楊敏,徐桂華
(南京中醫(yī)藥大學(xué)護(hù)理學(xué)院,南京210000)
·綜述·
蛋白質(zhì)組學(xué)在腰椎間盤突出癥中的研究進(jìn)展
楊敏,徐桂華
(南京中醫(yī)藥大學(xué)護(hù)理學(xué)院,南京210000)
腰椎間盤突出癥(LDH)是骨科常見病與多發(fā)病,其機(jī)制的初步探明已為LDH的診斷與治療提供了重要信息,但更深層次的分子機(jī)制尚不明了。蛋白質(zhì)組學(xué)注重參與特定生理或病理狀態(tài)下的所有蛋白質(zhì),為篩選疾病特異性生物標(biāo)記物,探索發(fā)病機(jī)制與治療靶點提供了新途徑。蛋白質(zhì)組學(xué)的常用技術(shù)包括蛋白質(zhì)分離技術(shù)、蛋白質(zhì)鑒定技術(shù)、生物信息學(xué)技術(shù)以及相對和絕對定量同位素標(biāo)記技術(shù)等,其在研究LDH中醫(yī)證型診斷,神經(jīng)根損傷、坐骨神經(jīng)痛以及腰椎退行性變發(fā)病機(jī)制中的應(yīng)用已經(jīng)比較明確,且取得了一定進(jìn)展。
腰椎間盤突出癥;蛋白質(zhì)組學(xué);蛋白質(zhì)分離技術(shù);神經(jīng)根損傷;腰椎退行性變
腰椎間盤突出癥(LDH)是指腰椎間盤各部分發(fā)生退行性變后,在外力因素的作用下,纖維環(huán)部分或全部破裂,單獨或連同髓核、軟骨終板向外突出,導(dǎo)致竇椎神經(jīng)和神經(jīng)根遭受刺激或壓迫,從而引起以腰腿痛為主要癥狀的一種疾病。LDH為骨科常見病和多發(fā)病,占門診腰痛患者的10%~15%,占骨科腰腿痛住院患者的25%~40%[1]。近年來LDH的發(fā)病率呈升高趨勢[2]。蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)的研究對象是生命活動的最終執(zhí)行者——蛋白質(zhì),該技術(shù)可篩選出與疾病相關(guān)的特異性生物標(biāo)記物,有助于探索發(fā)病機(jī)制與治療靶點,為LDH的深入研究提供新思路。
蛋白質(zhì)組的概念由澳大利亞學(xué)者Wilkins和Williams于1994年提出,是指一個細(xì)胞或一個組織基因組所表達(dá)的全部蛋白質(zhì)[3]。由其引申出的蛋白質(zhì)組學(xué)則是從整體角度出發(fā),分析細(xì)胞內(nèi)動態(tài)變化的蛋白質(zhì)組成成分、表達(dá)水平和修飾狀態(tài),了解蛋白質(zhì)之間相互作用和聯(lián)系,使人們能夠在分子水平上定量、動態(tài)、整體探討生命活動的規(guī)律和生命現(xiàn)象的本質(zhì)[4]。目前,蛋白質(zhì)組學(xué)的常用技術(shù)包括蛋白質(zhì)分離技術(shù)、蛋白質(zhì)鑒定技術(shù)、生物信息學(xué)技術(shù)及相對和絕對定量同位素標(biāo)記技術(shù)。
1.1 蛋白質(zhì)分離技術(shù) 該技術(shù)主要包括雙向凝膠電泳(2-DE)、雙向熒光差異電泳以及液相色譜(LC)技術(shù)等,其中2-DE為最經(jīng)典、最成熟的蛋白質(zhì)組學(xué)分離技術(shù),它依據(jù)蛋白質(zhì)等電點與相對分子質(zhì)量的不同而實現(xiàn)蛋白高通量的分離。2-DE技術(shù)在第一向IPG 膠條的制備和第二向凝膠的處理方面都有了很大提高,已廣泛應(yīng)用于醫(yī)學(xué)研究。Qian等[5]運用該技術(shù)發(fā)現(xiàn)了與膽固醇結(jié)石形成有關(guān)的4種蛋白質(zhì);Ayyub等[6]憑借該技術(shù)發(fā)現(xiàn)了可能對肺癌早期診斷有價值的蛋白生物標(biāo)記物。
