奚琦++許志茹++王琪++曲春浦++楊成君++劉關(guān)君
摘要:銅(Cu)是植物生長(zhǎng)發(fā)育所必需的微量元素,參與光合作用、呼吸作用及木質(zhì)素合成等多個(gè)生物學(xué)過(guò)程。銅離子具有氧化還原特性,低銅或者過(guò)量銅都會(huì)對(duì)植物造成傷害,因此植物在長(zhǎng)期進(jìn)化過(guò)程中產(chǎn)生了一套完整的銅穩(wěn)態(tài)調(diào)控體系,其中miRNA在此體系中扮演著重要的角色。介紹了miR397、miR398、miR408、miR857、miR1444等5種 Cu-miRNAs,它們的靶基因編碼了植物細(xì)胞中非常重要的4大類(lèi)含銅蛋白——漆酶、超氧化物歧化酶、質(zhì)體藍(lán)素和多酚氧化酶。在銅脅迫條件下,miRNA通過(guò)調(diào)控靶基因的表達(dá)優(yōu)化銅離子的分配,既保證了銅的正常供應(yīng),又避免了銅毒害。
關(guān)鍵詞:銅穩(wěn)態(tài);Cu-miRNAs;銅脅迫;研究進(jìn)展
中圖分類(lèi)號(hào): Q754文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A
文章編號(hào):1002-1302(2017)09-0005-05
銅(Cu)廣泛存在于動(dòng)物、植物和微生物體內(nèi),是正常生命活動(dòng)所必需的微量礦質(zhì)元素。銅在植物的生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中行使重要功能,植物中含有100多種不同的含銅蛋白,參與各種新陳代謝過(guò)程,如光合作用、呼吸作用電子傳遞鏈、活性氧代謝、對(duì)乙烯的感受、氮代謝、細(xì)胞壁的木質(zhì)化及花粉的形成等[1]。在這些過(guò)程中,銅作為輔因子與細(xì)胞內(nèi)Cu/Zn超氧化物歧化酶(Cu/Zn SOD)、細(xì)胞色素氧化酶、多酚氧化酶、抗壞血酸氧化酶、多胺氧化酶等多種酶結(jié)合后行使生物學(xué)功能。
缺銅條件會(huì)導(dǎo)致植物葉片失綠,葉尖卷曲變白,植株矮小,生長(zhǎng)緩慢,產(chǎn)量下降。植物細(xì)胞中銅濃度過(guò)高會(huì)使植株生長(zhǎng)發(fā)育不良,根部畸形,根細(xì)胞質(zhì)膜損傷,質(zhì)膜過(guò)氧化作用增強(qiáng),氮素吸收及氨基酸合成受阻;銅濃度過(guò)高,還可使植物葉片黃化,葉綠素a/b比降低,光合系統(tǒng)Ⅰ、Ⅱ的電子傳遞能力降低,光合作用速率下降;此外,銅濃度過(guò)高還會(huì)使細(xì)胞核中DNA與蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)被破壞、DNA復(fù)制和轉(zhuǎn)錄受影響,使含銅蛋白的合成、基因表達(dá)調(diào)控發(fā)生紊亂[2-4]。
植物在光合電子傳遞鏈、呼吸鏈中產(chǎn)生的活性氧(ROS)在生成部位就會(huì)被及時(shí)分解;而當(dāng)植物吸收過(guò)量銅后,植物細(xì)胞會(huì)快速積累超氧化物陰離子( O-2· )、羥自由基(·OH)、過(guò)氧化氫(H2O2)和單線(xiàn)態(tài)氧(1O2)等活性氧,并進(jìn)一步毒害植物細(xì)胞[5]。此外,自然界中的植物在不同土壤環(huán)境條件下可能會(huì)面臨重金屬脅迫,但植物銅中毒的情況并不常見(jiàn),由此認(rèn)為,植物通過(guò)在進(jìn)化過(guò)程中形成完善的銅穩(wěn)態(tài)調(diào)控體系應(yīng)對(duì)上述脅迫條件,以維持正常的生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程。