中醫(yī)藥信息學(xué)工程技術(shù)領(lǐng)域研究進(jìn)展

崔蒙　李海燕　楊碩　高博　胡雪琴　朱玲

摘要：工程技術(shù)在中醫(yī)藥信息學(xué)發(fā)展過程中發(fā)揮著重要的作用，不僅是在解決現(xiàn)實(shí)問題方面，而且對學(xué)科理論的發(fā)展也有著重要的促進(jìn)作用。中醫(yī)藥信息學(xué)在工程技術(shù)領(lǐng)域中的研究主要體現(xiàn)在3個(gè)方面：中醫(yī)藥科學(xué)數(shù)據(jù)建設(shè)工程、中醫(yī)藥信息標(biāo)準(zhǔn)建設(shè)工程和中醫(yī)藥知識服務(wù)工程。中醫(yī)藥信息學(xué)工程技術(shù)領(lǐng)域的發(fā)展支撐著整個(gè)學(xué)科在應(yīng)用領(lǐng)域中的發(fā)展。

關(guān)鍵詞：中醫(yī)藥信息學(xué)：工程技術(shù)：中醫(yī)藥信息標(biāo)準(zhǔn)：中醫(yī)藥科學(xué)數(shù)據(jù)：中醫(yī)藥知識服務(wù)

中圖分類號：R-058；R2-05 文獻(xiàn)標(biāo)識碼：A 文章編號：2095-57070016）01-0009-06

白春禮院士在談到創(chuàng)新驅(qū)動發(fā)展時(shí)指出，“應(yīng)積極促進(jìn)技術(shù)、工程與經(jīng)濟(jì)社會緊密結(jié)合，發(fā)揮技術(shù)創(chuàng)新在支撐當(dāng)前經(jīng)濟(jì)轉(zhuǎn)型和持續(xù)發(fā)展中的核心作用……加強(qiáng)產(chǎn)學(xué)研合作，推動科研院所、大學(xué)與企業(yè)共建技術(shù)研發(fā)平臺、創(chuàng)新聯(lián)盟，打通創(chuàng)新鏈與產(chǎn)業(yè)鏈，集中力量突破關(guān)鍵核心技術(shù)……要采取多種切實(shí)有效的舉措，綜合施策，努力通過技術(shù)創(chuàng)新支撐當(dāng)前經(jīng)濟(jì)轉(zhuǎn)型增效，通過創(chuàng)新驅(qū)動打造經(jīng)濟(jì)升級版”。中醫(yī)藥信息技術(shù)、信息工程研究與中醫(yī)藥臨床實(shí)踐、新藥研發(fā)緊密結(jié)合，在支撐中醫(yī)藥創(chuàng)新驅(qū)動發(fā)展中具有重要的作用。中醫(yī)藥信息學(xué)在工程技術(shù)領(lǐng)域中的研究主要體現(xiàn)在3個(gè)方面：中醫(yī)藥科學(xué)數(shù)據(jù)建設(shè)工程、中醫(yī)藥信息標(biāo)準(zhǔn)建設(shè)工程和中醫(yī)藥知識服務(wù)工程。

1中醫(yī)藥科學(xué)數(shù)據(jù)建設(shè)工程

中醫(yī)藥科學(xué)數(shù)據(jù)建設(shè)是一項(xiàng)浩大的工程，對中醫(yī)藥學(xué)的發(fā)展具有深遠(yuǎn)影響，主要體現(xiàn)在當(dāng)科學(xué)數(shù)據(jù)成為一種資源，支撐著科學(xué)研究的第四范式——數(shù)據(jù)科學(xué)時(shí)，對中醫(yī)藥學(xué)科學(xué)研究的推動作用將與理論研究和實(shí)驗(yàn)研究發(fā)揮同樣重要的作用。

中醫(yī)藥科學(xué)數(shù)據(jù)建設(shè)工程起源于20世紀(jì)80年代初，以文摘數(shù)據(jù)庫建設(shè)為起點(diǎn)。由于吳蘭成研究員的遠(yuǎn)見，在數(shù)據(jù)庫建設(shè)之初就與美國國立醫(yī)學(xué)圖書館的MEDLINE數(shù)據(jù)庫采用了相同的建設(shè)模式，即運(yùn)用主題標(biāo)引的方法加強(qiáng)數(shù)據(jù)庫的查全率與查準(zhǔn)率。為了貫徹這一思想，首先必須建設(shè)與《醫(yī)學(xué)主題詞表》（MeSH）相配套的中醫(yī)藥學(xué)主題詞表，才能夠?qū)崿F(xiàn)主題檢索。中醫(yī)藥學(xué)主題詞表采用了與MeSH詞表相一致的結(jié)構(gòu)，把其未收錄的、而在中醫(yī)藥科學(xué)文獻(xiàn)中又頻繁出現(xiàn)的概念編制成中醫(yī)藥學(xué)主題詞表，用于中國中醫(yī)藥期刊文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫的標(biāo)引。經(jīng)過主題詞標(biāo)引的中國中醫(yī)藥期刊文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫具有更為精確的查準(zhǔn)率和更為全面的查全率，成為當(dāng)時(shí)國內(nèi)外主要應(yīng)用的中醫(yī)藥文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫。在數(shù)據(jù)庫建設(shè)初期，收錄了國外多語種期刊發(fā)表的與中醫(yī)藥相關(guān)的文獻(xiàn)；后來由于經(jīng)費(fèi)和人員等原因，不再收錄中文以外的文獻(xiàn)，文摘量也逐漸減少。進(jìn)入21世紀(jì)后，受清華同方、萬方數(shù)據(jù)等全文數(shù)據(jù)庫的影響，中國中醫(yī)藥期刊文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫的建設(shè)受到了很大的沖擊，用戶量逐漸減少。但隨著信息爆炸，無效文獻(xiàn)越來越多，單憑關(guān)鍵詞檢索越來越無法滿足用戶的需求，主題詞檢索又引起了用戶的注意。因此，到目前為止，文摘型的中國中醫(yī)藥期刊文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫憑借著其特有的主題詞標(biāo)引，依然吸引著一批用戶。

