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      人殺菌/滲透增強(qiáng)蛋白N端功能片段基因突變文庫(kù)的構(gòu)建和鑒定

      2017-12-19 00:31:23李晶琴孔慶利安云慶
      關(guān)鍵詞:改組文庫(kù)易錯(cuò)

      李晶琴 孔慶利 安云慶*

      (1.首都醫(yī)科大學(xué)燕京醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)學(xué)系,北京 101300;2.首都醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院免疫學(xué)系,北京 100069)

      ·基礎(chǔ)研究·

      人殺菌/滲透增強(qiáng)蛋白N端功能片段基因突變文庫(kù)的構(gòu)建和鑒定

      李晶琴1孔慶利2安云慶2*

      (1.首都醫(yī)科大學(xué)燕京醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)學(xué)系,北京 101300;2.首都醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院免疫學(xué)系,北京 100069)

      目的為提高殺菌/滲透性增強(qiáng)蛋白N端功能片段BPI23對(duì)內(nèi)毒素(lipopolysaccharides,LPS)的親和性,通過(guò)易錯(cuò)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,PCR)和DNA改組技術(shù),對(duì)其編碼序列BPI600進(jìn)行突變,在大腸桿菌XL10-Gold中構(gòu)建BPI600基因突變體庫(kù)。方法通過(guò)控制Mg2+和Mn2+的濃度進(jìn)行易錯(cuò)PCR,獲得BPI600隨機(jī)突變基因片段,經(jīng)測(cè)序和基因比對(duì),確定BPI600的隨機(jī)突變率。再對(duì)易錯(cuò)PCR產(chǎn)物進(jìn)行DNA改組,將改組產(chǎn)物克隆至pYD1載體中,轉(zhuǎn)化大腸桿菌XL10-Gold,從Amp抗性(Luria-Bertani,LB)固體培養(yǎng)平板上任選10個(gè)單菌落,增菌后提取質(zhì)粒,得到pYD1-shuffledBPI600重組質(zhì)粒,將質(zhì)粒進(jìn)行HindⅢ/XhoⅠ酶切鑒定,取5個(gè)陽(yáng)性質(zhì)粒進(jìn)行DNA測(cè)序,通過(guò)基因和氨基酸比對(duì)鑒定突變情況。結(jié)果測(cè)序和基因比對(duì)顯示,BPI600經(jīng)易錯(cuò)PCR所獲突變文庫(kù)的隨機(jī)突變率達(dá)2.3%;改組后重組質(zhì)粒的酶切結(jié)果表明,在隨機(jī)選擇的10個(gè)菌落所提質(zhì)粒中,有6個(gè)含BPI600,表明構(gòu)建了重組質(zhì)粒pYD1-shuffledBPI600;在5個(gè)陽(yáng)性質(zhì)粒中,有4個(gè)重組質(zhì)粒的BPI23編碼序列分別發(fā)生了6、9、11和14個(gè)堿基突變;1個(gè)不僅有10個(gè)堿基突變,還存在1個(gè)堿基的缺失。氨基酸比對(duì)表明,有2個(gè)質(zhì)粒(分別有6和14個(gè)堿基突變)具有正確的讀碼框,能夠翻譯完整的蛋白質(zhì),各有4或14個(gè)氨基酸突變。3個(gè)質(zhì)粒因含終止密碼子而不能表達(dá)完整目的蛋白。結(jié)論成功構(gòu)建pYD1-shuffledBPI600重組質(zhì)粒,獲得庫(kù)容量為2×105的突變文庫(kù),為高內(nèi)毒素親和力突變體的篩選奠定了基礎(chǔ)。

      人殺菌/滲透增強(qiáng)蛋白;定向進(jìn)化;易錯(cuò)PCR;DNA改組

      殺菌/滲透增強(qiáng)蛋白(bactericidal/permeability increasing protein,BPI)是生物體內(nèi)存在的一種陽(yáng)離子抗菌蛋白,BPI及其功能性N端片段BPI23具有廣譜殺傷包括耐藥菌株在內(nèi)的革蘭陰性菌以及中和內(nèi)毒素的作用[1],在臨床上具有較大的應(yīng)用前景。

