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      大豆PM1蛋白抗氧化作用及提高酵母對銅耐受力

      2017-09-23 03:39:25李承娜劉子明劉國寶鄭易之
      深圳大學學報(理工版) 2017年5期
      關鍵詞:羥基酵母自由基

      李承娜,高 陽,劉子明,劉國寶,鄭易之

      深圳大學生命與海洋科學學院,深圳市微生物基因工程重點實驗室,廣東深圳518060

      【生物工程/Bioengineering】

      大豆PM1蛋白抗氧化作用及提高酵母對銅耐受力

      李承娜,高 陽,劉子明,劉國寶,鄭易之

      深圳大學生命與海洋科學學院,深圳市微生物基因工程重點實驗室,廣東深圳518060

      Cu2+是植物生長必需的微量元素之一,但土壤中過量的Cu2+會對植物細胞產生毒害作用.大豆GmPM1蛋白屬于第4組的胚胎晚期富集(late embroygenesis abundant, LEA)蛋白,該組蛋白序列中富含組氨酸殘基. 研究大豆GmPM1蛋白在提高植物耐Cu2+脅迫方面的保護作用及其機理. 對大豆幼苗進行150 μmol/L CuSO4脅迫實驗. 結果表明,Cu2+脅迫會造成大豆幼苗葉片失水萎蔫;在脅迫3 h和24 h時,幼葉內GmPM1基因表達上調. 構建了酵母表達載體pYES2-GmPM1,轉化Cu2+敏感型酵母(ΔYAP1)得到重組菌ΔYAP1-GmPM1. 檢測結果表明,表達GmPM1蛋白的酵母重組子對Cu2+脅迫耐受力得到提高. 采用Cu抗壞血酸體系,在體外檢測出GmPM1及富含組氨酸殘基的GmPM1-C端蛋白具有清除羥基自由基能力. 研究表明,大豆GmPM1蛋白可通過其C端的組氨酸殘基結合過多的Cu2+,清除由Cu2+脅迫造成的細胞內產生的過量羥基自由基,提高植物及其細胞對Cu2+脅迫的耐受性.

      大豆;GmPM1蛋白;組氨酸;Cu2+脅迫;清除羥基自由基;酵母重組子

      胚胎晚期富集蛋白(late embryogenesis abundant,LEA)是參與生物體抵抗非生物脅迫的一類重要蛋白質[1]. 根據 LEA 蛋白保守序列的特點,可將LEA蛋白分為7組. 大多數(shù)的LEA蛋白具有高度親水性和熱穩(wěn)定性[2]. LEA蛋白不僅在種子發(fā)育后期大量表達,也可被低溫、缺水、高鹽、滲透和重金屬等脅迫條件誘導表達[3]. 目前對第1~第3組LEA蛋白的保護功能已經進行了較多研究,但是對同樣在植物體內高表達的第4組的LEA蛋白(LEA4蛋白)研究較少,如棉花GossypiumhirsutumD-113蛋白在成熟的種子中的濃度可達286μmol/L[4].

      有研究表明,經質量濃度為250g/L聚乙二醇(polyethylene glycol)處理12h的擬南芥幼苗體內的3個LEA4基因(AtLEA4-1、AtLEA4-2和AtLEA4-5)mRNA表達量大量增加[5];與對照植株相比,AtLEA4-5基因的過表達植株在缺水處理時具有較高的相對含水量;當AtLEA4-5基因插入突變后,突變體幼苗及成苗對滲透脅迫及干旱的耐受力都有所減弱,可見,在抵抗非生物脅迫過程中LEA4蛋白可能有著重要功能[5]. 一些體外實驗也證明,擬南芥的AtLEA4-2和AtLEA4-5蛋白在凍融條件下可保護乳酸脫氫酶活性[6].

