易 輝,李 燕
(成都中醫(yī)藥大學(xué)醫(yī)學(xué)技術(shù)學(xué)院,四川成都611130)
表皮葡萄球菌生物膜形成中細(xì)胞間多糖黏附素的調(diào)控機(jī)制研究進(jìn)展
易 輝,李 燕*
(成都中醫(yī)藥大學(xué)醫(yī)學(xué)技術(shù)學(xué)院,四川成都611130)
近年來由于醫(yī)療植入物如導(dǎo)管、人工心瓣膜、人工關(guān)節(jié)等的廣泛應(yīng)用以及人口老齡化及免疫力低下人群的出現(xiàn)等因素,表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermidis,SE)導(dǎo)致的生物膜相關(guān)性疾病逐年上升,至今尚無藥物能有效地控制這類感染。細(xì)菌生物膜的形成是一個多基因調(diào)控、多因子參與的延續(xù)性過程,包括初始黏附、聚集、成熟、脫落四個階段,而細(xì)胞間多糖黏附素(polysaccharide intercellular adhesion,PIA)是存在于細(xì)菌細(xì)胞表面的多糖黏附因子,在SE生物膜形成過程中的細(xì)菌聚集階段發(fā)揮十分重要作用。因此,深入研究SE生物膜形成中PIA的調(diào)控機(jī)制對治療SE引起的生物膜感染意義重大。
PIA是存在于細(xì)菌細(xì)胞表面長達(dá)130個糖基的β-1,6-2-脫氧-2-氨基-D-吡喃葡萄糖糖鏈,其中大于80%的殘基去乙?;?。PIA不僅能介導(dǎo)細(xì)菌間黏附形成生物膜,而且參與細(xì)菌感染宿主的過程,如保護(hù)細(xì)菌抵抗宿主β防御素3、IL-37等抗菌肽天然免疫組分的識別清除等。同時PIA也是SE生物膜基質(zhì)中對抗人體免疫系統(tǒng)的第一道防線,是SE逃逸免疫攻擊和毒力所必需的[1]。
PIA主要是由ica基因編碼的酶蛋白催化合成的[2]。ica操縱子包含四個功能基因icaA、icaD、icaB、icaC和一個調(diào)節(jié)基因icaR。icaA編碼的IcaA是一種跨膜的N-乙酰氨基葡糖轉(zhuǎn)移酶,與IcaD的結(jié)合可顯著增強(qiáng)其酶活性,合成最長不超過20個殘基的N-乙酰葡糖胺低聚物,在IcaC的作用下,低聚物才能組成更長的鏈狀多聚物,而且IcaC很可能涉及到把不斷合成的多糖物質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)至細(xì)胞的表面,IcaB負(fù)責(zé)脫去N-乙酰葡糖胺多聚物中的乙?;蛊淠軌蚋街郊?xì)菌細(xì)胞表面介導(dǎo)生物膜的形成。IcaR屬于四環(huán)素阻遏蛋白家族,位于icaADBC操縱子的上游區(qū)域,能表達(dá)出轉(zhuǎn)錄抑制蛋白,其核心作用在于高效地負(fù)調(diào)節(jié)icaADBC操縱子的轉(zhuǎn)錄,減少PIA的形成[3]。
ica基因的表達(dá)受到許多因子的調(diào)控,包括雙組份信號轉(zhuǎn)導(dǎo)系統(tǒng)、密度信號感應(yīng)系統(tǒng)、全局調(diào)控因子(Sar蛋白家族、SigB、Spx等)等。在不同種屬間ica的調(diào)控機(jī)制不同,即使在同一種屬不同菌株間ica的調(diào)控機(jī)制也不同,特別值得注意的是在不同實驗條件下誘導(dǎo)形成的生物膜及其ica表達(dá)是不完全相同的。例如,許多研究是在體外使用標(biāo)準(zhǔn)96微孔板分析生物膜的形成,其中有些研究者使用的是未經(jīng)處理的平板,而有些研究者是在平板中添加血清使得生物膜形成的環(huán)境更接近于人體內(nèi)[4]。這些不同的實驗條件造成了各個實驗結(jié)果之間比較的復(fù)雜性。并且,目前對于SE中ica調(diào)控機(jī)制的研究結(jié)果幾乎都是基于體外模型或者動物模型,這都不能完全反應(yīng)人體內(nèi)生物膜感染的實際情況。盡管存在這些缺陷,這些研究結(jié)果還是顯示了生物膜形成中ica表達(dá)的重要性。