      為進(jìn)一步提高BPI23與內(nèi)毒素的親和性和抗感染效果,本實(shí)驗(yàn)在前期構(gòu)建的pYD1-BPI600重組質(zhì)粒的基礎(chǔ)上,對(duì)BPI N端功能片段BPI23的編碼序列BPI600進(jìn)行定向進(jìn)化。蛋白質(zhì)定向進(jìn)化可以模擬自然進(jìn)化的過(guò)程(隨機(jī)突變或重組),通過(guò)人為地改變反應(yīng)條件,在體外進(jìn)行基因的突變或重組,以構(gòu)建突變體庫(kù)并從中篩選出理想突變體。易錯(cuò)PCR(error-prone polymerase chain reaction,EP-PCR)和DNA改組(DNA shuffling)是目前常用的定向進(jìn)化技術(shù)[2]。易錯(cuò)PCR基于Taq DNA聚合酶不具備3′→5′外切酶活性,缺乏校對(duì)功能,故在DNA擴(kuò)增過(guò)程中會(huì)發(fā)生錯(cuò)誤摻入而引起突變[3]。DNA改組是將親本基因進(jìn)行盡可能多的組合,最終獲得大容量基因突變體庫(kù)的技術(shù)[4]。本實(shí)驗(yàn)通過(guò)易錯(cuò)PCR和DNA改組技術(shù),構(gòu)建了大容量的BPI600突變體庫(kù),為優(yōu)勢(shì)突變體的篩選打下基礎(chǔ)。

      1 材料與方法

      1.1 材料

      1.1.1 質(zhì)粒和菌株

      大腸桿菌DH5α由本室保存,大腸桿菌XL10-Gold超級(jí)感受態(tài)細(xì)胞購(gòu)自美國(guó)Stratagene公司,pMD18-T載體購(gòu)自日本TaKaRa公司,質(zhì)粒pYD1-BPI600由本室構(gòu)建,包含BPI600基因(約600 bp)。載體pYD1全長(zhǎng)5 009 bp,購(gòu)自美國(guó)Invitrogen公司。

      1.1.2 主要試劑

      dCTP、dTTP、dATP、dGTP、Taq DNA 聚合酶、MnCl2、MgCl2購(gòu)自上海生工生物工程公司。NZ胺購(gòu)自美國(guó)Amresco公司、β-巰基乙醇(β-ME)購(gòu)自美國(guó)Stratagene公司。限制性內(nèi)切酶BamHI、HindⅢ購(gòu)自日本TaKaRa公司。100 bp Ladder Marker、DL2000 Marker購(gòu)自中國(guó)BioDev公司。DL15000購(gòu)自日本TaKaRa公司。DNA小片段膠回收試劑盒購(gòu)自中國(guó)BioDev公司。質(zhì)粒大量提取試劑盒購(gòu)自威格拉斯生物技術(shù)有限責(zé)任公司。其余試劑為國(guó)產(chǎn)分析純。

      1.1.3 引物設(shè)計(jì)與合成

      參照GenBank中BPI基因的序列,設(shè)計(jì)擴(kuò)增BPI600的引物,P1:5′-CCC AAG CTT GTC AAC CCT GGC GTC GTG-3′,添加HindⅢ酶切位點(diǎn)(下劃線標(biāo)示),P2:5′-CCG CTC GAG TCA TAT TTT GGT CAT TAC TGG-3′,添加X(jué)hoⅠ酶切位點(diǎn)(下劃線標(biāo)示);P3:5′-AGTAACGTTTGTCAGTAATTGC-3′,P4:5′-GTCGA TTTTGTTACATCT ACAC-3′,為載體pYD1測(cè)序引物;P5:5′-GTC AAC CCT GGC GTC GTG-3′,P6:5′-TAT TTT GGT CAT TAC TGG-3′為易錯(cuò)PCR設(shè)計(jì)引物。P1/P2、P5/P6由上海生工生物工程公司合成;P3/P4購(gòu)自美國(guó)Invitrogen公司。

