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      基于改進(jìn)MC 和MT 算法的CT 圖像三維重建*

      2015-08-27 08:30:56吳建偉王子牛
      關(guān)鍵詞:標(biāo)量剖分四面體

      吳建偉 ,王子牛

      (1. 貴州大學(xué)計算機科學(xué)與信息學(xué)院,貴州貴陽550025;2. 貴州大學(xué)網(wǎng)絡(luò)與信息化管理中心中心,貴州貴陽550003)

      醫(yī)學(xué)圖像三維重建就是利用二維醫(yī)學(xué)圖像序列(如CT 切片,即計算機斷層掃描切片)重建出三維圖像模型,圖像三維重建的常用算法主要包括體繪制和面繪制。體繪制能表現(xiàn)更多結(jié)構(gòu)上的細(xì)節(jié),但要達(dá)到滿意的精度則需要很大的運算量,運行和存儲性能難以得到滿足。于是,面繪制成為醫(yī)學(xué)圖像三維重建的主流算法。MC(Marching Cubes)算法是面繪制中的經(jīng)典算法,由W.E.Lorenson 和H.E.Cline 在1987 年提出[1]。MC 算法較好的解決了在標(biāo)量數(shù)據(jù)場中抽取等值面的問題,適合在不規(guī)則的醫(yī)學(xué)體數(shù)據(jù)場中進(jìn)行等值面重建,并以大量的三角面片逼近真實的醫(yī)學(xué)三維圖像。但是,MC 算法也有一些缺點,主要在于抽取等值面時存在拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)二義性[2-5],處理的數(shù)據(jù)量大時對處理速度和存儲空間要求很高。隨著計算機硬件和并行計算的發(fā)展,后一問題得到了一定程度的緩和,而本文主要關(guān)注前一問題。作為MC 算法的發(fā)展,MT(Marching Tetrahedrons)算法[6]沒有等值面抽取的二義性問題,但計算量是MC 算法的好幾倍。為了在不明顯增加計算量的前提下,較好的解決MC 算法的二義性問題,本文結(jié)合兩種算法的優(yōu)點,提出一種改進(jìn)算法,在CT 圖像三維重建的實驗中進(jìn)行了驗證,并得到了較好的結(jié)果。

      1 MC 算法

      1.1 MC 算法的基本原理

      假設(shè)有一個CT 切片數(shù)據(jù)集,可以看作是一個三維標(biāo)量數(shù)據(jù)場,其中每一個切片其實是一個二維數(shù)組,數(shù)組中的某一位置的值即該標(biāo)量數(shù)據(jù)場中該位置的標(biāo)量值。在相鄰兩層切片中分別各取4 個數(shù)據(jù)點,構(gòu)成一個小立方體,稱為立方體素,而整個標(biāo)量數(shù)據(jù)場可由這些立方體素的集合表示。MC算法就是對這些立方體素一個一個的進(jìn)行處理,抽取等值面。首先設(shè)定一個等值面值,對每一個立方體素的8 個頂點,若其頂點的標(biāo)量值:

      (1)小于等值面值,則該頂點在等值面內(nèi)部;

      (2)等于等值面值,則該頂點在等值面上;

      (3)大于等值面值,則該頂點在等值面外部。

      可將在等值面內(nèi)部的頂點標(biāo)記為1,其余頂點標(biāo)記為0,然后將8 個標(biāo)記值按一定順序排列,可由一個字節(jié)表示。由于每個頂點的標(biāo)記值有兩種可能,故每個立方體素的頂點狀態(tài)共有28=256 種可能。而每一個頂點狀態(tài)確定了立方體素各邊是否與等值面相交,從而確定立方體素三角面片的拓?fù)錉顟B(tài)。通過旋轉(zhuǎn)對稱性和互補對稱性可將一個立方體素的拓?fù)錉顟B(tài)歸納為以下15 種情形,如圖1 所示:

      圖1 立方體素15 種基本拓?fù)錉顟B(tài)

      1.2 立方體素的邊與等值面的交點

      在確定立方體素的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)后,應(yīng)該計算出立方體素與等值面的交點??梢约僭O(shè)數(shù)據(jù)場中各點的值沿立方體素邊界呈線性變化,這樣就可以通過線性插值的方法求出立方體素的邊與等值面的交點,即三角面片的頂點。設(shè)立方體素某邊與等值面相交于一點P,該邊的兩個端點坐標(biāo)為(x1,y1,z1),(x2,y2,z2),標(biāo)量值為V1,V2,等值面值為V,那么P點的坐標(biāo)(x,y,z)為:

      1.3 三角面片的頂點法向量

      在OpenGL 中繪制三角面片需要提供三角面片頂點的法向量,從而可以使用光照效果。由于數(shù)據(jù)場中各數(shù)據(jù)點的標(biāo)量值的梯度垂直于等值面,所以數(shù)據(jù)場中某點P 的法向量可用該點處的梯度代替。設(shè)P 點處的法向量為n(x,y,z),其計算公式為:

      其中,V(i,j,k)代表點(i,j,k)處的標(biāo)量值,Δx,Δy,Δz 為三個方向上的立方體素的邊長。

      三角面片的頂點是通過對邊上兩端點坐標(biāo)進(jìn)行插補得到的,如式(1)。同樣,在已經(jīng)求得各數(shù)據(jù)點的法向量后,可以通過對邊上兩端點的法向量進(jìn)行插補來得到三角片頂點的法向量。頂點法向量的計算公式仍為式(1),但(x1,y1,z1),(x2,y2,z2)分別表示兩端點的法向量,(x,y,z)為要求的頂點法向量。

      1.4 MC 算法的二義性

      在圖1 中,有些頂點狀態(tài)下,可以有兩種不同的交點連接方式,也就會得到不同的三角面片,即存在二義性問題。MC 算法的二義性問題包括立方體素面二義性和體二義性。

      (1)立方體素面二義性

      在立方體某一面的兩個對角頂點的標(biāo)量值小于等值面值,而另外兩個對角頂點的標(biāo)量值大于等值面值時,就會有兩種交點連接方式,如圖2 所示:

      圖2 立方體素表面的不同交點連接方式

      (2)立方體素體二義性

      正如立方體素表面存在不同的交點連接方式,立方體素內(nèi)部也有類似情況,比如當(dāng)立方體素的兩個體對角頂點在等值面內(nèi)部,而其余頂點均在等值面外部時,有如圖3 所示兩種連接方式:

      圖3 立方體素內(nèi)部的不同交點連接方式

      2 MT 算法

      MT 算法與MC 算法的不同在于它把一個立方體再細(xì)分為若干個四面體,常見的劃分方法將一個立方體劃分為5 個,6 個或24 個四面體。四面體是最簡單的多面體,其等值面拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)可歸結(jié)為3種,如圖4 所示:

      圖4 四面體素的3 種拓?fù)錉顟B(tài)

      類似于MC 算法,只要確定了四面體的4 個頂點的標(biāo)記狀態(tài),就可以確定等值面與四面體邊的交點的連接方式,也就得到了用來逼近等值面的三角面片。重要的是,對于一個四面體來說,其邊上的交點的連接方式是唯一的,即對于單個四面體來說其交點的連接不存在二義性。但是若相鄰兩個立方體的剖分為四面體的方式不一致,則會產(chǎn)生剖分二義性。如圖5 所示,這兩個立方體剖分后,在其相接的面上兩條剖分線并不重合,這可能使得兩個立方體中生成的三角面片不能以一致的方式進(jìn)行連接,導(dǎo)致空洞的產(chǎn)生。

      圖5 相鄰兩立方體剖分不一致

      3 基于MC 和MT 算法的改進(jìn)算法

      為了避免MC 算法的面和體二義性,需先判斷立方體是否具有面和體二義性,這可以用一個二義性表來枚舉所有256 種情況。若立方體不具有面和體二義性,可以用MC 算法進(jìn)行處理;否則,對立方體執(zhí)行MT 算法,把立方體剖分為多個四面體進(jìn)行處理[7]。然而,對立方體進(jìn)行剖分會產(chǎn)生剖分二義性問題:一方面,相鄰的兩個剖分立方體之間可能拓?fù)洳灰恢?,如前面的圖5 所示;另一方面,剖分立方體也可能與相鄰的未剖分的立方體拓?fù)洳灰恢隆H鐖D6 所示,兩個相鄰的立方體中的三角面片沒有嚴(yán)密的連接起來,從而形成了中間白色區(qū)域的空洞。

      圖6 剖分立方體與相鄰的未剖分立方體拓?fù)洳灰恢?/p>

      下面將分別討論這兩種情形。

      3.1 相鄰兩剖分立方體之間拓?fù)洳灰恢?/h3>

      圖7 立方體6 -剖分的一種方式

      MT 算法常用的立方體剖分方式有5 -剖分,6-剖分和24 -剖分。為了避免相鄰兩個剖分立方體之間的拓?fù)洳灰恢滦?,可以使用一種6 -剖分方式,如圖7 所示:在這種剖分方式下,立方體的左右兩面的剖分線方向相同,因此在橫向方向上的兩個相鄰剖分立方體之間是拓?fù)湟恢碌摹M?,在另外兩個方向上,兩個相鄰剖分立方體之間也是拓?fù)湟恢碌?。所以,只要相鄰的剖分立方體的剖分都使用如圖7 所示的方式,就可以避免它們之間的剖分二義性問題。

