涉及單核苷酸多態(tài)性的專利申請策略分析

廖文勇，孫婷婷，朱曉樂

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涉及單核苷酸多態(tài)性的專利申請策略分析

廖文勇*，孫婷婷*，朱曉樂

作者單位：100190 北京，國家知識產(chǎn)權(quán)局專利局專利審查協(xié)作北京中心醫(yī)藥部

*同為第一作者

編者按

近年，知識產(chǎn)權(quán)，特別是專利在促進我國醫(yī)藥生物技術(shù)研發(fā)和產(chǎn)業(yè)發(fā)展中的作用越來越大。隨著我國國家知識產(chǎn)權(quán)戰(zhàn)略的逐步推進，醫(yī)藥企業(yè)實現(xiàn)由仿制向自主創(chuàng)新的模式轉(zhuǎn)變將成為大勢所趨。為了能及時有效地保護科研人員的智力成果，申請專利是最佳選擇。為了幫助廣大醫(yī)藥工作者進一步了解醫(yī)藥及生物領(lǐng)域知識產(chǎn)權(quán)保護的政策和法律法規(guī)，提高發(fā)明專利申請文件的質(zhì)量，了解專利局的審查實踐，更好地做好專利申請工作。我刊特邀了國家知識產(chǎn)權(quán)局專利局專利審查協(xié)作北京中心相關(guān)專家撰寫了系列講座，希望能夠?qū)︶t(yī)藥企業(yè)，科研院所的相關(guān)工作人員提供一定的幫助。

單核苷酸多態(tài)性（single nucleotide polymorphism，SNP）主要是指在基因組水平上由單個核苷酸的變異而引起的DNA 序列多態(tài)性變化，具體是指在 DNA 序列中的單個堿基的變異。由于堿基對排列方式的不同，與不同的脫氧核酸配對結(jié)合，從而構(gòu)成的遺傳密碼子以不同順序編碼成各種蛋白質(zhì)，形成了自然界中生命的多樣性［1］。SNP 標記被認為是繼限制性酶切片段長度多態(tài)性（restriction fragment length polymorphism，RFLP）和微衛(wèi)星多態(tài)性（micro-statellite polymorphism）之后的新一代分子標記技術(shù)［2］，在生物遺傳多樣性分析、基因標記、遺傳改良和醫(yī)學(xué)研究等領(lǐng)域均具有重要地位。在目前已知的 SNP 中，變異多發(fā)生在兩個堿基之間，尤其是胞嘧啶（C）和胸腺嘧啶（T）之間［3］。

圖1　2000 年 - 2015 年 SNP 類專利申請量

由于 SNP 標記用途廣泛，涉及疾病鑒定、患病風(fēng)險、耐藥性評估、用藥選擇、動植物育種等多個領(lǐng)域，近年來在向中國專利局所提交的涉及 SNP 類的發(fā)明專利申請也呈現(xiàn)逐年穩(wěn)步增長的趨勢。以“單核苷酸多態(tài)性”為關(guān)鍵詞，通過智能全球?qū)＠髷?shù)據(jù)關(guān)聯(lián)地圖分析系統(tǒng)以中國專利申請數(shù)據(jù)庫為分析對象，自 2000 年 - 2015 年，共計4356 件相關(guān)專利申請。年平均申請量近 300 件，2012 年達到高峰，509 件；2013 年 448 件；2014 年 301 件；2015 年因?qū)＠暾垟?shù)據(jù)存在滯后公開原因，目前檢索的申請數(shù)量為 183 件。預(yù)計 SNP 標記類年申請量將穩(wěn)定在300 件左右（圖1）。其中，2010 年 - 2014 年的年平均申請量為 400 多件，顯示 2010 年后申請量在進一步增長。通過關(guān)鍵詞的進一步擴展進行聚類分析，顯示有更多的相關(guān)熱點申請領(lǐng)域（圖2）。但作為生物領(lǐng)域一個新興的保護主題，目前不少國內(nèi)申請人對于該主題的前期初步檢索分析、申請階段權(quán)利要求主題的保護方式選擇以及說明書中提供的試驗數(shù)據(jù)的要求等方面存在一定程度上的問題和困惑，進而導(dǎo)致不能獲得有效的專利保護，從而使得申請人的時間和金錢成本付之東流。因此，針對該類申請在當(dāng)前審查中出現(xiàn)的問題和困惑，筆者提出一些意見和建議，供申請人參考。