      1.2 易錯(cuò)PCR

      1.2.1 隨機(jī)突變片段的獲得

      在高M(jìn)g2+離子濃度(5.0 mmol/L)和Mn2+存在的條件下,通過(guò)選擇不同的Mg2+濃度來(lái)控制隨機(jī)突變的頻率。以質(zhì)粒pYD1-BPI600為模板進(jìn)行易錯(cuò)PCR。反應(yīng)體系為(50 μL):10×EP-PCR 緩沖液5 μL,dNTP混合物(各10 mmol/L)1 μL,P5、P6引物(均為10 μmol/L)各2 μL,質(zhì)粒模板1 μL,MnCl2(5 mmol/L)5 μL,Taq DNA 聚合酶(5 u/μL)0.25 μL,去離子水加至50 μL。擴(kuò)增條件為:95℃預(yù)變性5 min;94℃ 1 min、55℃ 1 min、72 ℃ 1 min,共30個(gè)循環(huán)。用1%(質(zhì)量分?jǐn)?shù))瓊脂糖凝膠電泳分析擴(kuò)增產(chǎn)物,并在紫外燈下分離出含大小約600 bp基因片段的凝膠,利用DNA小片段膠回收試劑盒純化回收BPI600隨機(jī)突變片段;以回收物為模板,再行第二輪易錯(cuò)PCR,按上述方法回收純化大小約為600 bp突變基因片段。

      1.2.2 突變基因的克隆和鑒定

      將純化的易錯(cuò)PCR產(chǎn)物連接至克隆載體pMD18-T中,轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞。利用Amp抗性(Luria-Bertani,LB)固體培養(yǎng)基進(jìn)行篩選,菌落PCR鑒定是否含插入片段,并從含插入片段的陽(yáng)性菌落中隨機(jī)挑取5個(gè)菌落進(jìn)行測(cè)序和基因比對(duì),并計(jì)算隨機(jī)突變率。

      1.3 DNA改組

      1.3.1 隨機(jī)突變基因片段化處理

      將易錯(cuò)PCR獲得的隨機(jī)突變基因片段利用超聲波進(jìn)行碎片化處理,條件為:功率設(shè)為4 W,冰浴下超聲6 s,間隔12 s,循環(huán)處理400次。產(chǎn)物經(jīng)2%(質(zhì)量分?jǐn)?shù))瓊脂糖凝膠電泳,切下大小為50~100 bp左右的條帶,用DNA小片段回收試劑盒進(jìn)行回收純化。

      1.3.2 無(wú)引物PCR

      反應(yīng)體系(20 μL)為:10×PCR buffer 2 μL,dNTP(10 mmol/L)0.5 μL,MgCl2(25 mmol/L)1.2 μL,DNA小片段10 μL,Taq DNA 聚合酶(5 u/μL)0.25 μL,加超純水至20 μL。反應(yīng)條件為:95℃預(yù)變性5 min;94 ℃ 30 s、45 ℃ 30 s、72 ℃ 30 s,共50個(gè)循環(huán);72 ℃延伸10 min。用1%(質(zhì)量分?jǐn)?shù))瓊脂糖凝膠電泳鑒定反應(yīng)產(chǎn)物片段大小。

      1.3.3 有引物PCR

      將上述無(wú)引物PCR產(chǎn)物1∶20稀釋后,作為模板進(jìn)行有引物PCR擴(kuò)增。反應(yīng)體系(20 μL)為:無(wú)引物PCR產(chǎn)物稀釋液5 μL,10×PCR buffer 2 μL,dNTP(10 mmol/L)1 μL,MgCl2(25 mmol/L)3 μL,P1和P2各1 μL,Taq DNA 聚合酶(5 μ/μL)0.25 μL,加超純水至50 μL。擴(kuò)增條件為:95℃預(yù)變性5 min;94 ℃ 60 s、57 ℃ 60 s、72 ℃ 75 s,共35個(gè)循環(huán);72℃延伸5 min。擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)1%(質(zhì)量分?jǐn)?shù))瓊脂糖凝膠電泳分離后,在紫外燈下切下約600 bp的凝膠條帶,用DNA小片段膠回收試劑盒回收、純化BPI600的改組片段。