進(jìn)入20世紀(jì)90年代后，隨著對數(shù)據(jù)需求的不斷增加，國家在科學(xué)研究基礎(chǔ)條件建設(shè)方面逐漸加大投入，對中醫(yī)藥科學(xué)數(shù)據(jù)建設(shè)經(jīng)費(fèi)的投入也不斷加大，此時(shí)產(chǎn)生了一大批單表型數(shù)據(jù)庫，如中國中藥數(shù)據(jù)庫、中國方劑數(shù)據(jù)庫、疾病診療數(shù)據(jù)庫等。這批數(shù)據(jù)庫的建設(shè)主要是為了滿足臨床和科研人員對某一方面數(shù)據(jù)的需求。在此基礎(chǔ)上，中醫(yī)藥數(shù)據(jù)庫群逐漸形成，中醫(yī)藥科學(xué)數(shù)據(jù)平臺初見雛形。

20世紀(jì)90年代末期至21世紀(jì)初期，是中醫(yī)藥科學(xué)數(shù)據(jù)建設(shè)工程最為活躍的時(shí)期。由于多學(xué)科的介入，中醫(yī)藥科學(xué)數(shù)據(jù)建設(shè)與清華大學(xué)、浙江大學(xué)、中國科學(xué)院計(jì)算技術(shù)研究所、中國科學(xué)院軟件研究所等一批具有強(qiáng)大計(jì)算機(jī)研究實(shí)力的單位形成合作關(guān)系，開展中醫(yī)藥科學(xué)數(shù)據(jù)建設(shè)研究。與此同時(shí)，由于國家經(jīng)費(fèi)支持力度不斷加大，對中醫(yī)藥科學(xué)數(shù)據(jù)建設(shè)的要求不斷提升，加之中醫(yī)藥科學(xué)數(shù)據(jù)建設(shè)單位的規(guī)模均偏小，因此，中醫(yī)藥科學(xué)數(shù)據(jù)建設(shè)虛擬研究院應(yīng)運(yùn)而生。

在此期間，中醫(yī)藥科學(xué)數(shù)據(jù)建設(shè)轉(zhuǎn)向了結(jié)構(gòu)型數(shù)據(jù)庫，試圖通過數(shù)據(jù)拆分、數(shù)據(jù)清洗、數(shù)據(jù)關(guān)聯(lián)實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)間關(guān)聯(lián)關(guān)系的發(fā)現(xiàn)。通過不斷的磨合，最終中國中醫(yī)科學(xué)院中醫(yī)藥信息研究所與浙江大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)學(xué)院建立了長久、穩(wěn)定的合作關(guān)系，共同開發(fā)與建設(shè)中醫(yī)藥科學(xué)數(shù)據(jù)平臺，這項(xiàng)合作至今已經(jīng)持續(xù)了17年。在此平臺上，我們建立了中藥基礎(chǔ)數(shù)據(jù)庫，實(shí)現(xiàn)了中藥數(shù)據(jù)間的關(guān)聯(lián)檢索與統(tǒng)計(jì)功能，能在數(shù)秒內(nèi)完成所有中藥的歸經(jīng)、性、味統(tǒng)計(jì)，化學(xué)成分與中藥關(guān)聯(lián)檢索，中藥與功效關(guān)聯(lián)檢索等；中藥藥理數(shù)據(jù)倉庫基于8個(gè)軸，實(shí)現(xiàn)了中藥材、化學(xué)成分的藥理作用頻次、藥理實(shí)驗(yàn)頻次排序及相關(guān)文獻(xiàn)關(guān)聯(lián)；中國中藥化學(xué)成分?jǐn)?shù)據(jù)庫實(shí)現(xiàn)了化學(xué)成分與實(shí)驗(yàn)條件的關(guān)聯(lián)；還有一大批疾病數(shù)據(jù)庫，實(shí)現(xiàn)了各種疾病證候、癥狀、方劑、中藥、西藥的統(tǒng)計(jì)，以及診斷標(biāo)準(zhǔn)的關(guān)聯(lián)等。在中醫(yī)藥科學(xué)數(shù)據(jù)平臺上建設(shè)了42個(gè)結(jié)構(gòu)型數(shù)據(jù)庫，并實(shí)現(xiàn)免費(fèi)共享。

中醫(yī)藥信息研究單位規(guī)模都相對較小，人員結(jié)構(gòu)不盡合理，僅依靠1～2個(gè)中醫(yī)藥信息研究單位難以承擔(dān)如此浩大的工程。為此，建立了中醫(yī)藥科學(xué)數(shù)據(jù)工程虛擬研究院（以下簡稱虛擬研究院）。虛擬研究院相對穩(wěn)定，但也在不斷的變化之中，成員最多時(shí)有37個(gè)中醫(yī)藥大學(xué)、學(xué)院、研究院所及西醫(yī)相關(guān)單位和計(jì)算機(jī)研究相關(guān)單位參與建設(shè)。虛擬研究院之所以能夠相對穩(wěn)定，并一直持續(xù)到現(xiàn)在，主要是其組成結(jié)構(gòu)、運(yùn)作模型及操作平臺相對合理。虛擬研究院的組成結(jié)構(gòu)是縱橫支撐，橫向?yàn)楦鹘M成單位是穩(wěn)定的事業(yè)單位組織，保證了組織機(jī)構(gòu)的穩(wěn)定性，縱向是各數(shù)據(jù)庫形成的課題組，保證了參加人員的穩(wěn)定性。其運(yùn)行機(jī)制主要是依托課題項(xiàng)目，按課題項(xiàng)目的運(yùn)行機(jī)制，同時(shí)實(shí)行協(xié)調(diào)管理，即人力集成虛擬化、組織結(jié)構(gòu)柔性化、知識產(chǎn)權(quán)模糊化、并行作業(yè)分布化。虛擬研究院的操作平臺是面向Intemet的中醫(yī)藥異地、遠(yuǎn)程、同步數(shù)據(jù)共建平臺，在這個(gè)平臺上部署了3級審校程序、3級權(quán)限管理程序，實(shí)現(xiàn)了全國范圍內(nèi)的中醫(yī)藥科學(xué)數(shù)據(jù)共建。