      大豆GmPM1蛋白屬LEA4蛋白. 體外實驗證明,在干燥情況下GmPM1蛋白可結合海藻糖或蜜三糖;也能阻止干燥誘導的多聚賴氨酸聚集;且能起穩(wěn)定細胞膜的作用. 可見,在干燥脅迫下,GmPM1蛋白通過參與細胞內玻璃化結構的形成來保護蛋白質和細胞膜結構[7]. LEA4蛋白缺乏重復的基序,其N-端高度保守,C-端保守性略低. 計算軟件預測,N-端具有形成高比例兼性α-螺旋的潛能,而C-端則呈無規(guī)則卷曲結構[6]. 本實驗前期工作證明,GmPM1蛋白可結合Fe3+、Ni2+、Cu2+和Zn2+等離子,參與GmPM1同源寡聚體形成[8]. 然而,GmPM1蛋白能否提高植物對重金屬(如Cu2+)脅迫的耐受性,其作用機制還不清楚.

      本研究首先檢測了Cu2+脅迫下大豆幼葉形態(tài)變化及GmPM1的相對表達量. 又檢驗了轉GmPM1基因的酵母突變體對Cu2+脅迫耐受力. 比較了GmPM1蛋白及其N端和C端蛋白清除羥基自由基的能力,并檢測結合Cu2+對GmPM1蛋白結構的影響. 證明了GmPM1蛋白在抵抗Cu2+脅迫中可能發(fā)揮重要保護功能.

      1 材料方法

      1.1植物材料、菌株和質粒

      “白農六號”大豆(GlycinemaxL.)種子. 重組菌BL-Pet28a-GmPM1由本實驗室保存. 突變體菌株ΔYAP1是源于BY4742野生型酵母,購自Euroscarf(http://www.uni-frankfurt.de/fb15/mikro/euroscarf/), 菌株信息見表1. 酵母表達載體pYES2購自美國Invitrogen公司.

      表1 酵母突變株及基因型

      1.2方法

      1.2.1大豆幼苗的培養(yǎng)及Cu2+脅迫處理

      大豆種子萌發(fā)后移栽到霍格蘭氏營養(yǎng)液中培養(yǎng). 待生長至兩片真葉期時,用150μmol/LCuSO4進行脅迫處理,在不同時間點取幼葉進行液氮速凍.

      1.2.2熒光實時定量PCR

      大豆葉片RNA的提取及熒光實時定量聚合酶鏈式反應(quantitativereal-timepolymerasechainreaction,RT-PCR)參照Wang等[9]的實驗方法進行.GmPM1的正反向引物為GmPM1-F(GCTACAAACATTGGTGCTTCTG) 和GmPM1-R(GCTCCGCCTGGTTCATCT),并以大豆actin基因為內參,對應的引物為actinF(GTGCACAATTGATGGACCAG)和actinR(GTGCACAATTGATGGACCAG). 用2-△△Ct方法進行RT-PCR數(shù)據分析.

      1.2.3酵母表達載體的構建與轉化

      根據GmPM1基因序列設計引物Y-PM1F(GATAGAGCTCATGCAGGGAGGAAAGAAAGCG)和Y-PM1R(CCGGAATTCTTAAGTACCCCCAGTCCCATA),以重組質粒pET28a-GmPM1為模板進行PCR擴增. 將擴增的PCR片段進行HindIII和SacI酶切,再連接至酵母表達載體pYES2-CT. 采用醋酸鋰法,將空載體pYES2-CT和重組表達載體pYES2-GmPM1轉化Cu2+敏感型酵母 (ΔYAP1), 獲得重組酵母ΔYAP1-pYES2和ΔYAP1-GmPM1.