3.1 雙組份信號轉(zhuǎn)導(dǎo)系統(tǒng)調(diào)控ica基因的表達(dá)
雙組分信號轉(zhuǎn)導(dǎo)系統(tǒng)是在原核生物界廣泛存在且保守的一類系統(tǒng),不僅參與調(diào)控細(xì)菌基本生命活動和很多重要的生理功能,并且與很多病原菌的毒力和致病性(尤其是細(xì)菌生物膜形成)密切相關(guān),一般包括一個作為感受器的組氨酸蛋白激酶和一個作為效應(yīng)器的調(diào)節(jié)蛋白。當(dāng)外界信號作用于組氨酸蛋白激酶的膜外配體結(jié)合區(qū)時,激活激酶的ATP結(jié)合位點,從而結(jié)合、水解ATP為ADP,并將ATP的磷酸基團(tuán)轉(zhuǎn)移到激酶HisKA功能域的組氨酸位點,使其發(fā)生自身磷酸化。隨后反應(yīng)調(diào)節(jié)蛋白調(diào)控區(qū)域能夠與磷酸化的組氨酸蛋白激酶相互作用,將激酶上的磷酸基團(tuán)轉(zhuǎn)移到自身天冬氨酸位點上,發(fā)生自身磷酸化并激活效應(yīng)區(qū),使其構(gòu)象改變而暴露DNA結(jié)合位點,結(jié)合其靶DNA序列,從而產(chǎn)生一系列調(diào)控反應(yīng)。
目前發(fā)現(xiàn)在SE中存在16-17對雙組份信號轉(zhuǎn)導(dǎo)系統(tǒng),包括ArlSR、SrrAB、SaeSR等。劉敬然等[5]通過構(gòu)建ArlR的原核表達(dá)質(zhì)粒,并以純化ArlR作為抗原免疫小鼠,獲得相應(yīng)的多克隆抗體,然后采用蛋白免疫印跡法檢測SEl457野生株在生長期不同時間點ArlR的表達(dá)水平,結(jié)果顯示在SE生物膜形成細(xì)菌聚集階段ArlR蛋白的表達(dá)和arlR的轉(zhuǎn)錄水平均達(dá)到高峰,提示ArlRS可能通過調(diào)控ica的表達(dá)而影響PIA的合成。Yang等[6]用同源重組法構(gòu)建了ArlRS缺失突變株,發(fā)現(xiàn)缺失株不能形成生物膜,并通過基因芯片和實時定量PCR檢測證明缺失株中icaADBC的表達(dá)水平明顯降低,而在缺失株中過表達(dá)icaADBC可以恢復(fù)其生物膜形成能力。最后通過凝膠遷移阻滯實驗發(fā)現(xiàn)ArlR可以與ica操縱子的啟動子區(qū)結(jié)合,表明ArlRS可以直接上調(diào)ica操縱子的轉(zhuǎn)錄促進(jìn)PIA合成。武勇聰?shù)龋?]采用溫度敏感性質(zhì)粒pMAD敲除了SE1457srrA基因,發(fā)現(xiàn)srrA突變株與野生株相比,在有氧條件下生長明顯滯后,PIA合成減少,生物膜形成能力降低,對常用抗生素的敏感性無改變。然后利用激光共聚焦顯微鏡觀察到srrA突變株形成的生物膜較野生株薄,srrA回復(fù)株生長及生物膜形成能力均與野生株類似。