范秀博,閆菊娥,李毓新,吉智,李妍
(1西安交通大學醫(yī)學部公共衛(wèi)生學院,西安710061;2西安醫(yī)學院第二附屬醫(yī)院;3陜西省結核病防治研究所)
Xpert Mtb/RIF技術在結核性腦膜炎診斷中的應用
范秀博1,2,閆菊娥1,李毓新2,吉智2,李妍3
(1西安交通大學醫(yī)學部公共衛(wèi)生學院,西安710061;2西安醫(yī)學院第二附屬醫(yī)院;3陜西省結核病防治研究所)
目的探討利福平(RIF)耐藥實時熒光定量核酸擴增技術,即Xpert 結核分枝桿菌(Mtb)/RIF 技術在結核性腦膜炎診斷中的應用價值。方法分別采用抗酸染色法、培養(yǎng)法、Xpert Mtb/RIF技術對34例核性腦膜炎、43例疑似結核性腦膜炎、20例非結核性腦膜炎患者的腦脊液進行Mtb檢測。結果34例結核性腦膜炎患者的腦脊液用抗酸染色法、培養(yǎng)法、Xpert Mtb/RIF技術檢測到Mtb者分別為1、2、8例,陽性率分別為2.94%、5.88%、23.53%;抗酸染色法與培養(yǎng)法檢測陽性率相比,Pgt;0.05;培養(yǎng)法與Xpert Mtb/RIF技術檢測陽性率相比,Plt;0.05;Xpert Mtb/RIF技術與抗酸染色法檢測陽性率相比,Plt;0.05。43例疑似結核性膜炎患者的腦脊液用抗酸染色法、培養(yǎng)法、Xpert Mtb/RIF技術檢測到Mtb者分別為0、1、6例,陽性率分別為0、2.33%、13.95%;抗酸染色法與培養(yǎng)法檢測陽性率相比,P=0.5;培養(yǎng)法與Xpert Mtb/RIF技術檢測陽性率相比,Pgt;0.05;Xpert Mtb/RIF技術與抗酸染色法檢測陽性率相比,Plt;0.05。20例非結核性腦膜炎患者的腦脊液用抗酸染色法、培養(yǎng)法、Xpert Mtb/RIF技術均未檢測到Mtb。結論Xpert Mtb/RIF技術檢測腦脊液中的Mtb更有助于結核性腦膜炎的診斷。
核酸擴增技術;Xpert結核分枝桿菌/利福平技術;結核分枝桿菌;結核性腦膜炎;腦脊液
結核病是一個重要的全球性問題。在我國,結核病患者的死亡率僅低于艾滋病患者的死亡率,結核病已成為第二大傳染病[1]。2010年全國第5次結核病流行病學抽樣調查結果顯示,全國活動性肺結核患者高達499萬例,每年新發(fā)肺結核患者約100萬例[2]。結核病的臨床表現(xiàn)形式多樣,不但包括肺結核還包括肺外結核,而肺外結核中又以結核性腦膜炎最為常見,占結核病的0.5%~1.0%[3]。結核性腦膜炎是由結核分枝桿菌(Mtb)通過淋巴系統(tǒng)或血液系統(tǒng)播散入腦而引起的腦膜、脊膜的慢性非化膿性炎癥。由于結核性腦膜炎的致死率、致殘率非常高,迫切需要一種能快速、準確檢測Mtb的方法,以便于結核性腦膜炎的及時確診。目前,國內外有文獻[4~7]報道了利福平(RIF)耐藥實時熒光定量核酸擴增技術,即Xpert Mtb/RIF 技術在肺結核和肺外結核診斷方面的應用。本研究采用Xpert Mtb/RIF技術對部分結核性腦膜炎、疑似結核性腦膜炎患者腦脊液中的Mtb進行檢測,同時用抗酸染色涂片和培養(yǎng)法對受檢標本標本進行檢測,并對檢測結果進行對比分析,探討Xpert Mtb/RIF技術在結核性腦膜炎診斷中的應用價值。
