田萬(wàn)年,薛書(shū)江,賈立軍,張守發(fā)
(1.吉林農(nóng)業(yè)科技學(xué)院動(dòng)物科技學(xué)院,吉林 吉林 132101;2.預(yù)防獸醫(yī)學(xué)吉林省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,吉林 吉林 132101;3.延邊大學(xué)農(nóng)學(xué)院,吉林 延吉 133002)
羊泰勒蟲(chóng)病二溫式 PCR診斷方法的建立及初步應(yīng)用
田萬(wàn)年1,2,薛書(shū)江3,賈立軍3,張守發(fā)3
(1.吉林農(nóng)業(yè)科技學(xué)院動(dòng)物科技學(xué)院,吉林 吉林 132101;2.預(yù)防獸醫(yī)學(xué)吉林省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,吉林 吉林 132101;3.延邊大學(xué)農(nóng)學(xué)院,吉林 延吉 133002)
為建立特異、敏感、快速的羊泰勒蟲(chóng)病診斷方法。根據(jù)GenBank已報(bào)道的羊泰勒蟲(chóng)表面蛋白基因(AY274329)設(shè)計(jì)合成了1對(duì)引物,通過(guò)條件優(yōu)化,建立了羊泰勒蟲(chóng)病二溫式PCR診斷方法。該方法能擴(kuò)增出335 bp的羊泰勒蟲(chóng)特異性基因片段,測(cè)序結(jié)果與已知基因序列同源性為100%。對(duì)羊泰勒蟲(chóng)基因組DNA的最小檢測(cè)量為16 fg/μL,與新孢子蟲(chóng)、弓形蟲(chóng)、巴貝斯蟲(chóng)和瑟氏泰勒蟲(chóng)均無(wú)交叉反應(yīng)。與普通PCR相比,二溫式-PCR在敏感性方面無(wú)顯著差異,但其反復(fù)升溫降溫時(shí)間消耗短。結(jié)果表明,二溫式PCR診斷方法具有較高的特異性和敏感性,可用于羊泰勒蟲(chóng)病的快速診斷和流行病學(xué)調(diào)查。
羊泰勒蟲(chóng);表面蛋白基因;二溫式PCR
羊泰勒蟲(chóng)病是由羊泰勒蟲(chóng)引起的綿羊和山羊的一種經(jīng)蜱傳染的血液原蟲(chóng)病。本病呈地方性流行,主要以高熱、貧血和消瘦為主要臨床癥狀。該病主要分布于我國(guó)的四川、河北、遼寧、內(nèi)蒙古、重慶、廣東、貴州、新疆、甘肅、青海和寧夏等地區(qū)[1-3]。羊泰勒蟲(chóng)病可引起外地引進(jìn)羊大量死亡,慢性發(fā)病的羊產(chǎn)肉量和產(chǎn)毛量顯著下降,嚴(yán)重影響?zhàn)B羊業(yè)的發(fā)展。目前羊泰勒蟲(chóng)病的診斷主要通過(guò)血液涂片,顯微鏡檢查為主。但是,隱性感染羊的血液染蟲(chóng)率較低時(shí),顯微鏡檢測(cè)易出現(xiàn)漏檢和誤診。因此,急需建立一種敏感性高、特異性強(qiáng),用于羊泰勒蟲(chóng)病早期診斷。PCR方法是一種快速、敏感、特異的診斷方法,已廣泛應(yīng)用寄生蟲(chóng)病的診斷[4-5]。二溫式PCR方法比常規(guī)PCR方法特異性更強(qiáng),所需時(shí)間更短[6]。目前尚未見(jiàn)應(yīng)用二溫式PCR診斷羊泰勒蟲(chóng)病的文獻(xiàn)報(bào)道。本試驗(yàn)根據(jù)羊泰勒蟲(chóng)表面蛋白基因(surface protein,SP)基因序列設(shè)計(jì)1對(duì)引物,建立了能快速診斷羊泰勒蟲(chóng)病二溫式PCR方法,為今后羊泰勒蟲(chóng)病的診斷和流行病學(xué)調(diào)查奠定基礎(chǔ)。
1.1 病料來(lái)源 血液樣本采自吉林省琿春地區(qū)散養(yǎng)的綿羊45份,無(wú)菌采取抗凝血,用PBS洗3次。存于-20℃?zhèn)溆谩M瑫r(shí)制作了血液涂片,甲醛固定保存,供染色鏡檢。新孢子蟲(chóng)、弓形蟲(chóng)RH株、巴貝斯蟲(chóng)和瑟氏泰勒蟲(chóng)基因組DNA由延邊大學(xué)預(yù)防獸醫(yī)實(shí)驗(yàn)室保存。
1.2 主要試劑 全血DNA提取試劑盒、Taq DNA聚合酶、dNTP、Agarose Gel DNA Extraction Kit、DL-2000 DNA Marker等,均購(gòu)自寶生物工程(大連)有限公司。
1.3 PCR診斷方法的建立