最后采用qRT-PCR對影響生物膜形成的主要基因進(jìn)行轉(zhuǎn)錄譜分析,發(fā)現(xiàn)srrA突變株中icaR上調(diào)、icaA下調(diào),參與呼吸代謝的多個基因均下調(diào),這說明srrAB可以通過下調(diào)icaR的表達(dá)而上調(diào)icaA的表達(dá)促進(jìn)PIA合成。Qiang等[8]利用同源重組法構(gòu)建了saeSR刪除株,并對其生物學(xué)表型進(jìn)行了研究。生物膜半定量檢測法顯示saeSR刪除株生物膜形成能力明顯高于野生株,并發(fā)現(xiàn)saeSR可能是調(diào)控生物膜形成中的細(xì)菌聚集階段影響生物膜形成的,同時saeSR刪除株中生物膜PIA含量明顯高于野生株。但在后續(xù)saeSR刪除株基因與蛋白表達(dá)譜分析中,并沒有發(fā)現(xiàn)ica操縱子表達(dá)水平的變化。
3.2 密度信號感應(yīng)系統(tǒng)調(diào)控ica基因的表達(dá)
密度信號感應(yīng)系統(tǒng)是指細(xì)菌細(xì)胞密度依賴的細(xì)胞間信號機(jī)制,可以協(xié)調(diào)細(xì)菌特定基因的表達(dá),可調(diào)節(jié)毒力、二次代謝物的產(chǎn)生、細(xì)菌生物膜的形成以及細(xì)菌的存活,有利于細(xì)菌適應(yīng)環(huán)境壓力。目前,在SE中最重要的兩個密度信號感應(yīng)系統(tǒng)是輔助基因調(diào)節(jié)系統(tǒng)(accessory gene regulator,agr)和luxS系統(tǒng),但是,在SE中尚未發(fā)現(xiàn)agr系統(tǒng)可直接通過調(diào)控ica基因的表達(dá)而控制PIA的合成,與其相反的是,luxS基因可有效負(fù)調(diào)控ica操縱子的轉(zhuǎn)錄,顯著影響PIA的產(chǎn)量,從而抑制生物膜的形成。
luxS系統(tǒng)在環(huán)境變化時可以通過改變細(xì)菌細(xì)胞密度而影響細(xì)胞間信號轉(zhuǎn)導(dǎo),從而控制多種基因表達(dá),它是細(xì)菌硫代謝中參與甲基循環(huán)的代謝酶之一,可催化合成AI-2,AI-2是信號分子,廣泛存在于大多數(shù)細(xì)菌中[9]。Xu等[10]通過構(gòu)建luxS刪除株,發(fā)現(xiàn)刪除株比野生株的生物膜形成能力大大增強(qiáng),并且icaC的轉(zhuǎn)錄增加超過4倍,PIA的合成量增加3倍。而且在luxS基因回補(bǔ)株中或者是在刪除株中添加外源性的AI-2信號分子,ica的表達(dá)與PIA的合成量可以恢復(fù)至野生株水平。在中央靜脈插管感染模型中,刪除株比野生株表現(xiàn)出更大的毒力與致病性,這主要是因為刪除株中PIA合成明顯增多所致,這說明LuxS可以負(fù)調(diào)控ica的轉(zhuǎn)錄從而減少PIA合成,抑制生物膜形成。
3.3 全局調(diào)控因子調(diào)控ica基因的表達(dá)
SE生物膜形成中的全局調(diào)控因子包括Sar蛋白家族、SigB、Spx等。
3.3.1 Sar蛋白家族 目前在SE中的Sar蛋白家族主要有SarA、SarX、SarZ等。sarA基因表達(dá)的SarA蛋白是一種二聚DNA結(jié)合蛋白,擁有4個α螺旋的中心結(jié)構(gòu)和1個β折疊的結(jié)構(gòu)。在SE中,SarA調(diào)控ica的表達(dá),其對PIA的合成是必須的,SarA突變株不能形成生物膜[11]。Tormo等[12]構(gòu)建了SE sarA刪除株,發(fā)現(xiàn)無論是在靜止?fàn)顟B(tài)還是流動狀態(tài)下,sarA刪除株都不能形成生物膜。