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      均勻設(shè)計(jì)在釀酒酵母電轉(zhuǎn)化條件研究中的應(yīng)用

      2014-07-21 18:42:47張啟聲李珺王翠峰蔡祿
      湖北農(nóng)業(yè)科學(xué) 2014年3期

      張啟聲+李珺+王翠峰+蔡祿

      摘要:電穿孔方法是一種高效導(dǎo)入外源DNA的技術(shù)。通過(guò)電轉(zhuǎn)化法對(duì)酵母YPH 500進(jìn)行外源DNA轉(zhuǎn)化,研究了電轉(zhuǎn)化中各因素對(duì)酵母轉(zhuǎn)化率的影響。結(jié)果表明,電場(chǎng)強(qiáng)度、外源DNA濃度、感受態(tài)細(xì)胞狀態(tài)對(duì)轉(zhuǎn)化率有明顯影響。采用均勻設(shè)計(jì)試驗(yàn),利用逐步回歸方法對(duì)試驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行分析, 結(jié)果表明,當(dāng)電場(chǎng)強(qiáng)度在1 750 V,酵母OD 600 nm在1.3,外源DNA濃度為7.5 mg/L時(shí),酵母轉(zhuǎn)化率較高,約為24×102轉(zhuǎn)化子數(shù)/μg DNA。

      關(guān)鍵詞:電轉(zhuǎn)化;釀酒酵母;均勻設(shè)計(jì)

      中圖分類號(hào):Q785;S963.32+7 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A 文章編號(hào):0439-8114(2014)03-0693-04

      釀酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)是一種模式生物,常常作為表達(dá)系統(tǒng)。近些年,研究者常利用它進(jìn)行外源基因的表達(dá)或其他基因操作技術(shù),所以外源基因的導(dǎo)入是進(jìn)行試驗(yàn)的先決條件。20世紀(jì)80年代,研究者開始利用電轉(zhuǎn)化法將外源DNA導(dǎo)入酵母細(xì)胞,該方法現(xiàn)已成為常用方法[1,2]。在轉(zhuǎn)化時(shí),試驗(yàn)結(jié)果往往受感受態(tài)細(xì)胞狀態(tài)、外源DNA濃度、電場(chǎng)強(qiáng)度等多個(gè)條件的影響,需要探索最佳電轉(zhuǎn)化率的條件。但其中涉及多因素、多水平的試驗(yàn),常規(guī)探索性試驗(yàn)工作量較大。均勻設(shè)計(jì)具有試驗(yàn)次數(shù)少,信息量大的優(yōu)點(diǎn),只需做少量試驗(yàn),建立數(shù)學(xué)模型,就可得到最佳的配比。本試驗(yàn)將穿梭質(zhì)粒通過(guò)電轉(zhuǎn)化到釀酒酵母YPH 500中,從中考察電場(chǎng)強(qiáng)度、外源DNA濃度和酵母細(xì)胞不同的生長(zhǎng)狀態(tài)下3個(gè)因素對(duì)電轉(zhuǎn)化的影響,以期為釀酒酵母電轉(zhuǎn)化的應(yīng)用提供參考依據(jù)。

      1 材料與方法

      1.1 試驗(yàn)材料與儀器

      1.1.1 菌種和質(zhì)粒 釀酒酵母YPH 500(遺傳背景:MATα ura3-52 lys2-801anber ade2-101ochre trp1-Δ63 his3-Δ200 leu2-Δ1)、穿梭質(zhì)粒pRS405由美國(guó)新澤西州醫(yī)學(xué)院微生物學(xué)與分子遺傳學(xué)部Carol S. Newlon教授贈(zèng)送。

