基于SSR標記的21份粵糖甘蔗品種遺傳多樣性分析

石祥鵬

摘要：選用21對多態(tài)性高的引物時21份粵糖系列甘蔗材料進行SSR標記分析和遺傳多樣性分析。結果表明，擴增條帶數共134，多態(tài)性條帶數116，平均多態(tài)性條帶5.5238，每個位點有效等位基因數（Ne）為

1.3 420，Net's基因多樣性（H） h 0.2181， Shannon信息指數（I））} 0.3463 0依據Jaccard相似系數進行UPGMA聚類，可將21份材料分為A和B兩大類群，A類群中只有粵引8號，表明粵引8號材料相比較而言與其他材料存在較大差異。

關鍵詞：甘蔗;粵糖系列;遺傳多樣性;SSR

甘蔗是世界上主要的食糖原料，近年來，多位研究人員在親本親緣關系和遺傳多樣性方面作出評價，劉新龍對63份云南育種機構常用的甘蔗親本和10份甘蔗原始親本進行遺傳多樣性評價，結果表明中國大陸地區(qū)既是主栽品種又是親本的材料表現(xiàn)出較近的親緣關;SSR（simple sequence repeat）分子標記具有共顯性、多態(tài)性高、成本低等優(yōu)點，在遺傳多樣性評價方面得到了廣泛應用。

因此本研究選用21對多態(tài)性高的引物對21份粵糖系列甘蔗材料進行SSR標記分析，旨在比較材料間的遺傳差異，為今后甘蔗品種選育以及新品種的引進提供重要參考。1材料和方法

1.1 材料

以廣州測試分中心常用的粵糖系列甘蔗共21份為研究材料，見表1

1.2 葉片DNA提取

選取親本材料幼嫩葉片，采用CTAB法提取葉片基因組DNA，一20℃保存?zhèn)溆谩?/p>

1.3 數據統(tǒng)計分析

對SSR引物擴增條帶進行統(tǒng)計，建立“0-1”矩陣，應用NTSYSpc

2.1 0e軟件計算各材料間的Jaccard遺傳相似性系數（GS），使用UPGMA構建聚類圖。應用Popgen軟件計算有效等位基因數（Ne），Nei' s基因多樣性（H），Shannon信息指數（I）。2結果和分析

2.1 引物篩選和多態(tài)性條帶分析

分析結果得出擴增條帶134條，多態(tài)性條帶數116條，多態(tài)性條帶比例86.57%，每個引物平均擴增條帶數6.3810，平均多態(tài)性條帶5.5238，每個位點有效等位基因數（Ne）為

1.3 420，Nei' s基因多樣性（H）為0.2181，Shannon信息指數（1）為0.3463。說明本測試中心粵糖系列甘蔗品種SSR位點多態(tài)性屬于較高水平，各材料間遺傳差異屬于中等水平。

2.2 聚類分析

依據Jaccard相似系數，針對21份粵糖系列材料進行UPGMA聚類（見圖1），可將21份材料分為A和B兩大類群，A類群中只有粵引8號，表明粵引8號材料相比較而言與其他材料存在較大差異;B類群劃分為BI、B2兩類，BI類群中5份材料又劃分為兩類B1一1，B1-2兩類;聚類圖中粵糖57-423和粵糖59-264兩份材料有著共同的親本材料F108，且二者在相似系數局0.86左右聚為一類，表明二者確實存在相近的血緣關系。3討論

通過本研究分析發(fā)現(xiàn)，粵引8號材料與其他材料間存在較大遺傳分化，其親本由“CP72-370 X LCP82-89”兩個美國品種選育而成，因此外國品種的引進可以有效地擴大品種的遺傳基礎。

參試材料中粵糖54-143（F108 X F134）和粵糖57-423 （F108 X F134）二者具有相同的親本來源本無遺傳差異或有較小的遺傳差異而聚為一類，根據聚類圖上結果顯示，二者存在相對較大的遺傳差異，前人的研究中也出現(xiàn)類似情況，吳海蘭等（2014）研究發(fā)現(xiàn)云蔗81一173和桂糖11都是“Co419 X CP49一50”組合的后代卻分別聚在了兩類，因甘蔗是高度雜合的異源多倍體植物，致使其自交、雜交和回交后代出現(xiàn)了高度分離現(xiàn)象。

從整體來看，粵糖系列甘蔗材料間存在著較大的遺傳相似系數，遺傳差異性已相對較小，具體原因為粵糖系列甘蔗雖為華南地區(qū)甘蔗主栽品種，常被選做親本與其他材料雜交選育新品種，其血緣已融入后代材料中。因此粵糖系列甘蔗需通過引進外來優(yōu)良種質拓寬其遺傳基礎。

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