      1.2.4Cu2+脅迫固體平板酵母生長的測定

      挑取對照菌ΔYAP1-pYES2和重組菌ΔYAP1-GmPM1的單克隆,在SCR(syntheticcompletemediumcontainingraffinose)液體培養(yǎng)基中培養(yǎng)2~3d,按體積比為1∶50接種到誘導液體培養(yǎng)基(以20g/L半乳糖為碳源的SC-U(syntheticcompletemediumlackofura)培養(yǎng)基)中,置于200r/min30℃培養(yǎng)24h. 待菌液長至對數(shù)生長期,即光密度值D(600)為0.6~1.2,將其稀釋至D(600)=0.6, 再以10倍為梯度進行稀釋. 取稀釋的菌液4μL滴至含不同濃度CuSO4的SC-U半乳糖固體培養(yǎng)基上. 于28℃培養(yǎng)2~3d,并拍照記錄.

      1.2.5羥基自由基的清除

      參照Hara等[10]的實驗方法,采用Cu2+抗壞血酸鈉體系檢測羥基自由基活性.

      1.2.6圓二色譜(circulardichroism,CD)測定

      配置500μL的樣品溶液:1mmol/LHepes(pH=7.0),50mmol/LNa2SO4,10μmol/L的GmPM1、GmPM1-N或GmPM1-C蛋白,不同濃度(0、10、50和100μmol/L)的CuSO4溶液.25℃孵育10min,用J810圓二色譜儀(日本JASCO公司)測定. 用OriginPro8.0處理數(shù)據,并根據式(1)計算PII結構(polyprolineIItypehelicalstructure)含量[11].

      [θ]=fH[θ]H+fⅡ[θ]II+fU[θ]U

      (1)

      其中, [θ]為特定溫度下測定的222nm處的橢圓率;fH、fⅡ和fU分別為α-helix、PII和unordered的百分含量; [θ]H、[θ]II和[θ]U分別為α-helix、PII和unordered在222nm處的摩爾橢圓率常數(shù),分別為-30000、+9580和-5560deg·cm2·dmol-1.

      2 結果與分析

      2.1CuSO4脅迫下大豆幼苗形態(tài)及GmPM1基因表達的變化

      2.1.1 CuSO4脅迫下大豆幼苗表型變化

      大豆種子發(fā)芽后,移到改良的霍格蘭氏營養(yǎng)液中. 兩片真葉期時,對大豆幼苗進行150 μmol/L CuSO4處理,觀察大豆幼葉表型變化(圖1). 當CuSO4脅迫0 h時,真葉堅挺伸展;脅迫3 h時,葉片有些下垂;脅迫6 h時葉片再次開始堅挺;脅迫24 h時幼苗葉片基本上已恢復堅挺,但葉邊緣開始卷曲;脅迫48~72 h時葉片邊緣已經萎蔫,且葉片脫水嚴重.

      圖1 CuSO4脅迫下大豆幼苗表型變化Fig.1 Phenotype of soybean seedlings under CuSO4 stress

      2.1.2 CuSO4脅迫大豆幼苗葉中GmPM1基因的相對表達量

      采用熒光實時定量RT-PCR檢測Cu2+脅迫后大豆幼苗GmPM1基因的表達水平(圖2). 結果表明,Cu2+脅迫3 h后的幼葉GmPM1基因表達量上升;在脅迫6~12 h后表達量下降;脅迫24 h后再次上升;脅迫48~72 h后該基因相對表達量再次下降. 可見,Cu2+脅迫后,GmPM1基因的相對表達量與葉表型變化有一定對應關系.

      圖2 大豆幼葉中GmPM1基因的相對表達量Fig.2 Relative transcript level of GmPM1 gene in soybean seedling leaves

      2.2GmPM1蛋白表達提高Cu2+敏感型酵母(ΔYAP1)對Cu2+耐受力

      將空載體pYES2-CT和重組表達載體 pYES2-GmPM1轉化Cu2+敏感型酵母(ΔYAP1). 提取ΔYAP1-pYES2和ΔYAP1-GmPM1重組菌的可溶性蛋白進行十二烷基硫酸鈉聚丙烯酰胺凝膠電泳(sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis,SDS-PAGE),結果如圖3. 從中可見,與對照菌相比,ΔYAP1-GmPM1重組酵母可表達一特異條帶(21 ku, 1 u =1 Da),如圖3箭頭所示. 該條帶與文獻[8]報告的大腸桿菌表達的GmPM1蛋白大小一致,表明GmPM1能在重組酵母中正常表達.