圖2　SNP 類申請相關(guān)熱點聚類分析（等高線及明暗用于區(qū)分示意不同關(guān)鍵詞聚類，區(qū)域遠近表示技術(shù)路線或相關(guān)度遠近，數(shù)字表明關(guān)鍵詞相關(guān)專利申請數(shù)量）

1　研發(fā)及申請前的初步檢索

在SNP 類被駁回或視為撤回結(jié)案的專利申請中，有較大一部分是因為審查中檢索到了合適的新穎性或創(chuàng)造性對比文件。因此，申請人在涉足 SNP 類研發(fā)及申請前，開展相關(guān)的初步檢索分析是十分必要的。近年來，相關(guān) SNP 檢索數(shù)據(jù)庫的建立及發(fā)展也非常迅速，筆者結(jié)合近年來審查員工作實踐，篩選出部分便捷、易于掌握且成本低的檢索方式以供申請人開展前期初步檢索。

目前可進行序列檢索的免費平臺，主要是美國國家生物技術(shù)信息中心（NCBI）所提供的 GenBank（http：//blast.ncbi. nlm.nih.gov）、歐洲生物信息研究所（EBI）下的歐洲分子生物學(xué)實驗室（EMBL）所提供的檢索平臺 EMBL-EBI（http：// ebi.ac.uk/Tools/sss/）和日本國立遺傳學(xué)研究所（National Institute of Genetics）提供的 DDBJ（http：//www.ddbj.nig.ac. jp/searches-e.html）。對于 SNP 類序列的檢索，除了可通過上述平臺所提供的 BLAST 以及 FASTA 等程序采用含有SNP 位點的片段進行常規(guī)的序列檢索外，還應(yīng)在專門的SNP 數(shù)據(jù)庫中進行針對性檢索，如 NCBI 提供的 dbSNP數(shù)據(jù)庫（http：//www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/）。這些數(shù)據(jù)庫均收藏了大量的 SNP 數(shù)據(jù)，但目前 dbSNP 數(shù)據(jù)庫只能通過 rs 或 ss 號進行檢索。如果缺少 rs 或 ss 號，則可借助 UCSC 的 In-Silico PCR 工具（http：//www.genome.ucsc. edu/cgi-bin/hgPcr？org=Human&db=hg18&hgsid=97455841）檢索現(xiàn)有技術(shù)。通過在 SNP 位點上下游設(shè)計擴增引物，再通過引物進行定位完成擴增序列中的 SNP 位點檢索。最后，還應(yīng)嘗試以涵蓋 SNP 位點的多個短序列在常用搜索引擎，如 Google 中進行檢索確認。申請人在研發(fā)之初，尤其是在進行專利申請之前，應(yīng)采用上述序列檢索方式開展針對性的初步檢索，進而調(diào)整技術(shù)方案或引入最接近的現(xiàn)有技術(shù)進行分析比較，將較大地提高專利申請的成功率，也能有效地節(jié)約申請人的時間和金錢。

2　SNP 類申請權(quán)利要求主題的保護方式選擇

美國聯(lián)邦巡回上訴法院（CAFC）的前首席法官 Giles S Rich 有一句名言：“游戲的名稱是權(quán)利要求（the name of the game is claim）”。即專利申請的一切均是圍繞著權(quán)利要求而開展，權(quán)利要求是專利申請最核心的內(nèi)容，因此撰寫權(quán)利要求是專利申請文件準備工作中的一項重要內(nèi)容。那么對于SNP 類申請，應(yīng)該選擇哪些主題保護方式最能有效地體現(xiàn)申請的發(fā)明貢獻呢？

