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(浙江工業(yè)大學(xué) 藥學(xué)院,浙江 杭州 310032)
水蛭素是一種由65~66個氨基酸殘基組成的單鏈多肽,分子量約為7 KDa,是迄今發(fā)現(xiàn)的作用最強(qiáng)的凝血酶特異性抑制劑[1].天然水蛭素有十幾種變異體,其中研究最多且具有較好抗凝血酶活性的是HV1,HV2,HV3.由于三種水蛭素的提取部位不同使它們的活性存在差異,從口部提取的HV2活性最高,從頭部提取的HVl活性次之,從身體其他部位提取的HV3活性最低.由于天然醫(yī)用水蛭具有很好的開發(fā)價(jià)值,但在自然界中天然水蛭的來源十分有限,且提取成本高、效率低下,不利于大規(guī)模生產(chǎn).因而,隨著分子生物學(xué)的發(fā)展,國內(nèi)外醫(yī)藥界均著重研究通過基因工程的技術(shù)制備重組水蛭素[2].
大腸桿菌表達(dá)系統(tǒng)具有遺傳背景清楚、培養(yǎng)操作簡單、生長繁殖快速、生產(chǎn)成本低廉等優(yōu)點(diǎn),是目前應(yīng)用和研究最廣泛的蛋白表達(dá)系統(tǒng).然而,由于外源蛋白在大腸桿菌中多以包涵體的形式表達(dá),需要通過變性、復(fù)性等復(fù)雜步驟才可以恢復(fù)部分活性.在目的基因前面插入一段信號肽基因,可以利用信號肽引導(dǎo)外源蛋白到細(xì)胞周質(zhì)空間分泌表達(dá).不僅能使目標(biāo)蛋白以活性結(jié)構(gòu)生成,并且信號肽在分泌過程中可以自行切除,無需破菌,直接進(jìn)行周質(zhì)蛋白提取就能得到較高純度的目標(biāo)蛋白,從而簡化了后續(xù)的分離純化步驟[3-4].基于信號肽酶在切割信號肽的過程中與切割位點(diǎn)的氨基酸分子量有密切的聯(lián)系,本研究通過基因設(shè)計(jì)和重疊延伸(SOE)技術(shù),將一種水蛭素的N端第一個氨基酸進(jìn)行突變,經(jīng)克隆、表達(dá)后,成功構(gòu)建突變型和天然型的兩種分泌型水蛭素Ⅱ基因工程菌.兩種重組水蛭素Ⅱ經(jīng)周質(zhì)蛋白提取和陰離子交換層析,通過電泳檢測和活性測定,比活性相同,突變型的表達(dá)量更高.
pET-39b(+)購自Novagen公司;E.coliDH5α,BL21(DE3)為本實(shí)驗(yàn)室保存.
引物合成和測序均由南京金斯瑞生物科技有限公司完成;T4 DNA 連接酶、限制性內(nèi)切酶NdeI、BamH I購自Fermantas,pfuDNA聚合酶購自Sangon.
B型小量質(zhì)粒快速提取試劑盒購自北京博大泰克生物科技有限公司;3S DNA Gel Purification Kit購自北京莊盟生物科技有限公司;100 bp Loading DNA Marker和Protein Molecular Low Marker購自Sangon;凝血酶和纖維蛋白原購自上海源葉生物科技有限公司,其他試劑均為國產(chǎn)分析純.
按照DsbA信號肽基因序列以及HV2基因序列,用引物設(shè)計(jì)軟件DNASIS設(shè)計(jì)了以下6個片斷:
A: 5’GTTCATATGAAAAAGATTTGGCTGGCGCTGGCTGGTTTAGTTTTAGCGTTTAGCGC 3’
B1: 5’ACCCGACTCGGTGCAATCGGTGTAGGTAATCGCCGATGCGCTAAACGCTAAAACT 3’
B2: 5’ACCCGACTCGGTGCAATCGGTGTAGGTCGCCGCCGATGCGCTAAACGCTAAAACT 3’
S-1: 5’GTTCATATGAAAAAGATTTGGCTG 3’
H-1: 5’ATTACCTACACCGATTGCACC 3’
H-2: 5’TTTGGATCCTCATTGCAGGTACTCT 3’
其中:B1(B2)的5’端與HV2正義鏈5’端的30個堿基反向互補(bǔ),在B2鏈中將HV2正義鏈5’端的前3個堿基進(jìn)行了突變;A片段的3’端與B1(B2)片段的3’端有18個堿基互補(bǔ)配對;S-1為A片段5’端的前24個堿基;H-1和H-2片段用于擴(kuò)增HV2序列.
