大數(shù)據(jù)視角下的臨床醫(yī)學學科服務

趙志清 鄒立君

(華中科技大學圖書館醫(yī)學分館 武漢 430030)

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大數(shù)據(jù)視角下的臨床醫(yī)學學科服務

趙志清 鄒立君

(華中科技大學圖書館醫(yī)學分館 武漢 430030)

探討大數(shù)據(jù)時代下的臨床醫(yī)學學科服務，包括臨床研究和臨床醫(yī)療兩個方面，指出開發(fā)利用醫(yī)療大數(shù)據(jù)要求學科館員和醫(yī)生具有一定的信息素養(yǎng)，對學科館員和醫(yī)生信息素養(yǎng)的提升提出建議。

大數(shù)據(jù)；臨床醫(yī)學；學科服務

1 引言

隨著計算機技術(shù)的飛速發(fā)展，人們獲得、儲存、分析和應用數(shù)據(jù)的能力不斷增強，大數(shù)據(jù)時代已悄然來臨并帶來了生活、工作和思維的大變革。如今大數(shù)據(jù)應用在許多國家和地區(qū)的眾多領域，如在生物醫(yī)藥領域，美國、歐洲和日本分別建立了世界3大生物數(shù)據(jù)中心，即美國國家生物技術(shù)信息中心(National Center for Biotechnology Information，NCBI)，歐洲生物信息研究所(European Bioinformatics Institute，EBI)和日本DNA數(shù)據(jù)庫(DNA Data Bank of Japan，DDBJ)。中國政府也認識到大數(shù)據(jù)的重要意義，李克強總理2014年11月15日提出在疾病防治、災害預防、社會保障和電子政務等領域開展大數(shù)據(jù)應用示范，這為醫(yī)務工作者們打開了生物醫(yī)學大數(shù)據(jù)共享的大門。

大數(shù)據(jù)時代下信息呈爆炸式增長，據(jù)統(tǒng)計，每年有超過200萬篇文獻在21 000余種生物醫(yī)學期刊上發(fā)表，且以每年4%的速度遞增。如何在信息海洋中有效而準確地獲取本專業(yè)的最前沿信息，應用于自身臨床工作和科學研究，提高工作和科研效率，是急需解決的問題，也成為醫(yī)學圖書館開展臨床醫(yī)學學科服務的關(guān)鍵環(huán)節(jié)。

2 大數(shù)據(jù)臨床醫(yī)學學科服務

2.1 大數(shù)據(jù)臨床研究學科服務

2.1.1 調(diào)查用戶需求 提供學科服務的前提是知道對方需要什么，因此學科館員首先要開展需求調(diào)查，通過問卷、深入座談及參加科室研討會等形式，了解醫(yī)生的信息行為，獲取信息的途徑和使用圖書館資源的頻率及偏好等，掌握其主要研究方向和內(nèi)容，以及希望從圖書館和館員處獲得哪些幫助。各臨床專科研究的疾病不同，但也存在交叉，如肺癌可進行內(nèi)科治療，也可進行外科治療，學科館員在深入了解各課題組的研究內(nèi)容后，可將有類似研究領域的服務對象分門別類，劃分成不同的小組，這樣更有利于開展針對性學科服務，也有利于不同領域?qū)＜业膶W術(shù)爭論與合作，激發(fā)創(chuàng)新點，促進研究更快發(fā)展。

