孫志強(qiáng),何 玲,譚大為,詹 云,趙 靜,鄭 方
(1.貴陽(yáng)醫(yī)學(xué)院附屬白云醫(yī)院血液科 550014;2.貴陽(yáng)醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院血液科 550004;
3.貴陽(yáng)醫(yī)學(xué)院研究生學(xué)院 550004)
原發(fā)免疫性血小板減少性癥(immune thrombocytopenia,ITP)是一種獲得性器官特異性自身免疫性疾?。?],是臨床最常見(jiàn)的一種血小板減少性疾病。其發(fā)病機(jī)制尚未完全清楚,除傳統(tǒng)的體液免疫以及細(xì)胞免疫機(jī)制外,研究發(fā)現(xiàn)ITP在不同種族發(fā)病率有差異,提示ITP的發(fā)病可能與遺傳背景有關(guān)。蛋白酪氨酸磷酸酶非受體型22(protein tyrosine phosphatase nonreceptor 22,PTPN22)基因位于1號(hào)染色體短臂(1p13.3~13.1),作為自身免疫性疾病的易感基因,被認(rèn)為是除了主要組織相容性抗原復(fù)合物(MHC)以外最重要的自身免疫性疾病危險(xiǎn)因子,是從自身免疫角度研究ITP的重要候選基因。本實(shí)驗(yàn)分別檢測(cè)了PTPN22基因+1858位點(diǎn)(rs2476601)、3′UTR區(qū)rs3811021位點(diǎn)和啟動(dòng)子-1123位點(diǎn)(rs2488457)的單核苷酸多態(tài)性,旨在探討該位點(diǎn)變異與中國(guó)貴州漢族人群ITP發(fā)病的相關(guān)性。
表1 PTPN22 3個(gè)位點(diǎn)擴(kuò)增引物及片段大小
1.1 一般資料 選取貴陽(yáng)醫(yī)學(xué)院附屬白云醫(yī)院和貴陽(yáng)醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院血液科2013年4月至2014年2月住院及門診長(zhǎng)期隨訪的ITP患者100例作為研究對(duì)象,其中,男31例,女69例,年齡14~85歲,平均(41.3±18.468)歲,均為漢族患者,均符合《血液病診斷與療效標(biāo)準(zhǔn)》第2版ITP診斷標(biāo)準(zhǔn)[2]。同時(shí),以性別、年齡為匹配因素,選擇貴陽(yáng)醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院健康體檢者100例作為對(duì)照組,其中,男37例,女63例,年齡15~76歲,平均(41.19±15.162)歲,均為漢族人,所選對(duì)象間均無(wú)親緣關(guān)系。
1.2.1 基因組DNA提取 采清晨空腹靜脈血2mL,用EDTA抗凝管抗凝,置于-80℃冰箱中保存。用DNA提取試劑盒(生工SK8224)提取基因組DNA,-20℃冰箱中保存。DNA提取試劑盒由上海生工生物工程股份有限公司提供。
1.2.2 聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)擴(kuò)增及基因型分析 利用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(PCR-RFLP)技術(shù)進(jìn)行PTPN22基因+1858位點(diǎn)(rs2476601)和3′UTR區(qū)rs3811021位點(diǎn)的多態(tài)性分析,利用序列特異性引物聚合酶鏈反應(yīng)(PCRSSP)技術(shù)進(jìn)行啟動(dòng)子-1123位點(diǎn)(rs2488457)的多態(tài)性分析。參考文獻(xiàn)設(shè)計(jì)引物見(jiàn)表1,引物均由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系總體積為15.0μL,其中,DNA模板0.5μL,10×Taq緩沖液1.5μL,dNTP混合物0.3 μL,上下游引物各0.2μL,20mmol/L MgCl21.2μL,5U/μL TaqDNA聚合酶0.1μL,不足體積加高壓滅菌水補(bǔ)足;PCRRFLP反應(yīng)條件為95.0℃預(yù)變性5min后95.0℃變性30s,58.0℃退火30s,72.0℃延伸40s,共40個(gè)循環(huán),最后72.0℃延伸6min,4℃保存。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物分別以限制性內(nèi)切酶酶(RsaI,TaqI)酶切后以3%瓊脂糖凝膠電泳,將擴(kuò)增物(5.0 μL)與溴酚藍(lán)混合后加樣于1×TBE緩沖液中,150V電泳0.5 h。PCR-SSP反應(yīng)條件:96.0℃預(yù)變性1min后90.0℃變性20s,65.5℃退火45s,72.0℃延伸25s,5個(gè)循環(huán);再95.0℃變性30s,60.0℃退火50s,72.0 ℃延伸30s,21個(gè)循環(huán);再95.0℃變性25s,55.0℃退火50s,72.0℃延伸30s,4個(gè)循環(huán);最后20.0℃延伸2min,4.0℃保存。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳,150V電泳20min。得到擴(kuò)增條帶后,根據(jù)電泳結(jié)果分析每個(gè)個(gè)體基因型。
