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    運(yùn)動(dòng)緩解與肥胖相關(guān)疾病的作用

    2018-01-25 03:53:10王艷兵左建玲王春光王文霞何玉秀河北北方學(xué)院體育部河北張家口075000
    中國(guó)老年學(xué)雜志 2018年20期
    關(guān)鍵詞:多態(tài)性數(shù)據(jù)庫(kù)核心

    王艷兵 左建玲 王春光 王文霞 何玉秀 (河北北方學(xué)院體育部,河北 張家口 075000)

    肥胖是遺傳因素和多種環(huán)境因素相互作用的結(jié)果,環(huán)境因素包括飲食、壓力及運(yùn)動(dòng)等。肥胖與多系統(tǒng)的疾病都有密切聯(lián)系,如心腦血管疾病、消化系統(tǒng)疾病、糖脂代謝異常及癌癥等。從遺傳學(xué)的角度分析,肥胖及這些相關(guān)疾病是多基因控制的性狀,尋找與這些性狀相關(guān)的核心基因,將有助于有效控制肥胖及肥胖引起的各種疾病。

    運(yùn)動(dòng)是目前提倡較多的能降低肥胖及減輕相關(guān)疾病癥狀的方式之一。van Tienen等〔1〕通過(guò)基因芯片檢測(cè)了運(yùn)動(dòng)前后2型糖尿病患者基因表達(dá)量的變化,分析了運(yùn)動(dòng)對(duì)患者的作用途徑。Liu等〔2〕利用基因芯片技術(shù)檢測(cè)了運(yùn)動(dòng)前后冠狀動(dòng)脈患者基因表達(dá)量的變化,總結(jié)了運(yùn)動(dòng)對(duì)冠狀動(dòng)脈患者的作用。本文初步探討運(yùn)動(dòng)對(duì)緩解與肥胖相關(guān)疾病的輔助作用。

    1 材料與方法

    1.1 肥胖及與肥胖相關(guān)疾病的基因集 從肥胖相關(guān)基因數(shù)據(jù)庫(kù) T-HOD〔3〕、2型糖尿病相關(guān)基因數(shù)據(jù)庫(kù)T2DGADB〔4〕及冠狀動(dòng)脈相關(guān)基因數(shù)據(jù)庫(kù) CADgene〔5〕獲得與肥胖、糖尿病及冠狀動(dòng)脈疾病相關(guān)的基因并形成基因集合,比較并獲得肥胖及與肥胖相關(guān)疾病的重疊基因。

    1.2 蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)分析 將2型糖尿病及冠狀動(dòng)脈基因作為種子節(jié)點(diǎn)輸入到STRING10.0〔6〕數(shù)據(jù)庫(kù),選取交互作用評(píng)分大于0.9(最高等可信度)的互作關(guān)系構(gòu)建蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)(PPI)。網(wǎng)絡(luò)分析采用生物圖表可視化工具Cytoscape3.2.1軟件〔7〕,且利用“Network Analyzer”工具對(duì)各節(jié)點(diǎn)的“度”進(jìn)行計(jì)算?!岸取贝砹伺c目標(biāo)蛋白相互作用蛋白的數(shù)量,網(wǎng)絡(luò)中,節(jié)點(diǎn)越大,“度”越大。核心基因的選擇閾值為:中介中心性(BC)>0.05 和“度”>50〔8〕。

    1.3 運(yùn)動(dòng)對(duì)2型糖尿病及冠狀動(dòng)脈患者作用的初步評(píng)價(jià) 本文分析van Tienen等〔1,2〕研究的運(yùn)動(dòng)前后2型糖尿病和冠狀動(dòng)脈患者的差異基因,并與篩選出的肥胖、2型糖尿病和冠狀動(dòng)脈相關(guān)基因進(jìn)行比較。

