王穎,王玉琴,楊成德,姚玉玲,陳秀蓉,薛莉
(甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)草業(yè)學(xué)院 草業(yè)生態(tài)系統(tǒng)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 甘肅省草業(yè)工程實(shí)驗(yàn)室 中-美草地畜牧業(yè)可持續(xù)發(fā)展研究中心,甘肅 蘭州730070)
我國(guó)是世界第二大草地資源國(guó)家,擁有天然草地近432 hm2,而在各類草地中,高寒草甸類草地面積最大,占全國(guó)草地總面積的17.77%;線葉嵩草(Kobresia capillifolia)是高寒草甸類草地的優(yōu)勢(shì)牧草之一[1],其大量的內(nèi)生細(xì)菌是挖掘優(yōu)良生物學(xué)功能菌株的微生物資源庫(kù)。隨著生態(tài)農(nóng)業(yè)和綠色食品生產(chǎn)的興起和發(fā)展,作物病蟲害的生物防治越來越受到人們的重視。已從小麥(Triticum aestivum)[2-3]、水稻(Oryza sativa)[4]、馬鈴薯(Solanum tuberosum)[5]、番茄(Lycopersicon esculentum)[6]、柑橘(Citrus reticulata)[7]、煙草(Nicotiana tabacum)[8]、大豆(Glycine max)[9]、棉花(Gossypium)[10]和油茶(Camellia oleifera)[11]等植物中分離得到拮抗內(nèi)生細(xì)菌。拮抗內(nèi)生細(xì)菌防治范圍廣,對(duì)細(xì)菌病害、真菌病害和線蟲病害都有一定的作用,因此,內(nèi)生細(xì)菌作為一種生防資源,已成為近年來生防菌劑研制開發(fā)的熱點(diǎn)[12-13]。不少學(xué)者對(duì)內(nèi)生細(xì)菌的生物學(xué)功能進(jìn)行了深入研究,發(fā)現(xiàn)內(nèi)生細(xì)菌不僅可以通過產(chǎn)生植物生長(zhǎng)素、赤霉素及細(xì)胞激動(dòng)素等植物促生物質(zhì)[14]來促進(jìn)植物生長(zhǎng),而且可以通過溶磷作用[15-16]和固氮作用[17-18]轉(zhuǎn)化無效營(yíng)養(yǎng)為有效營(yíng)養(yǎng),刺激和調(diào)控植物生長(zhǎng),增強(qiáng)植物抗病和抗逆能力等。因此,開發(fā)應(yīng)用內(nèi)生細(xì)菌資源不僅能解決化學(xué)農(nóng)藥和肥料帶來的諸多問題,還能保持農(nóng)田微生態(tài)系統(tǒng)多樣性,維持農(nóng)田生態(tài)平衡,提高作物產(chǎn)量,實(shí)現(xiàn)農(nóng)業(yè)的可持續(xù)發(fā)展。
馬鈴薯壞疽病(Phoma foveata)、炭疽病(Colletotrichum coccodes)和枯萎?。‵usarium avenaceum)是甘肅省馬鈴薯貯藏期最主要的病害,在重病區(qū)引起的爛薯率在30%以上[19-21]。因此,本研究以東祁連山高寒草地線葉嵩草內(nèi)生細(xì)菌為對(duì)象,以馬鈴薯貯藏期壞疽病菌、炭疽病菌和枯萎病菌為指示菌進(jìn)行了篩選,對(duì)拮抗細(xì)菌的分泌IAA、溶磷和固氮等能力進(jìn)行了評(píng)價(jià),并對(duì)其進(jìn)行16S r DNA序列鑒定,以期為線葉嵩草生防內(nèi)生細(xì)菌的利用與開發(fā)提供理論依據(jù),也為馬鈴薯貯藏期病害生物防治提供優(yōu)質(zhì)菌種資源。
1.1.1 供試拮抗細(xì)菌 2012年7月分離自東祁連山高寒草地線葉嵩草中的44株內(nèi)生細(xì)菌,現(xiàn)保存于甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)草業(yè)學(xué)院微生物多樣性實(shí)驗(yàn)室。
1.1.2 供試病原真菌 馬鈴薯炭疽病菌、馬鈴薯枯萎病菌和馬鈴薯壞疽病菌,由甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)草業(yè)學(xué)院植物病理實(shí)驗(yàn)室提供。