1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 采用SPSS17.0統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件進(jìn)行分析處理,計(jì)算基因型以及等位基因頻率,檢驗(yàn)其是否符合Hardy-Weinberg遺傳平衡定律,基因型和等位基因頻率比較采用χ2檢驗(yàn),以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
100例ITP患者及100例對(duì)照者PTPN22基因+1858位點(diǎn)(rs2476601)均產(chǎn)生了176bp和42bp兩個(gè)片段,即該位點(diǎn)均為C等位基因,未檢測(cè)到T等位基因,未發(fā)現(xiàn)存在突變,無(wú)單核苷酸多態(tài)性(R620W)存在(圖1)。而rs3811021位點(diǎn)PCR片段擴(kuò)增長(zhǎng)度為162bp,該位點(diǎn)的C等位基因可被TaqI酶切產(chǎn)生137bp和25bp兩個(gè)條帶,如圖2。
2.2 PTPN22-1123位點(diǎn)(rs2488457)基因多態(tài)性檢測(cè) PCR擴(kuò)增長(zhǎng)度為500bp,每份標(biāo)本均用F1及F2進(jìn)行擴(kuò)增,F(xiàn)1對(duì)應(yīng)等位基因C,當(dāng)基因型為CC時(shí)F1可擴(kuò)增出PCR產(chǎn)物,得到擴(kuò)增條帶;F2對(duì)應(yīng)等位基因G,當(dāng)基因型為GG時(shí)F2可擴(kuò)增出PCR產(chǎn)物,得到擴(kuò)增條帶;當(dāng)基因型為GC時(shí),F(xiàn)1及F2均可得到擴(kuò)增條帶,見(jiàn)圖3~4。
圖1 PTPN22基因+1858位點(diǎn)(rs2476601)基因分型圖
圖2 PTPN22基因rs3811021基因分型圖
圖3 引物F1擴(kuò)增C等位基因電泳圖
圖4 引物F2擴(kuò)增G等位基因電泳圖
2.3.1 PTPN22基因rs2476601位點(diǎn) 對(duì)該位點(diǎn)SNP檢測(cè)的100例ITP患者及100例對(duì)照者中,未檢測(cè)到T等位基因,即沒(méi)有發(fā)現(xiàn)PTPN22+1858存在突變。
2.3.2 PTPN22基因rs3811021位點(diǎn) (1)比較ITP組與對(duì)照組總體基因型及等位基因頻率,PTPN22基因rs3811021位點(diǎn)TT、CT、CC 3個(gè)基因型在ITP患者中的頻率分別為52.0%、39.0%、9.0%;在對(duì)照組中分別為 60.6%、36.4%、3.0%(表2)。3種基因型在ITP患者中的頻率與對(duì)照者比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=3.686,P=0.158)。T等位基因、C等位基因在ITP患者中的頻率為71.5%、28.5%;在對(duì)照者中分別為78.8%、21.2%。2個(gè)等位基因在兩組人群中的頻率比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=2.828,P=0.093)。(2)按性別因素分別比較ITP組與對(duì)照組基因型及等位基因頻率,以ITP組女性及對(duì)照組女性比較,如表3所示,PTPN22基因rs3811021位點(diǎn)TT、CT、CC 3個(gè)基因型在ITP女性患者中的頻率分別為50.7%、42.0%、7.3%;在對(duì)照女性組中分別為 58.1%、37.1%、4.8%。3種基因型在ITP女性患者中的頻率與女性對(duì)照者相比差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=0.835,P=0.659)。T等位基因、C等位基因在ITP女性患者中的頻率為71.7%,28.3%;在女性對(duì)照者中分別為76.7%,23.4%。兩個(gè)等位基因在兩組女性人群中的頻率比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=0.807,P=0.369)。
表2 PTPN22基因rs3811021位點(diǎn)基因型和等位基因分布比較[n(%)]