首先在pfuDNA聚合酶的作用下,以A片段和B1(B2)片段的18個堿基反向互補(bǔ)配對,一步退火,延伸合成DsbA信號肽AB1(AB2)鏈.然后以化學(xué)合成的HV2全基因序列為模板,H-1和H-2為上下游引物PCR擴(kuò)增HV2片段.PCR參數(shù):94 ℃預(yù)變性3 min,進(jìn)入循環(huán):94 ℃變性30 s,41 ℃退火30 s,72 ℃延伸60 s,2個循環(huán);再94 ℃變性30 s,57 ℃退火30 s,72 ℃延伸60 s,26個循環(huán);最后72 ℃延伸10 min.
最后通過SOE-PCR法[5-6]分別將AB1(AB2)鏈和HV2序列拼接.以S-1和H-2為上下游引物,PCR擴(kuò)增全序列spHV2和spHV2mut,PCR條件參數(shù):94 ℃預(yù)變性3 min,進(jìn)入循環(huán):94 ℃變性30 s,41 ℃退火30 s,72 ℃延伸60 s,2個循環(huán);再94 ℃變性30 s,57 ℃退火30 s,72 ℃延伸60 s,26個循環(huán);最后72 ℃延伸10 min.全過程如圖1所示.
圖1 獲得全長目的基因的方法
將2.1所得到的PCR產(chǎn)物和pET-39b(+)質(zhì)粒分別用NdeⅠ和BamHⅠ在37 ℃消化2 h,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳和3S DNA Gel Purification Kit純化回收,回收產(chǎn)物用T4 DNA ligase在4 ℃冰箱中連接過夜后,用CaCl2法轉(zhuǎn)化克隆宿主E.coliDH5α.挑選能在卡那霉素抗性LB固體培養(yǎng)基上生長的單克隆,以T71測序引物、H-2作為正反向引物,菌落PCR篩選出陽性克隆子,送金斯瑞生物科技有限公司測序.將經(jīng)測序證實(shí)的陽性重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化表達(dá)宿主E.coliBL21(DE3),得到兩種基因工程菌.
采用“冷休克”法從細(xì)胞周質(zhì)空間中提取兩種目標(biāo)蛋白[7],具體流程:挑取2.2中經(jīng)篩選后的陽性克隆接種于3 mL含50 μg/mL 卡那霉素的LB培養(yǎng)中,37 ℃培養(yǎng)過夜,次日按1%接種量轉(zhuǎn)接于含50 μg/mL卡那霉素的LB培養(yǎng)基中,37 ℃培養(yǎng)至OD600為0.3~0.5時,加入終濃度為0.5 mmol/L的IPTG[8],28 ℃誘導(dǎo)培養(yǎng)4 h.取適量發(fā)酵液于4 000 r/min離心15 min,收集菌體,用含20%蔗糖的20 mmol/L Tris-HCl(pH8.0)緩沖液,重懸菌體,冰浴30 min;加4倍體積蒸餾水,冰浴30 min;4 000 r/min離心10 min,收集上清.
將上述收集的上清溶液,以2 mL/min的速度上樣于經(jīng)10 mmol/LTris-HCl(pH8.0)平衡過的Q-Sephorase FF柱中,用50 mL含10 mmol/L的NaCl溶液進(jìn)行預(yù)洗脫;接著用50 mL含40 mmol/L 的NaCl溶液進(jìn)行洗脫,得到兩種目標(biāo)蛋白[9-10].經(jīng)Tricine-SDS-PAGE凝膠電泳分析[11],初步確定純化效率.
按Markwardt凝血酶滴定法[12]對兩種蛋白的活性進(jìn)行測定.取1支小試管加入0.5%纖維蛋白原溶液200 μL,再加50 μL上述2.3中的兩種樣品,混勻,滴加100 NIH/mL凝血酶5 μL搖勻,37 ℃恒溫水浴下1 min不凝,再滴加相同濃度凝血酶5 μL,直到纖維蛋白原溶液在1 min內(nèi)凝結(jié),所用凝血酶總量,再乘以20即可計(jì)算出樣品每毫升活性.
