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    基于秈粳雜交重組自交系的水稻籽粒性狀的遺傳變異研究

    2016-07-14 08:34:37高維維陳立凱胡朝旭黃鈺婷陳志強
    西北農業(yè)學報 2016年7期
    關鍵詞:粒率谷粒精米

    高維維,陳立凱,胡朝旭,黃鈺婷,黃 明,郭 濤,王 慧,陳志強

    (華南農業(yè)大學 國家植物航天育種工程技術研究中心,廣州 510642)

    基于秈粳雜交重組自交系的水稻籽粒性狀的遺傳變異研究

    高維維,陳立凱,胡朝旭,黃鈺婷,黃明,郭濤,王慧,陳志強

    (華南農業(yè)大學 國家植物航天育種工程技術研究中心,廣州510642)

    為研究多環(huán)境條件下籽粒性狀的遺傳變異及性狀間相關性,解析籽粒性狀遺傳規(guī)律。以細長型秈稻品種‘玉針香’和短圓型粳稻品種‘02428’為親本構建的含192個株系的RIL(重組自交系)群體為研究材料,在4種環(huán)境下分別對籽粒相關的16個性狀進行相關性分析和遺傳變異解析。結果表明,兩親本的粒型、堊白性狀存在顯著差異,其中,‘玉針香’精米長寬比、堊白粒率和堊白度分別為4.03、1.00%和0.18%,‘02428’精米長寬比、堊白粒率和堊白度分別為 1.45、87.40%和52.21%。RIL群體各性狀的平均值介于兩親本之間,分布頻率呈趨于單峰的正態(tài)分布,符合數量性狀遺傳規(guī)律。多環(huán)境下變異分析表明,大部分籽粒性狀受環(huán)境及環(huán)境與株系互作不同程度的影響;而谷粒面積、谷粒圓度2個性狀受環(huán)境、環(huán)境與株系互作的影響均不顯著。遺傳群體各性狀變異系數為6.34%~84.55%,廣義遺傳力為4.26%~70.67%。粒長、粒寬、堊白粒率、堊白度間呈明顯互作關系。在RIL群體中篩選獲得4個在穗部性狀、粒質量和稻米外觀品質等方面綜合表現(xiàn)較為優(yōu)良的株系,具有較高育種價值。說明:基于遺傳背景明確的重組自交系群體,可解析籽粒性狀的遺傳變異規(guī)律,并有效創(chuàng)制優(yōu)異育種材料。

    水稻;重組自交系;籽粒性狀;遺傳變異

    水稻(OryzasativaL.)是中國最重要的糧食作物之一,與國家糧食安全密切相關[1]。隨著國民經濟的發(fā)展和人民生活水平的提高,人們對水稻產量和品質的要求逐步提高[2]。水稻籽粒性狀包括粒長、粒寬、粒質量及堊白等,籽粒性狀表現(xiàn)直接影響水稻產量和品質,籽粒性狀的改良被認為是水稻育種的重要目標。研究水稻籽粒性狀的遺傳規(guī)律,有助于提高品種選育效率。

    大量研究表明,水稻籽粒性狀表現(xiàn)為典型的數量性狀遺傳[3-5]。符福鴻等[6]采用3×10NC正交設計研究表明,粒長與長寬比、千粒質量與粒寬之間均呈極顯著正相關;粒長、粒寬和千粒質量之間相關性不顯著。雷東陽等[7]采用‘IR75589-31S’‘IR60’‘IR70’和90個秈粳成分不同的株系進行不完全雙列雜交,對雜交稻米外觀品質遺傳及性狀間的相關性進行研究,認為粒長、粒寬和粒長寬比以加性效應為主,母體效應也起到一定的作用,堊白度主要受到加性效應和母體效應控制,同時還受到細胞質的影響;粒長、粒寬和粒長寬比的遺傳力較高,堊白度的遺傳力相對較低。