對于保護主題的選擇，首先應(yīng)符合現(xiàn)行《專利法》和《專利法實施細則》的規(guī)定。而具體到 SNP 類申請的保護主題，則主要涉及《專利法》第二條第二款以及《專利法》第二十五條第一款。

《專利法》第二條第二款規(guī)定：發(fā)明，是指對產(chǎn)品、方法或者其改進所提出的新的技術(shù)方案。在目前的 SNP 類專利申請中，經(jīng)常出現(xiàn)下述類型的權(quán)利要求：

一種與……病易感性關(guān)聯(lián)的……區(qū)域的單核苷酸多態(tài)性位點，……。

一種分離出的或純化的……病癥相關(guān)的基因及其多態(tài)性位點，……。

一種……基因的標簽單核苷酸多態(tài)性位點，……。

一般認為，此類“位點”保護主題僅僅是一種位置“信息”，其即不是產(chǎn)品，也不是方法，通常不符合專利法第二條第二款的規(guī)定。申請人在撰寫此類申請時，應(yīng)盡量規(guī)避選擇此類權(quán)利要求主題撰寫方式。

另外，《專利法》第二十五條第一款規(guī)定：對下列各項，不授予專利權(quán)：①科學(xué)發(fā)現(xiàn)；②智力活動的規(guī)則和方法；③疾病的診斷和治療方法；……

SNP 類申請權(quán)利要求主題也常落入該條款①和③的范圍中。同樣，如上述“位點”類權(quán)利要求，也可能被認為僅僅是一種科學(xué)發(fā)現(xiàn)?！秾＠麑彶橹改稀?010 第二部分第一章規(guī)定：科學(xué)發(fā)現(xiàn)，是指對自然界中客觀存在的物質(zhì)、現(xiàn)象、變化過程及其特性和規(guī)律的揭示。而“位點”的“信息”本質(zhì)，正是對個體 DNA 特性和規(guī)定的一種揭示。因此，無論從以上何種角度，選擇“位點”作為 SNP 類申請權(quán)利要求保護的主題都將導(dǎo)致該權(quán)利要求的授權(quán)前景黯淡。

對于 SNP 類專利申請，還存在大量的方法權(quán)利要求，如：

一種檢測……基因單核苷酸多態(tài)性的方法，……。

一種……基因單核苷酸多態(tài)性位點的檢測方法，……。

一種檢測……易感基因的方法，……。

一種預(yù)測……病易感性的方法，……。

對于此類權(quán)利要求保護主題，由于 SNP 的特性，其檢測結(jié)果通常與檢測樣本來源個體的健康狀況或患病風(fēng)險度等直接相關(guān)，因此也通常會落入專利法第二十五條第一款第③項的范疇。盡管某些存在非疾病診斷應(yīng)用可能性的權(quán)利要求可以通過在主題中補入“非疾病診斷”這一限定以克服不符合專利法第二十五條第一款第③項的問題，但通常這也使得該權(quán)利要求缺失了相應(yīng)的商業(yè)應(yīng)用性以及商業(yè)應(yīng)用防御性。因此該類方法主題也并非 SNP 類申請的最佳選擇主題。

通常，對于 SNP 類專利保護主題的選擇，其應(yīng)是基于商業(yè)價值和易于維權(quán)的角度進行確定。在目前常見的 SNP類專利申請中，常采用的保護主題中有序列片段類主題、引物或探針主題、檢測芯片主題以及試劑盒類主題。