    2 結(jié)果

    2.1 肥胖、2型糖尿病、冠狀動(dòng)脈基因及網(wǎng)絡(luò)分析在3個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)中分別得到了835個(gè)與肥胖相關(guān)的基因、530個(gè)與2型糖尿病相關(guān)的基因、604個(gè)與冠狀動(dòng)脈相關(guān)的基因,分別在STRING10.0蛋白相互作用數(shù)據(jù)庫(kù)中構(gòu)建了作用網(wǎng)絡(luò),網(wǎng)絡(luò)中包括826個(gè)肥胖種子基因、421個(gè)2型糖尿病種子基因及599個(gè)冠狀動(dòng)脈種子基因。通過(guò)Cytoscape3.2.1軟件中的“Network Analyzer”工具得到3個(gè)與冠狀動(dòng)脈相關(guān)的核心基因(SRC、IL6、TP53)及2個(gè)與2型糖尿病相關(guān)的核心基因(AKT1、INS)。通過(guò)篩選重疊基因得到131個(gè)與2型糖尿病和冠狀動(dòng)脈都相關(guān)的基因(ABCA1,ACE,ADIPOQ,ADIPOR2,ADRA2B,ADRB1,ADRB2ADRB3,AGER,AGT,AGTR1,AHSG,AKR1B1,APOA1,APOA2,APOA5,APOB,APOC3,APOE,APOM,CAPN10,CCL2,CCR5,CD14,CD36,CDKN1C,CDKN2A,CDKN2B,CETP,CHI3L1,CRP,CX3CR1,CXCL5,CXCR4,CYP11B2,DIO2,ENPP1,EPHX2,ESR1,F(xiàn)3,F(xiàn)7,F(xiàn)ABP2,F(xiàn)ABP3,F(xiàn)ABP4,F(xiàn)OXO1,F(xiàn)TO,GCK,GCKR,GHRL,GHSR,GLO1,GNB3,GSTM1,GSTT1,GYS1,HFE,HIF1A,HMOX1,HNF1A,HSD11B1,ICAM1,IFNG,IGF1,IL10,IL1B,IL1RN,IL4,IL6,IL6R,IRS1,IRS2,ITGB3,KCNQ1,KL,KLF14,KLF2,KLF5,LDLR,LEP,LIPC,LMNA,LPL,LRP6,LTA,MIF,MMP1,MMP12,MTHFR,MTTP,NAMPT,NOS1AP,NOS3,NPPB,NPY,NR1H3,NR3C1,PDX1,PECAM1,PON1,PON2,PPARA,PPARD,PPARG,PPARGC1A,PRKG2,PTEN,PTGIS,PTGS2,PTPN22,RBP4,RETN,SELE,SHBG,SLC8A1,SOD1,SOD2,SOD3,SREBF1,STAT4,THBS2,TLR4,TNF,TNFRSF4,UCP2,USF1,UTS2,VDR,VEGFA,VWF,WRN,XRCC1),將該 131個(gè)節(jié)點(diǎn)蛋白構(gòu)建蛋白網(wǎng)絡(luò)(圖1),共包括1 054條相互作用,其中包括93個(gè)肥胖基因(ABCA1,ACE,ADIPOQ,ADIPOR2,ADRA2B,ADRB1,ADRB2,ADRB3,AGT,AHSG,APOA1,APOA2,APOA5,APOB,APOC3,APOE,CAPN10,CCL2,CD14,CD36,CDKN2B,CETP,CRP,CXCL5,DIO2,ENPP1,ESR1,F(xiàn)3,F(xiàn)ABP2,F(xiàn)ABP4,F(xiàn)OXO1,F(xiàn)TO,GCK,GCKR,GHRL,GHSR,GNB3,GSTM1,HFE,HIF1A,HMOX1,HNF1A,HSD11B1,ICAM1,IFNG,IGF1,IL10,IL1B,IL1RN,IL4,IL6,IL6R,IRS1,IRS2,KLF2,LDLR,LEP,LIPC,LPL,LTA,MIF,MMP12,MTHFR,MTTP,NAMPT,NOS3,NPPB,NPY,NR1H3,NR3C1,PDX1,PON1,PON2,PPARA,PPARD,PPARG,PPARGC1A,PTEN,PTGS2,RBP4,RETN,SELE,SHBG,SOD1,SREBF1,STAT4,TLR4,TNF,UCP2,USF1,UTS2,VDR,VEGFA)。