      圖3 GmPM1蛋白在重組酵母中表達Fig.3 Expression of GmPM1 protein in the recombinant yeast

      將ΔYAP1-pYES2和ΔYAP1-GmPM1重組菌培養(yǎng)至對數(shù)生長期,再分別接種到正常固體培養(yǎng)基及含80和100 μmol/L CuSO4的脅迫培養(yǎng)基上,培養(yǎng)2~3 d. 結果表明,在正常培養(yǎng)基上,對照菌和重組菌生長狀況接近. 但在80和100 μmol/L CuSO4培養(yǎng)基上,ΔYAP1-GmPM1重組菌長勢明顯優(yōu)于轉空載體對照菌,意味著GmPM1蛋白表達可提高ΔYAP1酵母對Cu2+脅迫耐受力(圖4).

      圖4 對照菌ΔYAP1-pYES2和重組菌ΔYAP1-GmPM1的生長情況Fig.4 Growth situation of ΔYAP1-pYES2 and ΔYAP1-GmPM1

      2.3GmPM1、GmPM1-N和GmPM1-C蛋白具有清除羥基自由基的能力

      參照Hara等[10]的實驗方法,檢測GmPM1蛋白及其N端和C端蛋白清除Cu2+產生的羥基自由基的能力. 用熒光檢測劑香豆素-3-羧酸來檢測羥基自由基量的變化,在反應初始階段熒光值會上升,但隨時間延長熒光值將會保持不變. 以反應30 min時的熒光值為縱坐標,蛋白濃度為橫坐標,做出擬合曲線,圖5(a)至(d)分別是加入牛血清蛋白(albumin from bovine serum,BSA;對照)、GmPM1、GmPM1-N和GmPM1-C后熒光值變化的擬合曲線. 由圖5(a)至(d)可知,樣品的熒光值隨蛋白濃度增加而降低,表明GmPM1、GmPM1-N和GmPM1-C蛋白清除羥基自由基能力有劑量依賴性.

      圖5 BSA、GmPM1、GmPM1-N和GmPM1-C蛋白清除羥基自由基能力Fig.5 Activities of scavenging hydroxyl radicals of BSA, GmPM1, GmPM1-N and GmPM1-C

      以熒光強度達到最大值的50%對應的蛋白濃度(inhibitory concentration 50%, IC50)表示羥基自由基清除能力,如圖5(e),即IC50值越小,該蛋白清除羥自由基能力越強,以未加入蛋白樣品時熒光值為最大熒光強度. 由圖5(e)知,BSA、GmPM1、GmPM1-N 和GmPM1-C的IC50分別為1.34、0.66、4.93和1.37 μmol/L,表明GmPM1蛋白及其短肽蛋白的清除羥基自由基能力順序為:GmPM1>GmPM1-C> GmPM1-N蛋白.

      2.4Cu2+對GmPM1、GmPM1-N和GmPM1-C蛋白結構變化的影響

      GmPM1蛋白屬固有無序蛋白. 在正常生理狀態(tài)下的GmPM1主要為無序結構狀態(tài). 本研究以CD光譜法檢測在不同Cu2+濃度下,GmPM1、GmPM1-N和GmPM1-C蛋白的二級結構變化.c(Cu2+)=0 μmol/L時,GmPM1、GmPM1-N和GmPM1-C的CD譜在198 nm附近存在一負峰,這是典型的無規(guī)則卷曲結構,如圖6(a)至(c). 加入高濃度Cu2+(10、50和100 μmol/L)后,GmPM1和GmPM1-N的CD圖譜未發(fā)現(xiàn)明顯改變. 與其不同,GmPM1-C的CD圖譜在205 nm處出現(xiàn)一等漫射點,如圖6(c)箭頭處,這為典型的多聚脯氨酸II型螺旋結構特征[12].

