廣州市出生缺陷干預(yù)工程標(biāo)本庫(kù)的建立與管理

唐林國(guó) 左連東 唐 盈 唐 芳 葉 倩

廣州市出生缺陷干預(yù)工程標(biāo)本庫(kù)的建立與管理

唐林國(guó) 左連東 唐 盈 唐 芳 葉 倩

目的開(kāi)發(fā)廣州市出生缺陷干預(yù)工程標(biāo)本管理信息系統(tǒng)，探討標(biāo)本庫(kù)的建立與管理方法。方法采集干預(yù)人群的全血標(biāo)本，按分子生物學(xué)要求分裝處理，于－80℃低溫冷凍保存。結(jié)果采集和保存廣州市出生缺陷干預(yù)工程血液標(biāo)本49 950份，包括病殘兒鑒定血液880份、免費(fèi)孕前檢測(cè)血液1 000份，實(shí)現(xiàn)了對(duì)標(biāo)本的統(tǒng)一規(guī)范化管理，使有限的臨床科研資源得到充分有效的利用。結(jié)論標(biāo)本庫(kù)的建立對(duì)廣州市出生缺陷干預(yù)工程管理工作及科研水平的提升起到了巨大的推動(dòng)作用。

標(biāo)本庫(kù);建立與管理;出生缺陷

【Author's address】Guangzhou Women’s and Children’s Medical Center，Guangzhou 510623，China

標(biāo)本庫(kù)(Sample Bank)是系統(tǒng)收集和存儲(chǔ)人體正常和病理組織、血液樣標(biāo)本以及病理類型、臨床分期和治療效果、預(yù)防等方面的相關(guān)信息平臺(tái)。標(biāo)本庫(kù)的建設(shè)不僅包括儀器設(shè)備的管理和維護(hù)、標(biāo)本信息的采集、保存和分析，更重要的是建立標(biāo)本庫(kù)信息化管理平臺(tái)［1－2］。目前，國(guó)內(nèi)外生物樣本庫(kù)的信息化建設(shè)各具特色［3］。為了使廣州市出生缺陷干預(yù)人群等臨床標(biāo)本信息得到充分有效的利用，我們所建立了科學(xué)合理、信息全面、專業(yè)化程度高的廣州市出生缺陷干預(yù)工程標(biāo)本庫(kù)信息管理系統(tǒng)，通過(guò)計(jì)算機(jī)進(jìn)行科學(xué)的存儲(chǔ)和管理，為研究臨床疾病的發(fā)病機(jī)理及醫(yī)學(xué)診斷、治療和研究提供一個(gè)非常實(shí)用的信息化平臺(tái)。

1 標(biāo)本庫(kù)的建立

1．1 設(shè)施與設(shè)備

設(shè)施:60 m3庫(kù)房，用于存放廣州市人類出生缺陷干預(yù)工程人群標(biāo)本;設(shè)備:－80℃超低溫冰箱，共計(jì)5臺(tái)(4臺(tái)青島海爾，1臺(tái)Thermo);條碼打印機(jī)(貝迪)、掃描槍(SYMBOL)，溫度監(jiān)控和報(bào)警系統(tǒng)、生物樣本庫(kù)管理系統(tǒng)等。另設(shè)分子生物實(shí)驗(yàn)室、生化免疫室等，配備有高速冷凍離心機(jī)、PCR儀、生物安全柜等實(shí)驗(yàn)設(shè)備。

1．2 采樣及保存

研究對(duì)象:地中海貧血及唐氏綜合癥高危人群，標(biāo)本采集前須獲得病人或家屬同意并簽署知情同意書(shū)，家系性疾病還需采集患者直系家屬血液標(biāo)本;采集病人全血使用10 mL EDTA抗凝管，采血后顛倒混勻幾次待入庫(kù)。按如下標(biāo)準(zhǔn)操作:通過(guò)輸入門(mén)診號(hào)將個(gè)體信息導(dǎo)入標(biāo)本庫(kù)管理軟件，將取材單上的流水編號(hào)和臟器名稱輸入軟件，同時(shí)輸入不同成份對(duì)應(yīng)的預(yù)設(shè)管數(shù)，按照規(guī)則自動(dòng)生成樣本編號(hào)，在實(shí)驗(yàn)室的條碼打印機(jī)上生成耐－80℃標(biāo)簽。將打出的條碼貼到事先準(zhǔn)備好的相應(yīng)的空標(biāo)本管壁上，并對(duì)照凍存盒行×列放入標(biāo)本盒相應(yīng)位置。將血液樣本存入預(yù)先排好的凍存管，每管1 mL，仔細(xì)核對(duì)編號(hào)。

