周 瑋 蘆 珊 魏海云 苗志國(guó)
P16、E-cad和hMLH1在胃癌中發(fā)揮抑癌基因功能,常由于高甲基化而失活[1]。本研究通過(guò)檢測(cè)早期胃癌患者外周血P16、E-cad和hMLH1基因啟動(dòng)子甲基化狀態(tài),探討其在胃癌早期非侵入性診斷中的臨床價(jià)值。
收集2011年1月至2014年6月間江西省腫瘤醫(yī)院腹部外科的早期胃癌標(biāo)本83例,其中男性49例,女性34例,年齡22~73歲。胃鏡下取材發(fā)現(xiàn)胃癌前病變37例(腸上皮化生、中重度不典型增生、胃息肉),其中男性21例,女性16例,年齡29~62歲。20例健康人胃粘膜組織(正常對(duì)照組)。同時(shí)留取上述研究對(duì)象外周靜脈血標(biāo)本。上述組織標(biāo)本均經(jīng)病理檢查證實(shí),記錄腫瘤部位、浸潤(rùn)深度、腫瘤大小、分化程度、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移情況、分期等臨床病理資料。將收集的組織標(biāo)本置-80℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.1 DNA 提取 用 TIANamp Micro DNA Kit提取靜脈血DNA,加入carrier RNA以提高純化效率,用30 μl滅菌雙蒸餾水洗脫,如DNA含量低可重復(fù)提取后,合并樣品并將總體積真空濃縮至30 μL。胃組織中DNA提取按照試劑盒說(shuō)明書步驟提取。
1.2.2 主要試劑 基因組 DNA提取試劑盒(Boehringer Mannheim公司,德國(guó)),Sssl甲基酶(New England Biolabs公司,美國(guó))。
1.2.3 DNA甲基化修飾和甲基化特異性PCR(MSP)
基因組DNA的甲基化修飾使用Boehringer Mannheim公司試劑盒,1 μg的DNA通過(guò)3 mol/L NaOH變性,再通過(guò)亞硫酸氫鈉修飾,50°避光水浴過(guò)夜,未甲基化的胞嘧啶轉(zhuǎn)變?yōu)槟蜞奏?,而甲基化的胞嘧啶保持不變,修飾后的DNA通過(guò)乙醇沉淀會(huì)在并重懸于去離子水中,用于甲基化特異性PCR。針對(duì)P16、E-cad、hMLH1基因啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄調(diào)控區(qū)域,參考文獻(xiàn)設(shè)計(jì)PCR引物。甲基化特異性的PCR反應(yīng)體系為25 μl,反應(yīng)條件:95°變性 10 min,特定溫度退火 45 s,延長(zhǎng) 72°45 s,共40個(gè)擴(kuò)增循環(huán)。PCR產(chǎn)物進(jìn)行12%聚丙烯酰胺凝膠電泳(PAEG),EB染色,運(yùn)用圖像采集與分析系統(tǒng),記錄并分析電泳結(jié)果。甲基化特異性引物擴(kuò)增的條帶計(jì)為甲基化(M),未甲基化特異性引物擴(kuò)增的條帶計(jì)為甲基化(U)。
應(yīng)用SPSS 10.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)整理劑分析。組間比較采用卡方檢驗(yàn)。
早期胃癌外周血組P16、E-cad和hMLH1基因啟動(dòng)子甲基化率分別為51.81%、46.99%和43.37%;胃癌前病變外周血組則分別為 37.84%、29.72%和29.72%;正常對(duì)照組分別為0、0和0,見(jiàn)表1。
聯(lián)合檢測(cè)P16、E-cad和hMLH1基因啟動(dòng)子甲基化狀態(tài),以任一基因表達(dá)陽(yáng)性即判定為陽(yáng)性。結(jié)果顯示,聯(lián)合基因甲基化在早期胃癌組陽(yáng)性率為77.11%,癌前病變組為56.76%,見(jiàn)表1。
表1 外周血中P16、E-cad和hMLH1的甲基化(例,%)
早期胃癌外周血組中P16、E-cad和hMLH1甲基狀態(tài)與早期胃癌患者的性別、年齡、腫瘤位置、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、分期均無(wú)關(guān)(P >0.05),見(jiàn)表2。
盡管胃癌的治療水平有顯著的進(jìn)步,然而診斷胃癌時(shí)常處于較晚期,其預(yù)后很不理想。因此,有效的胃癌早期診斷生物標(biāo)志物是迫切需要的。在散發(fā)性胃癌的發(fā)病中,表遺傳學(xué)改變比遺傳學(xué)改變占有更重要的地位。近20年的研究發(fā)現(xiàn),作為表遺傳學(xué)的重要組成部分,DNA甲基化是腫瘤中最常見(jiàn)的分子改變之一,5'CpG島甲基化致抑癌基因失活是引起細(xì)胞惡化的重要步驟[2-4]。由于CpG島的局部高度甲基化早于細(xì)胞的惡性增生,因此,甲基化的診斷可以用于腫瘤發(fā)生的早期預(yù)測(cè)。國(guó)內(nèi)劉文天等做了關(guān)于DNA甲基化在胃癌診斷中的研究[5]。