對于序列片段類主題，通常表現(xiàn)形式如下：

“一種……基因，其第……位核苷酸為……?！?/p>

“一種核酸序列，其核苷酸序列如 SEQ ID NO：1所示，且第……位為……?！?/p>

由于 SNP 類申請應(yīng)用的實質(zhì)是對 SNP 位點進行檢測，從而與某種疾病表征等相關(guān)聯(lián)，對于含有相應(yīng) SNP 位點區(qū)的片段，一方面在進行 SNP 檢測時基本不具備應(yīng)用該片段的可能性，從而使得該主題通常不具備產(chǎn)品開發(fā)性。另一方面，該片段的保護范圍也較容易規(guī)避，從而也不具備產(chǎn)品防御性。因此，在符合專利法和專利法實施細則其他條款規(guī)定的前提下，盡管此類主題能夠得到授權(quán)，但因缺乏商業(yè)價值和不易維權(quán)而不是最佳的主題選擇。

第二大類保護主題是“引物”、“探針”或“檢測芯片”，其通常的表現(xiàn)形式為：

“一種用于預(yù)測……的引物對，所述引物對中上游引物核苷酸序列為 SEQ ID NO：1，下游引物的核苷酸序列為SEQ ID NO：2?！?/p>

“一種用于擴增……的引物對，所述引物對特異性擴增出含 SEQ ID NO：1 所示序列中第……位單核苷酸多態(tài)性的擴增片段?！?/p>

“一種用于檢測……的探針，所述探針核苷酸序列為SEQ ID NO：1 所示。”

“一種用于檢測……的探針，所述探針特異性雜交并檢測 SEQ ID NO：1 所示序列中第……位的單核苷酸多態(tài)性?！?/p>

“一種用于檢測……的芯片，所述芯片含有核苷酸序列為 SEQ ID NO：……所示的檢測探針。”

“一種用于檢測……的芯片，所述芯片能夠針特異性檢測 SEQ ID NO：1 所示序列中第……位的單核苷酸多態(tài)性?！?/p>

第三類保護主題是“試劑盒”，其通常的表現(xiàn)形式為：

“一種檢測……病易感性的試劑盒，其特征在于，它包括特異性擴增……的引物對。”

“一種檢測……病易感性的試劑盒，其特征在于，它包括特異性檢測……的探針?！?/p>

“一種檢測……病易感性的試劑盒，其特征在于，它包括特異性檢測……的檢測芯片?！?/p>

對于第二類和第三類保護主題，是目前體現(xiàn) SNP 類專利商業(yè)價值之所在。通過以引物、探針、檢測芯片以及試劑盒構(gòu)建成體系化、整體性的保護主題。并且通過檢測特定SNP 位點的功能性限定的引物序列、探針、檢測芯片、試劑盒到具體的結(jié)構(gòu)限定的引物序列、探針序列或含有特定探針的芯片、試劑盒，通過在附加技術(shù)特征中從大到小的限定權(quán)利要求的組成或者通過結(jié)合功能性限定，可以對發(fā)明構(gòu)思形成全方位的保護。另一方面，這些保護主題也是 SNP 類申請最終應(yīng)用的產(chǎn)品形式，具有較佳的應(yīng)用前景。而作為一種產(chǎn)品，相對于方法類權(quán)利要求，也更易于維權(quán)。因此，對于 SNP 類申請，采用引物、探針、檢測芯片、試劑盒的體系組合以及從功能性限定到序列限定的多個權(quán)利要求主題撰寫方式是較佳的選擇。此外，以檢測特定 SNP 位點的功能性限定引物、探針、檢測芯片或試劑盒主題可以有效地發(fā)揮防御功能，從而有效克服具體序列結(jié)構(gòu)限定的相關(guān)權(quán)利要求主題保護范圍過小、容易規(guī)避侵權(quán)的問題。

