王 寧 張正海 王立浩 張寶璽
(中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所,北京 100081)
王寧,女,碩士研究生,專業(yè)方向:蔬菜遺傳育種,E-mail:andy2012win@163.com
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不同栽培條件下辣椒果實(shí)辣椒素含量的分析與QTL定位
王 寧 張正海 王立浩 張寶璽*
(中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所,北京 100081)
王寧,女,碩士研究生,專業(yè)方向:蔬菜遺傳育種,E-mail:andy2012win@163.com
摘 要:利用辣味辣椒Perennial(Capsicum annuum)和無辣味辣椒83-58種內(nèi)重組自交系群體構(gòu)建的辣椒種內(nèi)遺傳圖譜,以溫室和露地栽培條件下無辣味辣椒77013A與重組自交系群體各株系雜交F1果實(shí)的辣椒素和二氫辣椒素含量作為表型性狀進(jìn)行分析。結(jié)果表明,溫室和露地栽培條件下辣椒素和二氫辣椒素的含量和比值差異明顯。對露地和溫室栽培條件下辣椒果實(shí)辣椒素和二氫辣椒素含量、總和及其比值進(jìn)行了QTL定位,共獲得16個關(guān)于辣椒素和二氫辣椒素含量的QTL位點(diǎn),分布在辣椒第2、4、12號染色體上,2號染色體上同時控制辣椒素、二氫辣椒素、二者比值和辣椒素總量的主效QTL位點(diǎn)cap2.1、dhp2.1、C/D2.1和(C+D)2.1,均在露地和溫室被檢測到,其LOD值大于5.0,貢獻(xiàn)率為20.2%~76.6%,側(cè)翼標(biāo)記均為BD76366和Pun1,12號染色體上調(diào)控辣椒素總量的微效QTL也在溫室和露地同時被檢測到,其他QTL位點(diǎn)未在兩種環(huán)境下同時定位到。
關(guān)鍵詞:辣味;辣椒素類物質(zhì);環(huán)境;QTL
辣椒(Capsicum annuum)是茄科辣椒屬的一種重要蔬菜作物,在世界范圍內(nèi)廣泛種植。辣椒因其獨(dú)特的辛辣刺激性而廣為人們喜愛(Govindarajan,1985;Perkins et al .,2002)。人們感覺到“辣味”,是辣椒中的辣椒素與人體神經(jīng)系統(tǒng)中的辣椒素受體(Transient receptor potential vanilloid 1,TRPV1)結(jié)合,而使人產(chǎn)生的一種輕微痛覺刺激(Caterina et al.,1997)。辣椒中辣椒素類物質(zhì)主要存在于辣椒的胎座組織和隔膜中,其中以辣椒素(capsaicin,CAP)和二氫辣椒素(dihydrocapsaicin,DHP)為主,兩者含量達(dá)到了辣椒素總量的80%以上(Kozukue et al.,2005)。研究表明,控制辣椒辣味的單顯性基因Pun1位于2號染色體上,編碼?;D(zhuǎn)移酶(acyltransferase)(Lee et al.,2005;Lang et al., 2006),Kim等(2001)找到了一個Pun1的候選基因SB2-66,在胎座中特異表達(dá),編碼AT3。目前也發(fā)現(xiàn)了Pun1基因的3個無辣味突變位點(diǎn)pun11、pun12和pun13(Stewart et al.,2007;Stellari et al.,2010),并以此開發(fā)了特異的分子標(biāo)記(Wyatt et al.,2012)。
辣椒素的含量決定了辣味的強(qiáng)弱,表現(xiàn)為數(shù)量遺傳(Zewdie & Bosland,2000a,2000b;Ben-Chaim et al.,2006),辣椒素類物質(zhì)受環(huán)境條件的影響(Harvell & Bosland,1997;Gurung et al.,2011),Phimchan等(2012)的研究表明,干旱脅迫會影響不同辣度材料的辣椒素積累水平,彭瓊等(2015)認(rèn)為輕度干旱能顯著提高辣椒果實(shí)中辣椒素類物質(zhì)含量。對于辣椒素類物質(zhì)的QTL定位研究,在7號染色體上找到兩個QTL位點(diǎn)cap7.1和cap7.2(Blum et al.,2003;Paran et al.,2010),而后又在3、4、5、6、10和11號染色體上發(fā)現(xiàn)了辣椒素類物質(zhì)含量的QTL位點(diǎn)(Ben-Chaim et al.,2006;Yarnes et al.,2013),目前1、2、9、12 號染色體還未定位到和辣椒素類物質(zhì)含量相關(guān)的位點(diǎn),而且關(guān)于不同環(huán)境下辣椒素和二氫辣椒素含量變化及相應(yīng)的QTL定位比較分析的研究還較少。
