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      RASSF1A 基因甲基化和SCC聯(lián)合檢測在非小細胞肺癌轉(zhuǎn)移監(jiān)測中的應(yīng)用

      2018-03-22 05:53:35張洪彬張滿娥黃文濱盧志華
      分子診斷與治療雜志 2018年2期
      關(guān)鍵詞:甲基化標志物陽性率

      張洪彬 張滿娥 黃文濱 盧志華

      肺癌是否發(fā)生轉(zhuǎn)移對于術(shù)后的治療方式和預(yù)后有重要的影響,但是目前缺乏可早期、動態(tài)監(jiān)測肺癌轉(zhuǎn)移的標志物。目前多項研究表明,抑癌基因—Ras相關(guān)結(jié)構(gòu)域蛋白家族1A(ras association domain family 1A,RASSF1A)的編碼基因啟動子區(qū)的甲基化與肺癌相關(guān)[1?3]。因此RASSF1A基因甲基化有可能作為動態(tài)監(jiān)測肺癌轉(zhuǎn)移的標志物。同時,近幾年對于循環(huán)腫瘤DNA的研究顯示,腫瘤患者血液中游離DNA與相應(yīng)的原發(fā)腫瘤細胞基因變異相一致[2]。因此,循環(huán)血中的RASSF1A基因甲基化水平檢測也可能成為一種非侵入性的腫瘤診斷手段[3]。鱗狀上皮細胞癌抗原(squamous cell carcinoma antigen,SCC)是一種傳統(tǒng)的肺癌標志物,可輔助診斷肺鱗癌,配合癌抗原125(cancer antigen 125,CA125)、細胞角蛋白19片段(cytoker?atin?19?fragment,CYFRA21?1)、癌胚抗原(carcino embryonic antigen,CEA)聯(lián)合檢測可提高肺癌患者診斷的靈敏性[4],其水平與腫瘤的進展程度相關(guān),但是單獨檢測靈敏度不高[5?6]。本研究通過隨訪觀察非小細胞肺癌(non?small cell lung cancer,NSCLC)患者,采用甲基化特異性PCR(methyla?tion specific PCR,MSP)技術(shù)對NSCLC患者腫瘤組織及對應(yīng)術(shù)前血漿標本中RASSF1A甲基化水平進行檢測,并同時檢測上述病例術(shù)前血清SCC水平,旨在探討RASSF1A甲基化水平和SCC聯(lián)合檢測在NSCLC患者危險分層及術(shù)后轉(zhuǎn)移評估中的價值。

      1 資料與方法

      1.1 研究對象

      選擇2014年1月至2015年6月在龍巖市第二醫(yī)院就診的57例NSCLC患者,其中男性25例,年齡35~72歲,平均年齡(65.8±3.9)歲;女性 32例,年齡 30~70歲,平均年齡(59.5±5.6)歲。入選標準:①病理診斷為NSCLC,符合美國國家綜合癌癥網(wǎng)絡(luò)(National Comprehensive Cancer Network,NCCN)2015年 NSCLC臨床指南[7]。②未經(jīng)任何放化療等治療。③無其他腫瘤病史。

      1.2 方法

      在施行手術(shù)前采集患者外周靜脈血液標本5 mL,其中2 mL分離血清,3 mL置于經(jīng)過EDTA?Na處理的抗凝管中,3 000 r/min離心15 min,分離血漿。取5~10 g腫瘤組織,腫瘤組織需取自腫塊中心且未發(fā)生壞死的部分,術(shù)后均經(jīng)病理醫(yī)生確診為NSCLC。組織獲取均征得患者及家屬知情同意,并經(jīng)醫(yī)院倫理委員會同意,分別于1個月、3個月、6個月、12個月隨訪患者因肺癌轉(zhuǎn)移再次入院情況。