    2.2 運(yùn)動(dòng)對(duì)2型糖尿病患者及冠狀動(dòng)脈患者基因的影響及分析 將Liu等〔2〕篩選到的運(yùn)動(dòng)前后冠狀動(dòng)脈患者的差異表達(dá)基因,與本文篩選到的冠狀動(dòng)脈基因進(jìn)行比較,沒(méi)有發(fā)現(xiàn)重疊基因,但與肥胖基因進(jìn)行比較,得到 3個(gè)重疊基因:STAT3、PRKAR2B、INSR。將van Tienen等〔1〕篩選到的運(yùn)動(dòng)前后2型糖尿病患者的差異表達(dá)基因與本文篩選到的2型糖尿病基因進(jìn)行比較,發(fā)現(xiàn) 3 個(gè)重疊基因:RAPGEF1、IRS2、PIK3CB,與肥胖基因進(jìn)行比較,得到6個(gè)重疊基因:IRS2、PIK3CB、MAPK3、PFKFB3、GLUL、NOS1。但這些重疊基因都不屬于核心基因。

    3 討論

    核心基因是構(gòu)成網(wǎng)絡(luò)的關(guān)鍵點(diǎn),對(duì)蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)至關(guān)重要,在某種程度上可能是某種疾病發(fā)生過(guò)程中最主要的靶點(diǎn)之一。本文結(jié)果顯示2型糖尿病網(wǎng)絡(luò)中的核心基因?yàn)锳KT1和前胰島素原INS,這兩個(gè)基因與肥胖相關(guān)。冠狀動(dòng)脈網(wǎng)絡(luò)中的核心基因?yàn)?SRC、IL6、TP53,其中IL6和TP53與肥胖相關(guān)。AKT1是一種絲氨酸/蘇氨酸激酶,促進(jìn)細(xì)胞的生長(zhǎng)和存活,但最近也有很多研究證明AKT1在能量代謝途徑中發(fā)揮作用,說(shuō)明該基因可以作為治療肥胖的靶基因目標(biāo)之一〔9,10〕。轉(zhuǎn)基因鼠中AKT1的活化可以促進(jìn)葡萄糖代謝,降低與年齡有關(guān)的脂肪累積,顯著降低肥胖,同時(shí)這些動(dòng)物還表現(xiàn)出代謝參數(shù)的變化,如胰島素敏感性提高,血糖和瘦素濃度降低〔9,11〕。INS的多態(tài)性與 2型糖尿病的易感性有關(guān)〔12〕,且永久性的新生兒糖尿病與INS基因的突變有關(guān)〔13〕。研究發(fā)現(xiàn)人體中刪除INS基因的純合體會(huì)引發(fā)新生兒短暫性糖尿病,而刪除INS基因的雜合體成年后會(huì)發(fā)展為胰島素依賴性個(gè)體〔14〕。肥胖青少年體內(nèi)INS基因的串聯(lián)重復(fù)序列作為一種數(shù)量性狀基因位點(diǎn),影響葡萄糖誘導(dǎo)的胰島素生理功能〔15〕。Maitra 等〔16~18〕通過(guò)研究亞洲印度家庭成員IL6基因的多態(tài)性在早發(fā)冠狀動(dòng)脈急性期蛋白表達(dá)量的變化,發(fā)現(xiàn)在早發(fā)冠狀動(dòng)脈疾病IL6基因的多態(tài)性是一種很重要的遺傳影響因素,且該基因的變異與肥胖也有很大的相關(guān)性。Caamano等〔19〕通過(guò)對(duì)智利的個(gè)體研究發(fā)現(xiàn),TP53基因的多態(tài)性與冠狀動(dòng)脈相關(guān)聯(lián),而有關(guān)TP53與肥胖關(guān)系的研究還很少。

    運(yùn)動(dòng)是提倡較多的一種健身方式,有規(guī)律的運(yùn)動(dòng)在生理和心理兩方面促進(jìn)人類的健康。本文結(jié)果發(fā)現(xiàn)運(yùn)動(dòng)干預(yù)后2型糖尿病患者的差異表達(dá)基因與該病相關(guān)基因有重疊,與肥胖基因也有重疊,盡管這些基因在網(wǎng)絡(luò)中都不屬于核心基因,但也說(shuō)明運(yùn)動(dòng)在2型糖尿病中發(fā)揮了一定作用。而運(yùn)動(dòng)干預(yù)后冠狀動(dòng)脈患者的差異表達(dá)基因只與3個(gè)肥胖基因匹配,與該病相關(guān)基因沒(méi)有交叉,間接證明運(yùn)動(dòng)只是通過(guò)降低肥胖對(duì)一些與肥胖相關(guān)的疾病起到提前預(yù)防的作用,而對(duì)已發(fā)生冠狀動(dòng)脈患者在治療上起到的輔助作用還有待進(jìn)一步驗(yàn)證。

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