目前，中醫(yī)藥科學(xué)數(shù)據(jù)建設(shè)工程正在向提高數(shù)據(jù)質(zhì)量、服務(wù)臨床與科學(xué)研究需求方向努力。同時(shí)，隨著大數(shù)據(jù)理念及數(shù)據(jù)科學(xué)理念的逐步發(fā)展，數(shù)據(jù)應(yīng)用理念也在逐漸發(fā)生變化，正在探索通過Hadoop平臺上的MapReduce，在計(jì)算機(jī)上從全文本數(shù)據(jù)中自動抽取所需要數(shù)據(jù)，實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)的半自動結(jié)構(gòu)化和半自動關(guān)聯(lián)，并逐漸回歸中醫(yī)藥數(shù)據(jù)的本體，不再追求從所有數(shù)據(jù)中發(fā)現(xiàn)中醫(yī)藥的一般規(guī)律，而是基于1個(gè)醫(yī)生、1個(gè)科室、1個(gè)醫(yī)院、1個(gè)流派的全數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn)具有個(gè)體化特征的經(jīng)驗(yàn)性規(guī)律。隨著國家科技立法的進(jìn)程不斷推進(jìn)，中醫(yī)藥科研數(shù)據(jù)匯交最終能夠?qū)崿F(xiàn)，為中醫(yī)藥科學(xué)數(shù)據(jù)建設(shè)工程奠定更為堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。而中醫(yī)藥科學(xué)數(shù)據(jù)建設(shè)工程的持續(xù)推進(jìn)，最終也將為中醫(yī)藥學(xué)的發(fā)展做出應(yīng)有貢獻(xiàn)。

2中醫(yī)藥信息標(biāo)準(zhǔn)建設(shè)工程

中醫(yī)藥信息標(biāo)準(zhǔn)建設(shè)工程也是一個(gè)長時(shí)間持續(xù)推進(jìn)的工程。中醫(yī)藥信息標(biāo)準(zhǔn)的研制最早起源于20世紀(jì)80年代初期開始建設(shè)的中醫(yī)藥學(xué)主題詞表，該詞表規(guī)范了中醫(yī)藥文獻(xiàn)檢索的主題詞，開創(chuàng)了中醫(yī)藥信息標(biāo)準(zhǔn)研制的先河。20世紀(jì)90年代開始，陸續(xù)開展了中醫(yī)藥名詞術(shù)語標(biāo)準(zhǔn)的研究，并發(fā)布了一批國家標(biāo)準(zhǔn)和全國科學(xué)技術(shù)名詞審定委員會標(biāo)準(zhǔn)。除了這些標(biāo)準(zhǔn)外，為了協(xié)調(diào)全國的數(shù)據(jù)庫建設(shè)工作，研制了一批必須的標(biāo)準(zhǔn)表，放置在共建平臺上供建庫使用。這批標(biāo)準(zhǔn)表雖然不是公開的標(biāo)準(zhǔn)，但在中醫(yī)藥科學(xué)數(shù)據(jù)庫建設(shè)中發(fā)揮了極其重要的作用?？萍疾俊笆晃濉敝斡?jì)劃“中醫(yī)疾病分類代碼等基礎(chǔ)標(biāo)準(zhǔn)示范研究”中設(shè)立了16個(gè)中醫(yī)藥信息標(biāo)準(zhǔn)課題，這些課題的設(shè)立和完成極大地推進(jìn)了中醫(yī)藥信息標(biāo)準(zhǔn)的研制工作，并為此后的中醫(yī)藥信息國際標(biāo)準(zhǔn)的研制奠定了良好的基礎(chǔ)。

2.1國際標(biāo)準(zhǔn)化組織

進(jìn)入21世紀(jì)后，中醫(yī)藥信息國際標(biāo)準(zhǔn)的研制獲得了長足的發(fā)展。最先開展的國際標(biāo)準(zhǔn)化組織（ISO）中醫(yī)藥信息標(biāo)準(zhǔn)研制是從健康信息技術(shù)委員會（TC215）開始的。在此之前，中醫(yī)藥信息標(biāo)準(zhǔn)從未進(jìn)入過國際標(biāo)準(zhǔn)化組織的視野，而我國中醫(yī)藥信息學(xué)領(lǐng)域的研究人員也從未參與到國際標(biāo)準(zhǔn)化組織的標(biāo)準(zhǔn)研制工作中。中國中醫(yī)科學(xué)院中醫(yī)藥信息研究所具有開展中醫(yī)藥主題詞表、中醫(yī)藥學(xué)語言系統(tǒng)、中醫(yī)臨床術(shù)語系統(tǒng)的研制工作基礎(chǔ)，所以崔蒙、李海燕等主要在ISO/TC215的語義工作組（WG3）進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)研究工作。當(dāng)時(shí)ISO/TC215的與會專家認(rèn)為醫(yī)學(xué)信息學(xué)的語義標(biāo)準(zhǔn)已經(jīng)完全能夠涵蓋中醫(yī)藥信息學(xué)的需求，認(rèn)為中醫(yī)藥沒有獨(dú)立的信息模型。為此，崔蒙、李海燕及其研究團(tuán)隊(duì)做了大量的研究工作，說明中醫(yī)藥信息學(xué)不僅在內(nèi)容上與醫(yī)學(xué)信息學(xué)有所區(qū)別，而且在信息模型上也有所區(qū)別，最終得到了國際醫(yī)學(xué)信息學(xué)專家的認(rèn)可。標(biāo)準(zhǔn)的最基本要求是專家共識，國際標(biāo)準(zhǔn)的最基本要求是專家共識基礎(chǔ)上的國家實(shí)體的認(rèn)同，因而，獲得國際醫(yī)學(xué)信息學(xué)專家的認(rèn)同，為此后中醫(yī)藥信息國際標(biāo)準(zhǔn)研制工作的順利開展奠定了良好的基礎(chǔ)。與此同時(shí)，在于C215中說服國際醫(yī)學(xué)信息學(xué)的專家認(rèn)同不存在東亞、東洋、東方等以地區(qū)命名的傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)的概念，認(rèn)同中醫(yī)藥學(xué)已經(jīng)是一個(gè)國際通用性的醫(yī)學(xué)，研制中醫(yī)藥信息標(biāo)準(zhǔn)是具有國際意義的。