一般認(rèn)為,環(huán)境中的銅離子通過(guò)CTR銅轉(zhuǎn)運(yùn)家族成員高效轉(zhuǎn)運(yùn)到植物細(xì)胞內(nèi),之后,銅伴侶蛋白將銅離子運(yùn)送至需銅蛋白。銅伴侶蛋白ATX1、CCH向銅轉(zhuǎn)運(yùn)P型ATP酶HMA5、RAN1或Ccc2運(yùn)送銅離子,之后銅離子進(jìn)入分泌途徑或者運(yùn)送到細(xì)胞外;COX銅伴侶蛋白將銅離子運(yùn)送到線(xiàn)粒體中的細(xì)胞色素C氧化酶,參與呼吸鏈中的電子傳遞;P型ATP酶PAA1、PAA2將銅離子運(yùn)送到質(zhì)體藍(lán)素參與植物光合作用;銅伴侶蛋白CCS將銅離子運(yùn)送給銅鋅超氧化物歧化酶,參與細(xì)胞對(duì)氧自由基的清除[6]。在這些過(guò)程中,miRNA對(duì)銅穩(wěn)態(tài)的調(diào)節(jié)至關(guān)重要。
1miRNA簡(jiǎn)介
1.1miRNA的發(fā)現(xiàn)
miRNA是一類(lèi)目前被廣泛研究的內(nèi)源性單鏈非編碼小分子RNA,長(zhǎng)度約為16~29 nt,大部分長(zhǎng)度為21~23 nt[7]。1993年首次在秀麗新小桿線(xiàn)蟲(chóng)中發(fā)現(xiàn)了可時(shí)序調(diào)控胚胎后期發(fā)育的miRNA lin-4[8]。2000年,Reinhart等在線(xiàn)蟲(chóng)中發(fā)現(xiàn)了第2個(gè)異時(shí)性開(kāi)關(guān)基因let27,并在人類(lèi)細(xì)胞中找到了該基因的同源基因[9]。2001年,小RNA被統(tǒng)一命名為microRNA(miRNA)。2002年,4個(gè)科學(xué)小組從植物中分別發(fā)現(xiàn)了miRNA,自此拉開(kāi)了植物miRNA研究的序幕[10-13]。盡管植物miRNA的研究起步較晚,但是隨著研究方法的不斷革新,越來(lái)越多的植物miRNA逐步被鑒定(數(shù)據(jù)庫(kù)網(wǎng)址:http://microrna.sanger.ac.uk)。隨著高通量測(cè)序技術(shù)的發(fā)展與應(yīng)用,相信未來(lái)幾年內(nèi)該數(shù)據(jù)庫(kù)中植物miRNA的信息還會(huì)被快速豐富。
1.2miRNA的生物合成
編碼miRNA的基因在RNA聚合酶Ⅱ的作用下形成初級(jí)轉(zhuǎn)錄物 pri-miRNA[14],長(zhǎng)度大約為300~1 000核苷酸。pri-miRNA在一種類(lèi)Dicer酶——DCL1的作用下被剪切成包含莖環(huán)結(jié)構(gòu)的60~300 nt的miRNA前體pre-miRNA[15]。然后,pre-miRNA被DCL1切割產(chǎn)生約21~26 nt的雙鏈miRNA,構(gòu)成miRNA/miRNA*雙鏈分子[16]。在miRNA甲基轉(zhuǎn)移酶HEN1的作用下,miRNA/miRNA*雙鏈分子3′端最后1個(gè)核苷酸發(fā)生甲基化修飾,形成成熟的miRNA[17]。之后,成熟的miRNAs被HASTY(homogentisate solanesyl transferase,簡(jiǎn)稱(chēng)HST)轉(zhuǎn)運(yùn)至細(xì)胞核外[18]。成熟的miRNAs序列會(huì)自身折疊成不完全配對(duì)的發(fā)卡結(jié)構(gòu)進(jìn)入RNA介導(dǎo)的沉默復(fù)合體RNA誘導(dǎo)沉默復(fù)合體(RNA-induced silencing complex,簡(jiǎn)稱(chēng)RISC)中行使進(jìn)一步的功能[19]。miRNA本身并不具備核酸酶的功能,在RISC中它僅發(fā)揮靶向作用,與miRNA形成RISC的AGO蛋白對(duì)靶基因具有切割能力[20-21]。
