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    誘導(dǎo)型啟動(dòng)子在植物基因工程中的研究進(jìn)展

    2018-03-03 07:30:21楊瑞娟白建榮常利芳
    山西農(nóng)業(yè)科學(xué) 2018年2期
    關(guān)鍵詞:誘導(dǎo)型擬南芥元件

    楊瑞娟 ,白建榮 ,李 銳 ,常利芳

    (1.山西大學(xué)生物工程學(xué)院,山西 太原 030006;2.山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所,山西 太原 030031)

    啟動(dòng)子是位于基因的上游,能夠被RNA聚合酶特異性識(shí)別的一段DNA序列。它像“開關(guān)”,控制基因表達(dá)的起始時(shí)間和程度。啟動(dòng)子組成包括核心啟動(dòng)子與上游啟動(dòng)子元件。核心啟動(dòng)子由轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)、TATA框和5'UTR序列組成[1-2]。上游啟動(dòng)子元件包括CAAT框、GC框和一些組成型及特異型元件,這些元件結(jié)合相應(yīng)的蛋白因子能夠提高轉(zhuǎn)錄效率[3]。啟動(dòng)子按功能及作用方式可分為誘導(dǎo)型啟動(dòng)子、組織特異型啟動(dòng)子和組成型啟動(dòng)子[4]。但是某些條件下,一個(gè)啟動(dòng)子可能有2類啟動(dòng)子的特性[5]。

    植物基因工程是將外源基因?qū)胧荏w細(xì)胞,使其與受體染色體整合,改變受體植物遺傳特性的一種方法。它不但可以克服物種間的生殖隔離,還可以大大加快植物育種進(jìn)程。外源基因的表達(dá)必須有啟動(dòng)子的驅(qū)動(dòng)。傳統(tǒng)的基因工程中使用的大多是組成型啟動(dòng)子,它在植物的整個(gè)生命周期中都高強(qiáng)度表達(dá),導(dǎo)致基因產(chǎn)物過度累積以及隨之而來的代謝紊亂甚至植物死亡。誘導(dǎo)型啟動(dòng)子是在植物適應(yīng)環(huán)境和長(zhǎng)期進(jìn)化過程中形成的,能夠響應(yīng)特殊的生物、物理、化學(xué)信號(hào),進(jìn)而提高特定基因轉(zhuǎn)錄水平,來適應(yīng)一定范圍內(nèi)環(huán)境變化的一類啟動(dòng)子。在沒有誘導(dǎo)因子存在的條件下,它控制的編碼基因不表達(dá)或本底表達(dá),一旦環(huán)境中出現(xiàn)誘導(dǎo)因素,編碼基因表達(dá)迅速增加。按照響應(yīng)環(huán)境的不同可以分為生物脅迫誘導(dǎo)的啟動(dòng)子、物理脅迫誘導(dǎo)的啟動(dòng)子、化學(xué)脅迫誘導(dǎo)的啟動(dòng)子[6]。誘導(dǎo)型啟動(dòng)子不但可以避免目的基因的持續(xù)表達(dá)對(duì)植物能量的過度消耗,而且可以消除基因產(chǎn)物積累對(duì)植物本身造成的傷害,成為近年來植物基因工程的研究熱點(diǎn)。

    筆者從生物、物理、化學(xué)3個(gè)誘導(dǎo)方面對(duì)抗逆相關(guān)誘導(dǎo)型啟動(dòng)子的研究進(jìn)行了綜述,以期為相關(guān)學(xué)者的研究提供依據(jù)。

    1 生物脅迫誘導(dǎo)型啟動(dòng)子

    植物在生長(zhǎng)發(fā)育過程中會(huì)受到病原微生物如病毒、細(xì)菌、真菌等的侵染以及害蟲的吞食侵害,從而導(dǎo)致存活率下降。生物脅迫誘導(dǎo)型啟動(dòng)子是指在植物受到生物脅迫時(shí)可以激活保護(hù)蛋白基因并調(diào)控其相關(guān)表達(dá),從而消除有害代謝產(chǎn)物對(duì)植物自身起到保護(hù)作用。目前相關(guān)研究已取得一定進(jìn)展(表1)。

