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      人羊水特異蛋白質(zhì)組學(xué)的探討研究

      2014-09-11 02:21:38朱斌陳芳侯常黎麗紅黃素華
      新醫(yī)學(xué) 2014年6期
      關(guān)鍵詞:斑點(diǎn)羊水組學(xué)

      朱斌 陳芳 侯常 黎麗紅 黃素華

      羊水對(duì)于胎兒的正常發(fā)育至關(guān)重要,其生成量和成分與胎兒的發(fā)育、胎盤(pán)和羊膜腔的功能密切相關(guān)[1]。羊水中蛋白質(zhì)組學(xué)研究亦成為近年研究熱點(diǎn)。本研究初步觀察了在羊水中特異表達(dá)的蛋白質(zhì)及高表達(dá)的蛋白質(zhì),旨在為妊娠相關(guān)疾病的發(fā)生、發(fā)病機(jī)制的探索研究提供理論依據(jù),現(xiàn)報(bào)告如下。

      材料與方法

      一、試劑及儀器

      1.試 劑

      主要有:ProteoPrep Blue Albumin and IgG Depletion Kit血清高豐度蛋白去除試劑盒、四甲乙二胺(Sigma,美國(guó)),固相化pH 4~7、24 cm梯度干膠條、Bradford染液(Bio-Rad,美國(guó)),丙烯酰胺、甲叉雙丙烯酰胺、Tris、甘氨酸十二烷基磺酸鈉(SDS)、尿素、CHAPs、過(guò)硫酸銨、碘乙酰氨、二硫蘇糖醇(Amersham Pharmacia Biotech,瑞典),一氯乙腈(成都貝斯特)。

      2.儀 器

      包括:IPGphor3等電聚焦儀、EttanDALT垂直電泳槽、Image scanner掃描儀、超聲儀(GE,美國(guó)),Autoflex speed?MALDI-TOF質(zhì)譜儀(Bruker Dalton,美國(guó)),冷凍離心機(jī)(中國(guó)科學(xué)院武漢科學(xué)儀器廠)等。

      二、蛋白樣品的制備

      選擇3名正常妊娠晚期(37周)孕婦,征得其知情同意后,以羊膜穿刺法采集3份羊水標(biāo)本,每份5 ml,同時(shí)以肘部穿刺取靜脈血標(biāo)本3份,每份5 ml。所采集的標(biāo)本分別在4℃、16 000×g離心15 min,取上清,0.4μm過(guò)濾后分裝, -70℃保存。離心超濾濃縮樣品,ProteoPrep Blue Albumin and IgG Depletion Kit試劑盒去除血清高豐度蛋白質(zhì),加入4倍體積丙酮,-20℃沉淀過(guò)夜。沉淀所得到的蛋白于4℃、12 000×g離心20 min,棄上清,晾干,-80℃凍存?zhèn)溆谩S肂radford法定量蛋白質(zhì)濃度。

      三、雙向凝膠電泳及圖像分析

      將去除高豐度蛋白的蛋白團(tuán)塊重溶。24 cm干膠條在含100μg蛋白質(zhì)樣本和水化液的460μl混合液中20℃水化10~12 h。將膠條放入等電聚焦盤(pán)中加電壓聚焦。第一向等電聚焦電泳 (IEF)后,待膠條平衡,再進(jìn)行12%的聚丙烯電泳酰胺凝膠(SDS-PAGE)電泳,電泳所得的雙向凝膠用雙胺硝酸銀法染色及考馬斯亮藍(lán)染色,Imagescanner掃描儀進(jìn)行透射掃描,獲得的數(shù)字化圖像運(yùn)用ImageMaster 2D platinum 5.0軟件進(jìn)行蛋白質(zhì)點(diǎn)的檢測(cè)、量化、背景扣除、點(diǎn)的匹配。著重選擇pH4~7,分子量10~55 KDa區(qū)域進(jìn)行觀察,從羊水中找到僅在羊水中表達(dá)的蛋白質(zhì)點(diǎn)及在羊水中表達(dá)量高于血清2倍以上的蛋白質(zhì)點(diǎn),隨機(jī)選取重復(fù)性和分辨率較高的10個(gè)差異蛋白質(zhì)點(diǎn)行基質(zhì)輔助激光解吸/離子化飛行時(shí)間質(zhì)譜 (MALDI-TOF/TOFMS)鑒定。