      1.1.2 培養(yǎng)基 YPD培養(yǎng)基:1%酵母粉,2%蛋白胨,2%葡萄糖(固體培養(yǎng)基瓊脂含量1.5%)。SD篩選培養(yǎng)基:1.34%YNB,2%葡萄糖,2%瓊脂,氨基酸(ade、ure、trp、his、lys,均為20 mg/L),SD全營(yíng)養(yǎng)培養(yǎng)基:在SD篩選培養(yǎng)基的基礎(chǔ)上加100 mg/L leu。

      1.1.3 試劑與主要儀器 1 mol/L山梨醇(南京博爾迪生物科技有限公司);DP103型小提試劑盒[天根生化科技(北京)有限公司]。2510型電轉(zhuǎn)儀、高速冷凍離心機(jī)(Eppendorf公司);722型可見(jiàn)光分光光度計(jì)(上海馳唐電子有限公司);紫外分光光度計(jì)(美國(guó)Merinton公司);光學(xué)顯微鏡[OLYMPUS(中國(guó))有限公司]。

      1.2 試驗(yàn)方法

      1.2.1 酵母YPH 500生長(zhǎng)曲線的測(cè)定 將凍存菌種在YPD固體培養(yǎng)基上劃線,30 ℃培養(yǎng)3~4 d。立即挑取單菌落接種于含有100 mL YPD液體培養(yǎng)基的250 mL錐形瓶中,30 ℃、180 r/min培養(yǎng)。每隔2 h取樣測(cè)定OD600 nm值,同時(shí)通過(guò)細(xì)胞計(jì)數(shù)板計(jì)數(shù)。繪制酵母菌生長(zhǎng)曲線。

      1.2.2 外源DNA的制備 在穿梭質(zhì)粒pRS405上搭載酵母ARS304片段,導(dǎo)入大腸桿菌DH5α中儲(chǔ)存。采用DP103型小提試劑盒提取pRS405- ARS304質(zhì)粒。將所得產(chǎn)物用紫外分光光度計(jì)測(cè)量質(zhì)粒含量。

      1.2.3 感受態(tài)細(xì)胞的制備 挑取活化好的酵母單菌落接種于含有50 mL YPD液體培養(yǎng)基的250 mL錐形瓶中,30 ℃ 180 r/min培養(yǎng)。將培養(yǎng)好的細(xì)胞冰上放置10 min,倒入50 mL離心管中,4 ℃、1 300 r/min離心5 min。去掉培養(yǎng)液,用50 mL預(yù)冷的無(wú)菌水將菌體沉淀重懸,重復(fù)此步驟,洗滌2遍。再加入10 mL冰冷的1 mol/L山梨醇重懸菌體。最后加入1 mL冰冷的1 mol/L山梨醇。

      1.2.4 電轉(zhuǎn)化單因素驗(yàn)證 將制備好的不同時(shí)期感受態(tài)細(xì)胞、外源DNA分別混勻進(jìn)行以下處理,電轉(zhuǎn)化體系均為60 μL。①外源DNA 濃度5.0 mg/L,取不同感受態(tài)細(xì)胞的OD600 nm(0.2、0.4、0.7、1.1、1.3、1.4、1.5)進(jìn)行處理,感受態(tài)細(xì)胞用量80 μL,電場(chǎng)強(qiáng)度1 500 V;②感受態(tài)細(xì)胞OD600 nm為 1.1,用量為80 μL,取不同外源DNA濃度(0.25、1.25、2.5、5.0、7.5、10.0、12.5 mg/L )進(jìn)行處理,電場(chǎng)強(qiáng)度1 500 V;③感受態(tài)細(xì)胞OD600 nm 為1.1,外源DNA濃度5.0 mg/L,取不同電場(chǎng)強(qiáng)度(600、900、1 200、1 500、1 800、2 100、2 400 V)進(jìn)行處理。將反應(yīng)液在冰上加入到空管中混勻,轉(zhuǎn)移到電轉(zhuǎn)杯中進(jìn)行電轉(zhuǎn)化。

