王新杰,高智偉,黃磊,許欣
(1.濰坊市公安局,山東濰坊 261061;2.山東省公安廳,山東濟(jì)南 250001)
·研究簡(jiǎn)報(bào)·
山東地區(qū)漢族人群34個(gè)Y-STR基因座的遺傳多態(tài)性
王新杰1,高智偉1,黃磊2,許欣1
(1.濰坊市公安局,山東濰坊 261061;2.山東省公安廳,山東濟(jì)南 250001)
法醫(yī)遺傳學(xué);多態(tài)現(xiàn)象,遺傳;Y染色體;短串聯(lián)重復(fù)序列;漢族;山東
Y染色體具有男性特有、父系遺傳及單倍型遺傳的特征,在法醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)中作用獨(dú)特。本研究調(diào)查了山東地區(qū)漢族男性34個(gè)Y-STR基因座的遺傳多態(tài)性,以期為法醫(yī)學(xué)應(yīng)用及相關(guān)研究與實(shí)踐提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。
收集山東地區(qū)1000名身體健康、無(wú)父系親緣關(guān)系的漢族男性個(gè)體FTA卡血樣(均知情同意),采用Chelex-100法提取DNA。復(fù)合擴(kuò)增引物序列參照基因庫(kù)及相關(guān)文獻(xiàn)[1,2],由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。PCR擴(kuò)增程序同AmpF?STR?MiniFilerTMPCR擴(kuò)增試劑盒(美國(guó)AB公司),擴(kuò)增體積為10μL。使用5Dye Matrix標(biāo)準(zhǔn)品(無(wú)錫中德美聯(lián)生物技術(shù)有限公司)對(duì)3130xl DNA測(cè)序儀進(jìn)行光譜校正,以DNA標(biāo)準(zhǔn)品007、9948的分型結(jié)果作為對(duì)照,自行制備Ladder并編寫(xiě)panel及Bin,用GeneMapper ID 3.2軟件進(jìn)行基因分析。基因多樣性(gene diversity,GD)按照公式GD=[n(1-∑Pi2)]/(n-1)計(jì)算,其中n為所檢驗(yàn)的樣本數(shù)量,Pi為等位基因頻率。
1000 名山東地區(qū)無(wú)父系親緣關(guān)系漢族男性個(gè)體在34個(gè)Y-STR基因座中檢出的等位基因及GD值見(jiàn)表1~2。34個(gè)Y-STR基因座共檢出999種單倍型,GD值達(dá)0.999 998 999,高于目前報(bào)道的商品化試劑盒[3],且該復(fù)合擴(kuò)增體系易于擴(kuò)增,因此在法醫(yī)學(xué)上有重要應(yīng)用價(jià)值,適合于性犯罪案件中混合斑男性成分檢測(cè)及男性家系親緣鑒定及家族排查。在部分樣品中,發(fā)現(xiàn)在一個(gè)基因座上有多個(gè)等位基因,與有關(guān)文獻(xiàn)[4]報(bào)道一致,為Y染色體復(fù)制異常所致。
表1 山東地區(qū)漢族男性34個(gè)Y-STR基因座等位基因頻率和基因多樣性(n=1000)
續(xù)表1
續(xù)表1
表2 山東地區(qū)漢族男性34個(gè)Y-STR基因座的GD值(n=1000)
[1]Hanson EK,Ballantyne J.An ultra-high discriminationYchromosomeshorttandemrepeatmultiplex DNA typing system[J].PLoS One,2007,2(8):e688.
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[3]王新杰,羅莉靜,黃磊,等.29個(gè)Y-STR基因座復(fù)合擴(kuò)增體系的建立[J].法醫(yī)學(xué)雜志,2015,31(6):456-461.
[4]Butler JM.法醫(yī)DNA分型專(zhuān)論:方法學(xué)[M].第3版.侯一平,李成濤,譯.北京:科學(xué)出版社,2012:328.
DF795.2
B
10.3969/j.issn.1004-5619.2017.01.018
1004-5619(2017)01-0077-03
2015-07-01)
(本文編輯:李成濤)
王新杰(1973—),男,副主任法醫(yī)師,主要從事法醫(yī)物證學(xué)檢驗(yàn);E-mail:wfxjfy@aliyun.com