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      一個(gè)為高分辨質(zhì)譜代謝組學(xué)數(shù)據(jù)提供快速預(yù)鑒別服務(wù)的微信公眾號(hào)

      2015-01-16 10:44:49
      質(zhì)譜學(xué)報(bào) 2015年6期
      關(guān)鍵詞:正離子負(fù)離子四物湯

      一個(gè)由軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院放射與輻射醫(yī)學(xué)研究所梁乾德博士開(kāi)發(fā)的微信公眾號(hào),目前公益性地提供基于四類數(shù)據(jù)庫(kù)(HMDB、SWTDB、SDRSDB/SDRUDB和HMUDB)的對(duì)小分子單個(gè)高分辨電噴霧離子化(ESI)質(zhì)譜質(zhì)荷比(m/z)數(shù)據(jù)進(jìn)行快速匹配檢索(預(yù)鑒別)的服務(wù)。用戶將待鑒別的m/z數(shù)值冠以數(shù)據(jù)庫(kù)標(biāo)識(shí)和離子模式標(biāo)識(shí),形成一個(gè)字符串,發(fā)送給公眾號(hào),可立即獲得預(yù)鑒別結(jié)果(即:可能的化學(xué)結(jié)構(gòu))。匹配的m/z偏差門限為10 ppm(即:待鑒別m/z值與數(shù)據(jù)庫(kù)m/z值差值的絕對(duì)值除以數(shù)據(jù)庫(kù)m/z值小于等于10 ppm)。

      該公眾號(hào)的HMDB數(shù)據(jù)庫(kù)是著名的“人類代謝組數(shù)據(jù)庫(kù)”(The Human Metabolome Database,網(wǎng)址是http:∥www.hmdb.ca/,縮寫(xiě)是HMDB)的衍生數(shù)據(jù)庫(kù)。是將“人類代謝組數(shù)據(jù)庫(kù)”(第二版)中收錄的8000余種代謝物,計(jì)算出每種代謝物在ESI條件下的4種常見(jiàn)負(fù)離子和6種常見(jiàn)正離子的理論質(zhì)荷比,從而形成的衍生數(shù)據(jù)庫(kù),可用于代謝物的鑒別。

      該公眾號(hào)的SWTDB數(shù)據(jù)庫(kù),是“四物湯相關(guān)植物化學(xué)成分理論質(zhì)荷比數(shù)據(jù)庫(kù)”(四物湯相關(guān)植物包括地黃屬、當(dāng)歸屬、芍藥屬和藁本屬植物)。是對(duì)文獻(xiàn)報(bào)道的1000余個(gè)四物湯相關(guān)植物化學(xué)成分,計(jì)算出每種化合物在ESI條件下的4種常見(jiàn)負(fù)離子和6種常見(jiàn)正離子的理論質(zhì)荷比,從而形成的數(shù)據(jù)庫(kù),可用于相關(guān)植物成分的鑒別。

      該公眾號(hào)的SDRSDB/SDRUDB數(shù)據(jù)庫(kù),是“Sprague Dawley大鼠血清/尿液固有成分(實(shí)測(cè)m/z信號(hào))數(shù)據(jù)庫(kù)”。HMUDB數(shù)據(jù)庫(kù)是“健康青年尿液固有成分(實(shí)測(cè)m/z信號(hào))數(shù)據(jù)庫(kù)”,可用于生物樣品中內(nèi)源性代謝物和外源性化學(xué)成分的辨別。

      更詳細(xì)信息可閱讀公眾號(hào)歷史消息中的詳細(xì)說(shuō)明,或與開(kāi)發(fā)者聯(lián)系(Email: liangqiande@yeah.net)。

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