王小國(guó)
(三門峽職業(yè)技術(shù)學(xué)院食品園林學(xué)院,河南 三門峽 472000)
春小麥SSR標(biāo)記與農(nóng)藝性狀、品質(zhì)性狀聚類結(jié)果的關(guān)聯(lián)分析
王小國(guó)
(三門峽職業(yè)技術(shù)學(xué)院食品園林學(xué)院,河南 三門峽 472000)
以84份春小麥為材料,對(duì)SSR標(biāo)記聚類結(jié)果和農(nóng)藝性狀、品質(zhì)性狀的聚類結(jié)果進(jìn)行了關(guān)聯(lián)分析,結(jié)果表明:SSR標(biāo)記聚類與農(nóng)藝性狀聚類的對(duì)應(yīng)關(guān)系主要表現(xiàn)在大類之間,各亞類之間無明顯對(duì)應(yīng)關(guān)系;與品質(zhì)性狀聚類間存在一定的對(duì)應(yīng)關(guān)系,但這種對(duì)應(yīng)關(guān)系并不明顯。類間種質(zhì)吻合率分析也表明,SSR標(biāo)記聚類與農(nóng)藝性狀、品質(zhì)性狀聚類結(jié)果間的吻合率較低,最高上限分別為55.74%、54.55%,因此,在實(shí)際中應(yīng)將不同的標(biāo)記綜合起來進(jìn)行分析,以提高檢測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確性和可靠性。
SSR分子標(biāo)記;農(nóng)藝性狀;品質(zhì)性狀;聚類;關(guān)聯(lián)
小麥種質(zhì)資源的多樣性是小麥遺傳育種和品質(zhì)改良的基礎(chǔ),多樣性研究多借助于形態(tài)學(xué)標(biāo)記、細(xì)胞學(xué)標(biāo)記、生化標(biāo)記和分子標(biāo)記來進(jìn)行[1]。諸多研究表明,各類標(biāo)記方法都有其獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)和難以避免的局限[2-4],還找不到能完全取代其他方法的標(biāo)記技術(shù)。因此,在實(shí)際應(yīng)用中,將幾種標(biāo)記結(jié)合起來使用,揚(yáng)長(zhǎng)避短,提高檢測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確性和可靠性,并獲得更加有價(jià)值的信息[5-6]。本文以84份春小麥為材料,對(duì)其農(nóng)藝性狀、品質(zhì)性狀和SSR標(biāo)記聚類結(jié)果進(jìn)行了比較,以探討各標(biāo)記間的對(duì)應(yīng)關(guān)系和吻合率,為小麥品種的多樣性研究和種質(zhì)資源利用提供參考。
表1 供試春小麥材料編號(hào)、名稱和產(chǎn)地
1.1 試驗(yàn)材料
供試春小麥材料的編號(hào)、名稱和產(chǎn)地見表1。PCR反應(yīng)所用引物為從170多對(duì)SSR引物(分別由上海生工和北京賽百盛公司合成)中篩選出的41對(duì)多態(tài)性較好的引物。
1.2 試驗(yàn)方法
1.2.1 農(nóng)藝性狀的測(cè)定
田間收獲以后,按照金善寶[7]的方法對(duì)供試春小麥品種株高、穗長(zhǎng)、穗粒數(shù)、穗粒重、千粒重、株粒重、第2節(jié)間長(zhǎng)、第2節(jié)莖粗等8個(gè)農(nóng)藝性狀進(jìn)行考種。
1.2.2 品質(zhì)性狀的測(cè)定
主要測(cè)定蛋白質(zhì)含量、干濕面筋含量、淀粉含量等品質(zhì)性狀,其中,淀粉含量測(cè)定參照趙永亮[8]的方法。