      1.2.5 電轉(zhuǎn)化均勻試驗(yàn) 確定所要研究的感受態(tài)細(xì)胞狀態(tài)、外源DNA濃度、電場(chǎng)強(qiáng)度3個(gè)因素的不同水平,根據(jù)均勻設(shè)計(jì)[2]進(jìn)行試驗(yàn),試驗(yàn)因素和水平見(jiàn)表1。

      1.2.6 電轉(zhuǎn)化效果評(píng)價(jià) 將轉(zhuǎn)化產(chǎn)物加入1 mol/L 冰冷的山梨醇溶液中進(jìn)行洗滌。高速離心5 s去部分上清,輕柔混勻后涂布于SD篩選培養(yǎng)基上。每個(gè)試驗(yàn)3次重復(fù),其中對(duì)照組分別涂布于SD 篩選培養(yǎng)基和SD全營(yíng)養(yǎng)培養(yǎng)基上。30 ℃培養(yǎng)4 d,統(tǒng)計(jì)平板菌落個(gè)數(shù)。計(jì)算轉(zhuǎn)化率,評(píng)價(jià)每組試驗(yàn)效果[3],其定義如下:

      轉(zhuǎn)化率=轉(zhuǎn)化子/外源DNA量×稀釋倍數(shù)。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 外源DNA的制備

      將酵母YPH 500中的ARS304片段進(jìn)行克隆,通過(guò) BamHⅠ和SacⅠ進(jìn)行雙酶切后搭載于穿梭質(zhì)粒pRS405上形成pRS405-ARS,該質(zhì)粒結(jié)構(gòu)如圖1所示。

      在轉(zhuǎn)化時(shí),環(huán)狀質(zhì)粒線性化便于整合到宿主細(xì)胞基因組中從而提高轉(zhuǎn)化率[4]。pRS405作為穿梭質(zhì)粒,在一定條件下可以帶ARS304自由穿梭于原核生物和真核生物中,ARS(Autonomously replicating sequence)為酵母染色質(zhì)復(fù)制所依賴的順式作用元件,ARS序列可提高導(dǎo)入質(zhì)粒的復(fù)制活性,減少質(zhì)粒丟失率,同時(shí)少部分可整合到基因組中并隨基因組復(fù)制,所以目的基因不需要線性化。該質(zhì)粒攜帶有亮氨酸基因,可在亮氨酸缺陷性酵母菌株中篩選。

      2.2 酵母YPH 500生長(zhǎng)曲線的測(cè)定

      由酵母YPH 500細(xì)胞數(shù)量和OD600 nm可以看出(圖2),在30 ℃、180 r/min的條件下培養(yǎng),酵母YPH 500在16~26 h可達(dá)到對(duì)數(shù)期,其OD600 nm為0.2~1.5,酵母YPH 500數(shù)量約為3.86×1011~5.04×1012個(gè)/mL。其中在28 h之后酵母數(shù)量與OD600 nm沒(méi)有相關(guān)性。

      2.3 酵母YPH 500不同的生長(zhǎng)狀態(tài)對(duì)電轉(zhuǎn)化效果的影響

      酵母菌生長(zhǎng)狀態(tài)對(duì)轉(zhuǎn)化率的影響主要是由于分裂時(shí)酵母細(xì)胞壁的結(jié)構(gòu)發(fā)生變化[5]。在電壓1 500 V、外源DNA濃度5.0 mg/L的條件下,取處于不同階段(OD600 nm為0.2~1.5)的酵母YPH 500感受態(tài)細(xì)胞80 μL進(jìn)行電轉(zhuǎn)化。通過(guò)統(tǒng)計(jì)發(fā)現(xiàn),不同階段的感受態(tài)細(xì)胞對(duì)轉(zhuǎn)化率的影響差異較大,在對(duì)數(shù)初期和對(duì)數(shù)末期效率較低,是由于在初期菌量較少,外源DNA進(jìn)入細(xì)胞的概率較小,而在對(duì)數(shù)末期其細(xì)胞壁較為致密不利于電穿孔。所以酵母菌生長(zhǎng)狀態(tài)主要受2個(gè)因素控制,即細(xì)胞數(shù)和細(xì)胞壁的結(jié)構(gòu)。其中OD600 nm為1.3時(shí)的酵母YPH 500細(xì)胞電轉(zhuǎn)化率最高,達(dá)到19.5×102轉(zhuǎn)化子數(shù)/μg DNA(圖3)。