1.3植物miRNA對(duì)靶基因的調(diào)控
miRNA可以通過(guò)堿基互補(bǔ)配對(duì)的方式實(shí)現(xiàn)對(duì)靶基因mRNA的切割或者抑制mRNA翻譯,進(jìn)而參與調(diào)控植物的生長(zhǎng)發(fā)育。miRNA抑制mRNA的翻譯亦或是切割mRNA取決于miRNA與靶序列互補(bǔ)配對(duì)的程度。互補(bǔ)配對(duì)程度高則可能對(duì)mRNA進(jìn)行切割,而配對(duì)程度低則只是抑制mRNA的翻譯[22]。在植物中,miRNA和靶基因的互補(bǔ)程度高于動(dòng)物,大部分植物miRNA和靶基因只存在4個(gè)以下的核苷酸錯(cuò)配。
相比于動(dòng)物中有60%的蛋白質(zhì)受miRNA的調(diào)控,植物中只有不到10%的蛋白質(zhì)是受miRNA調(diào)控的。盡管如此,植物中的miRNA在生長(zhǎng)發(fā)育、激素響應(yīng)、抗逆抗病等多個(gè)方面仍然發(fā)揮著至關(guān)重要的調(diào)控作用。
2銅穩(wěn)態(tài)中的miRNAs
在銅脅迫響應(yīng)過(guò)程中,植物體內(nèi)多個(gè)miRNA通過(guò)調(diào)節(jié)不同功能的含銅蛋白以維持內(nèi)部環(huán)境的穩(wěn)定。有研究表明,miR395、miR397、miR398、miR408、miR857及miR1444均參與了植物的低銅響應(yīng)。Burkhead等將miR397、miR408、miR398和miR857這4種非常保守的miRNA統(tǒng)稱(chēng)為Cu-miRNAs[23]。Cu-miRNAs參與了光合作用、呼吸作用、抗氧化及木質(zhì)素合成等過(guò)程。近期的研究表明,miR1444在楊樹(shù)的銅應(yīng)答過(guò)程中也發(fā)揮重要功能。
大量研究顯示,Cu-miRNAs在植物營(yíng)養(yǎng)穩(wěn)態(tài)中扮演重要角色,即Cu-miRNAs除了受銅調(diào)控之外,還受多種元素的調(diào)控。miR397受碳(C)、氮(N)、硫(S)、磷(P)、鎘(Cd)、鐵(Fe)元素調(diào)控;miR398受C、N、S、P、Cd、Fe、鋅(Zn)元素調(diào)控;miR408受P、N、Fe元素調(diào)控;miR857受P、N元素調(diào)控;同時(shí),miR857在擬南芥中也是鎘應(yīng)答miRNA,植株缺乏C、N、S、P元素時(shí),miR857的表達(dá)受抑制[24-27]。
此外,Cu-miRNAs在植物發(fā)育、新陳代謝和防御過(guò)程中均發(fā)揮重要功能。各種脅迫處理也可以影響Cu-miRNAs表達(dá),如寒冷、NaCl、強(qiáng)光、病原菌、干旱、臭氧及氧化等非生物、生物脅迫會(huì)誘導(dǎo)或抑制Cu-miRNAs表達(dá),且同一種Cu-miRNA在不同植物中具有不同的應(yīng)答模式。因此,研究Cu-miRNAs生物學(xué)功能時(shí),不能忽視大量脅迫處理對(duì)其表達(dá)的影響,甚至有人推測(cè),這些脅迫對(duì)Cu-miRNAs的調(diào)控是影響植物生長(zhǎng)受阻的唯一因素[27]。
2.1miR397