    鑒于籽粒性狀遺傳的復雜性,RIL群體的構建及遺傳解析得到高度重視。RIL群體中個體均為純合體,利用RIL群體可以在多個不同的環(huán)境下進行性狀評價,在數量性狀研究上更準確地估計遺傳變異組分[8]。林志強等[9]利用水稻長穗大粒品系‘FJCD’與秈型三系恢復系‘IR24’配制雜交組合,構建含178 個株系的RILs 群體,并在不同環(huán)境下進行主要品質性狀遺傳分析,結果表明,在不同生態(tài)條件下稻米主要品質性狀間的相關性有82.22%的比率表現(xiàn)較為一致,不因環(huán)境的變化而改變其相關性。同時,利用RIL群體也定位大量與籽粒性狀有關的QTL位點[10-14]。 進一步構建不同遺傳背景的RIL群體,解析不同環(huán)境下籽粒性狀的遺傳表現(xiàn),對于籽粒性狀QTL位點鑒定和育種材料創(chuàng)制具有理論和實踐意義。

    本研究以籽粒性狀具有顯著差異的秈稻品種‘玉針香’和粳型種質‘02428’為親本構建重組自交系群體,調查4種環(huán)境下各親本及群體的單株穗質量、有效穗數、千粒質量、谷粒長、谷粒寬、谷粒長寬比、谷粒面積、谷粒周長、谷粒圓度、精米長、精米寬、精米長寬比、堊白粒率、堊白面積、堊白度和精米白度,比較分析水稻籽粒性狀的遺傳力,并對不同性狀進行相關性分析,以期為開展籽粒性狀QTL定位和育種材料創(chuàng)制奠定基礎。

    1材料與方法

    1.1試驗材料

    ‘玉針香’/‘02428’重組自交系(RIL)群體以及母本‘玉針香’(P1)和父本‘02428’(P2)。其中,‘玉針香’為湖南省審定的優(yōu)良秈稻品種,‘02428’為江蘇省選育的優(yōu)良廣親和粳型種質。RIL群體采用單粒傳的方法構建,世代為F5~F6,含192個株系。

    1.2試驗方法與性狀調查

    自交系群體和2個親本分別于2014年(晚季)、2015年(早季)在華南農業(yè)大學國家植物航天育種工程技術研究中心育種基地(廣州天河、廣州增城兩地)種植。2014年廣州天河試驗基地簡稱環(huán)境1(E1)、2014年增城試驗基地簡稱環(huán)境2(E2)、2015年廣州天河試驗基地簡稱環(huán)境3(E3)、2015年增城試驗基地簡稱環(huán)境4(E4)。2014年晚季:7月28日播種,8月10日移栽;2015年早季:3月7號播種,4月1日移栽。試驗采用隨機區(qū)組設計,2個重復,各小區(qū)中每個株系及親本均種植3 行,每行6株。株行距為20 cm×20 cm,單本栽插。田間管理(水、肥、病蟲害防治等)按當地大田常規(guī)栽培要求實施。為保證谷粒含水量一致,成熟時收獲烘干再進行有關性狀測定。

    參考《農作物品種區(qū)域試驗技術規(guī)范 水稻》(NY/T 1300-2007),考查單株穗質量(Panicle mass per plant)、每株有效穗數(Effective panicle number)、千粒質量(1 000-grain mass)等性狀。采用SmartGrain軟件(http://www.nias.affrc.go.jp/qtl/SmartGrain/)并參照操作說明測量谷粒長(Grain length)、谷粒寬(Grain width)、谷粒長寬比(Length-to-width ratio of grain)、谷粒周長(Perimeter length of grain)、谷粒面積(Area size of grain)和谷粒圓度(Circularity)等指標,分析模式選擇批量分析[batch analysis]。采用JMWT12 大米外觀品質檢測儀測量精米長(Milled rice length)、精米寬(Milled rice width)、精米長寬比(Length-to-width ratio of milled rice)、精米白度(Whiteness)、堊白粒率(Chalky rice rate)、堊白面積(Chalky area)以及堊白度(Chalkiness degree)。

    1.3數據分析

    采用Excel進行性狀的基本統(tǒng)計分析,采用OriginPro 8.0繪制各性狀測得數據平均值的頻次分布圖,采用SAS 9.3軟件進行描述性統(tǒng)計分析、方差分析和遺傳參數的估算。