1.1 臨床資料 研究對象為2014年4月~2016年4月西安醫(yī)學院第二附屬醫(yī)院收治的結核性腦膜炎患者34例、疑似結核性腦膜炎患者43例、非結核性腦膜炎患者20例,其中男63例、女34例,年齡13~79歲。 結核性腦膜炎的診斷標準[8]:既往有結核病病史,急性或亞急性起病,慢性遷延性病程,出現(xiàn)頭痛、嘔吐等顱內壓增高癥狀和腦膜刺激征,腦脊液壓力明顯增高、淋巴細胞增多、氯化物和糖含量減低,影像學檢查見顱底腦膜及側裂池呈點狀或團塊狀明顯強化,伴有腦積水等改變。43例疑似結核性腦膜炎患者包括腦梗死13例、癲癇9例、腦積水6例、腦炎15例。20例非結核性腦膜炎患者包括病毒性腦膜炎8例、化膿性腦膜炎12例。
1.2 腦脊液Mtb檢測及藥敏試驗方法 所有受檢者于治療前留取腦脊液,分別用抗酸染色法、培養(yǎng)法及Xpert Mtb/RIF技術檢測Mtb,培養(yǎng)出的菌株做RIF平藥敏試驗。
1.2.1 Mtb檢測 ①抗酸染色鏡檢Mtb:采用離心濃縮法[9]處理腦脊液,腦脊液標本靜置2~4 h,取沉淀部分30 mL并置50 mL的無菌螺旋蓋離心管中,3 000 g離心20 min。棄上清,取沉淀物涂片。自然干燥,用火焰固定2~3次。采用萋尼抗酸染色法染色(萋尼氏染色液購自中國珠海貝索生物技術有限公司)并于鏡下觀察結果。根據(jù)涂片Mtb含量的多少[9]判為4+、3+、2+、1+、1~8條/300個視野、陰性6級(其中前5級判為陽性)。②培養(yǎng)法檢測Mtb:采用中和離心法[9]處理腦脊液,腦脊液標本靜置2~4 h,取沉淀部分30 mL并置50 mL的無菌螺旋蓋離心管中,3 000 g離心20 min。棄上清,保留重懸沉淀物于5 mL滅菌生理鹽水中,加入1~2倍體積的4% NaOH消化液,渦旋振蕩30 s,靜置15 min后在生物安全柜內打開螺旋蓋,加入磷酸鹽緩沖液(pH 6.8,0.067mol/L)至40 mL,3 000 g離心20 min,棄上清,加入1~2 mL磷酸鹽緩沖液,混懸,接種。接種時以無菌吸管吸取上述處理液0.1 mL,均勻接種在2支羅氏培養(yǎng)基(購自中國珠海貝索生物技術有限公司)斜面上,保持斜面水平向上37 ℃培養(yǎng)24 h后,直立放置37 ℃繼續(xù)培養(yǎng)。接種后第3、7天觀察培養(yǎng)情況,此后每周觀察1次,并在分離培養(yǎng)結果記錄本上記錄Mtb生長結果。根據(jù)菌落生長占培養(yǎng)基斜面的比例[9]分為++++、+++、++、+、實際菌落數(shù)、陰性6級(其中前5級判為陽性)。③Xpert Mtb/RIF技術檢測Mtb:Gene Xpert Dx儀器、 Gene Xpert Mtb/RIF Cartridge檢測盒及SR(sample reagent)購自美國Cepheid公司。取1 mL腦脊液標本加入前處理管中,然后加入2倍標本體積的SR標本處理液,渦旋振蕩15~30 s,靜置15 min,使標本充分液化。打開反應盒,取2 mL處理后樣品由加樣孔緩慢加入反應盒,然后將反應盒放入檢測模塊,儀器開始進行自動化檢測。反應結束后,在檢測系統(tǒng)窗口下可直接觀察結果。GeneXpert Mtb/RIF系統(tǒng)以Mtb DNA拷貝的高低分為高、中、低、極低和未檢出5級(其中前4級判為陽性)。