      2.4 外源DNA濃度對(duì)酵母電轉(zhuǎn)化效果的影響

      在電壓為1 500 V,感受態(tài)細(xì)胞OD600 nm為1.1,用量為80 μL的條件下,分別加入不同濃度的外源DNA進(jìn)行電轉(zhuǎn)化。結(jié)果如圖4所示,當(dāng)外源DNA濃度在7.5 mg/L時(shí)轉(zhuǎn)化率最高,但在2.5~10.0 mg/L 的范圍內(nèi)其轉(zhuǎn)化率差異較小。當(dāng)外源DNA濃度較少時(shí),有效電擊會(huì)減少[6],而當(dāng)量多時(shí)反應(yīng)原理尚未弄清。有研究者猜想[7]可能是由于DNA較多時(shí),會(huì)對(duì)細(xì)胞表面點(diǎn)位造成影響或者是由于堵塞轉(zhuǎn)化孔道所致。當(dāng)外源DNA量低于2.5 mg/L或高于10.0 mg/L時(shí)其轉(zhuǎn)化率明顯下降。本試驗(yàn)中,外源DNA在一定范圍內(nèi)(2.5~10.0 mg/L)酵母電轉(zhuǎn)化率變化不大,而超出此范圍,轉(zhuǎn)化率則明顯減少。

      2.5 電場(chǎng)強(qiáng)度對(duì)酵母電轉(zhuǎn)化效果的影響

      采用1 mm寬度的電轉(zhuǎn)化杯,在OD600 nm為1.1的感受態(tài)細(xì)胞,用量為80 μL,外源DNA 濃度5.0 mg/L的條件下,分別施以不同的電壓進(jìn)行電轉(zhuǎn)化,結(jié)果如圖5所示。在不同電壓下酵母轉(zhuǎn)化率差異較大,其中在電場(chǎng)強(qiáng)度為1 500 V時(shí)轉(zhuǎn)化率最高,1 800 V時(shí)次之,當(dāng)電場(chǎng)強(qiáng)度大于1 800 V時(shí),會(huì)造成細(xì)胞形成難以自愈的較大孔道,細(xì)胞內(nèi)大分子容易溢出,造成細(xì)胞死亡,轉(zhuǎn)化率下降。而當(dāng)電場(chǎng)強(qiáng)度過(guò)小時(shí),在細(xì)胞表面形成的孔道較小,外源DNA難以進(jìn)入,使轉(zhuǎn)化率降低。在本試驗(yàn)中電場(chǎng)強(qiáng)度對(duì)酵母轉(zhuǎn)化率的影響較為明顯,其閾值范圍較?。? 500~1 800 V),超出此范圍,酵母轉(zhuǎn)化率明顯降低。

      2.6 均勻設(shè)計(jì)試驗(yàn)結(jié)果

      為進(jìn)一步探討電場(chǎng)強(qiáng)度、外源DNA濃度、感受態(tài)細(xì)胞狀態(tài)3個(gè)參數(shù)及其交互作用對(duì)酵母電轉(zhuǎn)化率的影響,以轉(zhuǎn)化率為考核指標(biāo)進(jìn)行優(yōu)化試驗(yàn)。優(yōu)化試驗(yàn)結(jié)果見(jiàn)表2。