2.1.2 搭建對口數(shù)據(jù)平臺 北京市神經(jīng)外科研究所張亞卓認為，大數(shù)據(jù)時代下的醫(yī)學科研應該具有3個主要特點：一是臨床醫(yī)學資源發(fā)現(xiàn)、收集、整理和利用(標準化、科學化)；二是大樣本、多中心的臨床研究(病因、診斷、治療及藥物開發(fā))；三是依托臨床信息的生物醫(yī)學資源整理、利用及研究(基因、蛋白和代謝)[1]?？梢姶髷?shù)據(jù)的整理是良好利用的前提，并且要開展機構(gòu)間的合作，擴大大數(shù)據(jù)的范圍，實現(xiàn)更大范圍的數(shù)據(jù)共享。學科館員可根據(jù)醫(yī)生的需求，盡量豐富對口館藏資源；收集服務對象對口的大數(shù)據(jù)資源，如生物醫(yī)學大型通用數(shù)據(jù)庫等；輔助醫(yī)生收集整合本院數(shù)據(jù)，建立具有?？铺厣男?shù)據(jù)庫，開展合作，統(tǒng)一標準，逐步擴大數(shù)據(jù)量；定向追蹤競爭對手科研信息。國家科學圖書館機構(gòu)知識庫、清華大學ArnetMiner和愛思唯爾(Elsevier)的Mendeley等都是很受關(guān)注的學術(shù)網(wǎng)絡分析挖掘系統(tǒng)，館員可參考其功能設計，將上述資源整合到一個平臺上，與醫(yī)生共同豐富平臺資源，提高館員工作效率和醫(yī)生科研效率。適用于某一臨床醫(yī)學?？频臄?shù)據(jù)庫或大數(shù)據(jù)處理平臺非一朝一夕就能建成，因此，館員要持續(xù)關(guān)注現(xiàn)有大數(shù)據(jù)平臺發(fā)布的相關(guān)信息，輔助醫(yī)生為其添磚加瓦，擴大數(shù)據(jù)覆蓋面積，要積極利用圖書館現(xiàn)有數(shù)據(jù)資源和數(shù)據(jù)處理能力，開展優(yōu)質(zhì)學科服務。

2.1.3 利用平臺輔助研究和成果發(fā)表 醫(yī)療大數(shù)據(jù)可應用于疾病診斷和治療研究，如采用目的序列捕獲測序技術(shù)對已知的特定基因組區(qū)域設計探針，捕獲后測序，分析人類基因組中相關(guān)區(qū)域與疾病的相關(guān)性；可應用于疾病流行病學研究，如利用大數(shù)據(jù)挖掘某些地區(qū)大氣污染物與惡性腫瘤發(fā)病和死亡的相關(guān)性；還可應用于藥物副作用分析等方面，如從大量病人數(shù)據(jù)中挖掘到與某種藥物相關(guān)的不良反應或從社交網(wǎng)絡中搜索服用某種藥物的不良反應記錄。學科館員的數(shù)據(jù)挖掘應圍繞這些方面展開，針對課題組的研究方向有的放矢。學科館員可借助湯森路透數(shù)據(jù)分析(Thomson Data Analyzer,TDA)等情報分析工具和科學引文索引(Science Citation Index,SCIE)、期刊引用報告(Journal Citation Reports,JCR)或基本科學指標(Essential Science Indicators, ESI)等數(shù)據(jù)庫中的分析功能，采用文獻計量分析等方法，挖掘某一領域的研究熱點、核心期刊、高被引文獻、核心人員、核心機構(gòu)和專利申請情況等，幫助醫(yī)生們掌握自身研究領域的最新進展和發(fā)展動態(tài)，遴選投稿雜志，選擇合作人員和機構(gòu)，跟蹤競爭對手，發(fā)現(xiàn)學科交叉創(chuàng)新點，過濾已有研究觀點和專利，提高研究創(chuàng)新性和專利申請成功率。學科館員需要對海量信息進行剔重、過濾、歸納、推理及聯(lián)想，發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)間的內(nèi)在關(guān)聯(lián)，發(fā)掘潛在的有價值的數(shù)據(jù)，以圖表等直觀形式展示給醫(yī)生。