miR397的靶基因是以銅為輔基的漆酶(LAC)的編碼基因。1985年,Bertrand首次在漆樹(shù)中鑒定了漆酶。漆酶是一種多銅氧化酶,1分子蛋白結(jié)合4個(gè)銅離子。植物漆酶分泌到細(xì)胞壁后,在有氧條件下可以催化木質(zhì)素單體聚合成木質(zhì)素。Liang等測(cè)定擬南芥lac15突變體種子木質(zhì)素含量時(shí)發(fā)現(xiàn),與野生型相比,突變體木質(zhì)素總含量約降低了30%,第1次直接證明了漆酶參與植物木質(zhì)素的合成過(guò)程[28]。Berthet等研究表明,擬南芥lac4-1lac17、lac4-2lac17雙突變體的木質(zhì)素含量均比野生型降低了20%~40%;而lac4、lac17單突變體中木質(zhì)素含量變化不明顯,首次證明了LAC4、LAC17參與了擬南芥莖的木質(zhì)化過(guò)程[29]。
擬南芥miR397家族有2個(gè)成員,通過(guò)與LAC2、LAC4、LAC17的第5個(gè)外顯子結(jié)合而降解這些靶基因[30]。在擬南芥中過(guò)表達(dá)miR397b,LAC2、LAC3、LAC9、LAC10、LAC12、LAC14、LAC15、LAC16、LAC17等基因的表達(dá)水平均降低,轉(zhuǎn)基因植株木質(zhì)素積累量明顯降低,次級(jí)細(xì)胞壁厚度降低,花序數(shù)量增加,種子增大,種子數(shù)量增加。突變LAC4基因的miR397作用位點(diǎn)(但不改變基因編碼的氨基酸序列)后,與野生型擬南芥相比,轉(zhuǎn)基因植株變矮,蓮座葉變小,果莢變少變短,種子數(shù)量減少[31]。在水稻中過(guò)表達(dá)OsmiR397,轉(zhuǎn)基因植株也出現(xiàn)了種子變大、花序增加的現(xiàn)象,且單位面積產(chǎn)量增加了25%[32]。
毛果楊miR397含有3個(gè)家族成員miR397a、miR397b、miR397c,生物信息學(xué)預(yù)測(cè)結(jié)果顯示,至少有26個(gè)漆酶基因可以作為miR397a的靶基因[33]。Lu等研究了毛果楊miR397的靶基因——3種漆酶基因PtLAC5、PtLAC6、PtLAC110a,發(fā)現(xiàn)在銅處理下,PtLAC5、PtLAC6在所檢測(cè)的組織中均表達(dá),PtLAC5在幼莖中表達(dá)量最高,PtLAC6在發(fā)育中的次生木質(zhì)部中表達(dá)量最高,PtLAC110a是一種根特異性表達(dá)的漆酶基因;此外,毛果楊根莖葉中miR397a的含量隨著銅濃度的增加而降低,其靶基因PtLAC5、PtLAC6、PtLAC110a的表達(dá)量則隨著銅處理濃度的增加而增加[34]。
2.2miRNA398
銅穩(wěn)態(tài)過(guò)程中,miR398的靶基因有3種,分別編碼含銅蛋白Cu/Zn超氧化物歧化酶、線(xiàn)粒體細(xì)胞色素C氧化酶亞基V(COX5b.1)、超氧化物歧化酶的銅伴侶蛋白(CCS1)[35]。相關(guān)研究表明,miR398與編碼銅/鋅超氧化物歧化酶的2個(gè)基因CSD1、CSD2及編碼線(xiàn)粒體細(xì)胞色素C氧化酶亞基Ⅴ的COX5b.1 mRNA上的核苷酸序列互補(bǔ)性在擬南芥、水稻中是保守的[36]。miR398與CSD2 mRNA的編碼區(qū)互補(bǔ),與CSD1、COX5b.1 mRNA的5′非編碼區(qū)(5′-UTR)互補(bǔ)[37]。miR398家族具有2個(gè)成員(3個(gè)基因座),其中miR398b與miR398c的核苷酸序列完全相同,miR398a 3′端的最后1個(gè)核苷酸與miR398b、miR398c存在差異[38]。