2009年，ISO成立了中醫(yī)藥技術(shù)委員會（TC249），其中第五工作組為名詞術(shù)語和信息工作組。由于該工作組的工作范圍與7C215有所交叉，經(jīng)ISO/TC215與ISO/7C249協(xié)調(diào)建立了聯(lián)合工作組（JWG），即TC249的JWG1（信息學(xué)聯(lián)合工作組）和TC215的JWGQ（中醫(yī)藥信息學(xué)聯(lián)合工作組），負(fù)責(zé)協(xié)調(diào)需要由2個(gè)技術(shù)委員會共同完成的中醫(yī)藥信息標(biāo)準(zhǔn)的研制工作。TC249的建立進(jìn)一步推動了中醫(yī)藥國際信息標(biāo)準(zhǔn)研制工作的開展。

到目前為止，ISO已經(jīng)發(fā)布了3項(xiàng)中醫(yī)藥信息標(biāo)準(zhǔn)，均由我國主導(dǎo)研制。（1）“ISO TS 17938：2014中醫(yī)藥學(xué)語言系統(tǒng)語義網(wǎng)絡(luò)框架”于2014年發(fā)布，由崔蒙研究員作為負(fù)責(zé)人，該項(xiàng)標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定了中醫(yī)藥學(xué)語言系統(tǒng)的語義類型、語義概念及語義關(guān)系，并對其進(jìn)行了詳細(xì)定義。該標(biāo)準(zhǔn)的提出不僅規(guī)范和支持了中醫(yī)藥學(xué)語言系統(tǒng)的建設(shè)，還為中醫(yī)藥學(xué)術(shù)語系統(tǒng)和本體創(chuàng)建提供了語義標(biāo)準(zhǔn)，為中醫(yī)藥學(xué)語言系統(tǒng)和統(tǒng)一的醫(yī)學(xué)語言系統(tǒng)映射提供了支持，對中醫(yī)藥學(xué)術(shù)語信息的交換具有重要意義。（2）“ISO TS17948：2014中醫(yī)藥文獻(xiàn)元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)”于2014年發(fā)布，由崔蒙研究員作為負(fù)責(zé)人，該項(xiàng)標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定了中醫(yī)藥文獻(xiàn)元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化的基本原則和方法，覆蓋中醫(yī)藥學(xué)領(lǐng)域具有共性的全部元數(shù)據(jù)內(nèi)容，為中醫(yī)藥學(xué)文獻(xiàn)資源提供了一套通用的描述元素。它能規(guī)范、科學(xué)、合理地描述中醫(yī)藥學(xué)文獻(xiàn)，提供有關(guān)中醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)的標(biāo)識、內(nèi)容、分發(fā)、質(zhì)量、限制和維護(hù)信息，以支持中醫(yī)藥文獻(xiàn)的收集、存儲、檢索和使用，促進(jìn)中醫(yī)藥文獻(xiàn)資源的交流與共享，對中醫(yī)藥文獻(xiàn)資源的系統(tǒng)保護(hù)和深度利用具有重要意義。2014年發(fā)布的這2項(xiàng)標(biāo)準(zhǔn)是迄今為止ISO首次發(fā)布的中醫(yī)藥信息標(biāo)準(zhǔn)，對中醫(yī)藥術(shù)語信息系統(tǒng)和文獻(xiàn)信息系統(tǒng)的建設(shè)起到重要的支撐作用。（3）“ISO/TS18790-1：2015中醫(yī)藥信息標(biāo)準(zhǔn)體系框架與分類”標(biāo)準(zhǔn)于2015年發(fā)布，由李海燕研究員作為負(fù)責(zé)人，該項(xiàng)標(biāo)準(zhǔn)是ISO/TC215與ISO/7C249的首個(gè)聯(lián)合工作項(xiàng)目，實(shí)現(xiàn)了中醫(yī)藥信息標(biāo)準(zhǔn)體系的頂層設(shè)計(jì)，有助于中醫(yī)藥行業(yè)內(nèi)部共識及其與大健康信息標(biāo)準(zhǔn)之間的銜接，對于中醫(yī)藥信息標(biāo)準(zhǔn)體系建設(shè)、信息標(biāo)準(zhǔn)制修訂、規(guī)劃計(jì)劃制定等具有深遠(yuǎn)意義。世界衛(wèi)生組織（WHO）開展的疾病分類代碼11版（ICD11）的研制工作，首次將傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)納入其中，專門開辟了ICTM一章。ICD11采用了與以往各版都不同的形式，將本體的概念引入了ICD11的修訂中，以醫(yī)學(xué)臨床術(shù)語系統(tǒng)（SNOMED CT）為其術(shù)語池，解決精確診斷的問題。因此ICTM也必須采用傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)術(shù)語系統(tǒng)作為其本體支撐。目前，中醫(yī)藥臨床術(shù)語系統(tǒng)是最佳選擇，但由于未能與日、韓達(dá)成統(tǒng)一意見，術(shù)語池的構(gòu)建工作處于被擱置狀態(tài)。無論如何，ICTM出現(xiàn)在ICD11中，是中醫(yī)藥信息標(biāo)準(zhǔn)國際化的一大進(jìn)展。

