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      小麥黃色素含量與多酚氧化酶活性相關(guān)基因的分子標(biāo)記檢測及分布差異

      2018-01-27 18:01:56陳泠高春保朱展望佟漢文劉易科張宇慶鄒娟鮑文杰
      湖北農(nóng)業(yè)科學(xué) 2017年24期
      關(guān)鍵詞:等位等位基因基因型

      陳泠+高春保+朱展望+佟漢文+劉易科+張宇慶+鄒娟+鮑文杰

      摘要:用黃色素含量和多酚氧化酶活性相關(guān)分子標(biāo)記對277份國內(nèi)小麥(Triticum aestivum L.)品種(系)進(jìn)行了檢測,發(fā)現(xiàn)1B/1R易位系出現(xiàn)頻率為27.1%,控制低多酚氧化酶(PPO)活性等位基因Ppo-A1b和Ppo-B1a分布頻率為53.1%和65.3%,控制低黃色素(YP)含量的等位基因Psy-A1b和Psy-B1b出現(xiàn)頻率分別是39.7%和55.6%。后4種基因型在各省份間分布頻率差異很大,等位基因Ppo-A1b在河南品種中頻率較低,為28.6%;Ppo-D1a基因型在陜西地區(qū)最低,為14.3%;Psy-A1b等位基因在河南和山東品種中分布頻率很低,僅為15.7%和13.3%;Psy-B1b在江蘇和山東地區(qū)較低,分別為25.0%和36.7%;四川品種中這4種等位基因出現(xiàn)頻率都較高。根據(jù)不同地區(qū)面粉色澤相關(guān)等位基因分布差異,制定適宜育種策略,能更有效地改善該地區(qū)小麥新品種的面粉色澤。

      關(guān)鍵詞:小麥(Triticum aestivum L.);黃色素含量;多酚氧化酶活性;1B/1R異位;分子標(biāo)記

      中圖分類號:S512.1 文獻(xiàn)標(biāo)識碼:A 文章編號:0439-8114(2017)24-4892-07

      隨著生活水平的提高,人們對面制品外觀色澤的要求也越來越高。亮白到乳白的面制品,如饅頭、餃子、鹽白面條等更受到消費者的喜愛。黃色素(YP)含量和多酚氧化酶(PPO)活性都影響面制品的色澤,前者含量高使面制品呈現(xiàn)黃色,后者活性高導(dǎo)致面制品褐化,色澤變暗[1,2]。選育低YP含量和低PPO活性的小麥(Triticum aestivum L.)品種可有效增強(qiáng)面粉及面制品白亮色澤[3,4],更受市場歡迎。

      應(yīng)用分子標(biāo)記可快速篩選目標(biāo)基因,提高品種選育效率。研究表明,八氫番茄紅素合成酶(PSY)是面粉中黃色素物質(zhì)——類胡蘿卜素合成的一個關(guān)鍵酶,對面粉中的YP含量起著重要作用[5]。He等[6,7]開發(fā)了PSY基因的多個分子標(biāo)記,其中YP7A標(biāo)記可區(qū)分小麥7A染色體上Psy-A1a和Psy-A1b等位變異,分別控制高、低YP含量;YP7B-1和YP7B-2標(biāo)記可區(qū)分小麥7B染色體上的Psy-B1a、Psy-B1b和Psy-B1c等位基因,分別對應(yīng)中高、低和高YP含量。He等[6,7]還發(fā)現(xiàn)1B/1R易位的存在對YP含量起正相關(guān)作用,因此,通過篩選基因組中含等位基因組合Psy-A1b/Psy-B1b/non 1B/1R的材料,進(jìn)而可選出YP含量低的品種。PPO活性控制基因主要位于第2染色體組,Sun等[8]開發(fā)了2AL染色體上PPO活性基因的分子標(biāo)記PPO18,可區(qū)分PPO-A1a和PPO-A1b等位變異,分別控制高、低PPO活性。He等[9]開發(fā)了2DL染色體上的分子標(biāo)記PPO16和PPO29,可分別檢測低PPO活性等位變異PPO-1Da和高PPO活性等位基因Ppo-D1b。PPO活性基因等位變異組合中,含Ppo-A1b/Ppo-D1a組合的小麥品種,其PPO活性相對最低。