      利用SPSS 17.0數(shù)據(jù)處理軟件對(duì)試驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行回歸分析處理,得到轉(zhuǎn)化率與各因素的回歸方程為:Y=321.4+46.75X1-32.54X2-12.9X3-26.151X12+103.48X22+1 343.5X32。其中相關(guān)系數(shù)R為0.999 9,F(xiàn)值為987,作F 檢驗(yàn),F(xiàn)>F0.05(8,1)=238.9,回歸方程顯著。將試驗(yàn)中的數(shù)據(jù)通過(guò)回歸方程進(jìn)行預(yù)測(cè),結(jié)果如表3所示,觀測(cè)值與擬合值誤差較小,準(zhǔn)確度高。通過(guò)單因素分析,其通徑系數(shù)為X1(0.827 6)>X3(-0.364 9)>X2(-0.283 4)。在3個(gè)參數(shù)中,感受態(tài)細(xì)胞狀態(tài)對(duì)酵母轉(zhuǎn)化率的影響最大,電場(chǎng)強(qiáng)度次之,外源DNA濃度最小。通過(guò)對(duì)回歸方程進(jìn)行極值分析,發(fā)現(xiàn)酵母感受態(tài)細(xì)胞OD600 nm為1.3,電場(chǎng)強(qiáng)度為1 750 V,外源DNA濃度為7.5 mg/L時(shí)可得到較高的電轉(zhuǎn)化效率,約為24×102轉(zhuǎn)化子數(shù)/μg DNA。

      3 小結(jié)與討論

      本試驗(yàn)通過(guò)電場(chǎng)強(qiáng)度、外源DNA濃度、感受態(tài)細(xì)胞狀態(tài)進(jìn)行單因素試驗(yàn),發(fā)現(xiàn)各因素對(duì)酵母電轉(zhuǎn)化率的影響較大,其中酵母感受態(tài)細(xì)胞OD600 nm達(dá)到1.3,電場(chǎng)強(qiáng)度達(dá)1 500~1 800V,DNA濃度達(dá)到7.5 mg/L時(shí)可在各自水平中取得較好的試驗(yàn)結(jié)果。

      對(duì)以上3個(gè)因素進(jìn)行均勻設(shè)計(jì),研究各因素的交互作用對(duì)酵母轉(zhuǎn)化率的影響,發(fā)現(xiàn)3個(gè)因素對(duì)酵母轉(zhuǎn)化率的影響各不相同,感受態(tài)細(xì)胞狀態(tài)影響最大,電場(chǎng)強(qiáng)度次之,外源DNA濃度最小。通過(guò)對(duì)回歸方程的極值運(yùn)算,可預(yù)測(cè)酵母感受態(tài)細(xì)胞OD600 nm達(dá)到1.3,電場(chǎng)強(qiáng)度達(dá)到1 750 V,外源DNA濃度達(dá)到7.5 mg/L時(shí)可得到較高的電轉(zhuǎn)化效率。本研究結(jié)果表明電轉(zhuǎn)化效率的條件優(yōu)化利用均勻設(shè)計(jì)試驗(yàn)簡(jiǎn)單、可信度較高。如果加入其他條件的研究,將大大降低試驗(yàn)組數(shù),節(jié)省試驗(yàn)材料。

      參考文獻(xiàn):

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      在轉(zhuǎn)化時(shí),環(huán)狀質(zhì)粒線性化便于整合到宿主細(xì)胞基因組中從而提高轉(zhuǎn)化率[4]。pRS405作為穿梭質(zhì)粒,在一定條件下可以帶ARS304自由穿梭于原核生物和真核生物中,ARS(Autonomously replicating sequence)為酵母染色質(zhì)復(fù)制所依賴的順式作用元件,ARS序列可提高導(dǎo)入質(zhì)粒的復(fù)制活性,減少質(zhì)粒丟失率,同時(shí)少部分可整合到基因組中并隨基因組復(fù)制,所以目的基因不需要線性化。該質(zhì)粒攜帶有亮氨酸基因,可在亮氨酸缺陷性酵母菌株中篩選。