2.2衛(wèi)生信息交換標(biāo)準(zhǔn)

衛(wèi)生信息交換標(biāo)準(zhǔn)（Health Level 7，HL7）是主要應(yīng)用領(lǐng)域?yàn)獒t(yī)院信息系統(tǒng)（HIS）/影像信息系統(tǒng)（RIS）的標(biāo)準(zhǔn)體系，規(guī)范HIS/RIS系統(tǒng)及其設(shè)備之間的通信，它涉及到病房和患者信息管理、化驗(yàn)系統(tǒng)、藥房系統(tǒng)、放射系統(tǒng)、收費(fèi)系統(tǒng)等各個(gè)方面。HL7的宗旨是開發(fā)和研制醫(yī)院數(shù)據(jù)信息傳輸協(xié)議和標(biāo)準(zhǔn)，規(guī)范臨床醫(yī)學(xué)和管理信息格式，降低醫(yī)院信息系統(tǒng)互連的成本，提高醫(yī)院信息系統(tǒng)之間數(shù)據(jù)信息共享的程度。近年來，中醫(yī)藥衛(wèi)生信息交換標(biāo)準(zhǔn)的加入也獲得了“HL7中國”委員會的認(rèn)可。由于中醫(yī)臨床處方用藥的特殊性，處方部分被西醫(yī)認(rèn)為是制藥的范疇，未能納入該體系。但HL7希望其標(biāo)準(zhǔn)模型能夠涵蓋所有醫(yī)學(xué)的電子病歷數(shù)據(jù)交換。因此，在“HL7中國”委員會的建議下，同意并積極支持把中醫(yī)臨床信息模型納入其范圍。

2.3臨床數(shù)據(jù)交換標(biāo)準(zhǔn)協(xié)會

臨床數(shù)據(jù)交換標(biāo)準(zhǔn)協(xié)會（CDISC）是一個(gè)開放的、包括各種學(xué)科的非盈利性機(jī)構(gòu)。協(xié)會致力于開發(fā)行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)，為醫(yī)學(xué)和生物制藥產(chǎn)品的開發(fā)提供臨床實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)和元數(shù)據(jù)的取得、交換、提交以及存檔的電子手段。如果完全按照西醫(yī)、西藥的思維模式指導(dǎo)中醫(yī)藥臨床實(shí)驗(yàn)標(biāo)準(zhǔn)的研制工作，不重視中醫(yī)藥學(xué)整體性的特點(diǎn)，而是將其碎片化，這對中醫(yī)臨床實(shí)驗(yàn)標(biāo)準(zhǔn)的研制工作會造成一定的困擾。近年來，CDISC注意到中醫(yī)藥臨床實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)交換的特殊性，正在積極開展相關(guān)研究，中醫(yī)藥CDISC標(biāo)準(zhǔn)的研制工作還在不斷地推進(jìn)中。

2.4醫(yī)學(xué)臨床術(shù)語的系統(tǒng)化命名

醫(yī)學(xué)臨床術(shù)語的系統(tǒng)化命名（SNOMED-CT）是目前國際上應(yīng)用較為廣泛的醫(yī)學(xué)臨床術(shù)語系統(tǒng)，其與美國國立醫(yī)學(xué)圖書館和世界衛(wèi)生組織均達(dá)成了一定程度的協(xié)議，因此在統(tǒng)一的醫(yī)學(xué)語言系統(tǒng)（UMLS）和ICD11中均使用了其術(shù)語。SNOMED-CT是以國家合作的方式允許其術(shù)語系統(tǒng)的應(yīng)用，到目前為止，其尚未與中國政府達(dá)成協(xié)議，因此該術(shù)語系統(tǒng)還無法在中國應(yīng)用。這對中醫(yī)藥臨床術(shù)語系統(tǒng)的使用造成了很大的困擾。中國的中醫(yī)醫(yī)院絕大部分都是中西醫(yī)結(jié)合，其病歷記錄中使用了大量的西醫(yī)術(shù)語，如果沒有西醫(yī)術(shù)語系統(tǒng)的支撐，基于規(guī)范術(shù)語的電子病歷交換是無法實(shí)現(xiàn)的。目前，我們正在努力改變這一局面。一是適應(yīng)中醫(yī)藥術(shù)語系統(tǒng)概念間關(guān)聯(lián)關(guān)系多為非線性的，因而不再采用SNOMED-CT的連接詞，而是使用語義關(guān)聯(lián)，完成概念間的復(fù)雜關(guān)聯(lián)；二是在中醫(yī)臨床術(shù)語系統(tǒng)的框架下，加入中醫(yī)醫(yī)院使用的西醫(yī)術(shù)語，以適應(yīng)中醫(yī)醫(yī)院電子病歷交換的需求，同時(shí)避免知識產(chǎn)權(quán)糾紛。由此可以看出，中醫(yī)藥信息標(biāo)準(zhǔn)的研制是一個(gè)浩大的工程，涉及中醫(yī)藥信息的方方面面，是開展中醫(yī)藥信息研究的基礎(chǔ)性工作，必須有一支專業(yè)的隊(duì)伍，有一批持之以恒不斷努力工作、不斷拓展創(chuàng)新的工作人員，才能夠?qū)⒋耸聵I(yè)發(fā)展下去。

