PHP技術(shù)支持的基因數(shù)據(jù)庫(kù)Web平臺(tái)設(shè)計(jì)及構(gòu)建

王浩

摘 要：近年來(lái)，對(duì)生物學(xué)的研究已經(jīng)從基因的組成和排列分析開始，已經(jīng)建成的基因數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)量和類別繁多，但由于數(shù)據(jù)庫(kù)所采用的格式不統(tǒng)一，對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)的查詢、檢索及數(shù)據(jù)庫(kù)的資源共享帶來(lái)了很多困難。利用PHP技術(shù)構(gòu)建基因數(shù)據(jù)庫(kù)的Web平臺(tái)，可以大大提高數(shù)據(jù)庫(kù)的利用率，該平臺(tái)具有良好的兼容性和擴(kuò)展性是其他數(shù)據(jù)庫(kù)所不具備的特點(diǎn)。對(duì)生物基因數(shù)據(jù)庫(kù)的共享及對(duì)推動(dòng)生物基因的研究和生物技術(shù)的發(fā)展有著重要的意義。

關(guān)鍵詞：數(shù)據(jù)庫(kù) PHP技術(shù) 資源共享 Web平臺(tái)

中圖分類號(hào)：Q343 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼：A 文章編號(hào)：1672-3791（2017）02（b）-0043-02

日前，針對(duì)生物學(xué)的研究已經(jīng)從基因的組成和排列進(jìn)行研究分析，而且已經(jīng)建成的基因數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)量和類別繁多。根據(jù)有關(guān)文獻(xiàn)資料記錄，已有的超過(guò)5 000多條記錄的基因數(shù)據(jù)有1 500萬(wàn)個(gè)左右，并且這個(gè)數(shù)據(jù)目前正逐年增加。

基因數(shù)據(jù)庫(kù)的數(shù)目如此繁多，但是格式并不統(tǒng)一。數(shù)據(jù)庫(kù)有一些使用的是標(biāo)準(zhǔn)的word格式、有一些是基因序列的記錄、有的是Excel電子表格格式、也有一些是基因信息點(diǎn)的記錄。由于基因數(shù)據(jù)庫(kù)采用的格式不統(tǒng)一，對(duì)基因數(shù)據(jù)庫(kù)的資源共享帶來(lái)了不可小覷的困難，這不僅不利于查詢和檢索，而且也沒(méi)有充分的發(fā)揮出基因數(shù)據(jù)庫(kù)的功能。

從這一原因出發(fā)，利用 PHP技術(shù)構(gòu)建的基因數(shù)據(jù)庫(kù)能為Web平臺(tái)的構(gòu)建提供了良好的操作平臺(tái)。

1 生物基因數(shù)據(jù)庫(kù)的的簡(jiǎn)要介紹

生物基因數(shù)據(jù)庫(kù)是在生物基因研究的過(guò)程之中，所得到的研究結(jié)果或者記錄的信息。由于生物基因自身的組成及序列的復(fù)雜性，研究人員在進(jìn)行基因數(shù)據(jù)庫(kù)的研究構(gòu)建過(guò)程中具有一定的復(fù)雜性?；驍?shù)據(jù)庫(kù)不僅能夠記錄和保存基因研究過(guò)程中的相關(guān)信息，而且也記錄了生物基因各個(gè)階段的測(cè)量數(shù)據(jù)和不同段位的基因排列的信息[1]。

生物基因數(shù)據(jù)庫(kù)中一般記錄的基因數(shù)據(jù)信息在20～60個(gè)。根據(jù)數(shù)據(jù)庫(kù)中儲(chǔ)存的生物基因數(shù)據(jù)信息來(lái)看，數(shù)據(jù)庫(kù)中的信息量來(lái)源廣泛、記錄的形式多樣。因此基因研究的數(shù)據(jù)信息量大，基因數(shù)據(jù)庫(kù)類別和數(shù)目眾多，這都對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)資源共享和數(shù)據(jù)庫(kù)共享帶來(lái)了局限和意想不到的難度。