以HV2全合成基因序列為模板,H-1和H-2分別為上下游引物,用pfuDNA聚合酶經(jīng)PCR擴(kuò)增后,得到HV2片段;A片段和B1(B2)片段在pfuDNA聚合酶作用下合成AB1(AB2)鏈;最后,以S-1和H-2分別為上下游引物,用pfuDNA聚合酶經(jīng)SOE-PCR,將AB1(AB2)鏈和HV2基因序列拼接,得到兩個基因片段spHV2和spHV2mut,經(jīng)2.5%瓊脂糖凝膠電泳分析,可見大小分別為200,100,270 bp左右的特異性擴(kuò)增條帶,與理論大小相符,結(jié)果見圖2.
1,3,6-DNA Marker;2-HV2基因;4,5-AB1片段,AB2片段;7,8-兩種目的產(chǎn)物
基因片段spHV2和spHV2mut分別經(jīng)NdeⅠ和BamHⅠ雙酶切后,重組于載體pET-39b(+).轉(zhuǎn)化E.coliDH5α,用T71測序引物和H-2分別作為正反向引物經(jīng)菌落PCR,擴(kuò)增得到與目的基因大小略大的PCR片段,初步說明兩個目的基因已經(jīng)分別插入pET-39b(+)中.經(jīng)測序證實(shí),確定pET39-spHV2和pET39-spHV2mut構(gòu)建成功.質(zhì)粒圖譜見圖3.
圖3 重組表達(dá)載體pET39-SHV2圖譜
工程菌經(jīng)IPTG誘導(dǎo)表達(dá)后,用“冷休克”法從細(xì)胞周質(zhì)空間中提取目標(biāo)蛋白,經(jīng)Q-Sephorase FF柱純化后得到純度較高的目標(biāo)蛋白HV2和HV2mut.再經(jīng)上樣—預(yù)洗—洗脫后,各個部分經(jīng)Tricine-SDS-PAGE凝膠電泳分析,結(jié)果見圖4,5.
M-protein marker;1,2,3—100 mmol/L NaCl 洗脫;4—40 mmol/L NaCl 洗脫;5—10 mmol/L NaCl 洗脫;6—穿透液; 7—周質(zhì)提取液
M-protein marker;1,2-100 mmol/L NaCl 洗脫;3-40 mmol/L NaCl洗脫;4-10 mmol/L NaCl洗脫;5-穿透液;6-周質(zhì)提取液
采用Markwardt凝血酶滴定法測定重組水蛭素HV2和HV2mut,結(jié)果顯示:HV2活性為500 ATU/mL,HV2mut活性為900 ATU/mL,兩者比活性相同,因此突變型的表達(dá)量約為天然型的2倍.
水蛭素作為一種凝血酶有效而特異的抑制劑,在動物模型實(shí)驗(yàn)及臨床研究中能夠有效地預(yù)防動、靜脈血栓的形成及彌散性血管內(nèi)凝血,是一種很好的溶栓藥物輔助劑.隨著分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展,重組水蛭素的制備已成為熱點(diǎn).在大腸桿菌周質(zhì)空間的分泌表達(dá)不僅有利于表達(dá)蛋白的純化,更重要的是蛋白在分泌過程中能正確折疊,從而獲得有活性的目標(biāo)蛋白.信號肽可以引導(dǎo)外源蛋白從胞內(nèi)向周質(zhì)空間分泌,在分泌過程中信號肽酶的切割位點(diǎn)多為小分子氨基酸.基于在質(zhì)粒載體pET-39b(+)中,DsbA信號肽酶在切割時的天然識別位點(diǎn)為Ala-Ala,為了提高DsbA信號肽酶的切割效率,增加目標(biāo)蛋白的周質(zhì)空間表達(dá)量.本研究采用SOE技術(shù)將水蛭素Ⅱ的N端第一個氨基酸Ile的基因序列突變?yōu)锳la的基因序列,并將突變和未突變的水蛭素Ⅱ基因與DsbA信號肽基因融合,實(shí)現(xiàn)兩種水蛭素Ⅱ在大腸桿菌周質(zhì)空間的分泌表達(dá).通過電泳檢測和活性測定,與天然型水蛭素Ⅱ相比,突變型的周質(zhì)空間表達(dá)量提高了近一倍.本研究制備了兩種分泌型水蛭素工程菌,簡化了后續(xù)的分離純化步驟,有望在進(jìn)一步完善后進(jìn)行產(chǎn)業(yè)化,為臨床應(yīng)用和基礎(chǔ)研究提供大量的重組蛋白.
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