      1.4 重組質(zhì)粒文庫(kù)的構(gòu)建和鑒定

      1.4.1 重組質(zhì)粒文庫(kù)的構(gòu)建

      BPI600改組基因片段和質(zhì)粒載體pYD1分別用HindⅢ/XhoⅠ酶切,產(chǎn)物分別經(jīng)1%(質(zhì)量分?jǐn)?shù))瓊脂糖凝膠電泳分離后,在紫外燈下切下含目的基因片段的凝膠,用DNA小片段膠回收試劑盒回收純化酶切產(chǎn)物并進(jìn)行連接,反應(yīng)體系為:質(zhì)粒載體pYD1的酶切產(chǎn)物0.5 μL,BPI600改組基因的酶切產(chǎn)物7.5 μL,10×連接緩沖液1 μL,T4 DNA連接酶1 μL,總體積10 μL;16 ℃孵育12 h。用預(yù)冷槍頭取大腸桿菌XL10-Gold超級(jí)感受態(tài)細(xì)胞100 μL、β-ME 4 μL放入預(yù)冷的Falcon聚丙烯離心管中,輕輕混勻后冰浴10 min;再加入1 μL上述連接產(chǎn)物,輕輕旋轉(zhuǎn)使感受態(tài)細(xì)胞與連接產(chǎn)物混勻,冰浴30 min;將聚丙烯離心管置于 42 ℃水浴中作用30 s后,立即放入冰浴中作用2 min;再加入預(yù)熱的NZY+肉湯900 μL,37 ℃、225 r/min培養(yǎng)1 h后,取100 μL菌液涂布于Amp抗性LB固體培養(yǎng)基上;37 ℃培養(yǎng)12~16 h,獲得Amp抗性陽(yáng)性克隆菌,計(jì)數(shù)菌落數(shù)。

      1.4.2 重組質(zhì)粒文庫(kù)的鑒定

      從Amp抗性LB固體培養(yǎng)基上隨機(jī)挑取10個(gè)單菌落,增菌、提取質(zhì)粒后進(jìn)行酶切鑒定;再?gòu)慕?jīng)鑒定含有插入片段的陽(yáng)性轉(zhuǎn)化菌落所提質(zhì)粒中隨機(jī)選取5個(gè),在pYD1測(cè)序引物P3和P4的引導(dǎo)下進(jìn)行測(cè)序分析。測(cè)序結(jié)果與GenBank中的野生型BPI600序列進(jìn)行DNA比對(duì),分析pYD1-shuffledBPI600重組質(zhì)粒中目的基因的突變情況。

      2 結(jié)果

      2.1 易錯(cuò)PCR結(jié)果

      1%(質(zhì)量分?jǐn)?shù))瓊脂糖凝膠電泳證實(shí)兩輪易錯(cuò)PCR均成功擴(kuò)增出大小約為600 bp的基因片段(圖1)。

      圖1 易錯(cuò)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物Fig.1 The product of EP-PCR

      1:product of the first EP-PCR;2:product of the second EP-PCR;3:DL 2 000 marker;EP: error prone;PCR: polymerase chain reaction

      從Amp抗性LB固體培養(yǎng)基篩選出的BPI600的隨機(jī)突變基因庫(kù)中,隨機(jī)挑選經(jīng)菌落PCR鑒定為陽(yáng)性的5個(gè)菌落進(jìn)行測(cè)序,測(cè)序結(jié)果與野生型BPI600基因進(jìn)行比對(duì)(圖2),經(jīng)過(guò)計(jì)算,BPI600隨機(jī)突變庫(kù)的隨機(jī)突變率達(dá)2.3%(68/3 000)。

      2.2 DNA改組結(jié)果

      對(duì)易錯(cuò)PCR產(chǎn)物進(jìn)行碎片化處理后,獲得50~100 bp左右的隨機(jī)片段,經(jīng)50個(gè)循環(huán)的無(wú)引物PCR,小片段DNA被拼接成許多大小不一的改組分子,再經(jīng)過(guò)35個(gè)循環(huán)的有引物PCR,重聚到與原基因分子大小相同的BPI600改組分子(圖3)。

      2.3 pYD1-shuffled BPI600重組質(zhì)粒文庫(kù)的構(gòu)建與鑒定結(jié)果

      將有引物PCR產(chǎn)物克隆至pYD1載體中,構(gòu)建重組質(zhì)粒pYD1-shuffledBPI600,并用其轉(zhuǎn)化大腸桿菌XL10-Gold,在Amp抗性LB固體培養(yǎng)平板上獲得Amp抗性陽(yáng)性克隆菌,計(jì)數(shù)菌落數(shù),獲得了2×105個(gè)轉(zhuǎn)化子。

      從上述平板上隨機(jī)選取10個(gè)單菌落,增菌后提取質(zhì)粒,用HindⅢ和XhoⅠ酶切,在10個(gè)質(zhì)粒中,6個(gè)被酶切為大小約為4 841 bp和600 bp的兩個(gè)條帶,表明重組質(zhì)粒中插入了BPI600片段(圖4)。