銅離子過(guò)量條件下ROS會(huì)過(guò)量積累。Cu/Zn SOD可以專(zhuān)一性地清除細(xì)胞內(nèi)的ROS,將其降解為分子氧、過(guò)氧化氫。當(dāng)水稻體內(nèi)產(chǎn)生大量ROS時(shí),miR398的表達(dá)水平降低,導(dǎo)致細(xì)胞質(zhì)CSD1、葉綠體CSD2的表達(dá)量快速上調(diào),使細(xì)胞內(nèi)的銅離子流向Cu/Zn SOD,Cu/Zn SOD的活性增強(qiáng),既降低了細(xì)胞內(nèi)自由銅離子的含量,又使細(xì)胞具有更強(qiáng)的清除氧自由基的能力,進(jìn)而使植物表現(xiàn)出抗氧化能力[39]。在擬南芥中過(guò)表達(dá)miR398前體的共抑制轉(zhuǎn)基因植株中,miR398b、miR398c的表達(dá)量降低,導(dǎo)致靶基因CSD的表達(dá)量增加,相對(duì)于野生型植株,在高銅處理狀態(tài)下轉(zhuǎn)基因幼苗發(fā)芽率明顯提高,在強(qiáng)氧化劑甲基紫精處理后轉(zhuǎn)基因幼苗的生長(zhǎng)發(fā)育未受影響[38]。
在水稻中,根據(jù)密碼子的簡(jiǎn)并性,突變CSD2基因上miR398的結(jié)合位點(diǎn),但不改變CDS2的氨基酸序列,相關(guān)研究表明,CSD2基因的表達(dá)不再受miR398調(diào)控,重金屬銅處理后轉(zhuǎn)基因植株的抗性明顯增加[40]。過(guò)表達(dá)miR398b、miR398c的擬南芥植株出現(xiàn)了CSD1、CSD2水平降低的現(xiàn)象,但COX5b.1的mRNA、蛋白質(zhì)含量均未受到影響;與miR398互補(bǔ)的CSD1、CSD2基因的核苷酸序列突變后,miR398不能識(shí)別CSDs基因,CSD1、CSD2的mRNA水平上調(diào),但是CSD1、CSD2蛋白水平卻依然對(duì)miR398敏感,這暗示miRNA在不能與靶mRNA完全互補(bǔ)的時(shí)候,可以負(fù)調(diào)控靶蛋白的翻譯過(guò)程[37]。
2.3miRNA408
miR408在植物體內(nèi)的主要功能是參與非生物脅迫應(yīng)答和維持細(xì)胞內(nèi)銅離子含量的穩(wěn)定性,目前對(duì)miR408的研究還比較少。miR408的靶基因編碼了光合電子傳遞鏈中的含銅蛋白質(zhì)體藍(lán)素(PC)、參與木質(zhì)素氧化聚合的漆酶[41]。PC是植物光合電子傳遞鏈中位于類(lèi)囊體膜內(nèi)表面的銅蛋白[42],是光系統(tǒng)Ⅰ電子傳遞鏈的重要組成部分,1分子PC含有1個(gè)銅離子。植物中大約有50%銅離子結(jié)合PC存在于葉綠體中,從而參與光合作用。
Sunkar認(rèn)為,擬南芥miR408的目標(biāo)基因是質(zhì)體藍(lán)素基因PC和3種漆酶基因LAC3、LAC12、LAC13[43]。預(yù)測(cè)表明,miR408通過(guò)與LAC3、LAC12、LAC13的5′-UTR結(jié)合而調(diào)控靶基因的表達(dá)[30]。在毛果楊中,miR408的靶基因包括質(zhì)體藍(lán)素蛋白家族基因(PCLs)PtPCL1、PtPCL2、PtPCL3及漆酶基因PtLAC4。毛果楊miR408在成熟葉、次生木質(zhì)部及韌皮部中表達(dá)量較高,且表達(dá)量隨著銅濃度的升高而降低,其靶基因的表達(dá)水平則隨著銅濃度的升高而增加[34]。擬南芥、毛果楊、水稻miR408的核苷酸序列比對(duì)結(jié)果表明,miR408是一種高度保守的miRNA,在大量單子葉、雙子葉甚至裸子植物中都存在[44]。
