方 舟,方 芳,季方茹,李艷翠
(佳木斯大學附屬第一醫(yī)院藥劑科,黑龍江 佳木斯 154003)
三種藥物相關基因多態(tài)性在黑龍江省東部地區(qū)糖尿病患者中的分布①
方 舟,方 芳,季方茹,李艷翠
(佳木斯大學附屬第一醫(yī)院藥劑科,黑龍江 佳木斯 154003)
目的:比較黑龍江佳木斯地區(qū)健康人群和2型糖尿病患者中藥物相關基因TCF7L2SNPrs12255372、IRS-1SNPrs2943650、MTHFRC677TSNPrs1801133基因多態(tài)性的分布,為糖尿病患者的診斷與個體化治療提供臨床依據(jù)。方法:應用熒光染色原位雜交法(Fish法)檢測佳木斯地區(qū)健康人群和2型糖尿病(T2DM)患者TCF7L2、IRS-1、MTHFRC677T的基因型。采用SPSS17.0軟件,計數(shù)資料采用χ2檢驗方法分析。結果:佳木斯地區(qū)健康人群和2型糖尿病患者TCF7L2、IRS-1的三種基因型頻率分布組間比較P>0.05,基因型分布無統(tǒng)計學意義;MTHFRC677T三種基因型頻率分布組間比較(P<0.05),基因型分布有統(tǒng)計學意義。結論:黑龍江佳木斯地區(qū)健康人群MTHFRC677TSNPrs1801133位點基因多態(tài)性分布與2型糖尿病患者存在關聯(lián);IRS-1SNPrs2943650、TCF7L2SNPrs12255372基因位點與2型糖尿病患者沒有相關性。
糖尿病,藥物相關基因,基因多態(tài)性,熒光原位雜交
熒光原位雜交DNA測序分析程序:北京華夏時代基因科技發(fā)展有限公司;TL-988實時熒光定量PCR儀:西安天隆科技儀器有限公司;掌式離心機:珠海博邁杰生物科技有限公司;HC-3017高速離心機:科大創(chuàng)新股份有限公司中佳分公司;PHARM-GENE200SNP分析樣品處理試劑,PHARM-GENE01SNP分析保存液(北京華夏時代基因科技
發(fā)展有限公司)。
2.1 標本來源
選取2014-06~2016-06住院的2型糖尿病患者324例,體檢健康人270例,糖尿病排除1型糖尿病、妊娠型糖尿病和特殊類型糖尿病,診斷依據(jù)WHO1998年新的診斷標準。
2.2 基因檢測
2.2.1 基因多態(tài)性檢測方法
檢測條件:95℃預變性600s;95℃變性30s,62℃復性75s,45或50個循環(huán)。在樣品檢測的同時,加測3種不同基因型的質控品作為對照。
方法:取150μL新鮮全血加入含有1000μL氯化銨溶液的Eppendorf試管中,混合混勻后室溫放置5min,離心5min,加入100μL耀金保,震蕩混合混勻,室溫放置20~30min。吸取本液1.0~1.5μL加入待測基因對應的耀金分試劑中,漩渦混合均勻,瞬時離心,上至機器中檢測。
解析:分析已知反應物和產物,結合題意“調節(jié)pH≈3”可知缺項是 H+,Ce3+→Ce(OH)4,失1 e-,H2O2→Ce(OH)4,得2 e-,根據(jù)得失電子守恒,Ce3+前的化學計量數(shù)為2,H2O2前的化學計量數(shù)為1,再根據(jù)電荷守恒,H+前的化學計量數(shù)為6,最后觀察可知H2O2前的化學計量數(shù)為6,配平的方程式為2Ce3++H2O2+6H2O==2Ce(OH)4↓+6H+。
2.2.2 基因型的判斷
將檢測的樣品熒光曲線圖與質控品曲線圖進行比較。
TCF7L2SNPrs12255372熒光擬合曲線見圖1;IRS1SNPrs2943650熒光擬合曲線見圖2;MTHFRSNPrs1801133熒光擬合曲線見圖3。
2.3 統(tǒng)計學方法
采用SPSS17.0統(tǒng)計軟件χ2檢驗來計算糖尿病組和健康人組的三種基因型的分布頻率,P<0.05為差異具有顯著性。
圖1 TCF7L2 SNP rs12255372(G>T)熒光擬合曲線
圖2 IRS 1 SNP rs2943650(C>T)熒光擬合曲線
圖3 MTHFR SNP rs1801133(C>T)熒光擬合曲線
3.1TCF7L2基因多態(tài)性在健康人和糖尿病患者中的分布
選取健康人對照組270例,糖尿病患者324例,按上述方法測定TCF7L2SNPrs12255372基因型,結果:GG基因型155例,分布頻率為57.4%;GT型75例,頻率27.8%;TT型40例,頻率14.8%,其中G等位基因頻率為66.7%,T等位基因頻率為33.3%。糖尿病患者324例,TCF7L2SNPrs12255372基因GG型170例,頻率52.5%;GT型86例,頻率26.5%;TT型68例,頻率21.0%,其中G等位基因頻率為65.7%,T等位基因頻率為34.3%。健康人與糖尿病患者TCF7L2基因分布頻率見表1。
表1 健康人與糖尿病患者TCF7L2基因型分布頻率表