有研究發(fā)現(xiàn)外周血游離DNA具有腫瘤細(xì)胞DNA的一些特征,因而提出腫瘤患者血液游離DNA可能源自腫瘤細(xì)胞[6-8]?,F(xiàn)已證實(shí),腫瘤患者血液中,具有腫瘤生物學(xué)特征的DNA主要來(lái)源于腫瘤細(xì)胞壞死集凋亡后自然散發(fā)或增生活躍時(shí)自動(dòng)釋放。因而可以通過(guò)檢測(cè)外周血DNA甲基化狀態(tài)來(lái)推測(cè)細(xì)胞的生物學(xué)特征。簡(jiǎn)言之,通過(guò)檢測(cè)某些抑癌基因甲基化情況來(lái)篩查早期腫瘤[9-10]。我們研究發(fā)現(xiàn)早期胃癌組外周血中P16、E-cad和hMLH基因啟動(dòng)子甲基化率明顯高于癌前病變組及健康人群組(P<0.05),該研究結(jié)果提示通過(guò)檢測(cè)外周血DNA甲基化狀態(tài)對(duì)于胃癌的早期診斷具有重要意義。腫瘤的發(fā)生是多種因素相互調(diào)控、共同作用的結(jié)果,單一基因的改變都不足以引起細(xì)胞的惡性轉(zhuǎn)化和發(fā)展,因而本研究選取P16、E-cad和hMLH1這三個(gè)有代表性的基因進(jìn)行研究。本研究結(jié)果顯示聯(lián)合檢測(cè)早期胃癌患者外周血P16、E-cad和hMLH基因啟動(dòng)子甲基化率均明顯高于單個(gè)基因的檢測(cè)(P<0.05)。因此可以通過(guò)聯(lián)合多個(gè)基因的檢測(cè)來(lái)提高檢測(cè)敏感性。本研究還發(fā)現(xiàn),外周血P16、E-cad和hMLH基因啟動(dòng)子甲基化狀態(tài)與患者的性別、年齡、腫瘤大小、TNM分期均無(wú)關(guān)(P>0.05),因而外周血P16、E-cad和hMLH基因啟動(dòng)子甲基化檢測(cè)可以成為判斷預(yù)后的獨(dú)立因子。由于我們研究選取對(duì)象均是早期胃癌患者,因而本研究結(jié)果更能證實(shí)P16、E-cad和hMLH基因啟動(dòng)子甲基化對(duì)胃癌的早期診斷具有重要價(jià)值。
表2 外周血P16、E-cad和hMLH1甲基化與胃癌臨床病理的關(guān)系/例
[1]He D,Zhang YW,Zhang NN,et al.Aberrant gene promoter methylation of p16,F(xiàn)HIT,CRBP1,WWOX,and DLC-1 in Epstein-Barr virus-associated gastric carcinomas〔J〕.Med Oncol,2015,32(4):525-529.
[2]Gebhard C,Benner C,Ehrich M,et al.General transcription factor binding at CpG islands in normal cells correlates with resistance tode novoDNA methylation in cancer cells〔J〕.Cancer Res,2010,70(4):1398-1407.
[3]Portela A,Liz J,Nogales V,et al.DNA methylation determines nucleosome occupancy in the 5'-CpG islands of tumor suppressor genes〔J〕.Oncogene,2013,32(47):5421-5428.
[4]Irizarry RA,Ladd-Acosta C,Wen B,et al.The human colon cancer methylome shows similar hypo-and hypermethylation at conserved tissue-specific CpG island shores〔J〕.Nat Genet,2009,41(2):178-186.
[5]劉文天,焦煥利,楊玉龍.鈣粘蛋白基因高甲基化與胃癌發(fā)生、發(fā)展的關(guān)系〔J〕.癌癥,2007,26(11):1199-1203.
[6]Martinez-Galan J,Torres B,Del Moral R,et al.Quantitative detection of methylated ESR1 and 14-3-3-sigma gene promoters in serum as candidate biomarkers for diagnosis of breast cancer and evaluation of treatment efficacy〔J〕.Cancer Biol Ther,2008,7(6):958-965.
[7]Glockner SC,Dhir M,Yi JM,et al.Methylation of TFPI2 in stool DNA:a potential novel biomarker for the detection of colorectal cancer〔J〕.Cancer Res,2009,69(11):4691-4699.
[8]Papageorgiou EA,F(xiàn)iegler H,Rakyan V,et al.Sites of differential DNA methylation between placenta and peripheral blood:molecular markers for noninvasive prenatal diagnosis of aneuploidies〔J〕.Am J Pathol,2009,174(5):1609-1618.
[9]Leung WK,To KF,Man EP,et al.Quantitative detection of promoter hypermethylation in multiple genes in the serum of patients with colorectal cancer〔J〕.Am J Gastroenterol,2005,100(10):2274-2279.
[10]Vatandoost N,Ghanbari J,Mojaver M,et al.Early detection of colorectal cancer:from conventional Methods to novel biomarkers〔J〕.J Cancer Res Clin Oncol,2015,(2):132-136.