3中醫(yī)藥知識服務(wù)工程

知識服務(wù)和知識工程都是很大的概念，真正要完成這樣的工程需要很長的時(shí)間和很多的人力。目前所開展的中醫(yī)藥知識服務(wù)工程的建設(shè)工作是從較窄的點(diǎn)面做起的，也是從較基礎(chǔ)的工作做起的。在此方面主要做了2項(xiàng)研究工作，一是構(gòu)建中醫(yī)藥學(xué)語義網(wǎng)絡(luò)，從根本上來說，是希望構(gòu)建起中醫(yī)藥知識體系，至少構(gòu)建起中醫(yī)藥概念體系，中醫(yī)藥學(xué)語言系統(tǒng)就是為了實(shí)現(xiàn)這一目標(biāo)而構(gòu)建起來的。二是開展中醫(yī)藥數(shù)據(jù)挖掘研究，從根本上來說，是為了實(shí)現(xiàn)知識發(fā)現(xiàn)，支撐中醫(yī)藥學(xué)領(lǐng)域的計(jì)算機(jī)臨床決策和計(jì)算機(jī)新藥輔助開發(fā)。

3.1構(gòu)建中醫(yī)藥學(xué)語義網(wǎng)絡(luò)

語義網(wǎng)絡(luò)是自然語言理解及認(rèn)知科學(xué)領(lǐng)域研究中的一個(gè)概念，20世紀(jì)70年代初美國科學(xué)家西蒙（Simon）發(fā)展與完善了語義網(wǎng)絡(luò)的概念和方法，把它作為知識表示（knowledge representation）的一種通用手段，語義網(wǎng)絡(luò)是一種采用網(wǎng)絡(luò)形式表示人類知識的方法。一個(gè)語義網(wǎng)絡(luò)是一個(gè)帶標(biāo)示的有向圖。其中，帶有標(biāo)識的結(jié)點(diǎn)表示問題領(lǐng)域中的物體、概念、時(shí)間、動作或者態(tài)勢。在語義網(wǎng)絡(luò)知識表示中，結(jié)點(diǎn)一般劃分為實(shí)例節(jié)點(diǎn)和類節(jié)點(diǎn)2種類型。結(jié)點(diǎn)之間帶有標(biāo)識的有向弧標(biāo)識結(jié)點(diǎn)之間的語義聯(lián)系，從而形成一個(gè)由節(jié)點(diǎn)和弧組成的語義網(wǎng)絡(luò)描述圖，是語義網(wǎng)絡(luò)組織知識的關(guān)鍵。同樣，用語義網(wǎng)絡(luò)方法也可以表達(dá)中醫(yī)藥學(xué)的知識，而這種知識表達(dá)的方法有可能構(gòu)建起中醫(yī)藥的知識體系。圍繞構(gòu)建中醫(yī)藥學(xué)語義網(wǎng)絡(luò)這一主題，中國中醫(yī)科學(xué)院中醫(yī)藥信息研究所和浙江大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)學(xué)院多名博士、碩士研究生和博士后工作人員開展了專題研究，如中國中醫(yī)科學(xué)院中醫(yī)藥信息研究所賈李蓉的碩士論文“中醫(yī)藥學(xué)語言系統(tǒng)語義關(guān)系初探”、楊陽的碩士論文“中醫(yī)臨床術(shù)語集語義關(guān)系的示范研究”、姚媛媛的碩士論文“針灸概念語義網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建研究”、謝琪的博士論文“基于本體方法構(gòu)建中醫(yī)藥概念信息模型的方法學(xué)示范研究”、王靜的博士論文“基于本體的中醫(yī)文獻(xiàn)診療信息的智能檢索示范研究”、楊陽的博士論文“中藥提取工藝文獻(xiàn)知識組織方法研究”、高博的博士后出站論文“用邏輯方法構(gòu)建五行子系統(tǒng)概念模型的探索性研究”、胡雪琴的博士后出站論文“中醫(yī)藥語言系統(tǒng)中的語義網(wǎng)絡(luò)研究”、李彥文的博士后出站論文“中醫(yī)藥信息研究所知識地圖的構(gòu)建研究”、楊繼紅的博士后出站論文“中醫(yī)藥隱性知識轉(zhuǎn)化的探索研究”、于琦的博士后出站論文“基于文獻(xiàn)與概念模型的中醫(yī)溫病理論繼承與發(fā)展研究”、于彤的博士后出站論文“面向中醫(yī)藥知識密集型數(shù)據(jù)的知識發(fā)現(xiàn)研究”、朱玲的博士后出站論文“中醫(yī)古籍語言系統(tǒng)構(gòu)建的探索性研究”、楊云松的進(jìn)修報(bào)告“基于本體的《蘭室秘藏》語義網(wǎng)構(gòu)建研究”等；浙江大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)學(xué)院張小剛的碩士論文“基于中醫(yī)藥本體的語義關(guān)系發(fā)現(xiàn)及驗(yàn)證方法”、方青的碩士論文“基于本體論的中醫(yī)藥一體化語言系統(tǒng)”、陶金火的碩士論文“基于語義的中醫(yī)藥數(shù)據(jù)采集工程及應(yīng)用平臺”、盛浩的碩士論文“基于超鏈數(shù)據(jù)的中醫(yī)藥語義查詢系統(tǒng)”、楊克特的碩士論文“面向中醫(yī)藥的多元語義搜索引擎”、湯萌芽的碩士論文“中醫(yī)藥本體工程及相關(guān)應(yīng)用”、吳振宇的碩士論文“基于語義標(biāo)注的中醫(yī)藥數(shù)據(jù)加工平臺”、范寬的碩士論文“基于語義本體的中醫(yī)藥科學(xué)數(shù)據(jù)共建工程”、宓金華的碩士論文“中醫(yī)藥知識工程應(yīng)用”、吳毅挺的碩士論文“DadSpora數(shù)據(jù)挖掘平臺的構(gòu)建”、封毅的博士論文“中醫(yī)藥知識發(fā)現(xiàn)可靠性研究”、于彤的博士論文“知識服務(wù)：語義Web在中醫(yī)藥領(lǐng)域的應(yīng)用研究”等。這些研究使中醫(yī)藥學(xué)語義網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建工作獲得了極大的進(jìn)展，有力地推動了中醫(yī)藥知識服務(wù)工程研究的開展。此外，崔蒙研究員為學(xué)術(shù)帶頭人的科研團(tuán)隊(duì)還通過虛擬研究院組織全國力量共同開展中醫(yī)藥學(xué)本體工程的建設(shè)工作，舉全國之力、共同建設(shè)，使中醫(yī)藥知識服務(wù)工程的工作獲得了高速推進(jìn)。