1.1.3 供試培養(yǎng)基 NA培養(yǎng)基、LB培養(yǎng)液、PDA培養(yǎng)基和金氏培養(yǎng)基按文獻(xiàn)[22]配制;PKO培養(yǎng)基、蒙金娜培養(yǎng)基[23]和阿須貝無氮培養(yǎng)基[24]分別按文獻(xiàn)的方法配制。
1.2.1 拮抗內(nèi)生細(xì)菌的篩選 采用平皿對(duì)峙法測(cè)定抑菌效果。將病原真菌(馬鈴薯枯萎病菌、馬鈴薯炭疽病菌和馬鈴薯壞疽病菌)打成直徑為6 mm的菌餅,接在PDA培養(yǎng)基中央,將內(nèi)生細(xì)菌點(diǎn)接在距菌餅2.5 cm處,每皿接4點(diǎn),以只接病原真菌為對(duì)照,3個(gè)重復(fù),置于25℃恒溫下培養(yǎng)8 d,測(cè)量抑菌帶并計(jì)算抑菌率,對(duì)拮抗能力強(qiáng)的菌株進(jìn)行以下試驗(yàn)。
1.2.2 對(duì)病原菌菌絲生長(zhǎng)的影響 采用平板對(duì)峙法于接種后8 d觀察病原菌菌絲形態(tài)并顯微照相。
1.3.1 培養(yǎng)性狀和形態(tài)特征 將拮抗內(nèi)生菌于NA平板劃單菌落,28℃下培養(yǎng)3 d后觀察并描述單菌落培養(yǎng)性狀;在NA平板上培養(yǎng)18~24 h后進(jìn)行革蘭氏染色、測(cè)量菌體大小并顯微照相。
1.3.2 16S r DNA序列鑒定 按上海生工提供的試劑盒(Ezup柱式基因組DNA抽提試劑盒,批號(hào):82561202)提取DNA并檢測(cè),對(duì)具有特異性DNA條帶的提取物進(jìn)行PCR擴(kuò)增。擴(kuò)增使用引物27F(5′-AGAGTTTGATCMTGGCTCAG-3′)和1492R(5′-GGTTACCTTGTTACGACTT-3′)。擴(kuò)增條件為:94℃預(yù)變性5 min,94℃變性1 min,48℃退火30 s,72℃延伸1 min,30個(gè)循環(huán);最后在72℃下延伸8 min,終止反應(yīng)。反應(yīng)體系:10×buffer(不含 MgCl2)5μL,MgCl2(25 mmol/L)3μL,d NTP(2.5 mmol/L)1μL,引物27F(10μmol/L)1 μL,引物1492R(10μmol/L)1μL,Taq酶 (2 U/μL)0.5μL,Target DNA(10 ng/μL)1.2μL,dd H2O定容至50μL。經(jīng)檢測(cè)具特異性條帶的擴(kuò)增產(chǎn)物送上海生工測(cè)序,所測(cè)序列與GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中序列進(jìn)行同源性對(duì)比,采用Clustal 1.8軟件和Mega 4.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,確定菌株的系統(tǒng)發(fā)育學(xué)地位。
1.4.1 產(chǎn)IAA能力的定性測(cè)定 采用Salkowski比色法[25]。將100μL菌懸液分別接到含100 mg/L色氨酸和不含色氨酸的金氏培養(yǎng)液中,設(shè)置3個(gè)重復(fù),以加等量無菌水的培養(yǎng)液為空白對(duì)照,于28℃、120 r/min恒溫振蕩培養(yǎng)12 d,后分別取50μL加入等量比色液(PC比色液或S2比色液),室溫靜置15 min后,觀察顯色反應(yīng),3個(gè)重復(fù)均變紅色表示能分泌IAA,否則不分泌IAA,顏色越深表示分泌數(shù)量越多。
1.4.2 產(chǎn)IAA能力的定量測(cè)定 采用純3-IAA 制作標(biāo)準(zhǔn)曲線。配制2組濃度依次為2.5,5.0,7.5,10.0,12.5,15.0,17.5 mg/L和25,50,75,100,125,150,175 mg/L的標(biāo)準(zhǔn)溶液,分別取4 m L,第1組中加等量PC比色液,另1組中加等量S2比色液,設(shè)置3個(gè)重復(fù),黑暗靜置30 min后測(cè)定其OD530值并制作標(biāo)準(zhǔn)曲線。將培養(yǎng)12 d的菌懸液和空白對(duì)照10000 r/min離心10 min,取上清液4 m L分別加入等量比色液,黑暗靜置30 min后測(cè)定OD530值,以只加比色液為空白對(duì)照。根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算菌株分泌IAA的量,并按照PC比色液和S2比色液的測(cè)定范圍最終確定結(jié)果[26]。