1.2.2 藥敏試驗及菌種鑒定 藥敏試驗所用培養(yǎng)基均購自中國珠海貝索生物技術有限公司。采用比例法[11]。用接種環(huán)取一環(huán)培養(yǎng)基上的菌落,研磨后與標準麥氏管比對制成1mg/mL菌懸液,梯度稀釋為10~2 mg/mL和10~4 mg/mL,接種到含RIF(40 μg/mL)的羅氏固體培養(yǎng)基和空白對照管培養(yǎng)基,37 ℃培養(yǎng)4周,觀察結果。每批藥敏試驗用H37Rv作為敏感對照,以評價含藥培養(yǎng)基質量;若對照培養(yǎng)基上生長的菌落數(shù)少于20個,則重復試驗。菌種鑒定與藥敏試驗同時進行,將1 mg/mL的菌懸液進行100倍稀釋,接種0.1 mL于對硝基苯甲酸和噻吩-2-羧酸肼鑒別培養(yǎng)基上,37 ℃培養(yǎng)4周后觀察結果。耐藥百分比=(含藥培養(yǎng)基上生長的菌落數(shù)/對照培養(yǎng)基上生長的的菌落數(shù))×100%,耐藥百分比lt;1%為受試菌對該藥敏感、≥1%為受試菌對該藥耐藥。
1.3 統(tǒng)計學方法 采用SPSS16.0統(tǒng)計軟件。率的比較用χ2檢驗、校正χ2檢驗和確切概率法。Plt;0.05為差異有統(tǒng)計學意義。
34例結核性腦膜炎患者的腦脊液用抗酸染色法、培養(yǎng)法、Xpert Mtb/RIF技術檢測到Mtb者分別為1、2、8例,陽性率分別為2.94%、5.88%、23.53%;抗酸染色法與培養(yǎng)法檢測陽性率相比,χ2= 0.00,Pgt;0.05;培養(yǎng)法與Xpert Mtb/RIF技術檢測陽性率相比,χ2=4.22,Plt;0.05;Xpert Mtb/RIF技術與抗酸染色法檢測陽性率相比,χ2=4.61,Plt;0.05。
43例疑似結核性膜炎患者的腦脊液用抗酸染色法、培養(yǎng)法、Xpert Mtb/RIF技術檢測到Mtb者分別為0、1、6例,陽性率分別為0、2.33%、13.95%;抗酸染色法與培養(yǎng)法檢測陽性率相比(確切概率法),P=0.5;培養(yǎng)法與Xpert Mtb/RIF技術檢測陽性率相比,χ2=2.49,Pgt;0.05;Xpert Mtb/RIF技術與抗酸染色法檢測陽性率相比,χ2=4.48,Plt;0.05。
20例非結核性腦膜炎患者的腦脊液用抗酸染色法、培養(yǎng)法、Xpert Mtb/RIF技術均未檢測到Mtb。
34例結核性腦膜炎患者、43例疑似結核性膜炎患者、20例非結核性腦膜炎患者腦脊液用抗酸染色法、培養(yǎng)法、Xpert Mtb/RIF技術檢測到Mtb者分別為11、7、0例,陽性率分別為32.35%、16.28%、0;結核性腦膜炎與疑似結核性膜炎患者相比,χ2=2.74,Pgt;0.05;疑似結核性腦膜炎和非結核性腦膜炎患者相比,χ2=2.20,Pgt;0.05;結核性腦膜炎與非結核性腦膜炎患者相比,χ2=6.25,Plt;0.05。
所有受檢對象的腦脊液通過培養(yǎng),3例發(fā)現(xiàn)陽性菌株,菌種初步鑒定均為Mtb,比例法藥敏試驗結果均為RIF敏感。同時,3例經過Xpert Mtb/RIF技術檢測為RIF敏感。二種方法檢測結果一致。