      四、MALDI-TOF/TOF-MS分析

      選取行MALDI-TOF/TOF-MS分析的蛋白質(zhì)點(diǎn)后行挖點(diǎn)、脫色、還原、烷基化、酶解、樣品回收及脫鹽處理、肽段提取后點(diǎn)靶上機(jī),使用Autoflex speedTMMALDI-TOF-TOF質(zhì)譜儀進(jìn)行質(zhì)譜分析。利用flexAnalysis軟件過(guò)濾基線峰、識(shí)別信號(hào)峰。利用Mascot軟件搜索NCBI及Uniprot數(shù)據(jù)庫(kù),尋找匹配的相關(guān)蛋白質(zhì),同時(shí)查詢其功能,明確鑒定的蛋白質(zhì)為何種蛋白質(zhì)。

      結(jié) 果

      一、高豐度蛋白去除后雙向凝膠電泳分析結(jié)果

      在pH 4~7、分子量10~55 KDa的區(qū)域中,羊水及血清的蛋白質(zhì)位點(diǎn)分布大部分相同,血清組的斑點(diǎn)多于羊水組(見(jiàn)圖1A、B)。經(jīng)ImageMaster 2D platinum 5.0軟件分析,羊水中約有(613±29)個(gè)蛋白質(zhì)點(diǎn),血清中約有(785±64)個(gè)蛋白質(zhì)點(diǎn),羊水中特異表達(dá)的蛋白點(diǎn)約50個(gè)(見(jiàn)圖1C),羊水中表達(dá)量高的蛋白點(diǎn)約50個(gè)(見(jiàn)圖1D)。

      圖1 去除高豐度蛋白后的雙向凝膠電泳分析結(jié)果

      二、MALDI-TOF/TOF-MS分析結(jié)果

      隨機(jī)選取重復(fù)性和分辨率較高的10個(gè)濃度差異的蛋白質(zhì)斑點(diǎn)行質(zhì)譜分析鑒定,質(zhì)譜分析結(jié)果見(jiàn)圖2及表1。

      討 論

      羊水作為胎兒生長(zhǎng)發(fā)育最為重要的因素之一,在多種妊娠疾病的發(fā)生中有重要作用。蛋白質(zhì)組學(xué)是繼人類(lèi)基因組計(jì)劃完成后的新興學(xué)科[2]。隨著人類(lèi)蛋白質(zhì)組學(xué)組織(HUPO)的正式成立,蛋白質(zhì)組學(xué)蓬勃發(fā)展,滲透到各個(gè)學(xué)科。近年來(lái),國(guó)內(nèi)外均有學(xué)者對(duì)妊娠婦女血液、羊水進(jìn)行了蛋白質(zhì)組學(xué)的研究,探索新的妊娠蛋白和疾病特異蛋白,以及蛋白質(zhì)在妊娠相關(guān)疾病發(fā)生、發(fā)展中的相互作用。然而,目前的多數(shù)研究集中于尋找羊水中特異性的差異蛋白,筆者前期經(jīng)nano LC/MS/MS對(duì)羊水的蛋白組學(xué)分析,已經(jīng)發(fā)現(xiàn)羊水中人62種特異性蛋白[3]。本次通過(guò)比較Anderson等[4]和Michel等[5]的結(jié)果,新檢測(cè)到了22種僅在AF中表達(dá)的蛋白,其中14種是分泌型蛋白,其余8種分布于細(xì)胞膜、細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核。羊水特異性蛋白斑點(diǎn)約50余個(gè),與此前nano LC/MS/MS的結(jié)果相符,故本研究不行此類(lèi)斑點(diǎn)的質(zhì)譜分析。

      圖2 3種在羊水和血清中呈濃度差異表達(dá)的蛋白質(zhì)