1.4.3 溶磷能力的定性測(cè)定 將263XY1分別點(diǎn)接于PKO和蒙金娜平板培養(yǎng)基上,每皿4個(gè)接菌點(diǎn),重復(fù)3次,28℃恒溫培養(yǎng)7 d后,觀察并測(cè)量菌株在培養(yǎng)基平板上形成的溶磷圈大小。根據(jù)溶磷圈直徑/菌落直徑(D/d值)確定內(nèi)生菌的溶磷能力。比值越大,表示溶磷能力越強(qiáng)。
1.4.4 溶磷能力的定量測(cè)定 將1 m L 263XY1菌懸液接于PKO和蒙金娜培養(yǎng)液中,裝液量為50/150 m L,以接入等量無菌水的培養(yǎng)液為對(duì)照,重復(fù)3次。28℃、160 r/min恒溫振蕩培養(yǎng)10 d后10000 r/min離心15 min,上清液采用鉬銻抗比色法測(cè)定有效磷增量[27]。計(jì)算公式如下:
式中,P為有效磷增量;K為標(biāo)準(zhǔn)曲線查得顯色液的磷含量(mg/L);V為顯色時(shí)溶液定容的體積(m L);V1為顯色時(shí)吸取上清液的體積(m L)。1.4.5 固氮能力的定性測(cè)定 將263XY1點(diǎn)接于阿須貝無氮平板培養(yǎng)基上,每皿4個(gè)接菌點(diǎn),重復(fù)3次,28℃恒溫培養(yǎng);同時(shí)將200μL菌懸液接于阿須貝液體培養(yǎng)基中,重復(fù)3次,以接種等量無菌水為對(duì)照,28℃恒溫振蕩培養(yǎng),于第3,5,7天觀察其生長(zhǎng)狀況,若菌株能夠在平板培養(yǎng)基上明顯生長(zhǎng)且能使液體培養(yǎng)基變渾濁則具有固氮能力。
運(yùn)用Excel 2007和SPSS 17.0統(tǒng)計(jì)分析軟件進(jìn)行試驗(yàn)數(shù)據(jù)處理與分析。
2.1.1 拮抗菌株篩選 從44株內(nèi)生細(xì)菌中篩選得到7株具拮抗作用的內(nèi)生細(xì)菌,編號(hào)分別為262XY1、262XY2′、262XY3、263XY1、263XG5、263XG6和 263XG8,其 中 263XG5、263XG6 和263XG8分離自線葉嵩草根部,262XY1、262XY2′、262XY3和263XY1分離自莖部。263XY1與馬鈴薯枯萎病菌、馬鈴薯炭疽病菌和馬鈴薯壞疽病菌對(duì)峙培養(yǎng),具明顯的抑菌帶(圖1),抑菌率分別為67.17%,86.24%和70.89%(表1),其抑菌能力顯著高于其他6株拮抗細(xì)菌(P<0.05),因此對(duì)該菌株進(jìn)行了以下試驗(yàn)。
表1 內(nèi)生細(xì)菌的抑菌能力測(cè)定Table 1 Inhibition rate of endophytic bacterium on pathogenic fungi
2.1.2 對(duì)病原菌菌絲生長(zhǎng)的影響 病原菌菌落生長(zhǎng)受抑制后,菌落邊緣和抑菌帶接觸部位的菌絲生長(zhǎng)緩慢。鏡檢發(fā)現(xiàn),受抑制菌絲的生長(zhǎng)端分支增多,菌絲頂端、中部膨大呈泡狀,有明顯的畸形,部分前端膨脹破裂,內(nèi)含物外溢(圖2),說明263XY1可使病原菌菌絲發(fā)生畸形變化從而影響菌絲正常生長(zhǎng)。
圖1 263XY1對(duì)3種病原真菌的抑制效果Fig.1 Inhibitory effects of 263XY1 on 3 species of fungus pathogensA:枯萎病菌對(duì)照和處理Normal and inhibit of F.avenaceum;B:炭疽病菌對(duì)照和處理Normal and inhibit of C.coccodes;C:壞疽病菌對(duì)照和處理Normal and inhibit of P.foveata;下同The same below.