本試驗(yàn)利用以SNP標(biāo)記(KASPar分型技術(shù))為主構(gòu)建的一年生辣椒種內(nèi)遺傳圖譜,以無辣味辣椒77013A與此種內(nèi)圖譜群體各株系雜交F1果實(shí)的辣椒素含量為表型性狀,對露地和溫室栽培環(huán)境下的辣椒素、二氫辣椒素含量、辣椒素總量和辣椒素/二氫辣椒素比值進(jìn)行了QTL定位,為辣椒辣味即辣椒素含量高低的遺傳控制研究提供參考。
1.1試材及取樣
有辣味辣椒Perennial和無辣味辣椒83-58雜交種內(nèi)重組自交系F7群體(RILs),以及無辣味辣椒77013A均由中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所辣椒課題組提供。作圖群體是Perennial×83-58以單粒傳的方式構(gòu)建的F7RILs群體,共113個株系(52個有辣味、61個無辣味);性狀調(diào)查的群體以77013A為母本,分別以Perennial、83-58和RILs群體113個株系為父本,進(jìn)行人工雜交獲得115個雜交F1。
于2013年9月將RILs群體113個株系、83-58、Perennial和77013A各4株定植于本所廊坊基地日光溫室,苗期提取基因組DNA;2014年3月和4月分別將77013A、 83-58、Perennial和115個雜交F1定植于中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院南口基地的露地和溫室,3次重復(fù),每個重復(fù)8株。定植后用溫濕度記錄儀實(shí)時記錄環(huán)境溫濕度變化,每隔2 h記錄一次。
1.2辣椒素和二氫辣椒素的測定
果實(shí)青熟時(約授粉后60 d),采集77013A、83-58、Perennial和115個雜交F1正常青熟果實(shí),摘除果柄、基部胎座和種子,65 ℃干燥24 h,用磨樣機(jī)打成粉末,取0.500 g粉末利用超高效液相色譜(UPLC)技術(shù)測定辣椒素和二氫辣椒素含量。每個樣本3個生物學(xué)重復(fù),每個重復(fù)6個果實(shí)。UPLC由中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)部蔬菜品質(zhì)監(jiān)督檢驗(yàn)測試中心完成,采用優(yōu)化的提取方法,將稱好的0.500 g辣椒粉末加入甲醇+四氫呋喃(1 V∶1 V)混合溶液25 mL,封口后搖床振蕩30 min,然后置于37 ℃水浴條件使用超聲波提取10 min,靜置30 min后吸取上清液加入到上樣瓶中,進(jìn)行色譜分析。
1.3遺傳連鎖圖譜構(gòu)建
辣椒種內(nèi)遺傳圖譜中以ES命名的400個SSR標(biāo)記由本所辣椒課題組開發(fā),其余521個SSR、228個CAPS和2個SCAR標(biāo)記來自已報道的辣椒遺傳圖譜(Wu et al.,2009;Wyatt et al.,2012)。4個InDel標(biāo)記和27個CAPS標(biāo)記是本所辣椒課題組通過對試驗(yàn)雙親SlEF重測序?qū)Σ町愋蛄性O(shè)計所得。SNP(KASpar)標(biāo)記的序列由法國農(nóng)業(yè)科學(xué)院提供,試驗(yàn)方法參照LGC公司的方法進(jìn)行(http://www.kbioscience.co.uk)。將親本和RILs群體中篩選到的多態(tài)性標(biāo)記數(shù)據(jù)導(dǎo)入Joinmap 4.0軟件(van Ooijen,2006)進(jìn)行分析并構(gòu)建遺傳連鎖圖。圖譜構(gòu)建的LOD≥ 3.0,步長為0.5,算法為regression mapping,去除無效標(biāo)記的閾值設(shè)為5.0,采用Kosambi函數(shù)(Kosambi,1943)計算遺傳距離。然后結(jié)合露地和溫室測定的辣椒素和二氫辣椒素含量數(shù)據(jù),利用MapQTL 3.0軟件區(qū)間作圖法(Interval Mapping)進(jìn)行QTL定位,將LOD閾值定為Permutation Test檢驗(yàn)結(jié)果>95%時的值來確定QTL存在。
表1 溫室與露地溫度和濕度比較
2.1溫室與露地的栽培環(huán)境差異
