,登革熱這些名詞地不斷涌現(xiàn)。沒有這些昆蟲傳播疾病,世界各地的生命將不會受到這些疾病的威脅。

      CRISPR可以幫助我們到達這個目的。然而從進化的角度來講,一個好主意可能會導致災難性的后果。一般來說,每個基因有50%的機會被遺傳給后代。但基因驅(qū)動卻可以用來確保某種基因有更大的遺傳幾率。如果科學家通過遺傳編輯技術改變基因驅(qū)動,他們則可以為進化創(chuàng)造一個加速通道。

      但在短期看來,這樣一個好辦法會破壞野生生態(tài)系統(tǒng)的自然平衡,改變自然進化的過程。通過生態(tài)系統(tǒng)造成的多米諾骨牌效應是無法預測的。

      結束語

      基因編輯的未來在100、50甚至10年后可能發(fā)生翻天覆地的變化。

      未來,在植物,動物甚至人類中修改或設計基因可能會合法,這也將給基因庫和進化過程造成不可逆轉的影響。

      雖然上面提出的一些想法在目前看來似乎很牽強,但這的確很有可能發(fā)生。畢竟,CRISPR不是一種昂貴和難以獲得的技術。CRISPR技術現(xiàn)在可以使用,很多人也正在使用這項技術。從農(nóng)民到研究人員,CRISPR將對我們的社會產(chǎn)生不可估量影響。

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