      1.2.1 血清SCC水平測定

      血清SCC水平測定采用電化學(xué)發(fā)光法,試劑和檢測儀器購自美國羅氏公司。實驗步驟按照說明書操作。血清SCC水平正常值為:<1.5 ng/mL。

      1.2.2 MSP法檢測RASSF1A甲基化水平

      DNA提取及修飾:取50 mg組織,使用蛋白酶K消化法提取組織DNA,采用DNA純化試劑盒(QIAGEN,德國)提取血漿樣本中的基因組DNA,按試劑盒說明書操作。提取后的DNA用紫外分光光度計(島津UV?1750,日本)測定濃度及純度。DNA甲基化修飾使用The Intergen CpGenome DNA Modification Kit(QIAGEN,德國),取DNA 1 μg用3 mol/LNaOH處理變性后,再通過亞硫酸氫鈉修飾,50℃避光水浴過夜,修飾后的DNA用乙醇沉淀回收并用去離子水重懸,即可用于MSP的檢測。

      MSP檢測:針對RASSF1A基因啟動子的轉(zhuǎn)錄調(diào)控區(qū)域,根據(jù)參考文獻[3]合成基因的各PCR引物,甲基化引物對的上游引物序列為5′?GTGTTA?ACGCGTTGCGTATC?3′,下游引物序列為 5′?AACCCCGCGAACTAAAAACGA?3′;非甲基化引物對的上游引物序列為5′?TTTGGTTGGAGTGT?GTTAATGTGT ?3′,下游引物序列為5′?CAAACCCCACAAACTAAAAACAA?3′。

      PCR 反應(yīng)體系如下:10×PCR 緩沖液2.5 μL,10 mol/L dNTP 4 μL,25 mol/L MgCl24 μL,上、下游引物各1 μL,已修飾的DNA模板10 μL,Taq酶0.5 μL,去離子水補充體積至50 μL。擴增條件如下:94℃預(yù)變性 5 min;94℃ 1 min,58℃ 1 min,72℃1 min,共35個循環(huán)。同時分別選取經(jīng)甲基化酶M.SssⅠ(NEB,美國)處理和未經(jīng)處理的正常人外周血淋巴細胞DNA作為甲基化、非甲基化陽性對照,去離子水作空白對照。取5 μL反應(yīng)產(chǎn)物進行3%瓊脂糖凝膠電泳,用凝膠成像儀(BIORAD,美國)拍照分析。甲基化引物擴增出條帶的樣品,判定為甲基化陽性;未甲基化引物擴增出條帶、甲基化引物擴增不出條帶的樣品,判定為甲基化陰性;2種引物均擴增出條帶的樣品,判定為甲基化陽性。

      1.3 統(tǒng)計學(xué)處理

      采用SPSS 19.0軟件進行統(tǒng)計分析。用χ2檢驗分別比較不同病理分期患者、鱗癌和非鱗癌患者、發(fā)生轉(zhuǎn)移和未發(fā)生轉(zhuǎn)移患者組織和血漿中RASSF1A基因甲基化陽性率;t檢驗分別比較鱗癌和非鱗癌患者、發(fā)生轉(zhuǎn)移和未發(fā)生轉(zhuǎn)移患者術(shù)前血清SCC水平。單因素方差分析法比較不同病理分期患者術(shù)前血清SCC水平差異。通過繪制受試者工作特征曲線(receiver operating characteris?tic curve,ROC)制定實驗數(shù)據(jù)的截斷點,采用Ka?plan?Meier進行生存分析,生存曲線比較采用Log Rank檢驗。以上統(tǒng)計學(xué)分析以P<0.05為差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。

      2 結(jié)果

      2.1 患者總體病理分期及組織學(xué)類型

      57例NSCLC患者,總體病理分期及組織學(xué)類型分布見表1。其中26例(45.6%)因肺癌轉(zhuǎn)移再次入院,為轉(zhuǎn)移組。其余31例未發(fā)生轉(zhuǎn)移為未轉(zhuǎn)移組。

      表1 患者總體病理分期及組織學(xué)類型Table 1 The overall pathological stage and histological type of the patient

      2.2 不同分組患者術(shù)前血清SCC水平、術(shù)后組織和術(shù)前血漿RASSF1A甲基化陽性率比較

      比較不同病理分期患者術(shù)前血清SCC、術(shù)后組織和術(shù)前血漿RASSF1A甲基化陽性率,Ⅲ期均高于Ⅱ期、Ⅱ期高于Ⅰ期,3組間術(shù)前血清SCC水平、術(shù)后組織RASSF1A甲基化陽性率差異均有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),術(shù)前血漿RASSF1A甲基化陽性率差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。鱗癌(包括鱗癌和腺鱗癌)患者術(shù)前血清SCC水平高于非鱗癌患者,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),組織、術(shù)前血漿RASSF1A甲基化陽性率差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。發(fā)生轉(zhuǎn)移的患者術(shù)前血清SCC水平、術(shù)后組織和術(shù)前血漿RASSF1A甲基化陽性率均高于未發(fā)生轉(zhuǎn)移的患者,差異均有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),具體數(shù)據(jù)見表2。