通過溫濕度記錄儀每2 h記錄一次溫室和露地的溫濕度數(shù)據(jù)(表1)。5~7月,露地的月平均溫度比溫室高1.01 ℃,月平均最低溫度比溫室低1.04℃,月平均最高溫度比溫室高3.52 ℃,從而使露地溫差比溫室大4.56 ℃。在環(huán)境濕度上,露地平均濕度為55.14%,溫室平均濕度為71.80%,溫室濕度比露地高16.66個百分點(diǎn)。
2.2不同栽培條件下辣椒素含量變化
77013A與Perennial、83-58、RILs群體的115個雜交F1中,露地77013A×Perennial辣椒素總量為3 490.50 mg·kg-1,溫室為4 419.72 mg·kg-1,溫室比露地高26.6%;而77013A×RILs的辣椒素總量在露地平均為272.42 mg·kg-1,溫室中平均為195.61 mg·kg-1,溫室比露地低28.2%(表2)。77013A與RILs群體各株系113個F1中,有52個單株同時合成辣椒素和二氫辣椒素(圖1,辣椒素和二氫辣椒素都為0的單株未列出),其中39個單株的辣椒素總量露地高于溫室,剩余13個單株則是溫室高于露地,露地整體的辣椒素總量高于溫室。
除77013A×Perennial的F1辣椒素含量溫室比露地高33.3%外;其余不論是辣椒素還是二氫辣椒素含量,露地條件下的測定值均高于溫室的測定值(表2)。而溫室中辣椒素與二氫辣椒素的比值則大于露地。綜上可以看出:露地在高溫且溫差較大、濕度較低的環(huán)境下,辣椒素和二氫辣椒素的積累量大多高于溫室。
表2 親本和RILs群體中辣椒素類物質(zhì)含量
圖1 有辣味的77013A×RILs F1群體在溫室和露地條件下辣椒素類物質(zhì)含量變化
2.3辣椒素含量的QTL定位
Perennial含辣椒素6 091.62 mg·kg-1,二氫辣椒素2 184.42 mg·kg-1,77013A兩物質(zhì)含量均為0。Perennial×77013A(辣味辣椒×無辣味辣椒)的F1辣椒素含量為2 513.61 mg·kg-1,二氫辣椒素為976.89 mg·kg-1,介于雙親Perennial與77013A之間,而83-58×77013(無辣味辣椒×無辣味辣椒)F1的辣椒素、二氫辣椒素含量均為0(表2)。可見辣椒素和二氫辣椒素含量的遺傳表現(xiàn)為數(shù)量性狀遺傳的特點(diǎn)。且77013A與RILs群體測交一代中,辣椒素和二氫辣椒素的含量呈連續(xù)分布,可以利用構(gòu)建的遺傳圖譜進(jìn)行QTL定位。
在RILs群體中共檢測到溫室和露地環(huán)境下有關(guān)辣椒素、二氫辣椒素、辣椒素總量及辣椒素/二氫辣椒素的16個QTL位點(diǎn),位于第2、4、12號染色體上(圖2)。在溫室和露地共同檢測到的辣椒素QTL位點(diǎn)1個、二氫辣椒素QTL位點(diǎn)1個,辣椒素總量QTL位點(diǎn)2個,辣椒素/二氫辣椒素QTL位點(diǎn)1個(表3)。其中,除了辣椒素總量在12號染色體上露地和溫室定位到了一個共同微效位點(diǎn)外,其他各項的共同位點(diǎn)均為位于P2b連鎖群上的主效QTL,而其他微效QTL位點(diǎn)未在兩種環(huán)境下同時檢測到。溫室中,辣椒素、二氫辣椒素和辣椒素總量均在P2c連鎖群同一位置檢測到微效位點(diǎn);在露地環(huán)境下,辣椒素和二氫辣椒素均在12號染色體上定位到同一減效微效位點(diǎn),二氫辣椒素在P4a連鎖群上也檢測到微效位點(diǎn)(表3)。
圖2 辣椒素、二氫辣椒素、辣椒素總量及辣椒素/二氫辣椒素在RILs(83-58×Perennial)群體中的QTL定位G指溫室QTL位點(diǎn);F指露地QTL位點(diǎn)。
表3 辣椒素和二氫辣椒素在RILs群體的QTL定位
辣椒素(CAP):共檢測到4個QTL位點(diǎn),其中2個為溫室和露地共同主效QTL位點(diǎn),側(cè)翼標(biāo)記均為BD76366和Pun1,位于2號染色體上,均為加性效應(yīng)。同時在2號染色體另一區(qū)域,溫室檢測到一微效QTL位點(diǎn),而露地未檢測到,側(cè)翼標(biāo)記為UN33215_371和UN23439_1194,貢獻(xiàn)率為8.0%,表現(xiàn)為增效位點(diǎn)。而在12號染色體上僅在露地條件下檢測到一微效QTL位點(diǎn),貢獻(xiàn)率11.0%,為減效位點(diǎn),說明控制辣椒素含量的位點(diǎn)受環(huán)境調(diào)控。
二氫辣椒素(DHP):共檢測到5個QTL位點(diǎn),除了僅在露地條件下檢測到位于P4a連鎖群一微效QTL位點(diǎn),其他位點(diǎn)位置均與辣椒素的QTL位點(diǎn)一致,只是貢獻(xiàn)率有所差異。該微效QTL位點(diǎn)側(cè)翼標(biāo)記為UN02951_367和UN30277_447,貢獻(xiàn)率為9.9%,表現(xiàn)為增效位點(diǎn)。