1.2.3 SSR標(biāo)記分析
采用CTAB法[9]提取各春小麥品種基因組DNA后,參照如下體系和程序進(jìn)行PCR擴(kuò)增,10μL反應(yīng)體系:其中 1.8μLDNA模板 (30ng/μL)+0.26 μLdNTPs(10mmol/L)+1.3μL10×Buffer+0.13μLTaq酶 (2u/μL)+1.2μLSSR引物 (20ng/μL)+ 5.31μLddH2O;擴(kuò)增程序?yàn)椤?5℃預(yù)變性3min→按變性(95℃)1min、退火(56℃)1min、延伸(72℃)2min進(jìn)行40個(gè)循環(huán)→72℃延伸10min;然后用6%變性聚丙烯酰胺凝膠對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行電泳分離,硝酸銀染色后,采用“0、l”系統(tǒng)法記錄電泳結(jié)果。
1.2.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)
采用平均數(shù)標(biāo)準(zhǔn)化處理農(nóng)藝性狀和品質(zhì)性狀的數(shù)據(jù)及SSR擴(kuò)增產(chǎn)物的電泳結(jié)果 (“0、1”矩陣),按照歐氏距離法計(jì)算供試材料之間遺傳距離后,以離差平方和法(WARD)進(jìn)行聚類分析。
在此基礎(chǔ)上,參照許占友[10]等的方法分析不同標(biāo)記類型聚類后的組間種質(zhì)吻合率 (Ir=2Xij/(Xi+ Xj)×100%)。
2.1 SSR標(biāo)記與農(nóng)藝性狀、品質(zhì)性狀聚類的分析
2.1.1 SSR標(biāo)記聚類與農(nóng)藝性狀聚類結(jié)果的比較
通過SSR標(biāo)記聚類與農(nóng)藝性狀聚類結(jié)果的比較表明,SSR標(biāo)記聚類第Ⅰ類群的西農(nóng)2000-6、川00062、革列尼3份材料對(duì)應(yīng)了農(nóng)藝性狀聚類的第V大類;SSR標(biāo)記聚類第Ⅲ類群第2亞類的京771、NS64、NS93、甘春11等4份材料對(duì)應(yīng)于農(nóng)藝性狀的第Ⅱ大類,新春19、臨優(yōu)2、Y20、安農(nóng)-8729-10等4份材料對(duì)應(yīng)于農(nóng)藝性狀的第Ⅳ大類,05引觀12、晉麥14、青96404、隴春4035、隴春26-08對(duì)應(yīng)于農(nóng)藝性狀的第Ⅵ大類的第1亞類;SSR標(biāo)記聚類第Ⅴ類群第2亞類材料分別對(duì)應(yīng)于農(nóng)藝性狀聚類第Ⅵ大類第3、4亞類;SSR標(biāo)記聚類第Ⅵ類群材料中新春7、新春19、新春18、新春8、新春10、新春6對(duì)應(yīng)于農(nóng)藝性狀聚類的第Ⅳ大類,新春24、寧春17、新春16、新春5、新春12、新春17對(duì)應(yīng)于第Ⅵ大類的第3亞類;盡管第Ⅶ類群多數(shù)材料來自于新疆,但與農(nóng)藝性狀聚類沒有明顯的對(duì)應(yīng)關(guān)系;此外,SSR標(biāo)記聚類第Ⅱ類群、第Ⅲ類群第1亞類、第Ⅳ類群、第Ⅴ類群的第1、3亞類與農(nóng)藝性狀聚類也無明顯的對(duì)應(yīng)關(guān)系。
2.1.2 SSR標(biāo)記聚類與品質(zhì)性狀聚類結(jié)果的比較