1.3.1 引物的設(shè)計(jì)與合成 根據(jù)GenBank上登錄的羊泰勒蟲(chóng)表面蛋白基因序列(AY274329),利用Primer Premier 5.0軟件在保守區(qū)設(shè)計(jì)了1對(duì)二溫式PCR引物,引物 P1:5'-GCGGTCCATGCGGTCCATTTCTTCCTTTA-3',P2:5'-AGATTCAGTAGCATG AACTGCG-3',擴(kuò)增預(yù)期片段大小為335 bp。根據(jù)羊泰勒蟲(chóng)18S rRNA基因序列(AY262117)設(shè)計(jì)普通PCR引物,引物P1:5'-CATCTTCTTTTTGATGAGTTGA-3',P2:5'-TTTCGTCTTGATAATGAAAAC-3',擴(kuò)增預(yù)期片段大小為300 bp。引物由寶生物工程(大連)有限公司合成。
1.3.2 羊泰勒蟲(chóng)DNA標(biāo)準(zhǔn)模板的制備 將經(jīng)姬姆薩染色后顯微鏡檢查確診為羊泰勒蟲(chóng)感染的綿羊抗凝血,按照全血基因組DNA提取試劑盒說(shuō)明書(shū)操作提取基因組DNA,抽提的DNA用50μL TE溶解,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.3.3 PCR擴(kuò)增及退火-延伸溫度的篩選 以提取的羊泰勒蟲(chóng)DNA為模板,PCR反應(yīng)條件如下: 94℃預(yù)變性5 min,94℃變性30 s,62℃退火-延伸30 s,30個(gè)循環(huán),最后72℃延伸7 min。退火-延伸溫度梯度為59℃ ~64℃。
1.3.4 PCR產(chǎn)物的鑒定 將回收的PCR產(chǎn)物經(jīng)純化后,送至上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司序列測(cè)定。
1.3.5 特異性試驗(yàn) 以羊泰勒蟲(chóng)基因組DNA為試驗(yàn)樣本,以新孢子蟲(chóng)、弓形蟲(chóng)RH株、巴貝斯蟲(chóng)和瑟氏泰勒蟲(chóng)基因組DNA為對(duì)照樣本,進(jìn)行二溫式和普通PCR擴(kuò)增,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳分析PCR產(chǎn)物。
1.3.6 敏感性試驗(yàn) 用紫外分光光度計(jì)測(cè)定已提取的羊泰勒蟲(chóng)DNA的D260nm值,計(jì)算DNA含量。以10倍為梯度進(jìn)行連續(xù)稀釋成7個(gè)不同濃度,按照最適退火-延伸溫度進(jìn)行二溫式和普通PCR擴(kuò)增,對(duì)比其敏感性。
1.4 臨床樣本的檢測(cè)試驗(yàn) 應(yīng)用所建立的二溫式PCR方法對(duì)采自吉林省琿春地區(qū)的45份血液樣品進(jìn)行檢測(cè)。同時(shí),與常規(guī)PCR和血液涂片鏡檢相對(duì)比,比較陽(yáng)性檢出率。
2.1 PCR擴(kuò)增 對(duì)羊泰勒蟲(chóng)基因組DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增后經(jīng)10 g/L瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),出現(xiàn)335 bp的特異性DNA條帶(見(jiàn)圖1),與預(yù)期的片斷大小相一致。
圖1 二溫式PCR擴(kuò)增結(jié)果
2.2 測(cè)序與序列比較 將PCR產(chǎn)物純化后送往上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司測(cè)序,結(jié)果表明,其核苷酸該序列與GenBank上登錄的羊泰勒蟲(chóng)表面蛋白基因序列(AY274329)同源性為100%,表明吉林省琿春地區(qū)流行的羊泰勒蟲(chóng)與國(guó)內(nèi)呂氏泰勒蟲(chóng)親緣關(guān)系較近。
2.3 退火-延伸溫度的篩選 退火-延伸溫度梯度為59℃ ~64℃。其中,61℃時(shí)目的條帶最亮,因此,把61℃定為最佳的退火-延伸溫度(見(jiàn)圖2)。
圖2 二溫式PCR退火-延伸溫度的篩選試驗(yàn)