2 利用PHP技術(shù)進(jìn)行基因數(shù)據(jù)庫(kù)Web平臺(tái)構(gòu)建的優(yōu)勢(shì)

2.1 PHP技術(shù)簡(jiǎn)介

PHP技術(shù)是計(jì)算機(jī)互聯(lián)網(wǎng)服務(wù)器端制作動(dòng)態(tài)網(wǎng)頁(yè)使用的一種腳本語(yǔ)言，PHP已經(jīng)被作為一項(xiàng)常用的應(yīng)用技術(shù)。動(dòng)態(tài)網(wǎng)頁(yè)界面的設(shè)計(jì)和制作處理經(jīng)常使用PHP和HTML編碼語(yǔ)言。如果動(dòng)態(tài)網(wǎng)頁(yè)是使用PHP技術(shù)制作的，當(dāng)用戶打開互聯(lián)網(wǎng)頁(yè)面時(shí)，互聯(lián)網(wǎng)的服務(wù)器端就會(huì)通過(guò)PHP指令進(jìn)行相關(guān)數(shù)據(jù)的傳輸，最后通過(guò)服務(wù)器將最終結(jié)果傳送到用戶的計(jì)算機(jī)上，進(jìn)而實(shí)現(xiàn)了用戶利用平臺(tái)對(duì)互聯(lián)網(wǎng)數(shù)據(jù)庫(kù)的訪問(wèn)。

2.2 利用PHP技術(shù)進(jìn)行基因數(shù)據(jù)庫(kù)Web平臺(tái)構(gòu)建的優(yōu)勢(shì)分析

作為計(jì)算機(jī)動(dòng)態(tài)網(wǎng)頁(yè)制作的一種腳本語(yǔ)言，PHP技術(shù)不僅具有廣泛的應(yīng)用范圍，而且具有一定的優(yōu)勢(shì)。其優(yōu)勢(shì)主要表現(xiàn)在以下幾點(diǎn)：

第一點(diǎn)：使用PHP技術(shù)制作動(dòng)態(tài)網(wǎng)頁(yè)的過(guò)程中，不僅設(shè)計(jì)語(yǔ)言簡(jiǎn)單、程序編寫容易，而且PHP技術(shù)不需要與其他程序進(jìn)行變量的聲明，比如其他的計(jì)算機(jī)語(yǔ)言如C語(yǔ)言或Basic語(yǔ)言，在動(dòng)態(tài)網(wǎng)頁(yè)制作過(guò)程中需要進(jìn)行變量聲明。除了上述優(yōu)點(diǎn)之外使用PHP技術(shù)還能加快陳列與散陳列的創(chuàng)建速度。在進(jìn)行Web平臺(tái)的構(gòu)建過(guò)程中PHP腳本語(yǔ)言還提供了組織和封裝代碼操作的簡(jiǎn)單方法。

第二點(diǎn)：PHP技術(shù)在Web平臺(tái)的設(shè)計(jì)和構(gòu)建過(guò)程中還具有實(shí)現(xiàn)跨平臺(tái)和較快平臺(tái)設(shè)計(jì)的優(yōu)勢(shì)，在動(dòng)態(tài)網(wǎng)頁(yè)的制作過(guò)程中，PHP技術(shù)不僅可以實(shí)現(xiàn)Web平臺(tái)在不同的Unix版本中進(jìn)行設(shè)計(jì)和構(gòu)建，而且還可以進(jìn)行Windows網(wǎng)頁(yè)平臺(tái)的設(shè)計(jì)。綜上所述，作為一種跨平臺(tái)、快速學(xué)習(xí)的PHP技術(shù)是一種具備良好的交換能力的應(yīng)用腳本語(yǔ)言。

第三點(diǎn)：在進(jìn)行Web平臺(tái)的構(gòu)建中， PHP技術(shù)具備較好的兼容性和擴(kuò)展性。該技術(shù)可與Apache以及其他的擴(kuò)展數(shù)據(jù)庫(kù)緊密結(jié)合，共同實(shí)現(xiàn)對(duì)Web平臺(tái)的設(shè)計(jì)和構(gòu)建。