2.1.4 利用平臺匯總科研成果 2011年美國國家科學基金會(National Science Foundation，NSF)要求所有基金申請者必須提交包括數(shù)據(jù)的長期保存、訪問方式與共享等內(nèi)容的研究數(shù)據(jù)管理計劃[2]，提醒研究者們要有意識地匯總保存自己的研究數(shù)據(jù)。學科館員可協(xié)助建立課題組和醫(yī)生個人研究檔案，使其研究均有跡可循，輔助課題申請和成果發(fā)表，使其研究成果(論文、專利和獲獎情況等)一目了然，隨時可用于成果鑒定或報獎。

2.2 大數(shù)據(jù)臨床醫(yī)療學科服務

2.2.1 挖掘醫(yī)療大數(shù)據(jù)輔助臨床診療 ?？漆t(yī)生不可能也沒必要通曉所有?？萍膊≈R，當遇到疑難雜癥或需跨?？圃\療時，在擁有大型臨床數(shù)據(jù)系統(tǒng)的理想情況下，可將病人的各項指標輸入臨床數(shù)據(jù)系統(tǒng)，通過挖掘提供相似病例或可能診斷，再結(jié)合病人的具體情況和醫(yī)生的經(jīng)驗進一步進行鑒別，制定較佳臨床診療路徑，降低醫(yī)療成本和病人經(jīng)濟負擔。若臨床數(shù)據(jù)系統(tǒng)中沒有此類病例，醫(yī)生可收集其整套記錄并錄入系統(tǒng)，豐富大數(shù)據(jù)系統(tǒng)的內(nèi)容，供他人借鑒。但建立標準、大型的臨床數(shù)據(jù)系統(tǒng)存在一定困難，美國特拉華大學生物信息學和計算機生物學中心吳慧華主任表示，不同系統(tǒng)和科研機構(gòu)之間難以實現(xiàn)標準化的數(shù)據(jù)共享和分析是生物醫(yī)學與信息科學結(jié)合過程中遇到的關(guān)鍵難題[3]。如一個病人會在不同醫(yī)院就診，但各家醫(yī)院擁有各自的電子病歷系統(tǒng)，疾病資料不能被便捷共享，醫(yī)生要調(diào)閱某個病人某一疾病自始至終的發(fā)生發(fā)展過程及治療經(jīng)歷幾乎沒有可能，從一定程度上妨礙了疾病的快速診斷和治療。建立臨床數(shù)據(jù)系統(tǒng)還涉及病人的隱私安全問題，由于國內(nèi)缺乏相關(guān)法律法規(guī)，使信息安全和保密等無法可依。另外，各國語言不同和非結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)需要被結(jié)構(gòu)化處理等，也阻礙了大數(shù)據(jù)的形成和利用。

2.2.2 匹配小數(shù)據(jù) 醫(yī)學的服務對象是人，由于個體情況千差萬別，即使患有同一種疾病，表征也可有不同，因此在醫(yī)療大數(shù)據(jù)使用中，要兼顧病人的個體差異，利用大數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn)規(guī)律并用小數(shù)據(jù)匹配個人，尋找最佳診療方式。如肺癌術(shù)后，可將手術(shù)方式、轉(zhuǎn)移情況、KRAS狀態(tài)、病理分型和標志物類型等匹配大數(shù)據(jù)，尋找適合的化療藥物和方案，再根據(jù)病人對藥物的敏感性和經(jīng)濟條件等個人特點，選擇最佳的化療藥物和方案。

2.2.3 提供健康信息服務 無論是健康人群還是病人及其家屬，都希望獲取健康信息，以促進健康或減輕痛苦，尤其是患有兒科疾病、慢性病和腫瘤等的病人和家屬，更迫切地想了解疾病相關(guān)知識，但統(tǒng)計顯示我國居民健康素養(yǎng)仍處于較低水平。國家衛(wèi)生和計劃生育委員會2014年12月17日發(fā)布的報告顯示，2008年我國居民健康素養(yǎng)水平為6.48%，2012年為8.80%，2013年為9.48%[4]，雖然逐年有所增加，但仍有待提高。學科館員可協(xié)助醫(yī)生設立健康信息服務網(wǎng)頁、微信或博客等，普及本?？萍膊』虺Ｒ姴〉脑\療相關(guān)知識。彭琰等[5]認為健康信息還可包括各種治療方案及其效果的描述、選擇醫(yī)院和醫(yī)生的方法、健康保險和替代療法等相關(guān)信息。健康信息服務就像在醫(yī)生和病人之間架起一座溝通的橋梁，可以提高病人及家屬的健康素養(yǎng)水平，減輕對疾病的恐懼，幫助他們正確面對疾病，從而積極配合醫(yī)生、護士的治療和護理，緩解醫(yī)患關(guān)系。