3種基因型在ITP男性患者中的頻率與男性對(duì)照者比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=5.097,P=0.078)。T等位基因、C等位基因兩個(gè)等位基因在兩組男性人群中的頻率比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=2.520,P=0.112)。
表3 PTPN22基因rs3811021位點(diǎn)按性別比較基因型和等位基因分布比較[n(%)]
2.4 PTPN22基因-1123位點(diǎn)(rs2488457) (1)比較ITP組與對(duì)照組總體基因型及等位基因頻率,PTPN22基因rs2488457位點(diǎn)GG、GC、CC 3個(gè)基因型在ITP患者中的頻率分別為27.6%、66.3%、6.1%;在對(duì)照組中分別為32.0%、58.0%、10.0%(表4)。3種基因型在ITP患者中的頻率與對(duì)照者比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=1.802,P=0.406)。C等位基因、G等位基因在ITP患者中的頻率為60.7%、39.2%;在健康對(duì)照者中分別為61.0%、39.0%。兩個(gè)等位基因在兩組人群中的頻率比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=0.003,P=0.954)。(2)按性別因素分別比較ITP組與對(duì)照組基因型及等位基因頻率 以ITP組女性及對(duì)照組女性比較,如表5所示,PTPN22基因-1123位點(diǎn)GG、CG、CC 3個(gè)基因型在ITP女性患者中的頻率分別為23.5%、75.0%、1.5%;在對(duì)照組女性中分別為28.6%、61.9%、9.5%。3種基因型在ITP女性患者中的頻率與健康女性對(duì)照者比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=5.106,P=0.078)。G等位基因、C等位基因在ITP女性患者中的頻率為61.0%、39.0%;在女性對(duì)照者中分別為60.0%、40.0%。兩個(gè)等位基因在兩組女性人群中的頻率比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=0.140,P=0.906)。3種基因型在ITP男性患者中的頻率與男性對(duì)照者比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=0.503,P=0.778)。G等位基因、C等位基因2個(gè)等位基因在兩組男性人群中的頻率比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=0.174,P=0.677)。
表4 PTPN22基因-1123位點(diǎn)基因型和等位基因分布比較[n(%)]
表5 PTPN22基因-1123位點(diǎn)按性別比較基因型和等位基因分布比較[n(%)]
2.5 Hardy-Weinberg遺傳平衡檢驗(yàn) 本研究對(duì)照人群中PTPN22基因rs3811021與rs2488457位點(diǎn)的基因型頻率分布符合 Hardy-Weinberg遺傳平衡定律(rs3811021,χ2=0.775,P>0.05;rs2488457,χ2=4.790,P>0.05),即群體的基因達(dá)到遺傳平衡,樣本選取和實(shí)驗(yàn)分型結(jié)果可靠。
ITP屬于獲得性器官特異性自身免疫性疾病,其病因及發(fā)病機(jī)理尚未完全清楚,大量研究證實(shí)ITP的發(fā)病與免疫功能異常密切相關(guān)。有關(guān)發(fā)病機(jī)制的研究,目前,傳統(tǒng)的理論認(rèn)為,是B細(xì)胞介導(dǎo)的自身抗體的產(chǎn)生導(dǎo)致單核巨噬細(xì)胞系統(tǒng)破壞血小板過(guò)多,為體液免疫異常所致。隨著研究的不斷深入,發(fā)現(xiàn)除了體液免疫外,細(xì)胞免疫在ITP的發(fā)病機(jī)制中也起著重要的作用,其中抗原特異性自身反應(yīng)性T細(xì)胞,特別是調(diào)節(jié)性T細(xì)胞的功能異常,是ITP免疫發(fā)病的關(guān)鍵因素。另外,ITP作為一種常見(jiàn)的自身免疫性疾病,除上述發(fā)病機(jī)理外,研究者發(fā)現(xiàn),其在不同種族的發(fā)病率有差異,提示ITP的發(fā)病可能與遺傳背景有關(guān)。近期,至少有12項(xiàng)關(guān)于ITP患者遺傳學(xué)方面的研究顯示,在ITP患者中可發(fā)現(xiàn)細(xì)胞因子基因多態(tài)現(xiàn)象,涉及甲基化轉(zhuǎn)移酶基因多態(tài)性[3-4]、CD72基因多態(tài)性[5]、MHC基因表達(dá)[6]等方面的研究。