      將酶切鑒定后的5個(gè)陽(yáng)性克隆進(jìn)行測(cè)序分析,與NCBI GenBank中野生型BPI編碼序列比對(duì),其中第1、2、4、5號(hào)質(zhì)粒分別發(fā)生9、14、6、11個(gè)堿基突變(圖5);第3號(hào)質(zhì)粒不僅有10個(gè)堿基突變,還存在一個(gè)堿基的缺失(圖6)。氨基酸序列比對(duì)結(jié)果(圖7)表明,在5個(gè)克隆中,第2、4號(hào)質(zhì)粒具有正確的讀碼框,能夠翻譯完整的BPI23,且分別存在14和4個(gè)氨基酸突變;第1、3、5號(hào)質(zhì)粒因含終止密碼子而不能表達(dá)完整的目的蛋白。

      圖2 5個(gè)易錯(cuò)PCR陽(yáng)性克隆的基因序列與野生型的比對(duì)結(jié)果Fig.2 Genetic comparison of 5 positive clones (after EP-PCR) with wild type

      圖3 BPI600 DNA改組結(jié)果Fig.3 The product of BPI600 shuffling

      1:fragmented fragments;2,3:product of primerless PCR;4:100 bp Ladder marker;5:product of PCR with primers;PCR:polymerase chain reaction.

      圖4 pYD1-shuffled BPI600重組質(zhì)粒的酶切鑒定 Fig.4 Double digestion of recombinant plasmid pYD1-shuffled BPI600 by HindⅢ/XhoⅠ

      1,3,4,5,7,8:positive clones;2,6,9,10:negative clones;M:100 bp Ladder marker

      圖5 1、2、4、5號(hào)克隆的基因序列與野生型的比對(duì)結(jié)果Fig.5 Genetic comparison of the number 1,2,4,5 clone with wild type

      圖6 3號(hào)克隆的基因序列與野生型的比對(duì)結(jié)果Fig.6 Genetic comparison of the number 3 clone with wild type

      3 討論

      蛋白質(zhì)的體外定向進(jìn)化又稱(chēng)實(shí)驗(yàn)分子進(jìn)化,因無(wú)需事先了解蛋白的空間結(jié)構(gòu)和作用機(jī)制,所以幾乎適用于任何蛋白質(zhì)分子的改造和優(yōu)選,為研究蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能之間的關(guān)系提供了一種更方便、更快捷的新途徑[2]。定向進(jìn)化是否成功主要受以下3個(gè)方面的影響:①合理的進(jìn)化策略;②合適的表達(dá)系統(tǒng);③高通量的篩選方法。

      在前期的實(shí)驗(yàn)中,研究組已成功構(gòu)建了BPI23的釀酒酵母細(xì)胞表面展示系統(tǒng),該系統(tǒng)能表達(dá)功能性BPI23,并可用流式細(xì)胞儀進(jìn)行快速鑒定和高通量分選[5],適合于大容量突變體庫(kù)的篩選和BPI23的進(jìn)化研究。但有了合適的表達(dá)系統(tǒng)和高通量的篩選方法,還必須在有足夠大的突變體庫(kù)構(gòu)建成功的基礎(chǔ)上才能發(fā)揮作用。

      易錯(cuò)PCR是一種簡(jiǎn)便易行的蛋白質(zhì)定向進(jìn)化策略,已廣泛應(yīng)用于蛋白質(zhì)的體外進(jìn)化,如酶活性的提高[6-8]、酶熱穩(wěn)定性的改良[9]等。在本實(shí)驗(yàn)中,通過(guò)控制Mg2+或Mn2+的濃度進(jìn)行連續(xù)易錯(cuò)PCR的方法[10],成功進(jìn)行了BPI600的隨機(jī)突變,突變率在2.3%,較為適于后續(xù)優(yōu)勢(shì)株的篩選[11]。到目前為止,尚未見(jiàn)到BPI亞型的報(bào)道,因此選擇易錯(cuò)PCR產(chǎn)生的隨機(jī)突變庫(kù)作為進(jìn)化的出發(fā)點(diǎn),可能是避免異源基因?qū)氲囊粋€(gè)有效的方法。DNA改組是用DNaseI消化或超聲處理多條具有同源序列的基因(一般同源性>70%)或基因家族[12]。

      圖7 2、4號(hào)改組克隆的氨基酸序列與野生型的比對(duì)結(jié)果Fig.7 Amino acid comparison of the number 2,4 clone with wild type