RT-PCR證實在sarA突變株中,icaADBC的表達(dá)明顯降低,而icaR的表達(dá)無明顯變化。阻滯凝膠電泳發(fā)現(xiàn)SarA與icaA的啟動子序列有很高的親和力,可以與之結(jié)合促進(jìn)ica的表達(dá)。SarX是一個新發(fā)現(xiàn)的全局調(diào)控因子,Row等[13]證實在SE CSF41498中SarX可以結(jié)合到同源agr啟動子上抑制agr的轉(zhuǎn)錄,促進(jìn)生物膜形成。在隨后的研究中Row等還發(fā)現(xiàn)SE CSF41498中SarX不僅可以與其agr P3啟動子結(jié)合促進(jìn)生物膜形成,而且可以直接與ica啟動子結(jié)合以ica依賴的方式促進(jìn)生物膜形成。然而RT-PCR結(jié)果卻顯示無論是sarX突變株還是sarX的過表達(dá)都能激活agr RNAⅢ的轉(zhuǎn)錄,所以這很難說明sarX對agr的調(diào)控作用。與之相反的是,RT-PCR和免疫印跡分析顯示了在sarX突變株中,icaA的轉(zhuǎn)錄和PIA的合成明顯下降,在sarX過表達(dá)株中,icaA的轉(zhuǎn)錄和PIA的合成明顯增多。SarZ與SE生物膜的毒力表達(dá)密切相關(guān),Wang等[14]利用高通量的分子篩檢測sarZ對生物膜形成相關(guān)基因的調(diào)控作用,發(fā)現(xiàn)在SE1457株中,sarZ可以通過調(diào)控ica基因的表達(dá)而控制PIA的合成。
3.3.2 SigB SE的sigB操縱子由rsbU,rsbV,rsbW和sigB四個基因組成,對sigB基因的調(diào)控是由復(fù)雜的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路控制,在此通路中RsbU,RsbV,RsbW在環(huán)境壓力下被激活,隨后調(diào)控sigB,其中RsbU和RsbV對sigB具有正調(diào)控作用,RsbW對sigB起負(fù)調(diào)控作用,這與枯草桿菌和金黃色葡萄球菌中sigB的調(diào)控作用具有同源性。無論是在體外還是體內(nèi),SigB對SE生物膜的形成意義重大[15]。Knobloch等[16]發(fā)現(xiàn)在SE sigB突變株中,icaADBC不能正常表達(dá),生物膜不能合成,并且在SE1457株和SE8400株中,RsbU的失活可以導(dǎo)致icaADBC的轉(zhuǎn)錄下降,因此認(rèn)為在某些環(huán)境壓力下(如高鹽),SE可以通過RsbU啟動sigB基因,減低icaR的表達(dá),促進(jìn)icaADBC的表達(dá),促進(jìn)PIA合成與生物膜形成。但是目前,無論是SE中還是金黃色葡萄球菌中,都沒有在ica操縱子中找到SigB的結(jié)合位點,提示sigB對ica的調(diào)控是間接的[17]。
3.3.3 ClpP與Spx SE基因組編碼的Clp蛋白酶(Clp proteases,ClpP)是一類ATP依賴的蛋白酶,具有糜蛋白酶活性,在切割蛋白過程中需要ATP的水解,而Spx為ClpP的酶活底物,它們在細(xì)菌應(yīng)對環(huán)境壓力時發(fā)揮作用。Wang等[18]發(fā)現(xiàn)在SE中,clpP基因的失活可導(dǎo)致其在小鼠模型中生物膜相關(guān)感染能力減弱,與野生株相比,clpP敲除株的附著能力下降了16倍,PIA的合成也明顯減少。