中醫(yī)藥學(xué)語義網(wǎng)絡(luò)是通過構(gòu)建基于本體的中醫(yī)藥學(xué)語言系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)的。所謂本體，從哲學(xué)到計(jì)算機(jī)科學(xué)有著不同的理解，而基于中醫(yī)藥學(xué)知識體系形成的概念與概念間的關(guān)聯(lián)關(guān)系，我們稱之為“輕本體”，這種本體并不強(qiáng)求基于公理的推理，因?yàn)樵谥嗅t(yī)藥學(xué)的知識體系構(gòu)建中，這一點(diǎn)是很難做到的。那么這種基于概念及概念的關(guān)系建立起來的語言系統(tǒng)有什么用呢？首先，這是一個(gè)概念體系，一個(gè)不是基于學(xué)科分類、而是基于語義分類的概念體系。這個(gè)概念體系幾乎包含了中醫(yī)藥學(xué)的所有概念，這些概念按照其所屬的語義類型被劃分；然后通過語義關(guān)系，亦即除了等級關(guān)系的上下位關(guān)系外，還包括功能上相關(guān)、時(shí)間上相關(guān)、空間上相關(guān)、物理上相關(guān)、概念上相關(guān)等非等級關(guān)系，建立起這些概念間的所有關(guān)聯(lián)關(guān)系，這樣就構(gòu)建了一個(gè)中醫(yī)藥學(xué)知識的網(wǎng)絡(luò)體系。在這個(gè)網(wǎng)絡(luò)體系中，所有的概念都被相關(guān)，并相互聯(lián)系。通過這個(gè)體系，擴(kuò)展了人類關(guān)于中醫(yī)藥學(xué)知識關(guān)聯(lián)的需求，使所有的知識點(diǎn)相互關(guān)聯(lián)，并無限循環(huán)。這樣就擴(kuò)展了人類的關(guān)聯(lián)思維，使人們清晰地知道中醫(yī)藥知識是關(guān)聯(lián)的，以及如何關(guān)聯(lián)的。因?yàn)樵谥嗅t(yī)藥學(xué)知識體系中，大量的相關(guān)關(guān)系都是非線性的相關(guān)關(guān)系，而我們構(gòu)建的這個(gè)基于本體的語言系統(tǒng)的中醫(yī)藥學(xué)的知識體系所展示的是概念間線性關(guān)系，也許這樣一個(gè)知識體系不足以涵蓋所有的中醫(yī)藥知識。但它已經(jīng)能夠滿足對于中醫(yī)藥學(xué)知識體系中概念間線性關(guān)系推演的需要。另外，在研究概念間的相關(guān)關(guān)系時(shí)，由于其非線性的特征，發(fā)現(xiàn)中醫(yī)藥學(xué)概念的關(guān)系往往不是二元的，而是三元的，甚至是多元的。也就是說僅用1個(gè)關(guān)系，不足以表達(dá)2個(gè)概念間的相關(guān)關(guān)系，需要用2個(gè)或者更多的關(guān)系，才能表達(dá)出中醫(yī)藥學(xué)2個(gè)概念間的相關(guān)關(guān)系。但限于中醫(yī)藥學(xué)語言系統(tǒng)構(gòu)建的模型，即使中醫(yī)藥學(xué)2個(gè)概念間存在著多元語義關(guān)系，也只能將其拆分成多個(gè)二元關(guān)系分別進(jìn)行表達(dá)，這在很大程度上限制了利用基于本體的中醫(yī)藥學(xué)語言系統(tǒng)構(gòu)建完整的中醫(yī)藥學(xué)知識體系。我們正在研究是否可以解決這個(gè)問題，以期能夠進(jìn)一步推進(jìn)中醫(yī)藥學(xué)知識體系的構(gòu)建。

