呼和浩特地區(qū)蒙古族人群19個(gè)STR基因座遺傳多態(tài)性

朱永強(qiáng)+莫日根+王月星+張文廣

本文應(yīng)用Goldeneye DNA身份鑒定系統(tǒng)20A擴(kuò)增試劑盒對(duì)呼和浩特地區(qū)346名蒙古族無(wú)關(guān)健康個(gè)體的血樣進(jìn)行19個(gè)STR基因座的復(fù)合擴(kuò)增、聯(lián)合檢測(cè)，并利用AB3130XL遺傳分析儀對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行檢測(cè)，用GeneMapper ID 3.2軟件進(jìn)行電泳后的基因分型，分型數(shù)據(jù)經(jīng)過(guò)統(tǒng)計(jì)分析，最終獲得呼和浩特地區(qū)蒙古族群體19個(gè)STR基因座的遺傳多態(tài)信息，完善了本地人群數(shù)據(jù)庫(kù)，為本地區(qū)蒙古族群體法醫(yī)學(xué)個(gè)體識(shí)別、親權(quán)鑒定中運(yùn)用相關(guān)參數(shù)提供了依據(jù)和可靠的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。

一、材料與方法

（一）樣本來(lái)源

本實(shí)驗(yàn)所使用的樣本是根據(jù)知情同意的原則，采集生活居住在呼和浩特地區(qū)的蒙古族無(wú)關(guān)健康個(gè)體血樣346份，其中男性286份，女性60份。以上樣本均系本實(shí)驗(yàn)室DNA數(shù)據(jù)庫(kù)和日常受理案件積累。

（二）DNA提取及分型檢驗(yàn)

本實(shí)驗(yàn)采用Chelex-100法[1]提取個(gè)體血樣的DNA，并使用Goldeneye TM身份檢定系統(tǒng)20A擴(kuò)增試劑盒對(duì)提取的DNA模板進(jìn)行19個(gè)STR 基因座復(fù)合擴(kuò)增。按照商品試劑盒提供的試驗(yàn)配比，配制10 μl 的PCR反應(yīng)體系。用3130XL型遺傳分析儀進(jìn)行毛細(xì)管電泳，電泳結(jié)束后使用Genemapper ID V3.2軟件，進(jìn)行基因分型。

（三）統(tǒng)計(jì)學(xué)處理

采用法醫(yī)學(xué)統(tǒng)計(jì)軟件Modified-PowerState V12分析軟件[2]對(duì)實(shí)驗(yàn)獲得的數(shù)據(jù)結(jié)果進(jìn)行分析，統(tǒng)計(jì)出各基因座的等位基因頻率、雜合度（H）、個(gè)人識(shí)別能力（DP）、多態(tài)信息含量（PIC）、非父排除率（PE）和匹配概率（Pm）等群體遺傳學(xué)參數(shù)。

根據(jù)以上獲得的數(shù)據(jù)，運(yùn)用相應(yīng)公式[3，4]計(jì)算出19個(gè)STR基因座的累積個(gè)體識(shí)別率（TDP），累積非父排除率（CEP），并用χ 2檢驗(yàn)各STR基因座是否符合Hardy—Weinberg平衡。

二、結(jié)果與討論

呼和浩特地區(qū)蒙古族群體346名無(wú)關(guān)個(gè)體在19個(gè)STR基因座共檢出217個(gè)等位基因和763種基因型。經(jīng)χ 2檢驗(yàn)，19個(gè)STR基因座分布均符合Hardy—Weinberg平衡定律（P>0.05）；各等位基因及其分布頻率見(jiàn)表1，相關(guān)遺傳學(xué)參數(shù)見(jiàn)表2。

本文發(fā)現(xiàn)本次呼和浩特地區(qū)蒙古族346名無(wú)關(guān)個(gè)體的調(diào)查檢測(cè)中，19個(gè)基因座共檢出217個(gè)等位基因和763種基因型。其中19個(gè)STR基因座中，檢出等位基因最多的基因座為PentaE，共計(jì)20個(gè)，其次為D21S11和D18S51，均為17個(gè)，等位基因最少的為TPOX、D16S539、TH01和D13S317，均為7個(gè)；D3S1358為8個(gè)， CSF1PO、D8S1179、D7S820、D5S818和vWA均有9個(gè)等位基因； Penta D有11個(gè)；D19S433有12個(gè)；D2S1338有13個(gè)；D12S391有14個(gè)；D6S1043和FGA均為16個(gè)等位基因。

這19個(gè)STR基因座中檢測(cè)中，測(cè)得頻率最高的等位基因?yàn)門POX的等位基因8 （ 0.5448 ），其它依次為TH01的等位基因9（0.4913）；CSF1PO的12 （0.3887）； D3S1358的15 （0.3627）； D7S820的11（ 0.3454）； D16S539的9（0.3338 ）；D5S818的11 （0.3295）。19個(gè)STR基因座單基因頻率最小為0.0014，最大為0.5448。