      繪制GmPM1-C蛋白CD差異譜,如圖6(d),即在190~210 nm有1個負峰,210 ~230 nm有1個正峰,且在215 nm處差異達最大,進一步證實GmPM1-C蛋白存在PII結構[12]. 利用公式計算PII結構含量[11]. 加入100 μmol/L Cu2+后,GmPM1-C蛋白的PII結構為從27%降低到18%. 可見,高濃度的Cu2+,可直接影響GmPM1-C蛋白的二級結構及其構象.

      3 討 論

      Cu2+是植物正常生長發(fā)育所必須的重要微量元素之一,但是,土壤中Cu2+過量存在會嚴重影響植物正常生長發(fā)育,甚至導致植物死亡. González-mendoza等[13]研究發(fā)現(xiàn),銅脅迫會使亮葉白骨壤(Avicenniagerminans)葉的氣孔導度及葉綠素含量降低,從而減弱凈光合作用. Cu2+還可增加活性氧(Reactive Oxygen Species,ROS)的產生,或降低植物細胞內抗氧化酶活性,導致ROS過量積累,造成氧化傷害[14]. 在長期進化中,植物體中產生了多種抵抗銅離子毒害的機制,如形成共生菌根和誘導表達金屬轉運蛋白,抗逆蛋白及植物絡合素合酶等[15]. 如香蕉MpDhn12蛋白(LEA2)在體外可結合Cu2+,過表達后可提高Cu2+敏感酵母Δsod1, 表明MpDhn12蛋白可能具有抗氧化功能[16].

      圖6 GmPM1、GmPM1-N和GmPM1-C的CD圖譜Fig.6 CD spectrum of GmPM1, GmPM1-N and GmPM1-C

      本研究表明,在Cu2+脅迫3 h和24 h時,大豆幼苗葉中GmPM1基因表達量兩次上升,意味著GmPM1基因的誘導表達可能存在快速應答和慢速應答,這與在高Cu2+脅迫下的植物葉片萎蔫反應有一定對應關系. 結合前人的有關報告[17],筆者認為Cu2+脅迫3 h時GmPM1基因表達量第1次上升應為“快速應答”,為植物對周圍環(huán)境變化的應激性反應;而Cu2+脅迫24 h時GmPM1基因表達量第2次上升應為“慢速應答”,是對脅迫的耐受性,即在較長脅迫下植物體產生的適應性反應.

      為準確地鑒定外源基因的功能,可利用酵母突變體及功能互補實驗.ΔYAP1是釀酒酵母YAP1基因的缺失株.YAP1基因可編碼堿性亮氨酸拉鏈類(basic leucine zipper, bZIP)轉錄因子,至少參與對32個氧化脅迫誘導基因的表達調控. 若YAP1基因突變,酵母突變株對氧化脅迫的敏感性將增強[18]. 本研究將GmPM1基因轉化ΔYAP1酵母后, GmPM1重組酵母對Cu2+脅迫耐受性提高. 還進一步證明GmPM1蛋白清除羥基自由基能力明顯高于GmPM1-C. GmPM1蛋白含10個組氨酸殘基,主要分布在其C端. 可見,大豆GmPM1蛋白清除羥基自由基能力與蛋白序列中組氨酸數(shù)目及蛋白的長度相關. 筆者推測,高濃度Cu2+會造成酵母細胞的離子毒害及氧化傷害. 酵母重組子表達的GmPM1蛋白可結合細胞內過多的Cu2+,并可清除過多的羥基自由基,從而減少Cu2+脅迫造成的過氧化傷害,這可能是GmPM1蛋白保護酵母細胞的機制之一.