    2結果與分析

    2.1親本及RIL群體穗部和籽粒外觀性狀分析

    采用2年2點的數據平均值對親本及192個RIL分離群體的16個性狀進行統(tǒng)計分析(表1),結果表明,4種環(huán)境下2親本各性狀均存在明顯差異,其中,粒型、堊白性狀存在極端差異(圖1):‘玉針香’為細長粒,精米長寬比達到4.03,而‘02428’為橢圓粒,精米長寬比為1.45;‘玉針香’的堊白粒率和堊白度分別為1.00% 和0.18%,而‘02428’分別為87.40%和52.21%,差異極明顯。另外,‘玉針香’單株穗質量和千粒質量分別為46.5 g和28.88 g,比‘02428’分別高17.6 g和 4.28 g?!襻樝恪挠行霐?、谷粒長、谷粒面積、谷粒周長、谷粒長寬比、精米長、精米長寬比均高于‘02428’。

    群體各性狀測得數據的平均值均介于兩親本之間,其中,單株穗質量、有效穗數、千粒質量等9個性狀出現(xiàn)明顯超親分離(表1)。16個性狀中,除堊白度外,其他各性狀的偏度和峰度的絕對值均小于1,表明這些性狀的觀測值在群體中呈對稱、均勻分布。各性狀的變異系數為6.34%~84.55%。粒型、粒質量的變異系數均小于10%,而堊白、穗質量、穗數性狀的變異系數較大。堊白粒率變異系數為84.55%;堊白面積和堊白度的變異系數次之,分別為28.17%和63.92%;單株穗質量、有效穗數的變異系數亦較大,分別為26.55%和21.49%,表明控制這些性狀的基因在數量和效應上較為復雜。

    表1 4種環(huán)境下親本和RIL群體穗部和籽粒性狀的表型變異分析

    A.‘玉針香’和‘02428’的谷粒形態(tài)Grains of ‘Yuzhenxiang‘ and ‘02428’;B.‘玉針香’和‘02428’的精米籽粒形態(tài)Kernels of ‘Yuzhenxiang’ and ‘02428’

    圖1‘玉針香’和‘02428’的籽粒性狀表現(xiàn)

    Fig.1The grain traits of ‘Yuzhenxiang’ and ‘02428’

    秈稻親本‘玉針香’的稻穗比粳型種質‘02428’更長,而著粒密度則低于‘02428’,其衍生的重組自交系產生極其廣泛的穗型變異分離。由圖2-A可觀察到,不同株系間穗部性狀存在明顯的差異,涵蓋長穗低著粒密度、長穗高著粒密度、短穗低著粒密度、短穗高著粒密度以及中間型等各種類型。

    粒長、粒寬是粒型的代表性指標,‘玉針香’籽粒細長、低堊白,而‘02428’籽粒寬短、高堊白。由表型變異分析結果可知,重組自交系后代的粒長性狀未出現(xiàn)超親分離,而精米粒寬則存在比親本‘玉針香’更細的后代。與此對應,分析發(fā)現(xiàn)粒寬的變異系數比粒長更高,這與以往許多研究大不相同,表明本試驗材料可能存在更多調控粒寬性狀的微效基因,而且顯隱性更為復雜。圖2-B為不同重組自交株系的籽粒表型,由圖2-B可知,群體后代的籽粒分離出短、小型,短、圓型,細、長型,短、寬型等不同類型。

    2.2各性狀在不同環(huán)境的比較及互作

    數量性狀往往受環(huán)境影響較大。為此,本研究采用一般線性模型分析籽粒主要性狀與環(huán)境的作用,結果表明(表2),環(huán)境對堊白率、堊白度和精米白度的影響達到極顯著水平,對谷粒周長影響達到顯著水平;其中,堊白度和精米白度受環(huán)境影響最大,F(xiàn)值分別為62.66和81.44。環(huán)境與株系互作對千粒質量、谷粒周長、精米長、精米寬、精米長寬比和堊白率的影響達到極顯著水平,說明籽粒這些性狀受到遺傳因素和環(huán)境因素的共同作用。谷粒面積、谷粒圓度2個性狀受環(huán)境、環(huán)境與株系互作的影響均不顯著,多環(huán)境下均值變異幅度小。