      2.3 血清SCC水平、組織和血漿RASSF1A甲基化陽性率評估患者術(shù)后轉(zhuǎn)移的價值

      根據(jù)出院后12個月NSCLC患者隨訪的轉(zhuǎn)移情況,繪制血清SCC水平、組織和血漿RASSF1A甲基化陽性率對NSCLC患者術(shù)后轉(zhuǎn)移判定的ROC曲線,血清SCC水平、組織和血漿RASSF1A甲基化陽性率曲線下面積分別為0.681、0.785、0.647,檢驗P值分別為0.019、0.000、0.058。以上結(jié)果表明血清SCC和組織RASSF1A甲基化陽性率面積有統(tǒng)計學(xué)意義,血清SCC和組織RASSF1A甲基化陽性率均符合預(yù)測NSCLC術(shù)后轉(zhuǎn)移的條件,見圖1。

      表2 不同分組患者術(shù)前血清SCC水平、術(shù)后組織和術(shù)前血漿RASSF1A甲基化陽性率比較Table 2 Comparison of preoperative serum SCC level,positive rate of RASSF1A methylation in postoperative tissue and preoperative plasma among different groups

      圖1 血清SCC水平、術(shù)后組織和術(shù)前血漿RASSF1A甲基化陽性率預(yù)測NSCLC術(shù)后轉(zhuǎn)移的ROC曲線Figure 1 The ROC curves of serum SCC level,positive rate of RASSF1A methylation in postoperative tissue and preoperative plasma that used to predict NSCLC postoperative metastasis

      2.4 生存曲線分析

      結(jié)合血清SCC水平、組織RASSF1A甲基化陽性率對NSCLC患者的術(shù)后轉(zhuǎn)移判定的ROC曲線的坐標點,血清SCC水平≥4.05 ng/mL預(yù)測NSCLC患者發(fā)生轉(zhuǎn)移的敏感性和特異性分別為42.3%和 96.8%,約登(Youden)指數(shù)為 0.391;RASSF1A甲基化陽性預(yù)測NSCLC患者發(fā)生轉(zhuǎn)移的敏感性和特異性分別為73.1%和83.9%,Youden指數(shù)為0.569。以血清SCC、組織RASSF1A甲基化水平越高,發(fā)生轉(zhuǎn)移的風(fēng)險越高進行危險分層。將血清SCC為4.05 ng/mL、組織RASSF1A發(fā)生甲基化(賦值為1)作為危險分層界值繪制Kaplan?Meier生存曲線,將入選的NSCLC患者分為高危組(血清SCC水平≥4.05 ng/mL和/或組織RASSF1A發(fā)生甲基化,共24例)、低危組(血清SCC水平<4.05 ng/mL和/或組織RASSF1A未發(fā)生甲基化,共33例)。Log Rank(Mantel?Cox)檢驗顯示,高危組與低危組患者生存時間差別具有統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.011,P<0.05),見圖2。

      3 討論

      圖2 不同危險分層的Kaplan?Meier生存曲線Figure 2 Kaplan?Meier survival curves of different risk stratification

      由于非小細胞肺癌易復(fù)發(fā)和轉(zhuǎn)移,因此判斷臨床病情的嚴重程度、危險分層和術(shù)后轉(zhuǎn)移給患者帶來了很大的困難。在非小細胞肺癌的研究中,主要依靠病理分期、生物標志物和患者的臨床特征來預(yù)測預(yù)后。尋找非小細胞肺癌轉(zhuǎn)移標志物是肺癌研究領(lǐng)域的熱點之一。近年來,CA125、CYFRA21?1、CEA等生物標志物已被確定在非小細胞肺癌的發(fā)生和發(fā)展中有重要作用。同時,還為非小細胞肺癌的診斷、危險分層、療效評價和術(shù)后轉(zhuǎn)移提供了有力的支持。