1.2 蛋白質(zhì)鑒定技術(shù) 目前最普遍的蛋白質(zhì)鑒定技術(shù)為生物質(zhì)譜分析技術(shù),質(zhì)譜可先將分析物離子化,隨后質(zhì)荷比不同的帶電粒子在空間或時間上分離并排列成圖譜,根據(jù)所形成的圖譜對分析物進(jìn)行檢測鑒定[7]。常用的一級質(zhì)譜技術(shù)有基質(zhì)輔助激光解析飛行時間質(zhì)譜(MALDI-TOF-MS)、電噴射離子井飛行時間質(zhì)譜以及表面增強激光解析電離飛行時間質(zhì)譜(SELDI-TOF-MS)等。除此以外,二級質(zhì)譜即同時將兩個一級質(zhì)譜連在一起構(gòu)成的串聯(lián)質(zhì)譜(MS/MS),因具有較高的特異性與靈敏性,且所需樣本量少,逐漸受到研究者的青睞。如串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù)作為新生兒遺傳代謝疾病的初篩手段,大大提高了疾病檢出率,有助于疾病的早期診斷和治療,從而降低病死率,改善預(yù)后[8]。
1.3 生物信息學(xué)技術(shù) 經(jīng)過分離與鑒定,還需對蛋白質(zhì)的功能和結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析。蛋白質(zhì)的功能分析一般采用Mascot搜索Swiss-prot、PIR等常用的蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫,將樣品蛋白質(zhì)與已知蛋白質(zhì)序列進(jìn)行比較以了解其功能;也可通過蛋白質(zhì)的物理性質(zhì)進(jìn)行預(yù)測,或者與保守基序和圖形數(shù)據(jù)庫比較,以判斷其功能。相比蛋白質(zhì)功能的測定,蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的測定則困難許多。雖然在PDB等數(shù)據(jù)庫中可檢測到蛋白質(zhì)高級結(jié)構(gòu)的同源性,但蛋白質(zhì)的折疊過程仍不清晰。蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的預(yù)測是目前最困難、最復(fù)雜的預(yù)測技術(shù),目前采用的方法有同源模建、threadin算法等[9]。
1.4 相對和絕對定量同位素標(biāo)記(iTRAQ)技術(shù) iTRAQ技術(shù)是美國應(yīng)用生物系統(tǒng)公司在2004年推出的一項新的體外同位素標(biāo)記技術(shù),具有高通量、高靈敏的特點,它的出現(xiàn)促使比較蛋白質(zhì)組學(xué)向定量蛋白質(zhì)組學(xué)升級發(fā)展[10]。iTRAQ技術(shù)的流程如下:將樣品酶分解為肽段后,分別用iTRAQ試劑進(jìn)行差異標(biāo)記、混合,最后用液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜(LC-MS/MS)技術(shù)進(jìn)行分析。該技術(shù)可對同一實驗下的8個樣品同時進(jìn)行相對量化,大大降低實驗過程中的技術(shù)誤差,因此很多醫(yī)學(xué)研究者用此技術(shù)尋找疾病狀態(tài)下的特異表達(dá)蛋白,以發(fā)現(xiàn)治療藥物的新靶點。Ran等[11]通過對15例胃癌患者的胃組織進(jìn)行iTRAQ技術(shù)分析,發(fā)現(xiàn)包括嗅質(zhì)蛋白4在內(nèi)的4種蛋白質(zhì)表達(dá)上調(diào),且體外研究發(fā)現(xiàn)抑制嗅質(zhì)蛋白4的表達(dá)后,胃癌細(xì)胞的轉(zhuǎn)移、侵襲與增殖也受到抑制。因此,抑制嗅質(zhì)蛋白4的表達(dá)可能成為未來抗癌藥物研制的方向之一。