      本研究利用與面粉及面制品色澤相關(guān)分子標(biāo)記YP7A、YP7B-1、YP7B-2、PPO18、PPO16、PPO29以及IB/1R易位系分子標(biāo)記[10]對277份小麥品種(系)進(jìn)行了檢測,分析了國內(nèi)小麥主產(chǎn)省間相關(guān)等位基因變異特點,以期為高白度色澤小麥品種的選育提供參考資料。

      1 材料與方法

      1.1 材料

      277份小麥品種(系)由湖北省農(nóng)業(yè)科學(xué)院糧食作物研究所提供,分別來自河南、江蘇、湖北、山東、陜西、四川、北京、河北、山西、甘肅、寧夏和安徽等?。ㄊ校?,為近20多年來育成的品種(系),基本反映了各省市的品種特點。因后6省市各自的樣品數(shù)較少 (≤12),本研究中僅列出有關(guān)數(shù)據(jù)提供參考,不進(jìn)行比較分析。

      1.2 葉片DNA的提取

      材料種于湖北省農(nóng)業(yè)科學(xué)院糧食作物研究所試驗田,2016年12月初取材,用CTAB法進(jìn)行葉片DNA的提取,詳細(xì)步驟見參考文獻(xiàn)[11]。每個品種(系)取不同3株小麥的葉片,結(jié)果一致的為準(zhǔn)確數(shù)據(jù),3次結(jié)果不同的繼續(xù)取3株材料,以重復(fù)次數(shù)最多者為最終檢測結(jié)果。

      1.3 分子標(biāo)記檢測

      試驗所用分子標(biāo)記的相關(guān)信息見參考文獻(xiàn)[11]。PCR反應(yīng)體系為10 μL,含2×Es Taq Mater Mix (Dye) 5 μL(康為世紀(jì)生物科技有限公司)、20 μmol/L上下游引物各0.1 μL、10~50 ng DNA模板1 μL。PCR產(chǎn)物用含EB的1%瓊脂糖凝膠電泳后成像分析,YP7B-1標(biāo)記PCR產(chǎn)物1 μL經(jīng)12%非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳后銀染分析。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 1B/1R異位系的分子標(biāo)記檢測

      供試小麥材料分子標(biāo)記檢測結(jié)果見表1所示。對277份材料的1B/1R易位系分析結(jié)果(表2)表明,27.1%的材料為1B/1R易位系。其中河南和陜西材料中1B/1R易位系頻率較高,分別為34.3%和38.1%;江蘇、湖北和山東品種中1B/1R易位系出現(xiàn)頻率較低,分別為15.4%、15.2%和16.7%;四川省與總體頻率相當(dāng)。

      2.2 PPO活性基因的分子標(biāo)記檢測

      PPO18分子標(biāo)記可檢測Ppo-2A位點的2種基因型,即Ppo-A1a和Ppo-A1b;Ppo-2D位點有Ppo-D1a和Ppo-D1b基因型,分別由PPO16和PPO29分子標(biāo)記檢測。這兩個位點控制低PPO活性的基因型是Ppo-A1b和Ppo-D1a,出現(xiàn)頻率分別為53.1%和62.3%,后者比前者高近10%,均略高于相對應(yīng)控制高PPO活性的基因型頻率。低PPO活性Ppo-A1b和Ppo-D1a兩種等位基因在各省份品種中頻率差異較大,河南品種Ppo-A1b頻率很低,僅為28.6%,其他5省品種差異較小,頻率范圍為60.6%~65.0%。等位基因Ppo-D1a在陜西品種中頻率最低,只有14.3%,四川品種中頻率最高,為85.0%,山東中頻率為50%,河南、江蘇和湖北地區(qū)該等位基因頻率差異較小。endprint

      2.3 YP含量相關(guān)基因分子標(biāo)記檢測

      YP7A標(biāo)記可檢測7A位點2種基因型Psy-A1a和Psy-A1b,YP7B-1和YP7B-2分子標(biāo)記可檢測7B位點3種基因型Psy-B1a、Psy-B1b和Psy-B1c。其中等位基因Psy-A1b和Psy-B1b都與低YP含量相關(guān),它們在277份材料中的出現(xiàn)頻率分別是39.7%和55.6%,而在各省間的頻率變化較大。Psy-A1b在河南和山東地區(qū)出現(xiàn)頻率最低,分別為15.7%和13.3%,在江蘇品種中頻率最高,為71.2%,在湖北、四川和陜西品種中頻率遞減,范圍為57.%~66.7%。等位基因Psy-B1b在江蘇品種中頻率卻最低,為25.0%,山東地區(qū)也較低,為36.7%。陜西和河南地區(qū)該基因型頻率較高,分別為81.0%和78.6%。