除此之外，使用PHP技術(shù)設(shè)計(jì)和構(gòu)建的動(dòng)態(tài)網(wǎng)頁(yè)更具有安全性。在與Apache相互結(jié)合應(yīng)用中，能夠靈活的進(jìn)行安全設(shè)置。使得計(jì)算機(jī)Web平臺(tái)的應(yīng)用具備較好的安全保障。

3 基于PHP技術(shù)的基因數(shù)據(jù)庫(kù)Web平臺(tái)構(gòu)建分析

圖1是使用PHP技術(shù)設(shè)計(jì)的生物基因數(shù)據(jù)庫(kù)Web平臺(tái)的系統(tǒng)構(gòu)建示意圖。在使用PHP技術(shù)進(jìn)行生物基因數(shù)據(jù)庫(kù)Web平臺(tái)的設(shè)計(jì)和構(gòu)建過(guò)程中，需要很多種軟件平臺(tái)和開發(fā)軟件支持。這其中包括了計(jì)算機(jī)數(shù)據(jù)庫(kù)軟件系統(tǒng)，例如：Oracle、PHP腳本語(yǔ)言、服務(wù)軟件Apache、PHP代碼編輯器、計(jì)算機(jī)網(wǎng)絡(luò)客戶端軟件系統(tǒng)等。這些計(jì)算機(jī)軟件系統(tǒng)和進(jìn)行開發(fā)的軟件系統(tǒng)，都是使用PHP技術(shù)進(jìn)行基因數(shù)據(jù)庫(kù)平臺(tái)構(gòu)建過(guò)程中所需要的軟件和工具。除此之外，在使用PHP技術(shù)進(jìn)行生物基因數(shù)據(jù)庫(kù)Web平臺(tái)的設(shè)計(jì)和構(gòu)建過(guò)程中，還需要使用相關(guān)的計(jì)算機(jī)數(shù)據(jù)庫(kù)轉(zhuǎn)換工具、命令查詢工具，以及計(jì)算機(jī)操作控制應(yīng)用軟件等。這些軟件和工具有利于基因數(shù)據(jù)庫(kù)Web平臺(tái)的設(shè)計(jì)和構(gòu)建。

使用PHP技術(shù)進(jìn)行生物基因數(shù)據(jù)庫(kù)Web平臺(tái)構(gòu)建的過(guò)程中，首先要對(duì)計(jì)算機(jī)軟件設(shè)計(jì)應(yīng)用到的語(yǔ)言、服務(wù)軟件及其相關(guān)的工具進(jìn)行安裝，其次對(duì)相關(guān)的軟件和工具進(jìn)行編譯，最后對(duì)httpd.txt和php.ini兩個(gè)文件進(jìn)行設(shè)置。從而使用PHP技術(shù)進(jìn)行基因數(shù)據(jù)庫(kù)的轉(zhuǎn)換和鏈接。進(jìn)而達(dá)到生物基因數(shù)據(jù)庫(kù)平臺(tái)的構(gòu)建和設(shè)計(jì)。在Web平臺(tái)構(gòu)建和設(shè)計(jì)完成以后，需要對(duì)基因數(shù)據(jù)庫(kù)的記錄格式統(tǒng)一以后對(duì)基因數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行轉(zhuǎn)換和鏈接，從而實(shí)現(xiàn)儲(chǔ)存相應(yīng)的數(shù)據(jù)。

4 結(jié)語(yǔ)

總而言之，在生物基因數(shù)據(jù)庫(kù)Web平臺(tái)設(shè)計(jì)和構(gòu)建的過(guò)程中使用PHP技術(shù)，不僅能夠?qū)崿F(xiàn)快速、高效、安全、靈活、簡(jiǎn)單的操作，而且使得該平臺(tái)具有良好的兼容性和擴(kuò)展性以及其他數(shù)據(jù)庫(kù)所不具備的特點(diǎn)。對(duì)生物基因數(shù)據(jù)庫(kù)的共享及對(duì)推動(dòng)生物基因的研究和生物技術(shù)的發(fā)展有著重要的意義。

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