      表1 10個(gè)在羊水及血清中呈濃度差異表達(dá)的蛋白質(zhì)斑點(diǎn)質(zhì)譜分析結(jié)果

      本研究初步探討在羊水和血清中均有表達(dá),但羊水中表達(dá)量明顯要高于血清的一些蛋白質(zhì)。研究初步挑選其中10個(gè)重復(fù)性和分辨率較高斑點(diǎn)行質(zhì)譜鑒定,檢索UniProt等在線蛋白數(shù)據(jù)庫(kù),除2個(gè)斑點(diǎn)為細(xì)胞膜及細(xì)胞質(zhì)蛋白外,余均為分泌型蛋白質(zhì)。這些蛋白的已知功能如下:硫酸類(lèi)肝素蛋白多糖(HSPG2)是基底膜的主要成分,對(duì)心臟發(fā)育及血管調(diào)節(jié)起著重要作用,此類(lèi)蛋白質(zhì)缺乏可導(dǎo)致常染色體隱性遺傳病侏儒綜合征的發(fā)生[6]。絨毛膜生成激素(CSH1)具有刺激泌乳、促進(jìn)胎兒生長(zhǎng)及新陳代謝等作用[7]。載脂蛋白AI為雙超螺旋模型的溶液結(jié)構(gòu)B鏈,參與膽固醇的轉(zhuǎn)運(yùn),使其從組織中轉(zhuǎn)運(yùn)至肝臟。因其影響膽固醇代謝,在HDL缺乏癥及淀粉樣變中起著重要的作用,其缺乏可引起早發(fā)冠心病,肝、脾腫大,復(fù)發(fā)性周?chē)窠?jīng)病變,進(jìn)行性肌肉萎縮和無(wú)力,其突變可致淀粉樣多神經(jīng)病腎病、家族性淀粉樣多神經(jīng)病[8-9]。AMBP蛋白是α1微球蛋白前體,具有抑制胰蛋白酶、纖溶酶、粒細(xì)胞前溶酶體酶及草酸鈣結(jié)晶的作用[10]。另外,胰島素樣生長(zhǎng)因子結(jié)合蛋白(IGFBP)具有延長(zhǎng)胰島素樣生長(zhǎng)因子的半衰期,調(diào)節(jié)IGF的促進(jìn)生長(zhǎng)作用[11]。載脂蛋白E與胎兒生長(zhǎng)有一定關(guān)系[8]。硫氧還原蛋白過(guò)氧化物酶2(PRDX2),與細(xì)胞氧化還原調(diào)節(jié)有關(guān),在清除新陳代謝過(guò)程中產(chǎn)生的過(guò)氧化物起著重要的作用,通過(guò)調(diào)節(jié)細(xì)胞內(nèi)過(guò)氧化氫的濃度,誘使生長(zhǎng)因子和TNF-α的信息傳導(dǎo)[12]。BPIFA1蛋白與接觸刺激物后引起的氣道炎癥有一定的關(guān)聯(lián),與上呼吸道的天然免疫有一定關(guān)系。亦在腫瘤的演化進(jìn)展起著一定的作用[13]。補(bǔ)體因子B是補(bǔ)體系統(tǒng)的替代途徑,被D因子激活成2個(gè)片段Ba、Bb,Bb結(jié)合3b因子產(chǎn)生C3或C5轉(zhuǎn)化酶,對(duì)B細(xì)胞的增殖及分化起著一定作用,Ba的作用與此相反,與溶血性尿毒綜合征非典型4(AHUS4)有關(guān)[14]。羊水的某些蛋白質(zhì)表達(dá)可反映妊娠生理或病理狀態(tài),可能有助于妊娠相關(guān)疾病如胎兒宮內(nèi)生長(zhǎng)受限、子癇前期、早產(chǎn)、宮內(nèi)感染甚至羊水栓塞等的早期診斷。本研究中在羊水表達(dá)水平偏高的蛋白質(zhì)是否可提供某種診斷依據(jù)還待進(jìn)一步研究證明。此外,鑒于本研究?jī)H采用質(zhì)譜蛋白鑒定策略,今后將對(duì)羊水中呈差異表達(dá)的蛋白質(zhì)采用免疫印跡或其他的方法行進(jìn)一步驗(yàn)證,以確定其是完整的蛋白還是片段蛋白。

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