    A.不同重組自交株系的穗部表型Phenotypes of panicles of different RILs;B.不同重組自交株系的籽粒表型Phenotypes of kernels of different RILs

    圖2 重組自交系群體穗部和籽粒的表型變異

    注:E1~E4.4個鑒定環(huán)境。*和**表示顯著水平分別為P<0.05和P<0.01。下同。

    Note:E1-E4.Four environments.Value with * and ** mean differ significantly atP<0.05 andP<0.01,respectively.The same as below.

    2.3籽粒性狀在RIL群體中的分離

    基于RIL群體中的16個目標性狀在4種環(huán)境下的平均值,對這些性狀的分布進行統(tǒng)計分析,性狀分布頻次見圖3(橫坐標為RIL群體的性狀平均值,縱坐標為RIL個數)。頻次圖表明,這些性狀群體均值與親本均值相近,分離模式呈連續(xù)變異。除堊白粒率外,其他各性狀分布頻率接近單峰的正態(tài)分布,符合典型的數量性狀遺傳規(guī)律,受多基因控制。

    圖3 籽粒性狀在RIL群體的分布

    2.4性狀的遺傳變異規(guī)律

    4種環(huán)境下,采用SAS 9.3中GLM(General linear models)對RIL群體16個性狀進行方差分析,結果表明,各株系間均存在顯著差異,除有效穗數的P值<0.01,其他P值均<0.001(表3)。堊白粒率、堊白面積和堊白度的表型變異系數較大,分別為98.38%、46.32%和94.22%;單株穗質量和有效穗數的表型變異系數分別為43.91%和39.29%;其他性狀的表型變異系數較小,為7.72%~15.17%。在遺傳變異系數方面,堊白粒率和堊白度的變異系數也較大,分別為73.47%和43.71%;堊白面積、單株穗質量、谷粒長寬比和精米長寬比的遺傳變異系數分別為16.52%、14.57%、12.75%和11.98%;其他性狀的遺傳變異系數較小,為5.06%~9.23%。

    群體遺傳參數結果表明,各性狀的廣義遺傳力為4.26%~70.67%,其中谷粒長、谷粒寬、谷粒長寬比、谷粒周長、谷粒圓度、精米長、精米寬、精米長寬比的廣義遺傳力介于59.33%和70.67%,受基因型控制為主。有效穗數廣義遺傳力最低,為4.26%,表明該性狀的表型變異受環(huán)境及隨機誤差的影響較大。

    表3 重組自交系群體籽粒性狀遺傳參數

    2.5不同性狀間相關性分析

    采用SAS統(tǒng)計軟件對4種環(huán)境下RIL群體各性狀表型值進行相關分析,發(fā)現(xiàn)多個性狀間存在不同程度的相關(表4)。

    單株穗質量與有效穗數、千粒質量、精米長呈極顯著正相關,與精米長寬比呈顯著正相關,與堊白粒率呈顯著負相關,與精米白度呈極顯著負相關,與其他性狀的相關性不顯著。粒質量是產量構成因子,其與精米粒長和精米粒寬呈顯著正相關,且系數達到0.45以上,表明粒質量受粒型影響較大。同時,粒質量與堊白3個性狀指標均達到極顯著正相關。

    籽粒外觀性狀方面,粒長、粒寬與堊白粒率、堊白度呈明顯互作網絡關系。首先粒長與粒寬表現(xiàn)負相關,相關系數r=-0.351;粒長與堊白性狀存在顯著負相關,與堊白粒率和堊白度的相關系數分別為-0.193和-0.114;而粒寬與堊白性狀則顯著正相關,與堊白粒率、堊白面積和堊白度相關系數分別為0.644、0.181和0.432。此外,白度與堊白粒率和堊白度呈顯著正相關,并且相關系數均較大。