      多聚脯氨酸II型螺旋結構,即PII結構[19]. 在水溶液中,PII結構與自由卷曲間處于動態(tài)平衡. 文獻[20]研究指出,PII結構常位于蛋白質的表面,可作為固有無序蛋白分子間互作的位點. 部分LEA蛋白也存在PII結構. 如點突變使大豆Em蛋白中的PII結構含量降低時,在凍融條件下Em蛋白保護乳酸脫氫酶活性也降低[21]. 鹽芥(Thellungiellasalsuginea)的TsDHN-1和TsDHN-2蛋白在磷酸化時PII結構增加;在溫度升高時PII結構降低. 并推測PII結構的改變會影響蛋白與靶分子的結合[22]. 本研究結果顯示,與Cu2+結合后的大豆GmPM1蛋白的C端發(fā)生二級結構改變,反映在PII結構的含量減少. 由此推測,GmPM1蛋白通過C-端與Cu2+結合后,可能會使其二級結構或三維構象發(fā)生改變,這種結構的改變也可能影響GmPM1蛋白的功能.

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      【中文責編:晨兮;英文責編:艾琳】

      CharacteristicsofantioxidantactivityofsoybeanPM1proteinandenhancementoftoleranceofrecombinantyeasttocopperstress

      LiChengna,GaoYang,LiuZiming,LiuGuobao,andZhengYizhi

      CollegeofLifeSciencesandOceanography,ShenzhenUniversity,ShenzhenKeyLaboratoryofMicrobiologyandGeneEngineering,Shenzhen518060,GuangdongProvince,P.R.China

      Cu2+is an essential micronutrient for plant growth, but it is toxic when plant growth under excess copper stress. Soybean GmPM1protein belongs to late embryogenesis abundant (LEA) group4(LEA4) proteins, which has a high proportion of histidine residues in the protein sequence. Firstly, we investigate the protective function and mechanisms of GmPM1protein in plant under Cu2+stress. The leaves of soybean seedling are withered under150μmol/L CuSO4stress, and at the meantime the expression ofGmPM1gene in the young leaves was up-regulated in3h and24h of the stress. Secondly, the yeast expression plasmid of pYES2-GmPM1is constructed and then transformed into the copper-sensitive yeast mutantΔYAP1to create recombinants ofΔYAP1-GmPM1. The recombinant yeast expressing GmPM1protein could enhance the tolerance to Cu2+stress. Then, the activities of scavenging hydroxyl radicals of GmPM1and GmPM1-C protein in vitro are determined by using Cu-ascorbic acid system, which is rich in histidine residual in their sequence. The results show that GmPM1could chelate Cu2+through histidine residual in the C-terminal of GmPM1protein and exert the activity of scavenge hydroxyl radicals, thus could improve the tolerance of plants to Cu2+stress.

      soybean; GmPM1protein; histidine; Cu2+stress; scavenging hydroxyl radicals; recombinant yeast

      2017-05-24;Accepted:2017-06-05

      Professor Zheng Yizhi. E-mail:yzzheng@szu.edu.cn

      Q 943.2;Q 71

      :Adoi:10.3724/SP.J.1249.2017.05457

      Foundation:National Natural Science Foundation of China(31370289)

      :Li Chengna, Gao Yang, Liu Ziming, et al. Characteristics of antioxidant activity of soybean PM1 protein and enhancement of tolerance of recombinant yeast to copper stress[J]. Journal of Shenzhen University Science and Engineering, 2017, 34(5): 457-463.(in Chinese)

      國家自然科學基金資助項目(31370289)

      李承娜(1991—),女,深圳大學碩士研究生. 研究方向:植物抗逆分子生物學.E-mail: 1324471270@qq.com

      引文:李承娜,高 陽,劉子明,大豆PM1蛋白抗氧化作用及提高酵母對銅耐受力[J]. 深圳大學學報理工版,2017,34(5):457-463.

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