      3.2 剖分立方體與相鄰的未剖分立方體拓?fù)洳灰恢?/h3>

      對于相鄰兩個立方體中一個是有二義性需要剖分成四面體,另一個是沒有二義性不需要剖分成四面體的情形??梢詫]有二義性的立方體在每個面上作一條對角線,該對角線的方向需與圖7 中的一致。這樣,剖分立方體和未剖分立方體在其相接的表面上的拓?fù)涫峭耆恢碌模簿筒淮嬖谄史侄x性了,如圖8 所示:

      圖8 兩個不同立方體的拓?fù)湟恢滦?/p>

      需要注意的是,當(dāng)一個立方體在每個面上各增加一條對角線之后,立方體的邊由12 條增加到18條。因此,MC 算法原有的相交邊索引表不再適用,需要重新生成。同樣,原有的三角面片索引表也需要根據(jù)新的立方體結(jié)構(gòu)重新生成。

      4 實驗結(jié)果及分析

      本文的實驗環(huán)境為:CPU 為AMD Athlon II X4 640 Processor,800 MHz × 4;內(nèi) 存2G;顯 卡 為NVIDIA GeForce GTS 450;操作系統(tǒng)為32 位Ubuntu14.04;編譯器為gcc 4.6。

      使用的CT 數(shù)據(jù)為:大腦,200 ×160 ×160,8位;腹部及骨盆,512 ×512 ×174,8 位。傳統(tǒng)的MC算法,MT 算法與改進(jìn)后的算法的三維重建效果如圖9,圖10 所示。

      實驗結(jié)果數(shù)據(jù)的比較見表1。

      圖9 大腦表面三維重建圖像

      圖10 腹部及骨盆部位三維重建圖像

      表1 傳統(tǒng)算法與改進(jìn)算法的實驗結(jié)果數(shù)據(jù)

      對比圖9 右邊的局部放大圖可以看出,MC 算法生成了不正確的三角面片,而MT 算法和本文的改進(jìn)算法均生成了正確的三角面片。另外,MT 算法和本文改進(jìn)算法的重建圖像顯示了更多的細(xì)節(jié),在重建精度上比MC 算法高。從表1 可知,本文改進(jìn)算法的執(zhí)行時間介于MC 算法和MT 算法之間,并且更接近于MC 算法。

      5 結(jié)語

      針對MC 算法二義性和MT 算法計算量大的問題,提出了一種結(jié)合兩種算法優(yōu)點的改進(jìn)算法。該算法解決了MC 算法的二義性問題,三維重建效果更接近于MT 算法,而計算量更接近于MC 算法,從整體上優(yōu)于這兩種算法。本文實現(xiàn)了傳統(tǒng)的MC 算法,MT 算法和本文提出的改進(jìn)算法,實驗結(jié)果與預(yù)想的效果一致。

      [1]Lerensen W E,Cline H E. Marching cubes:A high resolution 3D surface construction algorithm[J]. Computer Graphics,1987,21(3):163 -169.

      [2]T S Newman,H Li.A survey of the marching cubes algorithm[J].Computers Graphics,2006,30(5):854 -879.

      [3]王曉,何建英.考慮MC 算法二義性后的三角化方法[J].湖北工業(yè)大學(xué)學(xué)報,2007,22(6):65 -68.

      [4]楊吉宏,薛凌燕,張民,等.基于Double Marching Cubes 的表面重建算法[J].計算機工程與設(shè)計,2010,31(4):795 -797.

      [5]A Gueziec,R Hummel.Exploiting Triangulated Surface Extraction using Tetrahedral Decomposition[J].IEEE Transactions on Visualisation and Computer Graphics,1995(4):328 -342.

      [6]Nielson G M,Hamann B. The asymptotic decider:Resolving the ambiguity in marching cubes[C]//Proceedings of Visualization ’91,San Diego:IEEE,1991:83 -91.

      [7]Huiyan Jiang,Ye Zhang,Yudong Zhao.A medical image 3D reconstruction method based on improved MC and MT algorithms[J].Industrial Electronics and Applications,2009(25 -27):3765 -3768.

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