3.2開展中醫(yī)藥數(shù)據(jù)挖掘研究

如同圍繞構(gòu)建中醫(yī)藥學(xué)語義網(wǎng)絡(luò)這一主題，中國中醫(yī)科學(xué)院中醫(yī)藥信息研究所和浙江大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)學(xué)院部署了多名博士、碩士研究生和博士后工作人員開展專題研究一樣，圍繞中醫(yī)藥數(shù)據(jù)挖掘研究，2個(gè)單位也同樣部署了多名博士、碩士研究生和博士后工作人員開展該領(lǐng)域的研究工作。如中國中醫(yī)科學(xué)院中醫(yī)藥信息研究所李園白的碩士論文“中醫(yī)婦產(chǎn)科疾病辨證用藥規(guī)律研究”、王靜的碩士論文“中醫(yī)疫病現(xiàn)代文獻(xiàn)評析示范研究”、王靜的博士論文“基于本體的中醫(yī)文獻(xiàn)診療信息的智能檢索示范研究”、雷蕾的博士后出站論文“基于文獻(xiàn)的中藥化學(xué)數(shù)據(jù)利用研究”、于琦的博士后出站論文“基于文獻(xiàn)與概念模型的中醫(yī)溫病理論繼承與發(fā)展研究”等；浙江大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)學(xué)院蔡越君的碩士論文“數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)及其在中藥配伍系統(tǒng)中的應(yīng)用研究”、何前鋒的碩士論文“中藥方劑數(shù)據(jù)系統(tǒng)挖掘研究”、于彤的碩士論文“中醫(yī)臨床數(shù)據(jù)倉庫的設(shè)計(jì)與構(gòu)建”、周忠眉的博士論文“中醫(yī)方劑數(shù)據(jù)挖掘模式和算法研究”、周雪忠的博士論文“文本挖掘在中醫(yī)藥中若干應(yīng)用研究”等。這些學(xué)生的研究工作不僅從方法上，而且從內(nèi)容上，在很大程度上深化了中醫(yī)藥數(shù)據(jù)挖掘的研究工作。盡管這些工作獲得的認(rèn)可度不是很高，但依舊是中醫(yī)藥學(xué)領(lǐng)域中數(shù)據(jù)挖掘的推進(jìn)動力，為促進(jìn)行業(yè)廣泛開展數(shù)據(jù)利用的研究奠定了良好的基礎(chǔ)。

如前所述，目前我們研究團(tuán)隊(duì)開展的數(shù)據(jù)挖掘工作主要是2個(gè)方向：中醫(yī)臨床決策支持與中藥新藥輔助開發(fā)。在中醫(yī)臨床決策支持方面，主要開展了方證對應(yīng)、藥癥對應(yīng)、方藥對應(yīng)、病證對應(yīng)等方面的研究；既有基于整體數(shù)據(jù)的分析挖掘研究，也有基于某個(gè)老中醫(yī)經(jīng)驗(yàn)的分析挖掘研究；既有基于全體方劑的挖掘研究，也有基于某個(gè)病癥的挖掘研究；從研究結(jié)果看，既有常識性知識，也有非常識性知識；針對非常識性知識，既有臨床醫(yī)生認(rèn)可的知識，也有他們極不認(rèn)同的知識。總體來看，通過數(shù)據(jù)挖掘，確實(shí)可以發(fā)現(xiàn)知識，包括已知的和未知的、認(rèn)可的和不認(rèn)可的；但在系統(tǒng)性、整體上對于臨床決策的支持力度還是不夠大，未能引起足夠重視，也未能對提高中醫(yī)臨床療效發(fā)揮重大作用。究其原因，主要是未能找到適合發(fā)現(xiàn)中醫(yī)臨床診療規(guī)律的方法與技術(shù)，在數(shù)據(jù)處理的思路上還存在一定問題。在中藥新藥輔助開發(fā)方面，無論是飲片層次、組分層次，還是單體層次，都有過各種嘗試，其中一些組合知識也引起了新藥開發(fā)專家的重視。但到目前為止，還沒有一個(gè)從數(shù)據(jù)挖掘到新藥上市的完整案例，主要原因是這個(gè)過程過于復(fù)雜漫長，而數(shù)據(jù)挖掘所能提供的知識只是整個(gè)新藥開發(fā)過程中前期工作的一部分，因此，當(dāng)整個(gè)過程完成時(shí)，很難看出數(shù)據(jù)挖掘工作的成就。只有當(dāng)數(shù)據(jù)挖掘的組方能夠完成完整的新藥研發(fā)過程時(shí)，其作用才能夠得到完整的認(rèn)可。

白春禮院士指出，“從本質(zhì)上講，科學(xué)、技術(shù)和工程三者是不同類型的創(chuàng)造性活動，有著不同的發(fā)展規(guī)律，體現(xiàn)著不同的價(jià)值，需要不同的評價(jià)標(biāo)準(zhǔn)和支持政策?！茖W(xué)源于拉丁文scientia，本義是知識和學(xué)問的意思。通常認(rèn)為，科學(xué)以探索發(fā)現(xiàn)為核心，主要是發(fā)現(xiàn)、探索研究事物運(yùn)動的客觀規(guī)律?？茖W(xué)發(fā)現(xiàn)，特別是純科學(xué)的原始性創(chuàng)新突破，也就是純基礎(chǔ)研究，在于人們對科學(xué)真理的自由思考和不懈探索，往往不是通過人為地計(jì)劃和組織來實(shí)現(xiàn)的。‘技術(shù)由希臘文techne（工藝、技能）和logos（詞，講話）構(gòu)成，意為工藝、技能。一般認(rèn)為，技術(shù)以發(fā)明革新為核心，著重解決‘做什么、怎么做的問題?！こ桃辉~，最早產(chǎn)生于18世紀(jì)的歐洲，其本義是兵器制造、軍事目的的各項(xiàng)勞作，后擴(kuò)展到許多領(lǐng)域，如制造機(jī)器、架橋修路等。一般認(rèn)為，工程著重解決‘做出了什么的問題”。工程技術(shù)在人類發(fā)展過程中發(fā)揮重要的作用，并對科學(xué)的發(fā)展具有很大的促進(jìn)作用。同樣在中醫(yī)藥信息學(xué)發(fā)展過程中，工程技術(shù)也發(fā)揮著重要的作用，不僅是在解決現(xiàn)實(shí)問題，而且對學(xué)科理論的發(fā)展也有著重要的促進(jìn)作用，中醫(yī)藥信息學(xué)工程技術(shù)領(lǐng)域的發(fā)展支撐著整個(gè)學(xué)科在應(yīng)用領(lǐng)域中的發(fā)展。