3　SNP 類申請對試驗數(shù)據(jù)的要求

SNP 類申請，由于其體現(xiàn)的通常是一種偏好性、易感性，因此需更加強調(diào)試驗數(shù)據(jù)的充分和合理性。尤其是對照組的試驗數(shù)據(jù)，在 SNP 類申請中通常是不可或缺的。在實驗科學(xué)中，通常存在兩種程度上的對應(yīng)關(guān)系，一種是絕對的對應(yīng)，一種是相對的對應(yīng)。所謂絕對的對應(yīng)關(guān)系，即存在 A，則必然存在 B。A 是 B 的充分條件。而相對的對應(yīng)，則是一種群體上的關(guān)系，即存在 A，則在一定的可能性上存在B，表明的是一種發(fā)生的概率。對于 SNP 而言，以常見的病癥關(guān)聯(lián)為例，通常很難發(fā)現(xiàn)絕對的病癥關(guān)聯(lián)。絕大部分證明的是一種相對的關(guān)聯(lián)性，即對樣本數(shù)據(jù)進行相應(yīng)的統(tǒng)計學(xué)分析，從而獲得具有統(tǒng)計學(xué)意義上的易感性。

對于絕對的 SNP 類型，通常數(shù)據(jù)需要證明，通過對一定數(shù)量的樣本進行檢測，發(fā)現(xiàn)在某個位點具有某種堿基的個體均具有某種病癥，而不具有該堿基的個體均不具有此種病癥。其中，樣本來源分布的廣泛性以及隨機性將直接決定權(quán)利要求的應(yīng)用范圍，因此在選擇樣本時，因盡量提高樣本分布的廣泛性和隨機性，如提供多種地域、多個族群、不同年齡段、不同性別的多個樣本。

對于相對關(guān)聯(lián)的 SNP 類型，通常數(shù)據(jù)分析得出的結(jié)論應(yīng)具備一定的統(tǒng)計學(xué)意義。即并非簡單的結(jié)果對照，而是需對試驗數(shù)據(jù)進行統(tǒng)計學(xué)分析后得出的在一定顯著水平上的可信結(jié)論。并且對于樣本的來源分布的廣泛性和隨機性要求更高。

此外，為使得功能性限定相關(guān)權(quán)利要求能夠符合專利法第二十六條第四款有關(guān)權(quán)利要求應(yīng)當(dāng)以說明書為依據(jù)的問題，在所述 SNP 位點為新發(fā)現(xiàn)位點的情況下，應(yīng)盡量提供針對該 SNP 位點的多組有效引物、探針，以強化針對特定位點設(shè)計引物、探針的常規(guī)性，從而支撐相應(yīng)的功能性限定。而在所述 SNP 位點為現(xiàn)有技術(shù)已知的情況下，則應(yīng)著重于要求保護的引物、探針相對于常規(guī)設(shè)計的引物、探針的特殊性，比如有更高的檢測準確率或靈敏度等，以驗證所請求保護的引物或探針存在意料不到的技術(shù)效果。

4　建議

對于 SNP 類申請，首先在專利申請之初，應(yīng)有效地利用互聯(lián)網(wǎng)資源進行初步的檢索分析以評估申請專利的可行性。其次，在權(quán)利要求的撰寫中，應(yīng)盡量選擇引物、探針、檢測芯片、試劑盒的權(quán)利要求主題保護形式，并且通過功能性限定和結(jié)構(gòu)限定的方式形成從大到小的組合式權(quán)利要求。最后，在說明書的試驗數(shù)據(jù)方面，樣本的選擇上，應(yīng)盡量提高樣本來源分布的廣泛性和隨機性，強化對對照組的試驗設(shè)計，并根據(jù) SNP 的類型，提供相應(yīng)的試驗數(shù)據(jù)。

以上針對 SNP 類專利申請中涉及的相關(guān)問題進行了部分探討，希望能夠拋磚引玉，為申請人提供一些幫助。

參考文獻

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DOI：10.3969/j.issn.1673-713X.2016.03.018

通信作者：廖文勇，Email：liaowenyong@sipo.gov.cn