在他們的后續(xù)研究中[19],又發(fā)現(xiàn)SE clpP基因敲除突變株中Spx蛋白顯著蓄積,并且在spx突變株中icaR的轉(zhuǎn)錄明顯下降而icaADBC的轉(zhuǎn)錄明顯上升,這提示Spx蛋白能夠抑制細(xì)菌的黏附聚集,并通過正調(diào)控icaR的表達(dá)而抑制icaADBC操縱子的轉(zhuǎn)錄,抑制生物膜形成。由于Spx為ClpP的酶活底物,我們可以推測ClpP調(diào)控SE生物膜形成的功能是通過特異性降解Spx實現(xiàn)的。
3.4 ygs調(diào)控ica基因的表達(dá)
Ygs是近來發(fā)現(xiàn)的一個新的調(diào)控SE生物膜形成的因子,它可以影響SE生物膜形成的聚集階段和對環(huán)境壓力的抵抗,在生物膜相關(guān)感染中對生物膜的結(jié)構(gòu)和生理功能發(fā)揮重要作用。Wang等[20]利用轉(zhuǎn)座子對臨床分離的生物膜陽性SE1457株構(gòu)建了隨機(jī)插入突變庫,通過生物膜半定量的方法篩查了大約1000個菌株,發(fā)現(xiàn)12個菌株的生物膜形成明顯缺陷,這12個菌株插入到11個不同的基因中,ygs是其中一個基因。隨后又對ygs突變株與野生株進(jìn)行比較分析,發(fā)現(xiàn)突變株的生物膜形成明顯缺陷且在生物膜形成的第二階段PIA的合成量也明顯減少,通過回復(fù)突變發(fā)現(xiàn)其生物膜形成能力能回復(fù)到野生株的水平,說明ygs是一個影響生物膜形成的新基因。實驗組又通過定量PCR方法進(jìn)一步檢測了ica的表達(dá)水平,發(fā)現(xiàn)在對數(shù)期野生株中icaB的表達(dá)水平是突變株的9倍,而icaR在突變株的表達(dá)水平是野生株的2-3倍,這說明ygs可以通過抑制icaR的表達(dá)來促進(jìn)icaADBC的轉(zhuǎn)錄,從而促進(jìn)PIA的合成與生物膜的形成。另外,在各種壓力下,包括熱,高pH,高鹽,乙醇等條件都可以使突變株的生長明顯比野生株要慢,這些都說明ygs基因參與了多種應(yīng)激條件的反應(yīng),且通過控制PIA的產(chǎn)量來影響生物膜的形成。而且,ygs基因在大鼠中央靜脈插管感染模型和小鼠皮下置管感染模型的致病性方面都發(fā)揮著重要的致病作用。
3.5 真核類絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶(serine/threonine protein kinase,stk)調(diào)控ica基因的表達(dá)
細(xì)菌Stk是一類依賴ATP的蛋白激酶,能把ATP上的γ-磷酸轉(zhuǎn)移到蛋白質(zhì)分子的絲氨酸、蘇氨酸殘基上,既可以磷酸化其他的蛋白質(zhì),也可催化自身磷酸化反應(yīng)。結(jié)構(gòu)分析發(fā)現(xiàn)Stk蛋白有兩個功能域,即蛋白激酶功能域和PASTA重復(fù)序列區(qū)功能域。STK激酶功能域主要參與對底物蛋白的磷酸化修飾,PASTA重復(fù)序列功能域可能與細(xì)胞壁的代謝有關(guān)。Liu等[21]利用同源重組構(gòu)建stk突變株,采用生物膜半定量法檢測生物膜形成,發(fā)現(xiàn)stk突變株生物膜的形成能力顯著下降。隨后將stk基因全長以及各功能域克隆到質(zhì)粒上,轉(zhuǎn)化入stk突變株獲得互補(bǔ)株,發(fā)現(xiàn)stk基因全長互補(bǔ)株和具有蛋白激酶功能域的互補(bǔ)株其生物膜表型回復(fù),而具有PASTA重復(fù)序列功能域的互補(bǔ)株對生物膜的形成則沒有作用。