辣椒素總量(CAP+DHP):露地和溫室分別在P2b和P12的相同位置檢測到主效和微效QTL位點(diǎn),溫室還在P2c連鎖群檢測到微效QTL。
辣椒素/二氫辣椒素(CAP/ DHP):溫室和露地均在2號染色體的BD76366和Pun1之間檢測到控制辣椒素/二氫辣椒素的主效QTL位點(diǎn),貢獻(xiàn)率分別為30.4%和76.6%,加性效應(yīng),未在其他染色體上檢測到其他QTL位點(diǎn)。
分子遺傳圖譜的構(gòu)建和QTL定位有助于辣椒的分子標(biāo)記輔助育種選擇,在以往的研究中,依靠RAPD、RFLP、SSR等標(biāo)記構(gòu)建的辣椒圖譜取得了很大進(jìn)展,但也存在圖譜密度不夠高、連鎖群較多的問題(劉峰 等,2012;段蒙蒙,2014)。本試驗(yàn)利用種內(nèi)F7重組自交系為作圖群體,以KASPar技術(shù)分型SNP標(biāo)記為主,結(jié)合SSR和CAPs標(biāo)記構(gòu)建的較高密度的遺傳圖譜,有利于進(jìn)行農(nóng)藝性狀的定位和輔助育種。
對于辣味有無的遺傳,通過辣味辣椒×無辣味辣椒(F1)辣椒素類物質(zhì)的含量測定,可以看出辣味遺傳為非質(zhì)量性狀,辣味強(qiáng)弱在分離群體中差異明顯,辣椒素類物質(zhì)含量受環(huán)境影響。Otha(1962)認(rèn)為高溫可以增加辣椒素類物質(zhì)積累。本試驗(yàn)結(jié)果顯示:和溫室相比,露地表現(xiàn)為高溫低濕、溫差大,露地RILs測交群體的辣椒素類物質(zhì)的含量大多高于溫室,表明高溫且溫差較大、低濕環(huán)境更有利于辣椒素類物質(zhì)的積累;辣椒素/二氫辣椒素則為溫室高于露地,呈現(xiàn)相反的結(jié)果,說明環(huán)境條件對辣椒素和二氫辣椒素的影響是不同的。從露地和溫室二氫辣椒素的含量看,露地二氫辣椒素含量升高得快,使得辣椒素與二氫辣椒素比值降低,環(huán)境因素對二氫辣椒素的影響較大。本試驗(yàn)測交一代群體中,大部分單株辣椒素總量露地高于溫室,而少數(shù)則是露地低于溫室,是試驗(yàn)誤差還是環(huán)境敏感的遺傳位點(diǎn)調(diào)控使然,還有待進(jìn)一步探究。
本試驗(yàn)利用測交群體對辣椒素和二氫辣椒素含量進(jìn)行QTL定位,得到的16個QTL位點(diǎn),分別位于第2、4、12號染色體上,其中G-cap2.1、F-cap2.1、G-dhp2.1、F-dhp2.1、G-(C+D)2.1、F-(C+D)2.1、G-C/D2.1和F-C/D2.1同時被定位在了2號染色體上相同區(qū)域,且均為主效QTL位點(diǎn),側(cè)翼標(biāo)記為Pun1與BD76366,不同環(huán)境下的貢獻(xiàn)率有差別,且露地環(huán)境的貢獻(xiàn)率均超過了40%,高于溫室。QTL位點(diǎn)的重疊表明該位點(diǎn)同時調(diào)控辣椒素與二氫辣椒素的合成,也調(diào)控辣椒素與二氫辣椒素的比值及總量的大小。其他微效QTL位點(diǎn)中,G-cap2.2、G-dhp2.2和G-(C+D)2.2同時被定位在P2c連鎖群的UN33215_371和UN23439_1194之間,而露地環(huán)境下未被檢測到,表明該位點(diǎn)為溫室所特有的;而在12號染色體上同時獲得了露地調(diào)控辣椒素、二氫辣椒素和辣椒素總量的F-cap12.1、F-dhp12.1 和F-(C+D)12.1,溫室僅在辣椒素總量上定位到G-(C+D)12.1位點(diǎn),P2c和P12兩處的微效位點(diǎn)可能為環(huán)境敏感的微效QTL。露地環(huán)境下還檢測到位于4號染色體UN02951_367和UN30277_447之間的F-dhp4.1位點(diǎn),本試驗(yàn)沒有定位到關(guān)于辣椒素與二氫辣椒素比值的微效QTL位點(diǎn)。上述微效QTL位點(diǎn)調(diào)控了辣椒素和二氫辣椒素含量及辣椒素總量的變化,且在不同栽培環(huán)境下進(jìn)行調(diào)控的QTL位點(diǎn)有所差異,說明環(huán)境因子(溫度或濕度)通過影響某些QTL位點(diǎn)來調(diào)控兩物質(zhì)含量的變化,導(dǎo)致溫室與露地辣椒素類物質(zhì)含量及比值的差異。本試驗(yàn)利用種內(nèi)RILs群體作圖并進(jìn)行QTL定位,RILs群體遺傳背景較為相近,相比前人利用種間群體獲得的位點(diǎn)相對要少一些(Ben-Chaim et al.,2006;Yarnes et al.,2013)。本試驗(yàn)發(fā)現(xiàn)了兩種環(huán)境條件下存在差異的QTL位點(diǎn),為以后系統(tǒng)研究環(huán)境對辣椒素類物質(zhì)的影響提供了參考。而對于找到環(huán)境調(diào)控辣椒素類物質(zhì)含量變化的微效QTL位點(diǎn)以及某一環(huán)境因子對辣椒素類物質(zhì)含量的影響還需進(jìn)一步深入研究。