      在本研究中使用的SCC是一種常用的腫瘤標志物,其在子宮、肺、頭部和頸部等鱗癌中均有表達。大量的臨床研究表明,檢測SCC有助于判斷非小細胞肺癌患者的術(shù)后轉(zhuǎn)移,尤其是在肺鱗狀細胞癌患者中[4?6]。在非小細胞肺癌患者中,血清SCC的升高可能提示轉(zhuǎn)移或預(yù)后差。本研究結(jié)果顯示,越后期的病理分期,術(shù)前血清SCC水平越高,可以輔助病理分期的診斷;同時,鱗癌患者SCC水平可以作為肺鱗狀細胞癌的鑒別診斷指標;高水平SCC轉(zhuǎn)移率較高與國內(nèi)外SCC對于NSCLC術(shù)后轉(zhuǎn)移評價的研究結(jié)果一致[4?6]。

      在NSCLC標志物的研究中,通過檢測可預(yù)測化療療效和預(yù)后的分子標記物,可以識別出可從化療中受益的早期患者。RASSF1A是一個抑癌基因,多項研究表明其啟動子區(qū)異常的高甲基化會導(dǎo)致其喪失抑癌功能[8?9]。另外,有研究指出,腫瘤細胞在壞死的過程中,可釋放DNA進入循環(huán)血中,與相應(yīng)的原發(fā)腫瘤細胞在分子層面的變異相一致[10?11]。但是 NSCLC 的基因甲基化研究僅局限于組織方面,僅有少數(shù)檢測循環(huán)血中的研究[12]。針對河北地區(qū)人群的相關(guān)性研究表明,血漿中甲基化RASSF1A基因的檢出率與NSCLC的分化程度有關(guān)[13]。也有研究指出,肺癌組織和血漿RASSF1A基因甲基化檢出率與患者分化程度、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移有關(guān)[14],非小細胞肺癌患者的淋巴結(jié)有更高比例的RASSF1A基因甲基化檢出率[15]。這與本研究的結(jié)果具有一致性。本實驗通過檢測NSCLC患者術(shù)后組織和血漿RASSF1A甲基化水平,并對患者進行12個月的隨訪,隨訪期間發(fā)生轉(zhuǎn)移的患者組織和血漿RASSF1A甲基化陽性率均高于未發(fā)生轉(zhuǎn)移的患者,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。這表明RASSF1A甲基化與NSCLC患者術(shù)后轉(zhuǎn)移相關(guān),有望作為NSCLC術(shù)后轉(zhuǎn)移預(yù)測的新型標志物。另外,病理分期越晚,組織RASSF1A甲基化陽性率越高,可作為病理分期的輔助標志物[16?17]。

      本文研究結(jié)果表明,血清SCC和組織RASSF1A甲基化陽性率均可作為NSCLC術(shù)后轉(zhuǎn)移的標志物,但分別使用的正確診斷指數(shù)(約登指數(shù))并不高。Log Rank(Mantel?Cox)檢驗顯示,血清SCC、組織RASSF1A甲基化水平高與水平低的患者生存時間差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。血清 SCC、組織RASSF1A甲基化水平都與NSCLC的危險分層有關(guān),且水平越高發(fā)生轉(zhuǎn)移事件的風(fēng)險越大。綜上所述,血清SCC、血漿和組織RASSF1A甲基化水平在NSCLC患者危險分層及術(shù)后轉(zhuǎn)移評估中有一定的臨床意義。

      本研究數(shù)據(jù)僅限于龍巖地區(qū),樣本量不夠大;此外,本研究以無轉(zhuǎn)移的NSCLC患者為對照組,未建立良性肺病對照組、小細胞肺癌對照組,隨訪持續(xù)時間僅為一年。以上是本研究的不足之處。因不同的標志物有各自獨特的生物學(xué)特性和代謝過程,在NSCLC的發(fā)展過程中協(xié)同或單獨發(fā)揮作用,如果能對NSCLC患者血清SCC、血漿RASSF1A甲基化水平聯(lián)合并持續(xù)檢測,同時結(jié)合影像學(xué)等其他診斷手段,將有利于對NSCLC術(shù)后轉(zhuǎn)移不良患者的監(jiān)測和干預(yù),對延緩病情進展、延長患者的生存時間有重要意義。

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