中國熱帶農業(yè)科學院熱帶生物技術研究所在高通量簡化測序技術研究領域獲得突破

“AFSM技術，是目前為止全世界唯一的可以在全基因組高通量檢測SNVs的同時檢測甲基化位點的方法，具有其它簡化測序無法比擬的優(yōu)勢?！盇FSM技術發(fā)明人、熱帶生物技術研究所（簡稱生物所）青年科學家夏志強博士告訴記者。

近日，生物所在高通量簡化測序技術研究領域獲得突破，種質與基因資源研究室夏志強博士發(fā)明了AFSM技術，能夠提供世界領先的簡化測序和甲基化解決方案，相關成果已發(fā)表于《Nature》旗下子刊Scientific Reports（Xia et al.， 2015; IF： 5.578），并申請了國家發(fā)明專利（專利號：201410154134.9）。AFSM技術通過對酶切獲得的AFSM-tag進行高通量測序，能夠降低基因組的復雜度，操作簡便，同時不受參考基因組的限制，可快速鑒定出高密度的SNVs與甲基化，用于遺傳連鎖圖譜的快速構建、QTL定位、自然群體演化與結構分析、全基因組關聯(lián)GWAS分析和快速進行群體表觀遺傳學甲基化研究。

相比世界范圍內其它高通量簡化測序技術，它具備五大優(yōu)勢：一是適用對象廣泛，其研究對象有無參考基因組均能適用;二是精確度高，每個Tag 的平均覆蓋深度至少達到5倍，保證分子標記的高準確性;三是性價比高，它基于簡化后的基因組DNA測序，測序和甲基化檢測成本均較低，特別適合大樣本量研究;四是快速高效，只需3-4個月即可完成大樣本的群體研究;五是甲基化檢測優(yōu)勢，能夠在全基因組水平大規(guī)模高通量檢測甲基化。

（摘自中國熱帶農業(yè)科學院院網，2015-09-30）