2.4 特異性試驗(yàn) 將以羊泰勒蟲(chóng)、新孢子蟲(chóng)、弓形蟲(chóng)、巴貝斯蟲(chóng)和瑟氏泰勒蟲(chóng)基因組DNA為模板,分別用二溫式和三步法進(jìn)行擴(kuò)增,PCR產(chǎn)物經(jīng)10 g/L瓊脂糖凝膠電泳分析。電泳結(jié)果顯示,僅羊泰勒蟲(chóng)DNA樣本擴(kuò)增后出現(xiàn)特異性DNA條帶,與預(yù)期片斷大小相符,而作為對(duì)照樣本的新孢子蟲(chóng)、弓形蟲(chóng)、巴貝斯蟲(chóng)和瑟氏泰勒蟲(chóng)基因組DNA均無(wú)此擴(kuò)增條帶出現(xiàn)(見(jiàn)圖3)。
圖3 特異性擴(kuò)增試驗(yàn)
2.5 敏感性試驗(yàn) 根據(jù)DNA分光光度法測(cè)定陽(yáng)性模板DNA濃度為1.6 ng/μL。將所取的DNA依次做10倍梯度稀釋,分別進(jìn)行PCR擴(kuò)增,反應(yīng)結(jié)果進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)(見(jiàn)圖4)。當(dāng)DNA含量為16 fg/μL時(shí),也能擴(kuò)出特異目的條帶。
2.6 臨床樣本檢測(cè) 對(duì)采自吉林省琿春地區(qū)45份血液樣本分別進(jìn)行二溫式PCR方法、普通PCR和血液涂片進(jìn)行檢測(cè)。二溫式PCR和普通PCR方法的陽(yáng)性率均為40%(18/45),兩檢測(cè)方法檢出結(jié)果差異不顯著(P>0.05),而血涂片陽(yáng)性率為17.78% (8/45),且血液涂片鏡檢診斷為陽(yáng)性的樣本經(jīng)二溫式PCR診斷均為陽(yáng)性,表明二溫式PCR方法更為敏感。部分血液樣本進(jìn)行二溫式PCR方法擴(kuò)增結(jié)果(見(jiàn)圖5)。
圖4 敏感性試驗(yàn)
圖5 部分血液樣本二溫式PCR檢測(cè)結(jié)果
目前國(guó)內(nèi)報(bào)道的羊泰勒蟲(chóng)有3個(gè)種,呂氏泰勒蟲(chóng)、尤氏泰勒蟲(chóng)和綿羊泰勒蟲(chóng)。甘肅省主要由呂氏泰勒蟲(chóng)和尤氏泰勒蟲(chóng)混合感染;貴州、廣東和重慶僅存在呂氏泰勒蟲(chóng);新疆喀什僅存在綿羊泰勒蟲(chóng)。本試驗(yàn)根據(jù)羊泰勒蟲(chóng)表面蛋白基因序列設(shè)計(jì)的特異性引物,經(jīng)PCR擴(kuò)增出335 bp的基因片段,測(cè)序結(jié)果表明,該段基因與GenBank上羊泰勒蟲(chóng)China 1基因同源性達(dá)到100%,結(jié)果表明,吉林省琿春地區(qū)流行的羊泰勒蟲(chóng)為呂氏泰勒蟲(chóng),本試驗(yàn)結(jié)果豐富了羊泰勒蟲(chóng)流行病學(xué)資料,為吉林省琿春地區(qū)羊泰勒蟲(chóng)病的綜合防治提供了參考依據(jù)。據(jù)報(bào)道,羊泰勒蟲(chóng)病PCR診斷方法目的基因?yàn)?8S rRNA基因序列。李有權(quán)等[2]基于18S rRNA基因序列對(duì)國(guó)內(nèi)流行羊泰勒3個(gè)種構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)發(fā)現(xiàn),尤氏泰勒蟲(chóng)和綿羊泰勒蟲(chóng)各地方株之間差異較小,而呂氏泰勒蟲(chóng)各蟲(chóng)株之間差異較大,表明國(guó)內(nèi)羊泰勒蟲(chóng)種間差異較大。大量研究結(jié)果表明,一些保守的抗原蛋白為目標(biāo)序列建立的診斷方法已得到了廣泛應(yīng)用[7-9]。因此,我們?cè)趯?duì)吉林省琿春地區(qū)羊泰勒蟲(chóng)表面蛋白基因測(cè)序基礎(chǔ)上,針對(duì)該地區(qū)流行的羊泰勒蟲(chóng)病建立二溫式PCR診斷方法,特異性試驗(yàn)表明,該引物只能擴(kuò)增出羊泰勒蟲(chóng)表面蛋白基因片段,而不能擴(kuò)增出瑟氏泰勒蟲(chóng)、巴貝斯蟲(chóng)、新孢子蟲(chóng)和弓形蟲(chóng)的基因組DNA,對(duì)該地區(qū)羊泰勒蟲(chóng)病的臨床診斷方面具有一定的應(yīng)用價(jià)值。