2.1 在LDH中醫(yī)證型診斷中的應(yīng)用 蛋白質(zhì)組學(xué)是研究生物信息學(xué)在整體水平上的相互作用,與中醫(yī)的整體觀念不謀而合,并且其客觀的研究結(jié)果可彌補傳統(tǒng)中醫(yī)辨證指標(biāo)主觀性強的缺點[12]。蛋白質(zhì)組學(xué)運用于LDH的中醫(yī)證型診斷為研究其辨證規(guī)律提供了新思路。許建文等[13]應(yīng)用SELDI-TOF-MS技術(shù)對LDH血瘀證患者、LDH非血瘀證患者和健康人血清蛋白質(zhì)組學(xué)進(jìn)行了比較研究,發(fā)現(xiàn)了11個差異蛋白質(zhì)點;其采用Biomarker Patterns軟件構(gòu)建LDH血瘀證的血清學(xué)診斷模型,結(jié)果顯示LDH血瘀證患者ROC曲線下面積為0.984,說明該血清學(xué)診斷模型的診斷價值較高。趙偉等[14]采用SELDI-TOF-MS技術(shù)及蛋白質(zhì)芯片技術(shù)檢測壯族LDH血瘀證患者、漢族LDH血瘀證患者、壯族LDH非血瘀證患者和漢族LDH非血瘀證患者的血清樣本,共找出13個表達(dá)顯著差異的蛋白質(zhì)點,并由此構(gòu)建出壯族LDH血瘀證的血清學(xué)診斷模型;經(jīng)盲法驗證,該模型陽性預(yù)測值達(dá)到94.44%,表明由13個差異表達(dá)蛋白構(gòu)成的診斷模型可區(qū)分壯族與其他民族LDH血瘀證及其他中醫(yī)證型。以上研究為應(yīng)用生物標(biāo)志物進(jìn)行LDH的中醫(yī)辨證奠定基礎(chǔ)。
2.2 在神經(jīng)根損傷發(fā)病機(jī)制研究中的應(yīng)用 神經(jīng)根受壓是LDH的主要病理特征之一,除了單純的機(jī)械作用,突出的髓核可能引起神經(jīng)根的生化與免疫反應(yīng),從而引起LDH的一系列臨床癥狀。Liu等[15]采集觀察組(LDH引起的脊神經(jīng)根損傷患者)與對照組(椎間盤正常患者)的腦脊液,使用2-DE結(jié)合LC-IT-MS技術(shù)分析腦脊液蛋白質(zhì),結(jié)果發(fā)現(xiàn)兩組間存在15個表達(dá)差異的蛋白質(zhì)點,其中9個在觀察組腦脊液中水平升高,包括胱抑蛋白C、載脂蛋白A-IV、維生素D結(jié)合蛋白、神經(jīng)微絲的3種L蛋白、四連接素、免疫球蛋白G和血紅蛋白,并通過ELISA法證實了這些蛋白質(zhì)表達(dá)的改變可能與LDH引起的脊神經(jīng)根損傷有關(guān)。有研究建立了大鼠背根神經(jīng)節(jié)持續(xù)受壓(CCD)模型,28天后處死大鼠,提取蛋白,先通過雙向電泳分離蛋白,找出差異表達(dá)蛋白質(zhì)點后運用MALDI-TOF-MS技術(shù)進(jìn)行鑒定,分析所得肽指紋圖譜,發(fā)現(xiàn)共15種差異表達(dá)的蛋白;其中7種蛋白在CCD組表達(dá)上調(diào)(其中1種蛋白只存在于CCD組),并推測膜聯(lián)蛋白A2、p11和蛋白激酶Ce蛋白表達(dá)的上調(diào)可能參與了神經(jīng)性疼痛的發(fā)生[16, 17]。
2.3 在坐骨神經(jīng)痛發(fā)病機(jī)制研究中的應(yīng)用 LDH是導(dǎo)致坐骨神經(jīng)痛的主要原因之一,但其機(jī)制尚未明確;椎間盤源性痛目前主要依賴經(jīng)驗推測,無法通過臨床診斷證實[18],而蛋白質(zhì)組學(xué)有可能成為該病最有效的生物標(biāo)記物追蹤技術(shù)。Xie等[19]借助2-DE結(jié)合MALDI-TOF-MS技術(shù),分析了30例由LDH引起坐骨神經(jīng)痛患者與30位健康志愿者的血清樣本,發(fā)現(xiàn)了6種差異蛋白質(zhì),包括表達(dá)升高的載脂蛋白-L1與兩種血清白蛋白前體,以及表達(dá)降低的載脂蛋白M、四連接素與免疫球蛋白輕鏈;并通過ELISA法進(jìn)行反向驗證,結(jié)果表明載脂蛋白-L1、載脂蛋白M、四連接素以及免疫球蛋白輕鏈這4種蛋白質(zhì)可能是與LDH引起的坐骨神經(jīng)痛相關(guān)的生物標(biāo)志物。