    2.6綜合性狀優(yōu)良株系的篩選

    對4種環(huán)境下192個重組自交系的性狀表現(xiàn)進行篩選,獲得4個綜合性狀優(yōu)良的株系,分別為GL52、GL53、GL106和GL117,其主要性狀值見表5。這些株系的單株穗質量34.35~46.23 g,有效穗數為13~17,千粒質量均超過21 g,精米長寬比均大于2.7,堊白粒率均低于2%。表明這些株系在穗部性狀、粒質量和稻米外觀品質等方面綜合表現(xiàn)較為優(yōu)良,可用于育種實踐。

    表4 RIL群體籽粒性狀間的相關系數及其顯著性

    表5 4個優(yōu)良株系在4種環(huán)境下主要性狀平均值

    3討 論

    多數研究表明,稻米籽粒性狀屬于數量性狀,受環(huán)境影響較大,應在多種環(huán)境下進行鑒定才能正確評價性狀表現(xiàn)[15]。對于數量遺傳研究,理想的作圖群體應具備系間性狀變異大、系內性狀穩(wěn)定的典型特征[16]。而 RIL群體為穩(wěn)定群體,可在多個環(huán)境下進行重復試驗,因此可以更好地進行多環(huán)境下的鑒定和遺傳分析。本研究中,RIL群體各性狀遺傳變異分析及描述性統(tǒng)計分析表明,各性狀在不同環(huán)境下均存在較廣泛的變異,變異系數為6.34%~84.55%,表明該群體符合理想RIL作圖群體的標準。從各性狀的頻次分布圖可以看出,多數性狀表現(xiàn)出雙向超親分離,在后代群體中的分離表現(xiàn)基本一致,頻次分布圖呈正態(tài)分布,而后代群體表現(xiàn)為正態(tài)分布是數量性狀的遺傳特點[17],說明這些性狀在后代群體中的遺傳是受微效多基因的數量性狀座位控制的,可以進行遺傳圖譜的構建和QTL定位。

    進一步評價不同性狀的廣義遺傳力,本研究發(fā)現(xiàn)谷粒長、谷粒寬、谷粒長寬比、谷粒周長、谷粒圓度、精米長、精米寬、精米長寬比、千粒質量、堊白粒率等主要受遺傳效應控制,粒長、粒寬、長寬比遺傳力較高,堊白率遺傳力略低,這與前人研究結果基本一致[18-20]。而堊白度、單株穗質量、有效穗數受環(huán)境影響大,遺傳力較低,這與前人研究結果存在一定差異,張利華等[21]選擇米質不同的7 個不育系和7 個恢復系,采用NC Ⅱ設計,于2000 年冬至2001 年春在海南進行人工雜交并分析稻米外觀品質遺傳力,結果表明,堊白率、堊白面積、堊白度的廣義遺傳力較高,達到90%以上;本研究采用的材料為重組自交系群體,其個體均為純合體,可在多個不同的環(huán)境下對遺傳力進行估計,而不育系與恢復系雜交后代可能會發(fā)生分離,適合在同一環(huán)境下進行遺傳分析,因此結果可能與本研究結果不一致。

    已有研究表明,可采用RIL群體不同性狀間的表型相關系數鑒定群體中各株系的表現(xiàn)[22]。本研究中,單株穗質量與有效穗數、千粒質量、精米長呈極顯著正相關,與精米長寬比呈顯著正相關,與堊白粒率呈顯著負相關,與前人研究結果相符[23-24]。此外,本研究發(fā)現(xiàn),堊白率與精米白度呈極顯著正相關,與趙國珍等[25]對堊白度與精米白度的描述相符。因此進行育種選擇時可以同時選擇高單株穗質量、高精米長寬比、低堊白、低精米白度的優(yōu)良株系。通過篩選不同環(huán)境性狀下的表現(xiàn)值,本研究獲得4個綜合性狀優(yōu)良的株系,在單株穗質量、千粒質量、精米長寬比、堊白率、堊白度、精米白度等指標等方面均得到改良,具有較高的育種價值。

    本研究構建的192個重組自交系材料遺傳背景明確,各性狀在不同環(huán)境下均存在較廣泛的變異,且谷粒長、谷粒寬、谷粒長寬比、谷粒周長、谷粒圓度、精米長、精米寬、精米長寬比、千粒質量、堊白粒率等主要受遺傳效應控制。本研究將進一步利用該群體進行高遺傳力性狀的QTL定位研究,為水稻籽粒性狀分子改良提供理論參考。

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    GUO Tao,male,professor,master supervisor.Research area: crop genetics and breeding,functional components.E-mail: guo.tao@vip.163.com.