目前我國(guó)對(duì)于羊泰勒蟲(chóng)病的診斷主要通過(guò)血液涂片鏡檢來(lái)確診本病,但由于染色劑及相似病原體等人為因素影響鏡檢結(jié)果的判定,不適于對(duì)該病的早期診斷。應(yīng)用二溫式PCR方法診斷羊泰勒蟲(chóng)是較好的方法,該方法與常規(guī)PCR診斷方法相比具有特異性強(qiáng)、擴(kuò)增時(shí)間短特點(diǎn),提高了該病的診斷的效率。通過(guò)對(duì)45份血液樣本的PCR檢測(cè),陽(yáng)性率為40%(28/45),而血液涂片染色鏡檢出的陽(yáng)性率為17.78%(8/45),二者檢測(cè)的陽(yáng)性符合率為100%。因此基于羊泰勒蟲(chóng)表面蛋白基因建立的二溫式PCR方法是一種特異性強(qiáng)、敏感性高,且比常規(guī)PCR更省時(shí)的檢測(cè)技術(shù),為羊泰勒蟲(chóng)病的早期診斷和流行病學(xué)調(diào)查提供了有效方法。
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Establishment and Primary Application of Two-temperature PCR Method for Detection Theileriosis in goats and sheep
TIAN Wan-nian1,2,XUE Shu-jiang3,JIA Li-jun3,ZHANG Shou-fa3
(1.College of Animal Science,Jilin Agricultural Science and Technology College,Jilin 132101,China;2.Key Lab of Preventive Veterinary Medicine in Jilin Province,Jilin 132101,China;3.College of Agriculture,Yanbian University,Yanji133002,China)
To establish a rapid,specific and sensitive method for the detection of Theileriosis in goats and sheep,a pair of specific primers was designed and synthesized according to Theileria sp surface protein(SP)gene in GenBank(AY274329)and a two-temperature PCR assay was established.A 335 bp gene fragment was amplified,and had 100%of homology with the known gene sequence.The minimum detectable amount of DNA was 16 fg/μL.The method showed no cross reaction with Neoapora caninum,Toxoplasma gondii RH strain,Babesia gibsoni and Theileria sergenti.Compared with common PCR,two-temperature PCR had no significant difference in sensitivity.But,the method took a short time with repeated heating and cooling.The results showed that the PCR method was specific and sensitive.This study provided a method for rapid clinical diagnosis and epidemiological investigation of Theileriosis in goats and sheep.
ovine and captine theileriosis;surface protein(SP)gene two-temperature PCR
ZHANG Shou-fa
S852.273
A
0529-6005(2017)06-0043-03
2016-09-27
吉林省科技發(fā)展計(jì)劃項(xiàng)目(20150623004TC);吉林省重點(diǎn)學(xué)科培育項(xiàng)目(吉農(nóng)院合字[2015]第x030號(hào));吉林農(nóng)業(yè)科技學(xué)院種子基金項(xiàng)目(吉農(nóng)院合字[2014]第Z07號(hào))
田萬(wàn)年(1980-),男,講師,博士,主要從事動(dòng)物寄生蟲(chóng)病研究,E-mail:wannian2000@hotmail.com
張守發(fā),E-mail:shoufazhang@sina.com