PTPN22編碼產(chǎn)生淋巴蛋白酪氨酸磷酸酶(1ymphoid protein tyrosine phosphatase,LYP),LYP通過(guò)直接去磷酸化Scr家族的激酶來(lái)抑制TCR信號(hào)途徑,在T細(xì)胞信號(hào)通路中起負(fù)性調(diào)節(jié)作用[7]。在正常機(jī)體內(nèi),調(diào)節(jié)性T細(xì)胞對(duì)于防止自身免疫性疾病的發(fā)生有著極其重要的作用。有理論認(rèn)為PTPN22基因某位點(diǎn)突變可導(dǎo)致該基因活性增加,從而降低調(diào)節(jié)性T細(xì)胞的TCR信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo),減弱調(diào)節(jié)性T細(xì)胞的調(diào)節(jié)功能[8]。另外,PTPN22的活性增強(qiáng)還能提高胸腺細(xì)胞發(fā)育中效應(yīng)性TCR信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的閾值,導(dǎo)致缺乏對(duì)自身反應(yīng)性T細(xì)胞的陰性選擇[9]。通過(guò)上述機(jī)制的作用,PTPN22功能異常可以導(dǎo)致自身免疫性疾病的發(fā)生,并被認(rèn)為是除了MHC以外最重要的自身免疫性疾病危險(xiǎn)因子,是從自身免疫角度研究ITP的重要候選基因。
近年研究發(fā)現(xiàn),PTPN22基因+1858位點(diǎn)突變參與多種自身免疫性疾病的發(fā)生,其單核苷酸多態(tài)性由胞苷酸(C)突變成胸苷酸(T)(C1858T),蛋白水平的第620位由精氨酸(R)突變成色氨酸(W)(R620W),改變了LYP C端的一個(gè)富含脯氨酸基序的P1結(jié)構(gòu)域[10],而細(xì)胞中LYP正是通過(guò)該結(jié)構(gòu)域與酪氨酸激酶Csk的SH3結(jié)合來(lái)抑制T細(xì)胞信號(hào),因此,PTPN22+1858位點(diǎn)突變導(dǎo)致T細(xì)胞活性增加,從而參與多種自身免疫性疾病有關(guān),如Ⅰ型糖尿病(T1DM)[10]、類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎(RA)[11]、白癜風(fēng)[12]、系統(tǒng)性紅斑狼瘡(SLE)[13]、ANCA 相關(guān)性小血管炎[14]等,但在不同國(guó)家健康人群中該位點(diǎn)基因型的分布存在地域差異及種族差異,其中在北美地區(qū)1858T最高[13],由北向南逐漸降低,亞洲地區(qū)如日本[15]未檢測(cè)到該位點(diǎn)的T等位基因。另外,德國(guó) Kahles等[16]關(guān)于PTPN22 C1858T與T1DM的研究表明,女性T1DM組與健康女性對(duì)照組間PTPN22 1858T基因型分布比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.000 3),但男性T1DM組與健康對(duì)照組間比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。提示PTPN22C1858T的分布除了地域及種族差異外,可能還存在性別差異。本實(shí)驗(yàn)檢測(cè)的是貴州漢族人群中該位點(diǎn)的SNP,同樣未檢測(cè)到單核苷酸多態(tài)性(R620W)存在,這與有關(guān)學(xué)者關(guān)于PTPN22+1858位點(diǎn)在亞洲國(guó)家如日本及韓國(guó)人群中的基因多態(tài)性分布的研究結(jié)果相一致。這種結(jié)果的出現(xiàn)可能是由地域及人種之間的差異所致,而在亞洲人群中該位點(diǎn)的突變率可能極低。
本研究對(duì)中國(guó)貴州漢族人群PTPN22基因另外兩個(gè)SNP位點(diǎn)(rs3811021、rs2488457)進(jìn)行了檢測(cè),并針對(duì)性別因素分別對(duì)ITP組及對(duì)照組基因型及等位基因頻率進(jìn)行比較。
PTPN22基因rs3811021位于3,UTR區(qū),Kyogoku等[13]發(fā)現(xiàn)位于該區(qū)域(rs3811021)的SNP與風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎的發(fā)病有關(guān),其機(jī)制可能是通過(guò)影響轉(zhuǎn)錄穩(wěn)定性及拼接過(guò)程來(lái)改變PTPN22基因活性。本實(shí)驗(yàn)結(jié)果示該位點(diǎn)TT、CT、CC 3個(gè)基因型在ITP患者中的頻率與對(duì)照者比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=3.754,P=0.153),T等位基因、C等位基因在兩組人群中的頻率比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=0.005,P=0.944)。另外,根據(jù)性別因素比較兩組人群證實(shí),ITP組與對(duì)照組女性人群中3種基因型及等位基因頻率比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),兩組男性比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。表明該位點(diǎn)的單核苷酸多態(tài)性與ITP發(fā)病無(wú)相關(guān)性,且該SNP位點(diǎn)分布不存在性別差異,這與國(guó)內(nèi)2009年袁鋒等[17]關(guān)于該位點(diǎn)SNP與中國(guó)漢族人群白癜風(fēng)發(fā)病無(wú)顯著相關(guān)性的結(jié)論一致。