圖2 263XY1對(duì)病原菌菌絲的影響Fig.2 The influence of 263XY1 against hyphoae of pathogenic fungi
2.2.1 形態(tài)觀察 263XY1革蘭氏染色陽(yáng)性(圖3A),菌體大小為0.36~0.85μm×0.69~1.87μm。在NA平板培養(yǎng)基上菌落大小為3~4 mm,不規(guī)則形,邊緣不整齊,呈波狀,表面褶皺,較干燥,不透明,米白色(圖3B)。
2.2.2 16S r DNA序列鑒定 提取的263XY1基因組經(jīng)16S r DNA引物擴(kuò)增,產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),在近1500 bp處有一清晰的PCR特異性條帶 (圖4),經(jīng)上海生工測(cè)序得16S r DNA基因序列長(zhǎng)度為1451 bp,使用BLAST程序?qū)λ眯蛄性贕enebank中進(jìn)行同源性比較,263XY1與已報(bào)道的Bacillus vallismortis(JQ765433.1),Bacillussubtilis(FJ763648.1),Bacillussubtilis(JF926531.1)和Bacillus amyloliquefaciens(JF899260.1)等多個(gè)基因序列的同源性在99%以上,應(yīng)用Clustal 1.8和Mega 4.0軟件進(jìn)行多重序列比較后鄰接法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,表明263XY1與B.vallismortis相似性最高(圖5),因此將其鑒定為Bacillus vallismortis(KF818642)。
圖3 263XY1革蘭氏染色(A)與單菌落(B)Fig.3 Gram staining(A)and a single colony(B)of 263XY1
圖4 263XY1的16S r DNA電泳圖Fig.4 16S r DNA PCR electrophoresis map of 263XY1(1,2:263XY1;3:標(biāo)記 Marker)
圖5 263XY1的16S r DNA系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.5 16S r DNA phylogenetic tree of 263XY1
圖6 263XY1比色反應(yīng)Fig.6 263XY1 colorimetric reaction
2.3.1 產(chǎn)IAA能力的定性測(cè)定 與CK相比,加入不含色氨酸(Trp)的King菌懸液和含色氨酸的King菌懸液均有顯色反應(yīng),呈淡粉色(圖6),說明263XY1可以分泌IAA。
2.3.2 產(chǎn)IAA能力的定量測(cè)定 263XY1經(jīng)連續(xù)培養(yǎng)12 d后,測(cè)定OD530值,結(jié)果表明,不含色氨酸時(shí)其分泌IAA的濃度為1.52 mg/L;含100 mg/L色氨酸的金氏培養(yǎng)液中其分泌IAA的濃度為3.31 mg/L,是前者的2倍,說明色氨酸的存在能增加263XY1合成IAA的量,即外源色氨酸可以作為263XY1合成IAA的前體物質(zhì)。
圖7 263XY1在蒙金娜(A)和PKO(B)平板培養(yǎng)基上形成的溶磷圈Fig.7 Halo of phosphate-solubilization microorganism 263XY1 Mongina(A)and PKO(B)solid medium
2.3.3 溶磷能力的定性測(cè)定 263XY1在蒙金娜培養(yǎng)基上溶磷圈不明顯(圖7A),D/d值為1.10;但在PKO培養(yǎng)基上溶磷圈明顯(圖7B),D/d值為2.10,說明對(duì)無機(jī)磷有明顯溶磷能力,而對(duì)有機(jī)磷的溶解能力較差。