對照組與糖尿病組TCF7L2SNPrs12255372其等位基因概率經χ2檢驗,可知(χ2=0.104,P>0.05),其等位基因分布頻率沒有顯著性差異,無統(tǒng)計學意義。三種基因型GG/GT/TT分布頻率,經χ2檢驗,可知(χ2=3.826,P>0.05),三種基因型分布頻率沒有差異性,不具有統(tǒng)計學意義。
3.2IRS-1 基因多態(tài)性在健康人和糖尿病患者中的分布
選取糖尿病患者324例,按上述方法測定IRS1SNPrs2943650基因型:測定結果:CC型6例,頻率1.9%;CT型36例,頻率11.1%;TT型282例,頻率87%,其中C等位基因頻率為48%,T等位基因頻率為92.2%。選取健康人對照組270例,測定結果:CC型9例,頻率3.3%;CT型36例,頻率13.3%;TT型225例,頻率83.3%,其中C等位基因頻率為10%,T等位基因頻率為90%。健康人與糖尿病患者IRS-1基因型分布頻率見表2。
表2 健康人與糖尿病患者IRS 1基因型分布頻率表
對照組與糖尿病患者IRS-1SNPrs2943650基因型頻率,其等位基因概率經χ2檢驗,可知(χ2=1.654,P>0.05),其等位基因分布頻率無顯著性差異,不具有統(tǒng)計學意義。三種基因型CC/CT/TT頻率經χ2檢驗,可知(χ2=2.117,P>0.05),三種基因型分布頻率沒有差異性,不具有統(tǒng)計學意義。
3.3MTHFR基因多態(tài)性在健康人和糖尿病患者中的分布
選取健康人對照組270例,測定MTHFRSNPrs1801133基因,結果:CC型36例,頻率13.3%;CT型135例,頻率50%;TT型99例,頻率36.7%,其中C等位基因頻率為38.3%,T等位基因頻率為61.7%。測定糖尿病患者324例,MTHFRSNPrs1801133基因CC型70例,頻率21.6%;CT型119例,頻率36.7%;TT型135例,頻率41.7%,其中C等位基因頻率為40.0%,T等位基因頻率為60.0%。健康人與糖尿病患者MTHFR基因分布概率見表3。
表3 健康人與糖尿病患者MTHFR基因型分布頻率表
對照組與糖尿病組MTHFR677等位基因概率經χ2檢驗,可知(χ2=0.331,P>0.05),其等位基因分布頻率沒有顯著性差異。對照組與糖尿病組MTHFR677基因CC/CT/TT三種基因型頻率,經χ2檢驗,可知(χ2=12.647,P<0.05),三種基因型分布頻率有顯著性差異性,具有統(tǒng)計學意義。
TCF7L2基因(又稱T細胞因子-4)是Wnt信號傳導通路中的轉錄因子,參與細胞增殖與分化的調節(jié)[5],它位于人類10號染色體長臂25區(qū)(染色體10q25.3),共有2159個堿基對,包含17個外顯子,其表達產物是T細胞因子/淋巴細胞增強子結合因子中的一個。一些研究認為TCF7L2基因變異與2型糖尿病相關[7],但是同時也有研究認為沒有關聯(lián)[8]。這可能是不同的研究者選取的基因位點及病例入選標準不同有關??傊P于TCF7L2基因多態(tài)性與2型糖尿病的關聯(lián)還沒有定論,有必要進行大樣本深入研究。本試驗研究本地區(qū)健康人TCF7L2TSNPrs12255372基因多態(tài)性與2型糖尿病患者的基因多態(tài)性不相關。MTHFR基因位于染色體1q36.3,編碼區(qū)長1980bp,MTHFR基因的677位堿基胞嘧啶(Cytosine,C)變異為胸腺嘧啶(Thymine,T),使編碼的丙氨酸(Ala)變異為纈氨酸(Val)[9]而產生多態(tài)性,它與很多疾病相關[10],本實驗表明MTHFRSNPrs1801133三種基因型分布頻率在黑龍江省佳木斯地區(qū)健康人和糖尿病患者中有顯著性差異性。胰島素受體底物1(IRS-1)基因突變導致胰島素對血小板活性的抑制作用削弱,導致胰島素抵抗。胰島素受體底物1(IRS-1)廣泛存在于胰島素敏感的組織中,在胰島素受體信號傳導通路中處于關鍵部位,是胰島素受體激酶的第一個直接底物。本實驗對IRS-1SNPrs2943650基因CC/CT/TT三種基因頻率進行統(tǒng)計分析,經χ2檢驗,可知(χ2=2.117,P>0.05),三種基因型分布頻率沒有差異性,不具有統(tǒng)計學意義。
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佳木斯大學科學技術面上項目,編號:S2014-031。
方舟(1984~)男,黑龍江佳木斯人,碩士,主管藥師。
李艷翠(1973~)女,黑龍江鶴崗人,碩士,主任藥師。E-mail:liyancui3400@163.com。
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1008-0104(2017)03-0084-03
2016-12-08)