    表1 生物脅迫誘導(dǎo)型啟動(dòng)子

    1.1 病原菌誘導(dǎo)型啟動(dòng)子

    WRKYs轉(zhuǎn)錄因子在植物抗病反應(yīng)中起重要作用,PETITOT等[7]克隆了咖啡WRKY轉(zhuǎn)錄因子的同源基因啟動(dòng)子CaWRKY1a和CaW-RKY1b,發(fā)現(xiàn)真菌脅迫可以誘導(dǎo)該啟動(dòng)子。何康[8]通過研究水稻抗紋枯病基因OS2H16啟動(dòng)子POs2H16,確定AATCA片段能夠獨(dú)立響應(yīng)紋枯病菌誘導(dǎo)。牟少亮等[9]研究發(fā)現(xiàn),OsERF96基因可應(yīng)答白葉枯病或稻瘟病病原菌的侵染,其啟動(dòng)子可以應(yīng)答病原菌侵染誘導(dǎo)。

    1.2 害蟲誘導(dǎo)型啟動(dòng)子

    當(dāng)受到害蟲吞食后植物體內(nèi)水楊酸(SA)劇增,促使相關(guān)基因表達(dá)。KUMAR等[22]將煙草病害蛋白啟動(dòng)子PR-1a嵌合CaMV35S導(dǎo)入棉花,發(fā)現(xiàn)昆蟲吞食能夠驅(qū)動(dòng)cry1EC基因表達(dá),同時(shí)噴施SA可以提高棉花的抗蟲性。有研究發(fā)現(xiàn),當(dāng)擬南芥根部有線蟲寄生時(shí),3種細(xì)菌防衛(wèi)素基因(Pdf2.1,Pdf2.2,Pdf2.3)被誘導(dǎo)表達(dá)。SIDDIQUE等[23]將Pdf2.1啟動(dòng)子與GUS基因融合轉(zhuǎn)入擬南芥之后用線蟲感染,發(fā)現(xiàn)GUS基因在其根中特異性表達(dá)。關(guān)麗梅等[24]將從秈稻基因組中獲得的Os01g73940啟動(dòng)子片段BPHIP連接到帶有GUS報(bào)告基因的植物表達(dá)載體上,并轉(zhuǎn)入中花11。通過GUS組織化學(xué)染色和定量RT-PCR檢測(cè)證明,BPHIP是一個(gè)受褐飛虱和茉莉酸處理誘導(dǎo)上調(diào)的啟動(dòng)子。

    2 物理脅迫誘導(dǎo)型啟動(dòng)子

    物理脅迫誘導(dǎo)型啟動(dòng)子是指響應(yīng)光、極端溫度、干旱等逆境脅迫使植物適應(yīng)非正常光照、溫度和干旱等惡劣環(huán)境,維持生長(zhǎng)發(fā)育。這類啟動(dòng)子的研究開始的較早,研究成果最多(表2)。

    2.1 光誘導(dǎo)型啟動(dòng)子

    光在植物生長(zhǎng)發(fā)育中起重要作用,如光合作用、光形態(tài)建成。常見的光誘導(dǎo)型啟動(dòng)子有cab啟動(dòng)子和rbcS基因啟動(dòng)子。一般光誘導(dǎo)啟動(dòng)子同時(shí)具有綠色組織特異性[5,25]。王旭靜等[25]研究發(fā)現(xiàn),中棉Gacab啟動(dòng)子含有GT1元件I-box和G-box等光誘導(dǎo)元件并且具有光誘導(dǎo)性。習(xí)雨琳等[5]將A-tRBCS-1A啟動(dòng)子片段轉(zhuǎn)化擬南芥,分析不同光照條件下的表達(dá)模式,結(jié)果顯示,該啟動(dòng)子是光誘導(dǎo)型和組織特異型啟動(dòng)子。

    2.2 溫度誘導(dǎo)型啟動(dòng)子

    2.2.1 高溫誘導(dǎo)型啟動(dòng)子 高溫脅迫條件下植物體內(nèi)會(huì)大量合成如HSP70,HSP90和HSP100等熱激蛋白來減輕脅迫引起的傷害[26],當(dāng)熱激元件HSE與熱激因子HSF相互作用才能激活熱激蛋白基因的轉(zhuǎn)錄活性。RR?NDL等[27]研究發(fā)現(xiàn),大豆Gmhsp17.32B啟動(dòng)子具有一段熱誘導(dǎo)因子(HSE)的同功序列。FREEMAN等[28]研究表明,大麥Hvhsp17基因啟動(dòng)子在高溫下能驅(qū)動(dòng)Hvhsp17基因在水稻中表達(dá)。