3 學科館員和醫(yī)生信息素養(yǎng)的提升

3.1 概述

開發(fā)利用醫(yī)療大數(shù)據(jù)需要館員和醫(yī)生們具有一定的信息素養(yǎng)，包括信息意識、信息知識、信息能力和信息道德。國外高校圖書館科學數(shù)據(jù)素養(yǎng)教育是從數(shù)據(jù)的生命周期角度出發(fā)，圍繞科研流程所需的技能展開[6]，值得借鑒。

3.2 學科館員信息素養(yǎng)的提升

由通曉生物醫(yī)學和信息科學的復合型人才擔任臨床醫(yī)學學科館員是最佳選擇，他們能更好地解決生物醫(yī)學大數(shù)據(jù)利用中的融合問題。雖然國內(nèi)許多高校順勢而為，開設了醫(yī)學信息學專業(yè)，培養(yǎng)了許多跨學科人才，但遠遠不能滿足需求，現(xiàn)實情況是醫(yī)院或醫(yī)學院圖書館員往往只具備信息科學背景。因此學科館員要在學科服務的過程中不斷增長生物醫(yī)學知識，但更需培養(yǎng)對網(wǎng)絡資源、數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)挖掘能力，輔助醫(yī)生做出決策。特別要注意的是信息道德的培養(yǎng)，在學科服務過程中，學科館員會接觸到服務對象的隱私和研究信息等，對這些信息要保密，不能隨意泄露。

3.3 醫(yī)生信息素養(yǎng)的提升

醫(yī)生往往不具備信息科學背景，但在工作和科研的過程中，會逐漸掌握一些信息技能，一般都不系統(tǒng)。一些機構(gòu)面向醫(yī)務工作者開展了針對性培訓，內(nèi)容涉及信息檢索、組織、評價與利用、數(shù)據(jù)挖掘等方面，如中國醫(yī)科大學醫(yī)學信息學院開發(fā)的衛(wèi)生人員信息素質(zhì)培訓平臺向醫(yī)生提供系統(tǒng)化信息素養(yǎng)培訓，取得了良好效果。醫(yī)院和圖書館應加強相互合作和資源共享，學科服務的介入使得醫(yī)生可以借助學科館員的信息能力，輔助其科研和臨床工作，同時也使學科館員能更快、更準地獲得所需的醫(yī)學知識，互相促進，共同進步。

4 結(jié)語

大數(shù)據(jù)時代既是臨床醫(yī)學學科服務的機遇也是挑戰(zhàn)，學科館員要充分認識大數(shù)據(jù)的重要性，掌握大數(shù)據(jù)挖掘的方法，豐富自身醫(yī)學知識，利用現(xiàn)有資源的同時，盡力開發(fā)新資源，逐步開展優(yōu)質(zhì)化的學科服務。但信息的爆炸式增長不可避免地會使劣質(zhì)數(shù)據(jù)越來越多，數(shù)據(jù)質(zhì)量問題及其所導致的知識和決策錯誤已經(jīng)在全球范圍內(nèi)顯現(xiàn)，如美國由于數(shù)據(jù)錯誤而引發(fā)的醫(yī)療事故每年可導致約98 000人死亡，約占全部醫(yī)療事故致死人數(shù)的50%[7]。因此學科館員應和醫(yī)生一同去辨?zhèn)未嬲妫苊饬淤|(zhì)數(shù)據(jù)的不良影響，促進臨床和研究工作的良性發(fā)展。

1 張亞卓.醫(yī)療大數(shù)據(jù) 臨床怎么用[J]. 吉林醫(yī)學信息, 2014,30(8):32-34.