      Psy-B1c基因型與高YP含量相關(guān),該基因型在各地區(qū)小麥中的頻率都很低,出現(xiàn)頻率范圍為0~9.5%,供試材料中河南和四川品種中未檢測到該基因型。

      2.4 等位變異組合分布情況分析

      Ppo-2A和Ppo-2D位點基因型兩兩組合可形成4種組合類型,等位變異組合Ppo-A1b/Ppo-D1a的PPO活性最低,供試材料中該組合出現(xiàn)頻率為34.7%,高于4種組合類型的平均值25%。在各省份中,四川地區(qū)該組合頻率最高,達(dá)60.0%,而陜西品種頻率最低,為14.3%,與陜西品種中Ppo-D1a的出現(xiàn)頻率相同。Ppo-A1b/Ppo-D1a組合基因型在河南地區(qū)頻率為25.7%,與4種組合類型的平均值25%相當(dāng),其他3省中該組合出現(xiàn)頻率都高于平均值25%。

      PSY基因在7A位點的2種基因型和7B位點的3種基因型兩兩組合可形成6種組合類型,其中等位變異組合Psy-A1b/Psy-B1b對應(yīng)的YP含量最低,該組合在277份小麥品種(系)中出現(xiàn)頻率為22.2%,高于6種組合類型的平均值16.7%。在各省份中,低YP含量組合Psy-A1b/Psy-B1b在陜西地區(qū)頻率最高,為52.4%;四川和湖北次之,分別為50.0%和45.5%;山東地區(qū)最低,只有6.7%;河南和江蘇品種(系)中該組合頻率略低于6種組合類型的平均值16.7%。

      組合類型Ppo-A1b/Ppo-D1a/Psy-A1b/Psy-B1b/non 1B/1R的YP含量和PPO活性相對最低,是篩選優(yōu)良色澤品種的最優(yōu)組合類型。供試材料中該組合類型出現(xiàn)頻率為5.8%,是組合類型平均值2.1%的2倍多;四川地區(qū)頻率最高,達(dá)25.0%;湖北次之,頻率為12.1%,山東品種中最低,未檢測到該組合類型。

      3 小結(jié)與討論

      通過對PPO活性和YP含量相關(guān)基因型的分子檢測,6個省份基因型的出現(xiàn)頻率差異很大。低PPO活性基因型Ppo-A1b出現(xiàn)頻率范圍為28.6%~65.0%,Ppo-D1a頻率范圍為14.3%~85.0%,其組合的基因型頻率范圍在14.3%~60.0%。低YP含量基因型Psy-A1b的頻率范圍為13.3%~71.2%,Psy-B1b的頻率范圍為25.0%~81.0%,其組合的基因型頻率范圍為6.7%~52.4%。因此,為了培育低PPO活性和低YP含量的小麥品種,不同地區(qū)在選育策略上可因地制宜。

      河南品種中控制低PPO活性和低YP含量的4種基因型頻率非常有特點。Ppo-A1b頻率很低,為6個省份中最低,僅28.6%,而Ppo-D1a基因型頻率較高,為77.1%。該結(jié)果與左愛輝等[12]的報道較一致(文獻(xiàn)中Ppo-A1b為27.8%,Ppo-D1a為70.8%)。陳杰等[13]和楊子博等[14]的報道中也證實河南省品種Ppo-A1b頻率很低,分別為28.6%和19.8%,但這兩篇報道中Ppo-D1a的頻率低一些,分別為59.5%和56.0%。河南品種中低YP含量基因型Psy-A1b頻率很低,僅15.7%,但Psy-B1b的分布頻率較高,達(dá)78.6%。因此,河南地區(qū)在育種中需加強(qiáng)Ppo-A1b和Psy-A1b基因型的選擇,就能有效降低品種的PPO活性和YP含量。

