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      高羊茅黔草1 號SAMDC 基因的克隆及植物表達載體的構建

      2015-04-10 07:30:06曾慶飛楊春燕李小冬吳佳海王小利
      草業(yè)科學 2015年8期
      關鍵詞:甲硫氨酸高羊茅草業(yè)

      曾慶飛,楊春燕,李小冬,吳佳海,王小利

      ( 1. 貴州省草業(yè)研究所,貴州貴陽550006; 2. 貴州陽光草業(yè)科技有限責任公司,貴州貴陽550006)

      S-腺苷甲硫氨酸脫羧酶基因(SAMDC)是一個在植物生長發(fā)育過程中起著重要作用的抗逆相關基因[1-3]。SAMDC 是植物多胺生物合成途徑中的一個關鍵酶,該酶以S-腺苷甲硫氨酸(SAM)為底物催化形成脫羧S-腺苷甲硫氨酸(dcSAM),為精氨和亞精氨的合成提供氨丙基,是亞精胺和精胺合成的限速酶[4]。迄今為止,已從生菜(Lactuca sativa)、康乃馨(Dianthus caryophyllus)、擬南芥(Arabidopsis thaliana)、大豆(Glycine max)、水稻(Oryza sativa)、芥菜型油菜(Brassica juncea)、番茄(Lycopersicon esculentum)等植物中克隆出SAMDC 編碼基因[5]。

      通過超量表達SAMDC 基因來提高農(nóng)作物的抗鹽、抗高溫、抗旱性研究在國外已有不少成功的先例。Bhavna 和Manchikatla[6]將人類SAMDC 基因?qū)霟煵?Nicotiana tabacum),煙草內(nèi)源腐胺和亞精胺含量顯著升高,植物耐鹽性和滲透性提高。Cheng等[7]將酵母SAMDC 基因轉(zhuǎn)入番茄,轉(zhuǎn)基因植株亞精胺和精胺含量升高,且植株對高溫脅迫表現(xiàn)明顯抗性。Momtaz 等[8]將酵母的SAMDC 基因通過基因槍法轉(zhuǎn)化莖尖導入棉花(Gossypium hirsutum)Giza88和Giza90,發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)基因植株中精胺水平顯著提高,耐旱性增強。Zhao 等[9]通過融合GUS 蛋白對Md-SAMDC2 啟動子進行定位分析和逆境脅迫誘導表達分析,GUS 活性在鹽和低溫脅迫下上升表達,表明SAMDC 啟動子控制著逆境條件下的基因表達。

      在國內(nèi),李昌澎等[10]以小麥(Triticum aestivum)品種“晉麥47”為材料,利用半定量RT-PCR方法,對SAMDC 基因在正常供水、PEG-6000 模擬水分脅迫和復水過程中小麥葉片的表達模式進行了分析。結果表明,小麥SAMDC 基因的表達受水分脅迫誘導。同時,SAMDC 基因還參與水分脅迫后的復水調(diào)節(jié),說明S-腺苷甲硫氨酸代謝途徑在小麥抗旱節(jié)水中具有重要作用。陸俊杏等[11]對甘藍型油菜(Brassica napus)的SAMDC3 基因及其啟動子進行了克隆分析,表明SAMDC3 可能通過ABA、6-BA 和SA 信號途徑介導植物對非生物脅迫的響應。眾多研究已證實SAMDC 是參與抗旱響應和受鹽脅迫誘導的抗逆功能基因,植物SAMDC基因的研究與利用正逐漸受到重視[6]。本研究克隆了貴州省草業(yè)研究所自主育成的高羊茅新品種“黔草1 號”(Festuca arundinacea cv. Qiancao No.1)的SAMDC 基因,并針對高羊茅和黑麥草(Lolium perenne)組培再生系統(tǒng)對特定抗生素的敏感特性,構建了適合于單子葉禾本科牧草特別是高羊茅和黑麥草遺傳轉(zhuǎn)化的植物過量表達載體,以期通過下一步的遺傳轉(zhuǎn)化培育出禾草抗逆種質(zhì)新材料。

      1 材料與方法

      1.1 材料

      1.1.1 植物材料 高羊茅“黔草1 號”由貴州省草業(yè)研究所于2005 年育成并保存。

      1.1.2 菌株和質(zhì)粒 大腸桿菌(Escherichia coli)DH5α、JM109 購自TAKARA 公司,農(nóng)桿菌GV3101、EHA105 和改造過的pCAMBIA1300 載體由貴州省農(nóng)業(yè)科學院草業(yè)研究所分子生物學實驗室保存。