1．3 標(biāo)本數(shù)據(jù)庫(kù)的建立

標(biāo)本保存前應(yīng)認(rèn)真記錄標(biāo)本信息資料，標(biāo)本要有唯一可識(shí)別編碼，詳細(xì)記錄病人的一般資料:包括姓名、性別、年齡、民族、職業(yè)、聯(lián)系方式及隨訪、門(mén)診號(hào)、臨床診斷等;標(biāo)本資料包括標(biāo)本類型、病變部位、取材部位、標(biāo)本狀況描述;標(biāo)本入庫(kù)資料:包括入庫(kù)編號(hào)、入庫(kù)時(shí)間、保存期限、標(biāo)本數(shù)量、存放位置等;標(biāo)本出庫(kù)資料:包括出庫(kù)編號(hào)、出庫(kù)時(shí)間、使用單位、使用人、審批人等;標(biāo)本質(zhì)控信息包括設(shè)備實(shí)用和保養(yǎng)記錄、實(shí)驗(yàn)內(nèi)容、方法及結(jié)果、實(shí)驗(yàn)人、實(shí)驗(yàn)時(shí)間等;若標(biāo)本保存過(guò)期或損壞還應(yīng)填寫(xiě)標(biāo)本廢除信息(入庫(kù)編號(hào)、廢除標(biāo)號(hào)、標(biāo)本原始位置、廢除原因、經(jīng)手人等)。

2 標(biāo)本庫(kù)的管理

2．1 標(biāo)本庫(kù)管理主要流程包括

①基本信息錄入:包括項(xiàng)目編號(hào)及時(shí)間、標(biāo)本類型、取材部位、保存方式等。②樣本存放位置信息:包括存放設(shè)備編號(hào)、凍存盒規(guī)格及編號(hào)、樣本數(shù)量、計(jì)量單位、存放位置坐標(biāo)等。③樣本使用管理:包括出庫(kù)編號(hào)及日期、樣本原始位置、使用單位、使用數(shù)量、使用人等。④綜合查詢:包括數(shù)據(jù)導(dǎo)入導(dǎo)出、查詢、統(tǒng)計(jì)等。⑤樣本入庫(kù)時(shí)，管理員填寫(xiě)入庫(kù)登記表。⑥樣本出庫(kù)時(shí)，由使用者遞交申請(qǐng)單，經(jīng)審核人批準(zhǔn)后方可使用。⑦對(duì)于保存過(guò)期或損壞的標(biāo)本應(yīng)作為醫(yī)療廢物處理，同時(shí)填寫(xiě)標(biāo)本廢除記錄表(見(jiàn)圖1～3)。

圖1 系統(tǒng)登陸平臺(tái)

圖2 標(biāo)本入庫(kù)

圖3 標(biāo)本出庫(kù)

2．2 標(biāo)本庫(kù)的規(guī)范管理

廣州市出生缺陷干預(yù)工程標(biāo)本庫(kù)投入使用后，系統(tǒng)運(yùn)行情況良好。中心實(shí)驗(yàn)室制訂了標(biāo)本庫(kù)管理制度和標(biāo)準(zhǔn)操作規(guī)程(SOP)，明確了標(biāo)本庫(kù)工作人員的崗位職責(zé)，相關(guān)人員接受了專業(yè)知識(shí)培訓(xùn)取得上崗資質(zhì)，確保了標(biāo)本從收集、保存到利用整個(gè)過(guò)程均按照SOP科學(xué)、規(guī)范、有序的進(jìn)行。

2．3 加強(qiáng)標(biāo)本的質(zhì)量控制

避免標(biāo)本的反復(fù)凍融，避免基因組DNA、RNA和蛋白質(zhì)的降解，對(duì)已入庫(kù)標(biāo)本隨機(jī)抽樣進(jìn)行提取鑒定。

2．4 加強(qiáng)標(biāo)本庫(kù)的安全管理

安全管理是樣本庫(kù)建設(shè)和使用中不容忽視的一個(gè)重要問(wèn)題，其中包括人員安全、設(shè)施和設(shè)備安全、生物安全和標(biāo)本數(shù)據(jù)安全等，樣本庫(kù)配備必要的防護(hù)措施以保證操作人員的人身安全，定期做好設(shè)備的保養(yǎng)和維護(hù)，及時(shí)備份保存標(biāo)本庫(kù)數(shù)據(jù)不丟失。

3 成效

廣州市出生缺陷干預(yù)工程標(biāo)本庫(kù)的建立具有巨大的現(xiàn)實(shí)意義。通過(guò)生物樣本庫(kù)的信息化建設(shè)，實(shí)現(xiàn)了對(duì)廣州市出生缺陷干預(yù)工程人群標(biāo)本的網(wǎng)絡(luò)化管理，形成一個(gè)動(dòng)態(tài)的廣州市出生缺陷干預(yù)工程人群標(biāo)本科研數(shù)據(jù)中心和科研管理溝通平臺(tái)，全面、實(shí)時(shí)、準(zhǔn)確的提供有關(guān)科研信息:①集成檢測(cè)對(duì)象所有相關(guān)的標(biāo)本、檢驗(yàn)數(shù)據(jù)、治療、隨訪等完整數(shù)據(jù)信息，有利于發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)之間的關(guān)聯(lián)，分析疾病發(fā)生和發(fā)展的內(nèi)在規(guī)律性。②使用統(tǒng)一的信息平臺(tái)，支持適合多用途研究的網(wǎng)絡(luò)化用戶環(huán)境，建立了比較全面的分級(jí)權(quán)限管理。③通過(guò)條形碼提高了樣本管理的規(guī)范性與效率，以確保標(biāo)本存放的準(zhǔn)確性，通過(guò)掃描條形碼在數(shù)據(jù)庫(kù)系統(tǒng)中對(duì)標(biāo)本編號(hào)進(jìn)行自動(dòng)的判讀和確認(rèn)。④通過(guò)結(jié)構(gòu)化的數(shù)據(jù)提高數(shù)據(jù)質(zhì)量:實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)采用統(tǒng)一的選擇代碼和數(shù)值保存，便于對(duì)標(biāo)準(zhǔn)化的數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)和分析，提高了數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性。⑤實(shí)現(xiàn)了廣州市出生缺陷管理信息系統(tǒng)、實(shí)驗(yàn)室管理信息系統(tǒng)、實(shí)驗(yàn)室監(jiān)測(cè)信息系統(tǒng)等兼容，通過(guò)標(biāo)本數(shù)據(jù)的自動(dòng)導(dǎo)入方便資料匯總統(tǒng)計(jì)。