PTPN22基因rs2488457位于啟動(dòng)子區(qū)的-1123位點(diǎn),有學(xué)者對(duì)PTPN22基因的3′UTR區(qū),啟動(dòng)子區(qū),1~21號(hào)外顯子進(jìn)行單核苷酸掃描鑒定,研究亞洲人群中PTPN22基因SNP與T1DM的相關(guān)性,結(jié)果發(fā)現(xiàn)位于啟動(dòng)子區(qū)的-1123位點(diǎn)(rs2488457)的單核苷酸多態(tài)性與亞洲T1DM的發(fā)病具有相關(guān)性。Viken等[18]做了關(guān)于PTPN22基因-1123位點(diǎn)的SNP與挪威人群類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎患者的相關(guān)性研究,發(fā)現(xiàn)該位點(diǎn)變異與挪威人群RA的發(fā)病具有相關(guān)性。以上研究顯示,PTPN22基因-1123位點(diǎn)單核苷酸多態(tài)性與亞洲及歐洲人群的自身免疫性疾病的發(fā)病具有相關(guān)性。國(guó)內(nèi)也有相關(guān)報(bào)道,如于志云等[19]研究證實(shí),PTPN22基因啟動(dòng)子的-1123G>C的SNP與中國(guó)北方漢族人群Graves病的發(fā)生具有相關(guān)性。目前,關(guān)于該位點(diǎn)變異導(dǎo)致自身免疫性疾病的發(fā)生機(jī)制還不完全清楚,可能是通過(guò)影響LYP的轉(zhuǎn)錄效率進(jìn)而對(duì)LYP的表達(dá)產(chǎn)生影響。本實(shí)驗(yàn)結(jié)果示該位點(diǎn)GG、GC、CC 3種基因型在ITP患者中的頻率與對(duì)照者比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=0.441,P=0.802)。C等位基因和G等位基因在兩組人群中的頻率比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=0.094,P=0.76)。另外,根據(jù)性別因素比較兩組人群證實(shí),ITP組和對(duì)照組女性人群中3種基因型及等位基因頻率比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),兩組男性比較差異亦無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。表明該位點(diǎn)的單核苷酸多態(tài)性與ITP發(fā)病無(wú)相關(guān)性,且該SNP位點(diǎn)分布不存在性別差異。這與上述文獻(xiàn)報(bào)道結(jié)果不一致,其原因可能與研究的疾病種類不同,實(shí)驗(yàn)樣本數(shù)量多少以及PTPN22基因其他位點(diǎn)的潛在性影響有關(guān)。
綜上所述,PTPN22基因rs2476601這個(gè)SNP位點(diǎn)在中國(guó)貴州漢族人群中不存在,該基因另外2個(gè)SNP位點(diǎn)(rs3811021、rs2488457)與中國(guó)貴州漢族人群ITP的發(fā)病無(wú)顯著相關(guān)性,且該位點(diǎn)分布不存在性別差異。目前,發(fā)現(xiàn)的關(guān)于PTPN22基因的SNP位點(diǎn)有250個(gè),而本實(shí)驗(yàn)僅僅選擇了其中的3個(gè),并不能完全代表該基因的全部SNP位點(diǎn),因此,不能排除PTPN22基因其他位點(diǎn)的SNP參與ITP的發(fā)病。另外,本研究樣本數(shù)量較少,可能存在其他基因潛在影響PTPN22基因表達(dá)等也會(huì)影響實(shí)驗(yàn)的結(jié)果。雖然本實(shí)驗(yàn)未發(fā)現(xiàn)PTPN22基因這3個(gè)SNP位點(diǎn)的多態(tài)性與ITP發(fā)病具有顯著相關(guān)性,但對(duì)于ITP發(fā)病與PTPN22基因其他SNP位點(diǎn)相關(guān)性研究具有一定的參考價(jià)值,而PTPN22基因其他SNP位點(diǎn)是否與ITP的發(fā)病具有相關(guān)性還有待進(jìn)一步研究。
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