      產(chǎn)生基因隨機(jī)裂解片段后,先用無(wú)引物PCR進(jìn)行基因重排,然后再進(jìn)行有引物PCR擴(kuò)增全長(zhǎng)基因可獲得大容量基因突變體庫(kù),目前DNA改組技術(shù)廣泛應(yīng)用于基因突變體庫(kù)的構(gòu)建,大容量的突變庫(kù)再結(jié)合高通量的篩選方法,便于優(yōu)勢(shì)突變體的篩選[13-15]。本實(shí)驗(yàn)在易錯(cuò)PCR產(chǎn)生隨機(jī)突變的基礎(chǔ)上進(jìn)行DNA改組,與采用單純的隨機(jī)突變或定點(diǎn)突變方法構(gòu)建的突變庫(kù)相比,產(chǎn)生的庫(kù)容量大、多樣性好,可有效積累更多的有益突變,同時(shí)也可實(shí)現(xiàn)同源序列間的大片段交換,從而達(dá)到目的蛋白多種特性共進(jìn)化的目的。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,構(gòu)建的pYD1-shuffledBPI600重組質(zhì)粒中含有能夠翻譯為完整BPI23突變體的DNA片段,但文庫(kù)中也存在一些突變克隆,因含終止密碼子,最終只能翻譯BPI23的部分氨基酸片段。本實(shí)驗(yàn)成功構(gòu)建了庫(kù)容量達(dá)2×105的BPI600突變體庫(kù)和pYD1-shuffledBPI600重組質(zhì)粒文庫(kù),為下一步篩選優(yōu)勢(shì)突變體的研究提供了新途徑。

      [1] Wilde C G,Seilhamer J J,McGrogan M,et al.Bactericidal/permeability increasing protein and lipopolysaccharide(LPS)-binding protein.LPS binding properties and effects on LPS-mediated cell activation[J].J Biol Chem,1994,269(26):17411-17416.

      [2] 王松明,顧招兵,朱雅新,等.蛋白質(zhì)定向進(jìn)化技術(shù)概述[J].中國(guó)飼料,2017(14):15-19.

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      ConstructionandidentificationofgenemutationlibraryoftheN-terminalfragmentsofhumanbactericidal/permeabilityincreasingproteins

      Li Jingqin1,Kong Qingli2,An Yunqing2*

      (1.DepartmentofMedicalLaboratoryScience,YanjingMedicalCollege,CapitalMedicalUniversity,Beijing101300,China;2.DepartmentofImmunology,SchoolofBasicMedicalSciences,CapitalMedicalUniversity,Beijing100069,China)

      ObjectiveTo construct and identify a gene mutation library of the N-terminal fragments of human bactericidal/permeability increasing proteins (BPI23) for enhancing its activity binding lipopolysaccharides (LPS) by error-prone polymerase chain reaction (PCR) and DNA shuffling method.MethodsError-prone PCR was used to obtain random mutant fragments ofBPI600by adding different concentrations of Mg2+and Mn2+.Random mutation rate was calculated by DNA sequencing and genetic comparison with wild-typeBPI600.The product of error-prone PCR was further mutated via DNA shuffling.The reassembled product was cloned into pYD1 vector and transformed intoE.coliXL10-Gold.Ten clones were randomly picked out,digested and identified by restriction enzymeHindⅢ andXhoⅠ.The positive clones were identified by DNA sequencing.ResultsDNA sequencing result showed that the random mutation rate was 2.3% by error-prone PCR.After DNA shuffling,6 positive clones includingBPI600were identified in the 10 random clones selected from LB culture medium with ampicillin.Among them,4 had 6,9,11 and 14 mutations,respectively;1 had 10 mutations and 1 deletion determined by DNA sequencing.By amino acid comparison,only 2 DNA mutants were able to encode a full-length mutant BPI23protein,with 4 and 14 amino acid mutations respectively.ConclusionA library of BPI23mutants was constructed with a size of 2×105.The results laid the foundation for the study of its activity binding LPS.

      human bactericidal/permeability increasing protein;directed evolution;error-prone polymerase chain reaction(PCR);DNA shuffling

      *Corresponding author,E-mail:anyunq@ccmu.edu.cn

      時(shí)間:2017-12-13 21∶09

      http://kns.cnki.net/kcms/detail/11.3662.R.20171213.2109.026.html

      10.3969/j.issn.1006-7795.2017.06.024]

      Q78

      2017-10-16)

      編輯 陳瑞芳

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