      江蘇品種中控制低PPO活性和低YP含量的4種基因型中,僅基因型Psy-B1b頻率為25.0%,在6個省份中墊底,其他3種基因型出現(xiàn)頻率都較高,分別為63.5%、73.1%和71.2%。Ppo-A1b和Ppo-D1a頻率比楊子博等[14]的報道要高些。該省Ppo-A1b/Ppo-D1a、Psy-A1b/Psy-B1b組合類型頻率以及non 1B/1R頻率都高于河南省,但其最優(yōu)組合類型Ppo-A1b/Ppo-D1a/Psy-A1b/Psy-B1b/non 1B/1R卻低于河南省。所以,江蘇品種在增加Psy-B1b基因型選擇的同時,需提高這些優(yōu)良等位基因的聚合。

      湖北品種中1B/1R易位系頻率最低,僅15.2%。低PPO活性和低YP含量相關(guān)4種基因型的出現(xiàn)頻率都比較高,范圍為60.6%~69.7%,Ppo-A1b/Ppo-D1a和Psy-A1b/Psy-B1b組合類型頻率也較高,分別為42.4%和45.5%,只是最優(yōu)組合Ppo-A1b/Ppo-D1a/Psy-A1b/Psy-B1b/non 1B/1R的頻率稍低。因此,湖北品種可進(jìn)一步提高有利基因型的頻率,并加速這些基因型的聚合,從而增強(qiáng)品種色澤品質(zhì)。

      山東品種中Ppo-A1b頻率為63.3%,與陳杰等[13]和楊子博等[14]的報道一致,但等位基因Ppo-D1a的頻率差異較大,本研究中結(jié)果為50.0%,兩篇報道中分別是35.5%和65.7%。山東品種中與低YP含量相關(guān)的Psy-A1b和Psy-B1b基因型出現(xiàn)頻率都很低,分別為13.3%和36.7%,造成Psy-A1b/Psy-B1b組合頻率僅6.7%。郭鳳芝[15]也證實山東品種Psy-A1b頻率很低,為16.67%,因此,山東品種需要著重提高Psy-A1b和Psy-B1b基因型頻率,同時Ppo-D1a基因型頻率也有待提高。endprint

      陜西品種中Ppo-D1a頻率非常低,為14.3%。鄧彪等[16]和付曉潔等[17]的報道中也證實了陜西自育品種中Ppo-D1a的分布較少,頻率分別為32.43%和30.4%。但楊子博等[14]的報道中卻較高,為65.2%,推測這些差異跟供試材料選擇有關(guān)。Psy-A1b和Psy-B1b基因型在陜西品種中頻率較高,分別為57.1%和81.0%。與報道大體一致,頻率范圍在50.0%~67.4%[18,19]。陜西品種中1B/1R易位系頻率也較高,大大降低了最佳組合的出現(xiàn)頻率。因此,陜西地區(qū)需重點關(guān)注Ppo-D1a基因型頻率的提高,并降低易位系頻率,從而增加多個有利基因型的聚合。

      四川品種中4種有利基因型的頻率都較高,特別是Ppo-D1a基因型頻率達(dá)85.0%。陳靜等[20]報道Ppo-D1a頻率為83.6%,與本研究結(jié)果一致。李式昭等[21]的報道中略低,分布頻率為74.3%??梢娝拇ㄆ贩N中Ppo-D1a基因型頻率普遍較高。另外,Ppo-A1b、Psy-A1b和Psy-B1b基因型頻率在這兩篇報道中都低于本研究結(jié)果。4種有利基因型的聚合概率也較高,四川品種Psy-A1b和Psy-B1b基因型頻率都低于湖北品種,但Psy-A1b/Psy-B1b組合的頻率卻高于湖北品種。因此,對于四川品種,可進(jìn)一步提高Ppo-A1b、Psy-A1b和Psy-B1b基因型的頻率。

      綜上所述,四川品種中與低PPO活性及低YP含量相關(guān)基因型頻率都較高,湖北省次之,其他4省各有需要著重選擇的基因型。各省可以根據(jù)上述品種色澤相關(guān)等位基因分布特點制定具體育種策略,并在提高有利基因型頻率的同時,加速有利基因型的聚合,才能更好地改善品種色澤,達(dá)到培育優(yōu)質(zhì)色澤品種的目的。

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