SSR標(biāo)記試驗(yàn)聚類結(jié)果與品質(zhì)性狀聚類結(jié)果比較發(fā)現(xiàn),SSR標(biāo)記聚類第Ⅰ類群西農(nóng)2000-6、革列尼、黑引優(yōu)1號(hào)3份材料對(duì)應(yīng)于品質(zhì)性狀聚類的第Ⅴ類群;SSR標(biāo)記聚類第Ⅲ類群僅第2亞類材料主要對(duì)應(yīng)于品質(zhì)性狀聚類的第Ⅱ大類第2、3亞類;SSR標(biāo)記聚類第Ⅳ類群春節(jié)4、05引觀304、05引觀443對(duì)應(yīng)于品質(zhì)性狀聚類的第Ⅱ大類第2亞類;第V類群第2亞類除甘春20、寧春33、巴97-5797外,其余9份材料均對(duì)應(yīng)于品質(zhì)性狀聚類第Ⅱ大類第1亞類;SSR標(biāo)記聚類第Ⅵ類群中有9份材料(安農(nóng)90202、遼春10、寧春17、晉春15號(hào)、隴春4099、NS85、蒙麥36、新春10和新春6等)對(duì)應(yīng)于品質(zhì)性狀聚類第Ⅱ大類第2亞類;而新春11、新春7、新春19、新春18、新春1、新春24等6份材料對(duì)應(yīng)于品質(zhì)性狀聚類的第Ⅲ大類,其余SSR標(biāo)記聚類的第Ⅱ類群、第Ⅲ類群第1亞類、第V類群第1、3亞類、第Ⅶ類群材料與品質(zhì)性狀聚類沒有明顯的對(duì)應(yīng)關(guān)系。
2.2 3類標(biāo)記聚類結(jié)果間種質(zhì)吻合率分析
為了更加準(zhǔn)確的認(rèn)識(shí)農(nóng)藝性狀、品質(zhì)性狀與SSR標(biāo)記聚類間的差異,對(duì)不同聚類方式大類水平的組間種質(zhì)吻合率進(jìn)行了分析 (亞類水平的對(duì)應(yīng)關(guān)系非常不明顯),結(jié)果見表2。結(jié)果表明,SSR標(biāo)記聚類與農(nóng)藝性狀、品質(zhì)性狀聚類結(jié)果間的吻合率總體較低,最高上限分別為55.74%和54.55%。
作物種質(zhì)資源的多樣性研究和多數(shù)都是從形態(tài)學(xué)標(biāo)記、細(xì)胞學(xué)標(biāo)記、生化標(biāo)記或分子標(biāo)記等單一的標(biāo)記方法進(jìn)行分析[11],但每種方法的實(shí)用性有所不同,沒有一種方法能全面反映出作物資源的多樣性情況。將多種標(biāo)記結(jié)合起來使用,提高檢測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確性和可靠性,在作物品種的改良中具有非?,F(xiàn)實(shí)的意義。
本研究對(duì)3類標(biāo)記聚類結(jié)果比較分析發(fā)現(xiàn),SSR標(biāo)記聚類與農(nóng)藝性狀、品質(zhì)性狀聚類間均有著不同程度的對(duì)應(yīng)關(guān)系,但這種對(duì)應(yīng)關(guān)系并不明顯,究其原因:一方面,由于3類標(biāo)記所反映的遺傳信息有較大差異,另一方面,在于農(nóng)藝性狀、品質(zhì)性狀易于受環(huán)境因素影響有關(guān)[12]。此外,類間種質(zhì)吻合率分析表明,SSR標(biāo)記聚類與農(nóng)藝性狀、品質(zhì)性狀聚類結(jié)果間的吻合率較低,最高上限分別為55.74%、54.55%。這與衛(wèi)澤[13]、韓洪強(qiáng)[14]等研究者在棉花、茄子中的相關(guān)研究結(jié)果類似。但武玉國(guó)[15]的關(guān)聯(lián)分析表明,SSR標(biāo)記與株高、產(chǎn)量相關(guān)性狀顯著關(guān)聯(lián)(P<0.01)的標(biāo)記有23個(gè),其中3個(gè)標(biāo)記達(dá)到極顯著(P<0.001)水平。
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2015—12—29