在擬南芥中,當(dāng)銅離子匱乏時(shí),轉(zhuǎn)錄因子SPL7會(huì)與miR408啟動(dòng)子區(qū)的多個(gè)GTAC基序結(jié)合,誘導(dǎo)miR408表達(dá);在spl7突變體中過(guò)表達(dá)miR408,低銅條件下轉(zhuǎn)化子的光合速率、質(zhì)體藍(lán)素功能恢復(fù)正常[45]。此外,研究者推測(cè),轉(zhuǎn)基因植物如果能降低miR408表達(dá)量,引起漆酶含量升高,即可達(dá)到通過(guò)增加維管組織中木質(zhì)素含量而增強(qiáng)植物抵抗病原菌侵染能力的目的。
2.4miR857
目前,對(duì)miR857的研究還較少。miR857的靶基因是漆酶家族中的LAC7,通過(guò)與LAC7的第1個(gè)外顯子結(jié)合控制LAC7的表達(dá)[30]。LAC7在擬南芥葉片的排水器、根毛中特異表達(dá)[46];miR857還在擬南芥維管組織的次生生長(zhǎng)中發(fā)揮作用[47]。此外,在擬南芥果實(shí)中miR857不表達(dá),過(guò)表達(dá)miR857的擬南芥轉(zhuǎn)基因植株出現(xiàn)了異常的小角果,使種子嚴(yán)重減產(chǎn);盡管在轉(zhuǎn)基因植株中并沒(méi)有找到miR857和角果大小的相關(guān)性,但是擬南芥LAC7的表達(dá)量與種子數(shù)量具有明顯的相關(guān)性,LAC7的表達(dá)量不足,會(huì)嚴(yán)重影響種子的生成[48]。在很長(zhǎng)一段時(shí)間內(nèi),研究者認(rèn)為,miR857只在擬南芥中存在。隨著測(cè)序技術(shù)的不斷發(fā)展,在其他植物中陸續(xù)鑒定了miR857。有研究表明,miR857在十字花科植物中是保守的[49]。在白色羽扇豆中,miR857在根、莖、葉中均表達(dá),缺磷處理后其表達(dá)量降低[50]。Zhang等于2014年在棉花中也鑒定了miR857[51]。
2.5miR1444
毛果楊中的miR1444是一種楊樹(shù)特異性miRNA。在楊樹(shù)中,miR1444調(diào)控銅蛋白多酚氧化酶(PPO)[34],PPO具有將酚類(lèi)氧化成醌類(lèi)的功能[52]。Lu等研究表明,PtPPO3、PtPPO6是miRNA1444的靶基因,并預(yù)測(cè)楊樹(shù)中至少有13個(gè)PtPPOs基因受miR1444調(diào)控;隨著銅處理濃度的增加,miR1444的表達(dá)量降低,而其靶基因PtPPO3、PtPPO6的表達(dá)量逐漸增加[34]。當(dāng)銅缺乏時(shí),miR1444積累,PPO的表達(dá)被抑制[53]。此外,銅缺乏條件下,毛果楊中鋅離子含量明顯上升;隨著鋅離子濃度的增加,各組織中miR1444含量均呈上升趨勢(shì),且miR1444的靶基因表達(dá)量下降。這些研究表明,miR1444不僅受銅調(diào)控,還參與了鋅脅迫的應(yīng)答[54]。
綜上所述,隨著外界銅濃度的變化,植物通過(guò)特定Cu-miRNAs的表達(dá)調(diào)節(jié)含銅蛋白的含量,進(jìn)而維持植物細(xì)胞內(nèi)的銅穩(wěn)態(tài)。表1中列舉了植物中的Cu-miRNAs及其靶基因[27,44]。
3SPL7轉(zhuǎn)錄因子對(duì)miRNA的調(diào)控
所有低銅響應(yīng)相關(guān)的miRNA和基因,在其啟動(dòng)子上均含有GTAC基序。GTAC基序最初是在綠藻的糞生素氧化酶(Cpx1)和細(xì)胞色素C6(Cyc6)基因的啟動(dòng)子區(qū)域鑒定的,GTAC基序被稱(chēng)為銅響應(yīng)元件(CuRE)[55]。GTAC基序是轉(zhuǎn)錄因子SPL7的結(jié)合位點(diǎn),SPL7與這一銅響應(yīng)特定基序的結(jié)合決定了植物miRNA對(duì)銅脅迫的應(yīng)答[56]。