      2.2 酵母YPH 500生長(zhǎng)曲線的測(cè)定

      由酵母YPH 500細(xì)胞數(shù)量和OD600 nm可以看出(圖2),在30 ℃、180 r/min的條件下培養(yǎng),酵母YPH 500在16~26 h可達(dá)到對(duì)數(shù)期,其OD600 nm為0.2~1.5,酵母YPH 500數(shù)量約為3.86×1011~5.04×1012個(gè)/mL。其中在28 h之后酵母數(shù)量與OD600 nm沒(méi)有相關(guān)性。

      2.3 酵母YPH 500不同的生長(zhǎng)狀態(tài)對(duì)電轉(zhuǎn)化效果的影響

      酵母菌生長(zhǎng)狀態(tài)對(duì)轉(zhuǎn)化率的影響主要是由于分裂時(shí)酵母細(xì)胞壁的結(jié)構(gòu)發(fā)生變化[5]。在電壓1 500 V、外源DNA濃度5.0 mg/L的條件下,取處于不同階段(OD600 nm為0.2~1.5)的酵母YPH 500感受態(tài)細(xì)胞80 μL進(jìn)行電轉(zhuǎn)化。通過(guò)統(tǒng)計(jì)發(fā)現(xiàn),不同階段的感受態(tài)細(xì)胞對(duì)轉(zhuǎn)化率的影響差異較大,在對(duì)數(shù)初期和對(duì)數(shù)末期效率較低,是由于在初期菌量較少,外源DNA進(jìn)入細(xì)胞的概率較小,而在對(duì)數(shù)末期其細(xì)胞壁較為致密不利于電穿孔。所以酵母菌生長(zhǎng)狀態(tài)主要受2個(gè)因素控制,即細(xì)胞數(shù)和細(xì)胞壁的結(jié)構(gòu)。其中OD600 nm為1.3時(shí)的酵母YPH 500細(xì)胞電轉(zhuǎn)化率最高,達(dá)到19.5×102轉(zhuǎn)化子數(shù)/μg DNA(圖3)。

      2.4 外源DNA濃度對(duì)酵母電轉(zhuǎn)化效果的影響

      在電壓為1 500 V,感受態(tài)細(xì)胞OD600 nm為1.1,用量為80 μL的條件下,分別加入不同濃度的外源DNA進(jìn)行電轉(zhuǎn)化。結(jié)果如圖4所示,當(dāng)外源DNA濃度在7.5 mg/L時(shí)轉(zhuǎn)化率最高,但在2.5~10.0 mg/L 的范圍內(nèi)其轉(zhuǎn)化率差異較小。當(dāng)外源DNA濃度較少時(shí),有效電擊會(huì)減少[6],而當(dāng)量多時(shí)反應(yīng)原理尚未弄清。有研究者猜想[7]可能是由于DNA較多時(shí),會(huì)對(duì)細(xì)胞表面點(diǎn)位造成影響或者是由于堵塞轉(zhuǎn)化孔道所致。當(dāng)外源DNA量低于2.5 mg/L或高于10.0 mg/L時(shí)其轉(zhuǎn)化率明顯下降。本試驗(yàn)中,外源DNA在一定范圍內(nèi)(2.5~10.0 mg/L)酵母電轉(zhuǎn)化率變化不大,而超出此范圍,轉(zhuǎn)化率則明顯減少。