由于結核性腦膜炎患者病情輕重程度不同、就診階段不同、臨床表現(xiàn)多樣,加之腦脊液實驗室檢查特征性結果較少,導致確診結核性腦膜炎的難度較大。因此,腦脊液中檢測出Mtb仍然是確診結核性腦膜炎的金標準和重要手段。目前,用于結核性腦膜炎診斷的方法有腦脊液抗酸染色法和培養(yǎng)法,前者容易漏檢,后者出結果時間長(1~2個月)。隨著分子生物學手段的不斷發(fā)展,越來越多的新診斷技術應用于臨床,Xpert Mtb/RIF技術便是其中之一。該技術只需手工加入已處理的待測樣本,其余均由儀器自動操作判讀是否為Mtb及其是否對RIF耐藥,整個流程僅需 2 h。本研究利用Xpert Mtb/RIF技術檢測結核性腦膜炎患者的腦脊液標本,并與傳統(tǒng)的抗酸染色法、培養(yǎng)法相比較,探討其在結核性腦膜炎診斷中的應用價值。
Xpert Mtb/RIF檢測技術是一種半巢氏實時熒光定量PCR體外診斷技術,可對Mtb以及其RIF耐藥性進行檢測。該技術針對Mtb的rpoB基因81bp的RIF耐藥決定區(qū)序列設計引物、探針,可以檢測rpoB基因是否發(fā)生突變,從而判斷受檢標本是否對RFP耐藥[9]。據(jù)報道[10],通常需Mtb達5 000 CFU/mL時抗酸染色法才能得到陽性結果,Xpert Mtb/RIF技術的臨床檢出限為131 CFU/ mL[11]。在本研究中,采用Xpert Mtb/RIF技術檢測結核性腦膜炎與疑似結核性腦膜炎患者的腦脊液,Mtb陽性檢出率分別為23.53%、13.95%,均高于抗酸染色法(2.94%、0)和培養(yǎng)法(5.88%、2.33%)的檢出率,與鄒月麗等[12]報道確診結核性腦膜炎組的23.68%和可能結核性腦膜炎組的18.18%接近。所有受檢者Xpert Mtb/RIF技術陽性檢出率為14.43%(14/97),低于Tortoli等[7]報道的84.6%,其原因可能有以下幾點:①入選者腦脊液標本本身含菌量較低;②腦脊液標本中存在某些抑制因子;③入選的病例數(shù)較少。
本研究中有3例腦脊液培養(yǎng)陽性,菌種初步鑒定均為Mtb,比例法藥敏試驗和Xpert Mtb/RIF技術監(jiān)測均顯示其對RIF敏感,結果一致率為100%,高于筆者之前的研究結果[13]。此次試驗由于腦脊液標本數(shù)量有限,加之培養(yǎng)法陽性率較低,最終可以和Xpert Mtb/RIF技術檢測結果作比較的RIF敏感/耐藥的結果較少。
近幾年,世界衛(wèi)生組織及國家結核病參比實驗室推薦了多種結核菌快速檢測技術,如Xpert Mtb/RIF技術、CPA 恒溫技術、LAMP 恒溫技術等,使得結核病的診斷更加快速、準確、簡便。這些技術對痰標本具有較高的診斷價值,對于含菌量較低的肺外標本更具臨床意義。Xpert Mtb/RIF技術對Mtb的陽性檢出率明顯高于其他檢測方法,大大提高了其病原學診斷率,具有特異性強、敏感度高、快速、簡便,且能同時檢測出Mtb是否對RIF耐藥等特點,在結核性腦膜炎的診斷和治療中具有重要的應用價值,可在資源豐富的地區(qū)作為一種常規(guī)方法大力推廣,使其在肺外結核病的診療中發(fā)揮重要作用。
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10.3969/j.issn.1002-266X.2017.43.019
R529.3
B
1002-266X(2017)43-0061-03
陜西省社會發(fā)展科技攻關項目(2016SF-272)。
閆菊娥(E-mail: 55709810@qq.com)
2017-05-31)