    (責任編輯:郭柏壽Responsible editor:GUO Baishou)

    Genetic Variation of Grain Traits Based on Indica-Japonica Cross of RILs in Rice (Oryzasativa)

    GAO Weiwei,CHEN Likai,HU Chaoxu,HUANG Yuting,HUANG Ming,GUO Tao,WANG Hui and CHEN Zhiqiang

    (National Engineering Research Centre of Plant Space Breeding,South China Agricultural University,Guangzhou510642,China)

    Using the RIL population derived from the Indica-Japonica cross,the genetic variation and correlation of rice grain traitsand other traitswere analyzed under multiple environments,and to provide efficient genetic dissection of grain traits in rice.A RIL (Recombinant Inbred Line) population with 192 lines developed from a cross between indica ‘Yuzhenxiang’(long grain) and japonica cultivars ‘02428’(short grain),was used in this study.The correlation and genetic variation analysis were conducted about 16 kernel traits under four environments.The result showed that a significant difference for grain shape and chalkiness traits was observed between the two parents.The kernel length-to-width ratio of ‘Yuzhenxiang’ was 4.03,the chalky rice rate was 1.00%,and the chalkiness degree was 0.18%,whereas,the kernel length-to-width ratio of ‘02428’ was 1.45,the chalky rice rate and chalkiness degree were 87.40% and 52.21%,respectively.The average values of the traits in RIL were between the two parents; all traits tended to be normal distribution with a single peak,and met with quantitative genetics.Analysis of genetic variability under different environment indicated that grain traits were vary affected by environment and their interactions,but influence of environments to grain area and circularity was non-significant.The coefficient variation was 6.34% to 84.55%,and the generalized heritability ranged from 4.26% to 70.67%.There was a significant interrelate relationship among kernel length,kernel width,chalky rice rate and chalkiness degree.Fourrecombinant inbred lines with fine performance in panicle traits,grain mass,and appearance quality traits were obtainedfrom the RIL population,which possessed superior utilization value in breeding.In conclusion,this study dissected the genetic variation of grain-related traits in rice,and developed elite lines for breeding efficiently.

    Rice; Recombinant inbred line; Kernel traits; Genetic variation

    2015-11-03

    2016-01-21

    The National Natural Science Foundation of China (No.31200250); National High Technology Research and Development Program of China (No.2012AA101201); International Science & Technology Cooperation Program of Guangzhou (No.2014J4500030); Modern Agro-industry TechnologyResearch System (No.CARS-01-12).

    GAO Weiwei,female,master student.Research area: rice genetics and breeding,functional components.E-mail: 18819266044@163.com

    CHEN Zhiqiang,male,professor,doctoral supervisor.Research area: crop genetics and breeding,functional components.E-mail: chenlin@scau.edu.cn

    1004-1389(2016)07-0979-10

    2015-11-03修回日期:2016-01-21

    國家自然科學基金(31200250);國家高技術研究發(fā)展計劃(863)(2012AA101201);廣州市對外科技合作項目(2014J4500030);現(xiàn)代農業(yè)產業(yè)技術體系建設專項(CARS-01-12)。

    高維維,女,碩士研究生,研究方向為水稻遺傳育種。E-mail:18819266044@163.com

    陳志強,男,教授,博士生導師,主要從事水稻遺傳育種研究。E-mail:chenlin@scau.edu.cn

    S511.01

    A

    網絡出版日期:2016-06-30

    網絡出版地址:http://www.cnki.net/kcms/detail/61.1220.S.20160630.1624.010.html

    郭濤,男,教授,碩士生導師,主要從事水稻遺傳育種研究。E-mail:guo.tao@vip.163.com

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