19個(gè)STR基因座個(gè)體識(shí)別力DP值最大為PentaE （0.9860），最小為TPOX（0.7881） ；雜合度H值最大為Penta E （0.9220），最小為TPOX（ 0.5838）； 認(rèn)為DP>0.9， H>0.7的基因座為具有高鑒別力的基因座[5]，根據(jù)表2可見(jiàn)，本次調(diào)查的19個(gè)STR基因座除了CSF1PO，D3S1358，TPOX和TH01四個(gè)基因座的DP值在0.7881至0.8801之間，H值在0.5838至0.7514之間，其多態(tài)性偏低，鑒別力較弱，信息量較少外，其余15個(gè)STR基因座都為高雜合度、高多態(tài)性、高信息量、高鑒別力的基因座。

本次呼和浩特地區(qū)蒙古族346名無(wú)關(guān)個(gè)體的調(diào)查檢測(cè)中，19個(gè)STR基因座多態(tài)性信息含量PIC值最大為PentaE（0.9151），最小為TPOX（0.5494）； 19個(gè)STR基因座非父排除率PE值最高為基因座PentaE（0.8405），最小為TPOX（0.2719）；匹配概率Pm最高的為TPOX（0.2119），最小的為PentaE（0.0140）。

本次呼和浩特地區(qū)蒙古族346名無(wú)關(guān)個(gè)體的調(diào)查檢測(cè)中，19個(gè)STR基因座累積匹配率為1.594×10-23； 19個(gè)STR基因座的累積個(gè)體識(shí)別率TDP大于99.99999999999999999999%，19個(gè)STR基因座累積非父排除率CPE達(dá)0.999999990743111，在呼和浩特地區(qū)蒙古族人群中，該19個(gè)STR基因座構(gòu)成的檢測(cè)系統(tǒng)可以滿足該群體個(gè)體識(shí)別和親權(quán)鑒定的需要，在該群體中具有高度多態(tài)性。

經(jīng)χ 2檢驗(yàn)，本次研究中所使用的19個(gè)STR基因座，其19個(gè)基因座的P值均大于0.05，均符合Hardy—Weiberg平衡。

觀察19個(gè)STR基因座，在D12S391、D21S11、D6S1043、D18S51、D7S820和D2S1338共6個(gè)基因座上共檢出9個(gè)微變異等位基因。這些特殊位點(diǎn)等位基因按Jhon M. Butler法[6，7]確定、命名， 由表1可知，這些微變異等位基因的頻率均小于0.0100。

劉淑萍等[46]對(duì)中國(guó)蒙古族群體（內(nèi)蒙古土默特左旗）6個(gè)STR基因座（vWA、FGA、Penta E、D6S1043、D2S1772、D7S3048）的遺傳多態(tài)性進(jìn)行調(diào)查的結(jié)果顯示，其DP值在0.9160～0.9826，H值在0.7945～0.9234之間，PIC值在0.7617～0.9161之間。本文與之比較，19個(gè)基因座中與之相同的基因座的DP值、H值、PIC值略有差異，但本文除與之相同的四個(gè)基因座（vWA、FGA、Penta E、D6S1043）外，另外增加了15個(gè)基因座檢出了更多的等位基因，更多的基因型，獲得了更多的群體遺傳學(xué)基礎(chǔ)信息。endprint

參考文獻(xiàn)：

[1] walsh P S， Metzger D A， Higuchi R. Chelex-100 as a medium for simple extraction of DNA for PCR-based typing from forensic material[J]. Biotechniques， 1991，10（4）：506-513.

[2]趙方，伍新堯，蔡貴慶等. Modified-Powerstates軟件在法醫(yī)生物統(tǒng)計(jì)中應(yīng)用[J]. 中國(guó)法醫(yī)學(xué)雜志，2003，（05）：297-298+312.

[3] Fisher RA. Standard Calculation for evaluating a blood group system[J]. Heredity， 1951，5：95-97.

[4]Odelberg SJ ， White R. Repetitive DNA：Molecular Structure， Polymorphism， and forensic application[A]. In： DNA and other polymorphisms in forensic science[M].lst ed. Chicago： Year book medical publishers Inc， 1990，26-28.

[5] Gill P. A new method of STR interpretation using inferential logie development of a criminal intelligence database[J].Int J LegMed， 1996， 109：14.

[6]Gill P. A new method of STR interpretation using inferential logie development of a criminal intelligence database[J].Int J LegMed， 1996， 109：14.

[7] John M. Butler（侯一平，劉雅誠(chéng)，譯）.法醫(yī)DNA分型STR遺傳標(biāo)記的生物學(xué)、方法學(xué)及遺傳學(xué)[M].北京：科學(xué)出版社，2007：99-100， 107-109，353.

[46]劉淑萍，畢力夫，蘇秀蘭. 中國(guó)蒙古族群體六個(gè)短串聯(lián)重復(fù)序列位點(diǎn)的遺傳多態(tài)性[J]. 中華醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)雜志，2005，（02）：222-223.

【作者簡(jiǎn)介】朱永強(qiáng)，男，漢族，法醫(yī)師，學(xué)士學(xué)位，主要從事法醫(yī)DNA檢驗(yàn)工作。endprint