      1.1.3 酶和化學試劑 植物總RNA 提取試劑盒、pGM-T 平末端DNA 片段加A 試劑盒購自天根生化科技(北京)有限公司;cDNA 合成試劑盒購自Clontech 公司;限制性內(nèi)切酶、T-DNA 連接酶購自Thermo Scientific 公司;DNA 片段回收試劑盒、潮霉素、卡那霉素、氨芐青霉素等購自生工生物工程(上海)股份有限公司;其他試劑均為分析純。

      1.2 試驗方法

      1.2.1 高羊茅總RNA 的提取及cDNA 的合成 高羊茅“黔草1 號”葉片總RNA 的提取按照天根公司的總RNA 提取試劑盒操作步驟進行;以提取的RNA 為模板,按照Clontech cDNA 擴增試劑盒的操作說明合成cDNA 第一鏈。

      1.2.2 目的基因的克隆與序列分析 根據(jù)Gen-Bank 上所登錄的高羊茅SAMDC 基因序列,采用Primer Premier 5 軟件設計一對引物FaSF/R,用于擴增高羊茅SAMDC 基因的全長CDS。并根據(jù)載體pCAMBIA1300 的結構特點,在引物的5'端分別加上KpnI 和PstI 酶切位點,引物序列為,F(xiàn)aSFwd1:5'-CGGGGTACCAAAATCCGTAAACTCGTCG-3'; FaSRev1: 5'-ACGCTGCAGCCTAGAGCCAACAATAGTTTAT-3'。

      擴增產(chǎn)物大小為1 821 bp。以高羊茅“黔草1號”cDNA 為模板,用FaSF/R 引物擴增高羊茅SAMDC 基因的全長CDS。PCR 反應采用Thermo Fisher公司的Thermo Scientific Phusion 高保真DNA 聚合酶進行擴增。通過平末端DNA 片段加A 試劑盒在純化的PCR 產(chǎn)物3'末端加A 后與pGM-T 連接,得到pGM-T-FaSAMDC 重組質(zhì)粒,通過熱激法將質(zhì)粒轉(zhuǎn)入大腸桿菌DH5α 中,挑選陽性克隆送大連寶生物有限公司測序。

      1.2.3 SAMDC 基因表達載體的構建

      1)酶切反應:在一滅菌的EP 管中依次加入10 ×Tango Buffer 2 μL、改造后的pCAMBIA1300 或pGM-T-FaSAMDC 15 μL、KpnI 2 μL、PstI 1 μL,輕輕混勻,瞬時離心,37 ℃水浴3 h,60 ℃滅活15 min 終止反應。瓊脂糖凝膠電泳,DNA 片段回收試劑盒回收目的片段。

      2)連接反應:在一滅菌的EP 管中依次加入經(jīng)雙酶切后回收的pCAMBIA1300 2 μL、經(jīng)雙酶切后回收的FasAMDC 8 μL、滅菌去離子水7 μL、10 ×連接Buffer 2 μL,45 ℃水浴5 min 后加入T4-DNA 連接酶1 μL,混勻于16 ℃條件下過夜。

      3)轉(zhuǎn)化及鑒定:取10 μL 連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化JM109感受態(tài)細胞,涂布于含氨芐青霉素的LB 瓊脂平板上,挑選陽性單菌落于LB 液體培養(yǎng)基中,37 ℃培養(yǎng)過夜,少量抽提質(zhì)粒,用PCR 及雙酶切進行鑒定。

      1.2.4 根癌農(nóng)桿菌重組質(zhì)粒的導入 取5 μL pCAM-SAMDC 過表達載體,分別加入200 μL 根癌農(nóng)桿菌GV3101 和EHA105 感受態(tài)細胞中,混勻,冰浴15 min;轉(zhuǎn)入液氮冷凍l min,迅速置37 ℃水浴鍋溫浴5 min;加入400 μLYEB 液體培養(yǎng)基,28 ℃250 r·min-1預表達4 ~5 h;取適當體積均勻涂布于含有抗生素的YEB 平板,28 ℃培養(yǎng)2 d,待長出單菌落后挑取單克隆,擴大培養(yǎng)后提取質(zhì)粒,并進行PCR 和酶切驗證,將陽性克隆加15%的甘油置于-70 ℃冰箱中保存。