2.4 在腰椎退行性變研究中的應(yīng)用 腰椎退行性變是LDH發(fā)生的致病基礎(chǔ),因此腰椎退行性變后的蛋白質(zhì)組學(xué)研究也成為LDH蛋白質(zhì)組學(xué)研究的重要方向[20]。馮皓宇等[21]采用2-DE聯(lián)合MALDI-TOF-MS對人正常椎間盤纖維環(huán)和髓核細(xì)胞外基質(zhì)分子蛋白進(jìn)行鑒定,發(fā)現(xiàn)了19種相同的蛋白質(zhì),為進(jìn)一步研究這些蛋白質(zhì)在椎間盤退變過程中的變化打下基礎(chǔ)。呂志德等[22]通過2-DE和MALDI-TOF-MS技術(shù)確定了正常和退變腰椎間盤組織中的6種差異蛋白質(zhì),有助于深入研究這些蛋白質(zhì)在腰椎退行性變過程中的作用及其機(jī)制。Ye等[23]通過對椎間盤退行性變患者與正?;颊叩睦w維環(huán)細(xì)胞蛋白質(zhì)表達(dá)進(jìn)行分析,找到了10種差異表達(dá)的蛋白質(zhì),認(rèn)為這些蛋白質(zhì)與椎間盤退行性變的發(fā)病有關(guān),并可作為其生物標(biāo)志物。Yee等[24]采用iTRAQ標(biāo)記LC-MS/MS技術(shù),發(fā)現(xiàn)退變椎間盤組織中Ⅰ型膠原蛋白、纖連蛋白與HTRA1等蛋白表達(dá)上調(diào),這種變化在年輕椎間盤退化患者的纖維環(huán)組織中亦能觀察到,證實椎間盤細(xì)胞外基質(zhì)的改變與其衰老和退化有關(guān)。以上研究可為腰椎退行性變生物特異性標(biāo)記物的確定及靶向藥物的研發(fā)提供參考。
綜上所述,與傳統(tǒng)技術(shù)注重研究單一蛋白質(zhì)不同,蛋白質(zhì)組學(xué)注重研究參與特定生理或病理狀態(tài)下的所有蛋白質(zhì),這樣的優(yōu)勢使其在多個醫(yī)學(xué)領(lǐng)域被廣泛研究與應(yīng)用。LDH的早期防治與發(fā)病機(jī)制的闡明是目前醫(yī)學(xué)的難點和重點,但蛋白質(zhì)組學(xué)的興起為該問題的解決帶來了新的希望。盡管與骨科其他經(jīng)典的檢驗技術(shù)相比,蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)尚不成熟,如2-DE技術(shù)檢測敏感性與分辨率較低,質(zhì)譜技術(shù)對低分子量蛋白質(zhì)的鑒定效果欠佳等。但是,隨著現(xiàn)有技術(shù)的不斷完善和更多新技術(shù)的產(chǎn)生,蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)會為闡明LDH的發(fā)病機(jī)制、識別早期病變、明確診斷等做出更大的貢獻(xiàn)。目前,運用蛋白質(zhì)組學(xué)闡明LDH發(fā)病機(jī)制的研究正在開展,但是尚缺乏運用該技術(shù)探討蛋白質(zhì)變化與治療效果之間關(guān)系的研究,今后可從蛋白質(zhì)組層面闡述LDH的治療手段。
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國家自然科學(xué)基金資助項目(81473791);江蘇省基礎(chǔ)研究計劃自然科學(xué)基金資助項目(BK20141464);江蘇省第四期“333工程”培養(yǎng)基金資助項目。
徐桂華(E-mail: xgh88@126.com)
10.3969/j.issn.1002-266X.2016.16.037
R681.5
A
1002-266X(2016)16-0095-03
2015-11-26)