我所中心實(shí)驗(yàn)室出生缺陷干預(yù)工程標(biāo)本庫(kù)建立以來(lái)，先后采集和保存血液標(biāo)本500余份，主要包括病殘鑒定300余份、免費(fèi)孕前檢測(cè)100余份。廣州市出生缺陷干預(yù)工程標(biāo)本庫(kù)加強(qiáng)了對(duì)標(biāo)本的統(tǒng)一規(guī)范化管理，建立了完整的標(biāo)本采集、保存、使用質(zhì)量保證體系和完善的標(biāo)本數(shù)據(jù)庫(kù)，做到了有效地實(shí)現(xiàn)標(biāo)本的儲(chǔ)存、管理、查詢、統(tǒng)計(jì)和圖文打印，并可隨時(shí)查詢標(biāo)本庫(kù)庫(kù)存記錄，為廣州市出生缺陷工作的順利開(kāi)展和本所的科研工作提供了有價(jià)值的病例資源，為加快科研成果的應(yīng)用和臨床轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)奠定基礎(chǔ)［4］。

建立規(guī)范的生物樣本庫(kù)還應(yīng)該做好以下幾方面的工作:首先倫理保護(hù)是不容忽視的問(wèn)題［5－6］，采集標(biāo)本前應(yīng)在患者知情同意的前提下規(guī)范進(jìn)行，這樣可以有效避免不必要的糾紛。其次保證標(biāo)本保存質(zhì)量是關(guān)鍵，應(yīng)盡量縮短標(biāo)本從離體到凍存的時(shí)間;分裝的體積和數(shù)量應(yīng)考慮到樣本后續(xù)的使用頻率，避免反復(fù)凍融，減少不必要的浪費(fèi)［7－8］。樣本庫(kù)在取得現(xiàn)有成績(jī)的基礎(chǔ)上正努力完善，未來(lái)計(jì)劃可以將全血標(biāo)本提取DNA保存，進(jìn)一步豐富完善標(biāo)本資源，如病理組織、體液等，更加合理有效地利用資源。

［1］ 張雪嬌，李海燕，龔樹(shù)生．國(guó)內(nèi)生物樣本庫(kù)建設(shè)現(xiàn)狀分析與對(duì)策探討［J］．中國(guó)醫(yī)院管理，2013，33(7):76－77．

［2］ 高 艷，顧國(guó)浩，邱 駿．血清樣本庫(kù)信息化管理系統(tǒng)的建設(shè)及應(yīng)用［J］．臨床檢驗(yàn)雜志，2014，32(12):881－884．

［3］ 朱建輝，陳佳美，林 潔，等．臨床實(shí)驗(yàn)室體液樣本庫(kù)建設(shè)［J］．臨床檢驗(yàn)雜志，2014，32(12)885－888．

［4］ 李國(guó)壘，陳先來(lái)．醫(yī)學(xué)信息學(xué)新分支—轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)信息學(xué)［J］．醫(yī)學(xué)信息學(xué)雜志，2013，34(1):15－18．

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Establishment and Management of Samples Bank for Birth Defects Intervention Project of Guangzhou

TANG Linguo，ZUO Liandong，TANG Ying，et al

ObjectiveTo develop Guangzhou information system for sample banks of birth defect intervention．MethodsThe samples of whole blood were collected and then classified and processed according to requirements of molecular biological research．Then，the samples were stored at－80℃．Results49 950 blood samples from intervened population with birth defect were collected and stored，including 880 samples from disabled children，1 000 free samples from prepregnancy test．The stored samples were managed with standards so that they were reasonably used in clinical research．ConclusionThe establishment and standardized managed of the samples bank of birth defect plays a role in the scientific research of birth defects in Guangzhou．

Samples Bank;Establishment and Management;Birth Defects

R197．323．1

B

10．3969/j．issn．1671－332X．2016．09．050

廣東省自然科學(xué)基金－自由申請(qǐng)(編號(hào):S2012010008318)

唐林國(guó) 左連東 唐 盈 唐 芳 葉 倩:廣州市婦女兒童醫(yī)療中心 廣東廣州 510623