最后利用RT-PCR檢測生物膜相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄水平,發(fā)現(xiàn)stk是通過促進(jìn)ica操縱子的表達(dá)而增加PIA的合成,從而促進(jìn)生物膜形成。利用小鼠插管局部感染模型發(fā)現(xiàn)stk突變株感染小鼠后其在感染組織中的細(xì)菌數(shù)量明顯低于野生株,引起的炎癥反應(yīng)也明顯減弱。所以,stk在SE生物膜形成以及致病過程中都起著重要作用,stk的蛋白激酶功能域可以上調(diào)ica操縱子的表達(dá),從而促進(jìn)PIA合成及生物膜形成。
3.6 環(huán)境因子調(diào)控ica基因的表達(dá)
許多研究表明向培養(yǎng)基中添加額外的葡萄糖、乙醇、氯化鈉,都會增加葡萄球菌生物膜中PIA的合成,并且這一調(diào)控是發(fā)生在icaADBC轉(zhuǎn)錄之后[22]。Vuong等[23]發(fā)現(xiàn)在許多相同環(huán)境下,如高滲透壓(高糖、高鹽等)、高溫、乙醇等,都會誘導(dǎo)PIA的合成,并且這些條件都能抑制三羧酸循環(huán),所以Vuong等提出這些條件誘導(dǎo)PIA的合成是通過三羧酸循環(huán)這個中間物調(diào)控ica的表達(dá)實現(xiàn)的。acnA編碼的順烏頭酸酶是參與三羧酸循環(huán)中的一個重要的物質(zhì)。Sadykov等[24]發(fā)現(xiàn)在SE1457acnA突變株中,三羧酸循環(huán)被阻斷,而icaADBC的表達(dá)明顯增加,這說明高滲透壓、高溫、乙醇等環(huán)境因素可能是通過抑制三羧酸循環(huán)從而促進(jìn)icaADBC的表達(dá),促進(jìn)PIA合成與生物膜形成。還有一些抗生素(如四環(huán)素、慶大霉素等)的亞抑菌濃度也可以增強(qiáng)ica操縱子的轉(zhuǎn)錄,促進(jìn)PIA合成與生物膜形成[25-26]。
在SE生物膜形成過程中PIA起著非常重要的作用。PIA的合成主要受ica操縱子的調(diào)控,然而許多因子都調(diào)節(jié)著ica的表達(dá),所以PIA的調(diào)控機(jī)制非常復(fù)雜。同時生物膜的形成也不僅僅是依賴于PIA途徑,許多研究還發(fā)現(xiàn)存在獨(dú)立于PIA以外的蛋白依賴途徑,如Aap、Bhp、Embp途徑[27]。目前已發(fā)現(xiàn)大約有90%的SE攜帶aap基因,其表達(dá)產(chǎn)物Aap與生物膜形成密切相關(guān)。在無PIA合成的情況下,雖然僅有15%-45%的SE表達(dá)Bhp,但是Bhp也可以誘導(dǎo)SE細(xì)菌聚集及生物膜的形成。而Embp是一種能與細(xì)胞外基質(zhì)結(jié)合的大蛋白,可與纖連蛋白結(jié)合引起細(xì)胞間黏附從而使細(xì)菌形成生物膜。由此可見,SE生物膜的形成是一個復(fù)雜的過程,具有多種調(diào)控機(jī)制,需要更廣泛、更深入研究才能闡明。
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易輝(1991-),女,四川成都人,研究生在讀,主要從事細(xì)菌耐藥分子機(jī)制研究。
2015-03-04)
1007-4287(2015)09-1598-05
基因項目:四川省教育廳自然科學(xué)重點課題(10ZA084)
*通訊作者