2 肖健,李焱,馮占英,等. 大數(shù)據(jù)及其對醫(yī)學圖書館的啟示[J]. 中華醫(yī)學圖書情報雜志, 2014,23(4):29-34.

3 王慶. 大數(shù)據(jù)：生物醫(yī)學的待解之題[N]. 工人日報, 2013-03-22(6).

4 中華人民共和國國家衛(wèi)生和計劃生育委員會. 2013年我國居民健康素養(yǎng)水平提高至9.48%[EB/OL]. [2014-12-17].http://www.nhfpc.gov.cn/xcs/s3582/201412/971753f 8b9504caba6e081cb88cf6a58.shtml.

5 彭琰,嚴莉,朱紅. 大數(shù)據(jù)時代用戶健康信息學的價值[J]. 醫(yī)學信息學雜志, 2014, 35(1):2-6.

6 孟祥保,李愛國. 國外高校圖書館科學數(shù)據(jù)素養(yǎng)教育研究[J]. 大學圖書館學報, 2014, (3):11-16.

7 Kohn L T, Corrigan J M, Donaldson M S. To Err is Human: building a safer health system [M]. Washington: National Academies Press, 2000.

2016年《醫(yī)學信息學雜志》征訂啟事

《醫(yī)學信息學雜志》是國內(nèi)醫(yī)學信息領域創(chuàng)刊最早的醫(yī)學信息學方面的國家級期刊。主管：國家衛(wèi)生和計劃生育委員會；主辦：中國醫(yī)學科學院；承辦：中國醫(yī)學科學院醫(yī)學信息研究所。中國科技核心期刊(中國科技論文統(tǒng)計源期刊)，RCCSE中國核心學術(shù)期刊(武漢大學中國科學評價研究中心，Research Center for Chinese Science Evaluation)，美國《化學文摘》、《烏利希期刊指南》及WHO西太區(qū)醫(yī)學索引(WPRIM)收錄，并收錄于國內(nèi)3大數(shù)據(jù)庫。主要欄目：專論，醫(yī)學信息技術(shù)，醫(yī)學信息研究，醫(yī)學信息組織與利用，醫(yī)學信息教育，動態(tài)等。讀者對象：醫(yī)學信息領域?qū)＜覍W者、管理者、實踐者，高等院校相關(guān)專業(yè)的師生及廣大醫(yī)教研人員。

2016年《醫(yī)學信息學雜志》國內(nèi)外公開發(fā)行，每冊定價：15元(月刊)，全年180元。郵發(fā)代號：2-664，全國各地郵局均可訂閱。也可到編輯部訂購：北京市朝陽區(qū)雅寶路3號(100020)醫(yī)科院信息所《醫(yī)學信息學雜志》編輯部；電話：010-52328673,52328674，52328671。

《醫(yī)學信息學雜志》編輯部

Subject Service of Clinical Medicine from the Perspective of Big Data

ZHAOZhi-qing,ZOULI-jun,

MedicalLibrary,HuazhongUniversityofScienceandTechnologyLibrary,Wuhan430030,China

The paper discusses the subject service of clinical medicine in the age of big data, including two aspects: clinical research and clinical medical treatment. It points out that the development and utilization of medical big data require for subject librarians and doctors with certain information literacy and proposes suggestion for enhancing the information literacy of subject librarians and doctors.

Big data；Clinical medicine；Subject service

2015-06-26

趙志清，碩士，中級職稱，發(fā)表論文6篇。

R-056

A 〔DOI〕10.3969/j.issn.1673-6036.2015.10.017