GTAC基序是Cu-miRNAs和某些基因受低銅調(diào)控所必需的。當(dāng)銅獲取受限時(shí),SPL7會(huì)上調(diào)細(xì)胞的銅攝取量和吸收量,即SPL7通過(guò)上調(diào)細(xì)胞膜上的COPT1銅轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的表達(dá)量來(lái)行使此功能[53]。銅缺乏條件會(huì)誘導(dǎo)植物中miR398、miR397、miR408和miR857的上調(diào)表達(dá),miRNAs進(jìn)而下調(diào)含銅蛋白CCS、Cu/Zn SOD、PCL、LAC和PPO的表達(dá)量。例如,銅匱乏條件下,毛果楊中一些銅相關(guān)miRNA會(huì)下調(diào)一些含銅蛋白基因的轉(zhuǎn)錄,降低含銅蛋白的含量,從而將銅優(yōu)先供給COX和PC等光合電子傳遞鏈中重要的含銅蛋白[23]。在恢復(fù)銅供給后,質(zhì)體藍(lán)素水平和光合電子傳遞效率先于其他含銅蛋白被優(yōu)先恢復(fù),銅相關(guān)的miRNAs能調(diào)節(jié)輔因子銅的優(yōu)先供給順序[53]。在spl7突變體中,miR397a、miR408和miR857的表達(dá)不再受低銅條件誘導(dǎo),這說(shuō)明SPL7在調(diào)節(jié)植物體內(nèi)銅分配過(guò)程中發(fā)揮重要作用(圖1)[56]。
4展望
自線(xiàn)蟲(chóng)中發(fā)現(xiàn)的第1個(gè)miRNA至今,已有30 000多個(gè)miRNAs被鑒定,據(jù)估計(jì)miRNA基因約占基因總量的1%,因此,仍有大量的miRNA尚未被鑒定。目前,Cu-miRNAs的研究仍集中于miR397、miR398、miR408、miR857和miR1444等miRNAs中。隨著高通量測(cè)序技術(shù)的不斷進(jìn)步,期望能在更多的物種中發(fā)現(xiàn)新的Cu-miRNAs。
盡管很多miRNAs被證實(shí)與植物的生長(zhǎng)發(fā)育和逆境脅迫抗性相關(guān),但是某些miRNAs對(duì)靶基因的調(diào)控機(jī)制尚不清晰。miRNA一般靶向1個(gè)基因家族或者作用于相同代謝途徑中的基因,這種一對(duì)多的形式為研究miRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)增加了難度。目前對(duì)植物miRNA的相關(guān)研究多集中在確定miRNA與脅迫抗性的相關(guān)性方面。
植物殺菌劑的施加、銅礦的長(zhǎng)期開(kāi)采、生活污水的排放等提高了土壤中的銅離子濃度[57]。在發(fā)現(xiàn)Cu-miRNAs之前,銅轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白及銅伴侶蛋白是植物抗銅分子生物學(xué)研究的重點(diǎn);miRNA的表達(dá)比蛋白質(zhì)更迅速,效率更高,可以快速應(yīng)對(duì)外界銅離子濃度的變化情況。因此,通過(guò)轉(zhuǎn)基因手段調(diào)控 Cu-miRNAs 表達(dá),培育更具耐受銅脅迫特性的轉(zhuǎn)基因植株,為采用生物技術(shù)手段對(duì)銅污染土壤進(jìn)行植物修復(fù)提供了一種新思路。
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