      2.5 電場(chǎng)強(qiáng)度對(duì)酵母電轉(zhuǎn)化效果的影響

      采用1 mm寬度的電轉(zhuǎn)化杯,在OD600 nm為1.1的感受態(tài)細(xì)胞,用量為80 μL,外源DNA 濃度5.0 mg/L的條件下,分別施以不同的電壓進(jìn)行電轉(zhuǎn)化,結(jié)果如圖5所示。在不同電壓下酵母轉(zhuǎn)化率差異較大,其中在電場(chǎng)強(qiáng)度為1 500 V時(shí)轉(zhuǎn)化率最高,1 800 V時(shí)次之,當(dāng)電場(chǎng)強(qiáng)度大于1 800 V時(shí),會(huì)造成細(xì)胞形成難以自愈的較大孔道,細(xì)胞內(nèi)大分子容易溢出,造成細(xì)胞死亡,轉(zhuǎn)化率下降。而當(dāng)電場(chǎng)強(qiáng)度過(guò)小時(shí),在細(xì)胞表面形成的孔道較小,外源DNA難以進(jìn)入,使轉(zhuǎn)化率降低。在本試驗(yàn)中電場(chǎng)強(qiáng)度對(duì)酵母轉(zhuǎn)化率的影響較為明顯,其閾值范圍較小(1 500~1 800 V),超出此范圍,酵母轉(zhuǎn)化率明顯降低。

      2.6 均勻設(shè)計(jì)試驗(yàn)結(jié)果

      為進(jìn)一步探討電場(chǎng)強(qiáng)度、外源DNA濃度、感受態(tài)細(xì)胞狀態(tài)3個(gè)參數(shù)及其交互作用對(duì)酵母電轉(zhuǎn)化率的影響,以轉(zhuǎn)化率為考核指標(biāo)進(jìn)行優(yōu)化試驗(yàn)。優(yōu)化試驗(yàn)結(jié)果見(jiàn)表2。

      利用SPSS 17.0數(shù)據(jù)處理軟件對(duì)試驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行回歸分析處理,得到轉(zhuǎn)化率與各因素的回歸方程為:Y=321.4+46.75X1-32.54X2-12.9X3-26.151X12+103.48X22+1 343.5X32。其中相關(guān)系數(shù)R為0.999 9,F(xiàn)值為987,作F 檢驗(yàn),F(xiàn)>F0.05(8,1)=238.9,回歸方程顯著。將試驗(yàn)中的數(shù)據(jù)通過(guò)回歸方程進(jìn)行預(yù)測(cè),結(jié)果如表3所示,觀測(cè)值與擬合值誤差較小,準(zhǔn)確度高。通過(guò)單因素分析,其通徑系數(shù)為X1(0.827 6)>X3(-0.364 9)>X2(-0.283 4)。在3個(gè)參數(shù)中,感受態(tài)細(xì)胞狀態(tài)對(duì)酵母轉(zhuǎn)化率的影響最大,電場(chǎng)強(qiáng)度次之,外源DNA濃度最小。通過(guò)對(duì)回歸方程進(jìn)行極值分析,發(fā)現(xiàn)酵母感受態(tài)細(xì)胞OD600 nm為1.3,電場(chǎng)強(qiáng)度為1 750 V,外源DNA濃度為7.5 mg/L時(shí)可得到較高的電轉(zhuǎn)化效率,約為24×102轉(zhuǎn)化子數(shù)/μg DNA。

      3 小結(jié)與討論

      本試驗(yàn)通過(guò)電場(chǎng)強(qiáng)度、外源DNA濃度、感受態(tài)細(xì)胞狀態(tài)進(jìn)行單因素試驗(yàn),發(fā)現(xiàn)各因素對(duì)酵母電轉(zhuǎn)化率的影響較大,其中酵母感受態(tài)細(xì)胞OD600 nm達(dá)到1.3,電場(chǎng)強(qiáng)度達(dá)1 500~1 800V,DNA濃度達(dá)到7.5 mg/L時(shí)可在各自水平中取得較好的試驗(yàn)結(jié)果。