2.3.4 溶磷能力的定量測(cè)定 263XY1在PKO和蒙金娜液體培養(yǎng)基培養(yǎng)10 d后,有效磷增量分別為38.94和0.11 mg/L,說明263XY1對(duì)無機(jī)磷有較強(qiáng)的溶磷能力,但對(duì)有機(jī)磷溶磷能力差。
2.3.5 固氮能力的定性測(cè)定 263XY1點(diǎn)接于阿須貝平板培養(yǎng)基后,在第3天時(shí)形成菌落;接種于阿須貝液體培養(yǎng)基,7 d后培養(yǎng)液變渾濁,說明262XY1有固氮能力。
近年來,草地退化問題嚴(yán)重,在草地的生產(chǎn)中,應(yīng)及時(shí)采取措施,才可逆轉(zhuǎn)草地的退化進(jìn)程,實(shí)現(xiàn)草地的可持續(xù)利用。恢復(fù)退化的草地已成為亟待解決的問題,而養(yǎng)分供給能力是成功恢復(fù)退化草地主要依賴的因素之一[28-30]。開發(fā)具有拮抗作用等多功能的牧草內(nèi)生細(xì)菌應(yīng)用于草地,一方面可以補(bǔ)充草地自身養(yǎng)分,協(xié)調(diào)草地資源利用中生產(chǎn)功能與生態(tài)功能的沖突;另一方面也可以應(yīng)用于農(nóng)作物病蟲害的生物防治中。本研究以東祁連山高寒草地線葉嵩草中分離的內(nèi)生細(xì)菌263XY1為對(duì)象,經(jīng)16S r DNA序列鑒定為芽孢桿菌屬的細(xì)菌。目前,在國(guó)內(nèi)外內(nèi)生細(xì)菌多樣性研究的報(bào)道中,認(rèn)為芽孢桿菌作為優(yōu)勢(shì)菌種[31-32],具有開發(fā)成為生物農(nóng)藥和生物肥料的潛力,且效果顯著[33-34],有進(jìn)一步開發(fā)利用的價(jià)值。
內(nèi)生細(xì)菌通過釋放土壤中不溶性的磷元素,促進(jìn)植物生長(zhǎng)和次級(jí)代謝物積累已有報(bào)道[15,16]。263XY1在PKO含無機(jī)磷培養(yǎng)基中的有效磷增量為38.94 mg/L,說明263XY1有較好溶解無機(jī)磷的能力,即具有較好促生作用,但是其溶磷機(jī)制有待進(jìn)一步研究。周佳寧等[35]從茅蒼術(shù)(Rhizoma areactylodis)葉片中分離得到45株內(nèi)生細(xì)菌研究其促生潛力,其中43株能夠分泌IAA,其濃度在22~268 mg/L,說明內(nèi)生細(xì)菌可以分泌IAA促進(jìn)宿主生長(zhǎng)和抗逆;張英等[36]研究4株牧草根際促生細(xì)菌互作效應(yīng)中發(fā)現(xiàn),其分泌IAA量為0.212~9.33 mg/L,低于單株263XY1分泌的IAA量,263XY1與其他菌株復(fù)配時(shí)產(chǎn)生IAA的能力可能更強(qiáng),但還有待進(jìn)一步研究。263XY1分離自高寒草地線葉嵩草,其生存的極端環(huán)境可能有利于內(nèi)生細(xì)菌在逆境中適應(yīng)力的提高,如拮抗或增加IAA的分泌量等,發(fā)揮更好的促生作用[37]。另外,高寒的生存環(huán)境與馬鈴薯在貯藏期所需要的低溫條件正好吻合,更加適合于開發(fā)為防治馬鈴薯貯藏期病害的生物農(nóng)藥。
目前報(bào)道的具生物學(xué)功能的內(nèi)生細(xì)菌較多,但同時(shí)具備多種功能于一體的內(nèi)生細(xì)菌并不多。263XY1為G+,經(jīng)16S r DNA序列分析將其鑒定為死谷芽孢桿菌,對(duì)馬鈴薯枯萎病菌、馬鈴薯炭疽病菌和馬鈴薯壞疽病菌均具有較強(qiáng)拮抗作用,抑菌率分別達(dá)到67.17%,86.17%和70.89%,且還具有較強(qiáng)溶磷、產(chǎn)生IAA和固氮能力,是一株多功能拮抗內(nèi)生細(xì)菌。因此,該菌株有進(jìn)一步開發(fā)為防治馬鈴薯貯藏期病害的微生物產(chǎn)品的巨大潛力。