    2.2.2 冷凍誘導(dǎo)型啟動(dòng)子 低溫條件下,植物體內(nèi)會(huì)發(fā)生如改變蛋白質(zhì)、碳水化合物組分或合成一些新的物質(zhì)等一系列生化反應(yīng)。冷響應(yīng)基因COR(cold-regulated)含有順式作用元件CRT和DRE[29]。BELINTANI等[30]研究發(fā)現(xiàn),甘蔗ipt基因啟動(dòng)子ATCOR15a可使ipt基因在冷凍脅迫下表達(dá)量增加,減少冷凍引起植物的損傷。WANG等[31]分離了玉米中受低溫、干旱誘導(dǎo)顯著表達(dá)的蛋白激酶基因ZmCKS2的啟動(dòng)子,并對(duì)其進(jìn)行功能驗(yàn)證。結(jié)果表明,ZmCKS2啟動(dòng)子受干旱、低溫脅迫和不同激素(ABA,MeJA,SA)的多因素誘導(dǎo),缺失啟動(dòng)子片段P2(367 bp)是受低溫、MeJA和SA誘導(dǎo)的最小的啟動(dòng)子片段。呂兆勇等[32]研究證明,葡萄PCAN啟動(dòng)子具有低溫和干旱脅迫下誘導(dǎo)表達(dá)的特性(表2)。

    表2 物理脅迫誘導(dǎo)型啟動(dòng)子

    2.3 干旱誘導(dǎo)型啟動(dòng)子

    干旱條件下,植物根毛細(xì)胞感知水分脅迫信號(hào)并進(jìn)行信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo),誘導(dǎo)水分脅迫相關(guān)基因的表達(dá)。1992年YAMAGUCHI-SHINOZAKI等[53]首次從擬南芥中分離并且克隆出逆境誘導(dǎo)型啟動(dòng)子rd29。BIHMIDINE等[54]研究發(fā)現(xiàn),rd29A,rd29B基因啟動(dòng)子在干旱條件下均被明顯激活,是抗旱型啟動(dòng)子。楊梅等[55]分離了干旱脅迫強(qiáng)烈誘導(dǎo)的水稻內(nèi)源基因Oshox24的啟動(dòng)子Oshox24P,并通過GUS活性檢測(cè)證明,該啟動(dòng)子是干旱誘導(dǎo)型啟動(dòng)子,可以調(diào)控目標(biāo)基因在水稻中的表達(dá)。

    3 化學(xué)脅迫誘導(dǎo)型啟動(dòng)子

    化學(xué)脅迫誘導(dǎo)型啟動(dòng)子是指在激素、高鹽、營(yíng)養(yǎng)元素缺乏和含量過高等逆境條件下使植物可以生長(zhǎng)的一類啟動(dòng)子。這類啟動(dòng)子的誘導(dǎo)因素受人類活動(dòng)影響較大,比如為了作物增產(chǎn)而過量施肥,導(dǎo)致土地鹽堿化和土壤板結(jié),使農(nóng)作物受到新的脅迫,導(dǎo)致減產(chǎn)。與物理脅迫誘導(dǎo)型啟動(dòng)子相比,該類啟動(dòng)子研究較少(表3)。

    表3 化學(xué)脅迫誘導(dǎo)型啟動(dòng)子

    3.1 激素誘導(dǎo)型啟動(dòng)子

    植物的生長(zhǎng)發(fā)育過程受激素的調(diào)節(jié)作用,但是激素不能直接作用于啟動(dòng)子序列,而是先與植物體內(nèi)受體結(jié)合,激活受體蛋白,然后再由作用于啟動(dòng)子中相應(yīng)激素應(yīng)答元件,驅(qū)動(dòng)下游基因的表達(dá),從而引起一系列生理反應(yīng)[87]。XU等[70]分離了白松PsPR10啟動(dòng)子,并構(gòu)建融合報(bào)告基因載體轉(zhuǎn)入煙草,分別用 SA,ABA,JA,NaCl,甘露醇和 PEG-6000 處理轉(zhuǎn)基因植株,分別分析各種脅迫條件下GUS基因在根、莖、葉中的表達(dá)。結(jié)果表明,在所有脅迫條件下根的GUS活性均比對(duì)照組高,而莖和葉中GUS活性只在SA,ABA和JA條件下有增高。余建等[74]克隆了桑樹MnACO基因MnACO1啟動(dòng)子片段,對(duì)序列進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),含有響應(yīng)赤霉素的GARE-motif和響應(yīng)植物激素的AuxRE元件。GUS活性分析表明,MnACO1為誘導(dǎo)型啟動(dòng)子兼具組成型啟動(dòng)子特性。

