梁媛 蘭冬雪 程吉云
摘 要:在本文中,主要介紹NBS型抗病基因的進(jìn)展,NBS型抗病基因的共線性非常低。 原因可能是NBS抗性基因之一在進(jìn)化過程中導(dǎo)致基因丟失;NBS抗病基因進(jìn)化太快,這可能導(dǎo)致植物病害抗性基因的很大程度的遺傳差異,NBS疾病抗性基因作為一個(gè)很大的基因,也是近幾年植物病害抗性基因和分子育種研究熱點(diǎn)。
關(guān)鍵詞:植物;禾本科;抗病基因;核苷酸結(jié)合位點(diǎn)
中圖分類號:S184 文獻(xiàn)標(biāo)識碼:A DOI:10.11974/nyyjs.20171233036
禾本科植物需要抵抗細(xì)菌,病毒,真菌等,可以起到保護(hù)自己的作用,有時(shí)還有其他動(dòng)物攻擊,禾本科植物又不能移動(dòng),所以不能逃脫,禾本科植物為了適應(yīng)這種環(huán)境,有必要抵抗性基因侵襲,植物抗病基因在預(yù)防疾病和動(dòng)物入侵中起著非常大的作用,也是產(chǎn)品的長期存活。NBS-LRR抗性基因是其編碼蛋白質(zhì)的特征之一,其特征在于含有對病毒,真菌,線蟲,細(xì)菌和昆蟲具有抗性的富含亮氨酸的重復(fù)序列(LRR)和核苷酸結(jié)合位點(diǎn)(NBS)的序列。
1 NBS型抗病基因介紹
抗病基因幾乎屬于NBS-LRR類型,在基因編碼蛋白N端附近存在NBS結(jié)構(gòu)域,又叫做NB-ARC結(jié)構(gòu)域,其功能是結(jié)合和水解ATP。在近C端則由LRR結(jié)構(gòu)域組成,能夠?qū)π盘柧哂凶R別作用,有專家研究得出與病原無毒基因直接識別為LRR結(jié)構(gòu)域[1]。通過與基因組對比,禾本科基因組估計(jì)約存在549個(gè)NBS-LRR基因,水稻基因組中約存在480個(gè),楊樹基因組中約存在300個(gè)。NBS-LRR類基因在植物所有基因中占有1%~2%,屬于比較大的一類基因。NBS區(qū)域經(jīng)常被廣泛地用于植物抗病基因的識別和分類,該區(qū)域包含一些非常保守的基序[2]。
2 NBS基因在禾本科植物基因組中的進(jìn)化模式
根據(jù)NBS前端的結(jié)構(gòu)不一樣,研究得出,NBS-LRR在植物中編碼的基因(簡稱NBS-LRR基因)主要分為2類,TIR-NBS-LRR型基因,簡稱TNL型基因,編碼的蛋白質(zhì)在N末端含有TIR區(qū)域,TNL型基因可能參與信號轉(zhuǎn)導(dǎo)并通過脂肪酶EDS1起到一定的作用。已發(fā)現(xiàn)的TNL基因主要存在于雙子葉植物中[3,4]。
3 NBS基因在禾本科植物中的快速進(jìn)化
R基因在植物病害抗性和病原體應(yīng)答中起重要作用。一些專家已經(jīng)表明,在4個(gè)禾本科植物的NBS-LRR基因中,R位點(diǎn)的核苷酸甚至從一個(gè)位點(diǎn)的進(jìn)化仍然是顯著的。其中,玉米基因組NBS-LRR基因甚少,對于水稻基因1/5,小于其他2個(gè)[5]。但玉米基因組(2,300Mb)明顯大于高粱(730MB)(distachyon(350Mb),表明基因組總數(shù)和NBS(或NBS-LRR)不是直接相關(guān)基因的擴(kuò)增,另外NBS在整個(gè)基因組中-RRR的總數(shù)和編碼蛋白質(zhì)的基因總數(shù)也不直接相關(guān)。玉米,高粱,短柄草和水稻基因組中已經(jīng)測序了約32,504,35,899,32,25,37,544個(gè)基因。 NBS-LRR基因分別占4種預(yù)測蛋白的0.40%,0.68%,0.74%和1.35%,而LRK基因接近4種(0.65,0.65,0.61,0.82%)。這些結(jié)果表明,NBS編碼的蛋白質(zhì)數(shù)量與預(yù)測蛋白質(zhì)數(shù)量成正比,玉米基因組中NBS-LRRs的絕對和相對數(shù)量明顯低于其他2個(gè)物種[6]。
4 展望
根據(jù)目前抗病基因研究,一些專家認(rèn)為,NBS-LRR抗病基因通過共同進(jìn)化和分娩過程進(jìn)化演變,抗病基因主要是這2種抗病機(jī)制。到目前為止,對單個(gè)物種進(jìn)行了基因組水平的疾病抗性基因進(jìn)化研究,還對水稻,高粱,小穗和玉米的4個(gè)基因進(jìn)行了系統(tǒng)發(fā)育分析。并獲得了禾本科植物抗病基因的進(jìn)化特征。
參考文獻(xiàn)
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[3]丁菁,NBS基因在禾本科植物基因組中的進(jìn)化模式[D].南京大學(xué),2012.
[4]陳德西.抗稻瘟病基因pi-d2導(dǎo)入水稻提高稻瘟病抗性和一份條斑和穎花異常水稻突變體研究[D].四川農(nóng)業(yè)大學(xué),2007.
[5]林勇翔.豆科和禾本科植物熱激轉(zhuǎn)錄因子基因家族的分子進(jìn)化研究[D].安徽農(nóng)業(yè)大學(xué),2013.
[6]陳秋玲,高建明,羅峰,等.分子標(biāo)記技術(shù)在禾本科作物基因定位上的研究進(jìn)展[J].中國農(nóng)學(xué)通報(bào),2010(9):42-48.
作者簡介:梁媛(1990-),女,碩士在讀,研究方向:植物進(jìn)化生態(tài)學(xué);戚曉利(1971-),女,黑龍江佳木斯人,教授,博士研究生,研究方向:生物化學(xué)與分子生物學(xué)。endprint