      2 結果

      2.1 目的片段的克隆與序列分析

      2.1.1 FaSAMDC 基因cDNA 片段的擴增與回收

      以反轉(zhuǎn)錄合成的高羊茅“黔草1 號”cDNA 為模板,利用設計合成的引物FaSFwd1 和FaSRev1 進行PCR 擴增,得到預期約1 821 bp 的條帶(圖1),采用DNA 膠回收試劑盒純化回收PCR 產(chǎn)物。

      圖1 高羊茅“黔草1 號”的SAMDC 基因擴增Fig.1 Amplification of SAMDC geng from Qiancao No. 1

      2.1.2 基因的克隆與序列分析 通過平末端DNA片段加A 試劑盒在純化的PCR 產(chǎn)物3'末端加A 后與pGM-T 連接,得到pGM-T-FaSAMDC 重組質(zhì)粒,通過熱激法將質(zhì)粒轉(zhuǎn)入大腸桿菌DH5α 中,挑選陽性克隆送大連寶生物有限公司測序?;驕y序分析表明,包括引物的擴增片段共1 835 個核苷酸,包含有9 bp 的微型上游閱讀框、147 bp 的小型上游閱讀框和1 185 bp 的主閱讀框。微型上游閱讀框和小型上游閱讀框存在一個堿基重疊。整個克隆片段與GenBank 上公布的高羊茅SAMDC 基因的核苷酸同源性為95.05%。

      2.1.3 克隆基因氨基酸序列的推導與分析 采用DNAMAN 軟件推導得出,擴增的SAMDC 基因主閱讀框編碼395 個氨基酸,與GenBank 登錄的FaSAMDC 基因編碼的氨基酸數(shù)量相同,同源性為98.22%,說明克隆的“黔草1 號”的SAMDC 基因與注冊的高羊茅FaSAMDC 基因存在著微小的差異。

      2.2 SAMDC 基因植物表達載體的構建

      根據(jù)克隆出的FaSAMDC 基因核苷酸的序列特征,選擇經(jīng)貴州省草業(yè)研究所分子生物學實驗室改造后的pCAMBIA 1300 作為表達載體。用KpnI 和PstI 雙酶切pGM-T-FaSAMDC 重組質(zhì)粒,回收1.8 kb的SAMDC 基因片段,與經(jīng)KpnI 和PstI 雙酶切回收的pCAMBIA 1300 大片段連接,獲得重組質(zhì)粒pCAM-SAMDC。

      用重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化JM109 感受態(tài)細胞,挑選陽性克隆培養(yǎng)抽提質(zhì)粒,以提取的重組質(zhì)粒為模板,采用與擴增FaSAMDC 基因相同的引物和體系進行PCR 鑒定,結果擴出了1.8 kp 的目的片段(圖2);用KpnI 和PstI 雙酶切重組質(zhì)粒pCAM-SAMDC,得到8.9 和1.8 kb 的兩條片段(圖3),說明pCAM-SAMDC 為本文需要的過表達載體,接下來重組質(zhì)粒部分序列的測定結果進一步證明了表達載體構建的正確性。構建出的過表達載體結構如圖4 所示。

      圖2 重組質(zhì)粒的PCR 鑒定Fig.2 Identification of recombinant plasmids with PCR

      圖3 重組質(zhì)粒的酶切鑒定Fig.3 Analysis of recombinant plasmid with restriction enzyme

      2.3 重組質(zhì)粒導入農(nóng)桿菌株

      通過凍融法將構建的重組質(zhì)粒pCAM-SAMDC導入根癌農(nóng)桿菌GV3101 和EHA105 菌株中,提取2個轉(zhuǎn)化后的根癌農(nóng)桿菌菌株的質(zhì)粒,經(jīng)PCR 擴增都獲得了1.8 kb 的目的片段(圖5),證明構建的過表達載體已成功轉(zhuǎn)入農(nóng)桿菌菌株中,為下一步通過農(nóng)桿菌介導法將SAMDC 基因?qū)牒瘫究颇敛莸於嘶A。

      圖4 構建的植物表達載體結構簡圖Fig.4 The structural diagram of constructed plant expression vector