    3.2 鹽誘導(dǎo)型啟動(dòng)子

    最早被克隆并進(jìn)行功能分析的鹽誘導(dǎo)型啟動(dòng)子是擬南芥rd29A基因的啟動(dòng)子[53]。張新宇等[82]對(duì)經(jīng)300 mmol/LNaCl處理前后的轉(zhuǎn)AtPUB18基因啟動(dòng)子的擬南芥幼苗進(jìn)行組織化學(xué)染色,結(jié)果表明,處理后GUS基因的表達(dá)量明顯上調(diào),說明At-PUB18基因啟動(dòng)子是高鹽誘導(dǎo)型啟動(dòng)子。SUN等[83]研究發(fā)現(xiàn),旱稻液泡膜質(zhì)子轉(zhuǎn)運(yùn)焦磷酸酶啟動(dòng)子TsVP1在高鹽誘導(dǎo)下有較強(qiáng)的活性。

    3.3 營(yíng)養(yǎng)元素相關(guān)誘導(dǎo)型啟動(dòng)子

    營(yíng)養(yǎng)元素在植物的生命活動(dòng)中起重要作用,是植物正常的生長(zhǎng)發(fā)育不可缺少的因素。在一定的濃度范圍內(nèi),植物可以正常吸收外界環(huán)境中的營(yíng)養(yǎng)元素,然而當(dāng)環(huán)境中元素濃度不足或者過高,卻會(huì)對(duì)植物造成脅迫,影響植物生長(zhǎng)發(fā)育。

    氮是植物蛋白質(zhì)、核酸和葉綠素的重要組成部分,氮素的含量直接影響葉片中葉綠素的含量,土壤中氮素缺乏會(huì)導(dǎo)致植物葉片黃化、根系量減少。劉生等[84]克隆了2個(gè)在大豆葉片或根系高豐度表達(dá)且響應(yīng)低氮脅迫的基因(RNDI和LNDI)的啟動(dòng)子,并分別融合GUS基因轉(zhuǎn)化擬南芥。GUS染色表明,2個(gè)基因的啟動(dòng)子都對(duì)低氮脅迫有響應(yīng),在氮素脅迫環(huán)境條件下能夠調(diào)控組合的功能基因表達(dá)。銅是植物體多種酶類(細(xì)胞色素氧化酶、抗壞血酸氧化酶、多酚氧化酶等)的組成成分,還與光合作用有關(guān)。但植物正常生長(zhǎng)對(duì)銅需要少,土壤中銅含量由于污水灌溉和施用農(nóng)藥遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過了植物所需,導(dǎo)致植物生長(zhǎng)受抑制甚至死亡。鐘活權(quán)[86]研究發(fā)現(xiàn),擬南芥AtRD22啟動(dòng)子含有多個(gè)銅響應(yīng)元件CURECORECR,把該啟動(dòng)子與連接GUS報(bào)告基因轉(zhuǎn)化擬南芥后,發(fā)現(xiàn)高Cu2+脅迫條件下,AtRD22啟動(dòng)子能明顯誘導(dǎo)GUS基因在轉(zhuǎn)基因擬南芥莖和葉中表達(dá)。

    4 小結(jié)與展望

    誘導(dǎo)型啟動(dòng)子是僅在轉(zhuǎn)基因植物受到外界脅迫時(shí)驅(qū)動(dòng)外源基因表達(dá)的一種啟動(dòng)子,相比組成型啟動(dòng)子的表達(dá)模式,誘導(dǎo)型啟動(dòng)子可以節(jié)約植物體能量,減輕代謝負(fù)擔(dān),在避免目的基因過量表達(dá)對(duì)植物的負(fù)面影響的同時(shí)提高植物抗逆性,具有重要的科研價(jià)值和商業(yè)價(jià)值。啟動(dòng)子主要通過順式作用元件來調(diào)控基因表達(dá)。一種啟動(dòng)子常常存在多種順式作用元件,這些元件以特殊組合方式調(diào)控相關(guān)抗逆基因的表達(dá)。目前脅迫誘導(dǎo)啟動(dòng)子研究主要集中在極端溫度、干旱和高鹽等方面,而關(guān)于營(yíng)養(yǎng)元素相關(guān)的誘導(dǎo)型啟動(dòng)子報(bào)道較少。

    綜上所述,研究誘導(dǎo)型啟動(dòng)子作用方式和信號(hào)傳遞途徑之間聯(lián)系,可以為外源基因在轉(zhuǎn)基因植株精細(xì)調(diào)節(jié)提供理論依據(jù)。同時(shí)開展誘導(dǎo)型啟動(dòng)子尤其是營(yíng)養(yǎng)元素相關(guān)的啟動(dòng)子研究,培育營(yíng)養(yǎng)元素高吸收利用和重金屬耐受性新品種。最終將相關(guān)研究結(jié)果大規(guī)模應(yīng)用于生產(chǎn)實(shí)踐,加速植物基因工程改良植物的進(jìn)程。

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