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WANG Ning,ZHANG Zheng-hai,WANG Li-hao,ZHANG Bao-xi*
(Institute of Vegetables and Flowers,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Beijing 100081,China)
Abstract:In the present study,we constructed an intraspecific genetic map by using a recombinant inbred lines crossed by pungent pepper ‘Perennial’(Capsicum annuum) and non-pungent pepper ‘83-58’,and analyzed capsaicin and dihydrocapsaicin contents investigated on a test cross progeny by non-pungent pepper ‘77013A ’and RILs (‘83-58’בPerennial’) both in greenhouse and open fields. And the differences in capsaicin content,dihydrocapsaicin content,total capsaicinoids and capsaicin/dihydrocapsaicin ratio between greenhouse and open fields were obvious. We did QTL mapping on them and found 16 QTLs located in chromosome 2,4 and 12. The major QTL cap2.1,dhp2.1,C/D2.1 and (C+D)2.1 on chromosome 2 that controlling capsaicin content,dihydrocapsaicin content,total capsaicinoids content and capsaicin/dihydrocapsaicin ratio,was detected in both greenhouse and open fields. The LOD was above 5.0,accounting for 20.2%-76.6% of the phenotypic variation. The interval markers were BD76366 and Pun1. We also found minor QTLs in P12 that regulating total capsaicinoids content in 2 environments. Other minor QTLs were not detected at the same time in these 2 environments.
Key words:Pungency;Capsaicins;Environment;QTL
基金項目:公益研究所基金項目(1610032011011),國家“863”計劃項目(2012AA100103002),中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新工程項目(CAAS-ASTIP-IVFCAAS),國家科技支撐項目(2011BAZ01732),創(chuàng)新工程農(nóng)業(yè)部大宗蔬菜技術(shù)產(chǎn)業(yè)體系項目(CARS-25)
收稿日期:2015-04-16;接受日期:2015-06-02
*通訊作者(
Corresponding author):張寶璽,研究員,碩士生導(dǎo)師,專業(yè)方向:蔬菜遺傳育種,E-mail:zhangbx@caas.cn