      圖5 農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化菌株的PCR 鑒定Fig.5 Identification of transmitted Agrobacterium tumefacien strains with PCR

      3 討論與結論

      高羊茅、黑麥草等草種是世界上廣泛栽培的重要冷季型禾草,在我國很多地區(qū)被大量引進種植,其株型外觀優(yōu)美,植株營養(yǎng)豐富、耐踐踏,具有作為牧草和草坪草的很多優(yōu)點,但在草地草坪建植過程中也存在著一些缺點,如不耐高溫、干旱及高鹽等非生物脅迫[12],通過轉(zhuǎn)入可利用的抗性基因來提高它們的抗性具有重要的生產(chǎn)意義。

      S-腺苷甲硫氨酸脫羧酶基因(SAMDC)是一個在植物多胺合成途徑中起著重要調(diào)節(jié)作用的抗逆相關基因。SAMDC 基因表達受高鹽、高熱、干旱及寒冷的誘導,但不受植物創(chuàng)傷的影響,說明SAMDC 能對多種環(huán)境條件的脅迫作出反應[13]。Wi 等[14]在煙草中過量表達康乃馨的SAMDC 能讓轉(zhuǎn)基因植株獲得對非生物脅迫的廣譜抗性;Peremarti 等[15]研究證明,SAMDC 調(diào)節(jié)合成的精胺積累有助于植物在經(jīng)受干旱后的快速復蘇;Hazarika 和Rajam[16]的試驗還證明,轉(zhuǎn)基因番茄中SAMDC 基因的組成型表達同時提高了植株對生物及非生物脅迫的耐受性。Lasanajak 等[17]將酵母SAMDC 基因轉(zhuǎn)入番茄,結果在果實中觀察到多胺生物合成流量的增加,而乙烯的生成減少。Wi 等[18]最近發(fā)現(xiàn),除調(diào)節(jié)多胺的生物合成外,SAMDC 還能通過抑制活性氧的積累來增強擬南芥對干旱的耐受性。

      植物的SAMDC 基因存在著序列結構的多態(tài)性。本研究從高羊茅“黔草1 號”葉片中擴增SAMDC 基因時,采用高保真DNA 聚合酶平末端擴增法,以最大程度降低堿基的錯配率??寺〕龅腟AMDC基因包括引物序列共有1 835 個核苷酸,包含有9 bp 的微型上游閱讀框、147 bp 的小型上游閱讀框和1 185 bp 的主閱讀框,微型上游閱讀框和小型上游閱讀框存在一個堿基重疊,這與葡萄(Vitis vinifera)、馬鈴薯(Solanum tuberosum)、大豆中的SAMDC基因上游閱讀框的結構特征相同。Tassoni 等[3]將去除上游2 個微小讀碼框的葡萄SAMDC cDNA 片段導入酵母細胞內(nèi)表達,結果顯示SAMDC 酶的活性比完整片段的酶活性要高出50 倍之多,說明SAMDC 基因上游的2 個微小讀碼框具有很強的調(diào)節(jié)功能。本研究克隆出的高羊茅“黔草1 號”SAMDC 基因主閱讀框編碼395 個氨基酸,這與GenBank登錄的FaSAMDC 基因編碼的氨基酸數(shù)量一致,但與大豆GmSAMDC1 基因編碼355 個氨基酸的片段長度差異較大[13]。

      本研究構建SAMDC 基因植物表達載體的目的是針對黑麥草和高羊茅的遺傳轉(zhuǎn)化。高羊茅與黑麥草的胚性愈傷組織對卡那霉素、頭孢霉素等抗生素較為敏感,選用潮霉素作為篩選抗生素能明顯提高陽性株系的出苗率[19-20]。本研究選擇經(jīng)貴州省草業(yè)研究所分子生物學實驗室改造過的pCAMBIA1300 作為表達載體,一方面,能將插入的SAMDC 基因直接置于35S 啟動子之下,另一方面,可用潮霉素作為遺傳轉(zhuǎn)化時的篩選抗生素,以增加轉(zhuǎn)基因株系的獲得率。成功構建的pCAM-SAMDC 過表達載體,為下一步通過遺傳轉(zhuǎn)化手段培育黑麥草和高羊茅的抗旱、耐熱、耐鹽新品系奠定了物質(zhì)基礎。

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