      對(duì)以上3個(gè)因素進(jìn)行均勻設(shè)計(jì),研究各因素的交互作用對(duì)酵母轉(zhuǎn)化率的影響,發(fā)現(xiàn)3個(gè)因素對(duì)酵母轉(zhuǎn)化率的影響各不相同,感受態(tài)細(xì)胞狀態(tài)影響最大,電場(chǎng)強(qiáng)度次之,外源DNA濃度最小。通過(guò)對(duì)回歸方程的極值運(yùn)算,可預(yù)測(cè)酵母感受態(tài)細(xì)胞OD600 nm達(dá)到1.3,電場(chǎng)強(qiáng)度達(dá)到1 750 V,外源DNA濃度達(dá)到7.5 mg/L時(shí)可得到較高的電轉(zhuǎn)化效率。本研究結(jié)果表明電轉(zhuǎn)化效率的條件優(yōu)化利用均勻設(shè)計(jì)試驗(yàn)簡(jiǎn)單、可信度較高。如果加入其他條件的研究,將大大降低試驗(yàn)組數(shù),節(jié)省試驗(yàn)材料。

      參考文獻(xiàn):

      [1] HASHIMOTO H, MORIJAWA H, YAMATA Y, et al. A novel method for transformation of intact yeast cells by electroinjection of plasmid DNA[J]. Applied Microbiol Biotechnol,1985, 21(5):336-339.

      [2] 方開泰.均勻設(shè)計(jì)與均勻設(shè)計(jì)表[M].北京:科學(xué)出版社,1994. 13-17.

      [3] 劉秀蓮,王宇光,雷祿旺. 海洋紅酵母電轉(zhuǎn)化條件的研究[J].生命科學(xué)研究,2008,12(2):136-140.

      [4] 秦玉靜,金建玲,鮑曉明,等.影響釀酒酵母電擊轉(zhuǎn)化率的條件[J]. 山東大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版),1999,34(2):236-240.

      [5] BECHER D M, GUARENTE L. High-efficiency transformation of yeast by electroporation[J]. Methods Enzymol,1991,194:182-187.

      [6] MEIHOC E, MASSON J M, TEISSIE J. High efficiency transformation of intact yeast cellls by electric field pulses[J].Biotechnol,1990,8:223-227.

      [7] HICKS J B, HINNEN A, FINK G P. Properties of Yeast Transformation[M]. New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press,1978.

      在轉(zhuǎn)化時(shí),環(huán)狀質(zhì)粒線性化便于整合到宿主細(xì)胞基因組中從而提高轉(zhuǎn)化率[4]。pRS405作為穿梭質(zhì)粒,在一定條件下可以帶ARS304自由穿梭于原核生物和真核生物中,ARS(Autonomously replicating sequence)為酵母染色質(zhì)復(fù)制所依賴的順式作用元件,ARS序列可提高導(dǎo)入質(zhì)粒的復(fù)制活性,減少質(zhì)粒丟失率,同時(shí)少部分可整合到基因組中并隨基因組復(fù)制,所以目的基因不需要線性化。該質(zhì)粒攜帶有亮氨酸基因,可在亮氨酸缺陷性酵母菌株中篩選。

      2.2 酵母YPH 500生長(zhǎng)曲線的測(cè)定

      由酵母YPH 500細(xì)胞數(shù)量和OD600 nm可以看出(圖2),在30 ℃、180 r/min的條件下培養(yǎng),酵母YPH 500在16~26 h可達(dá)到對(duì)數(shù)期,其OD600 nm為0.2~1.5,酵母YPH 500數(shù)量約為3.86×1011~5.04×1012個(gè)/mL。其中在28 h之后酵母數(shù)量與OD600 nm沒(méi)有相關(guān)性。

      2.3 酵母YPH 500不同的生長(zhǎng)狀態(tài)對(duì)電轉(zhuǎn)化效果的影響

      酵母菌生長(zhǎng)狀態(tài)對(duì)轉(zhuǎn)化率的影響主要是由于分裂時(shí)酵母細(xì)胞壁的結(jié)構(gòu)發(fā)生變化[5]。在電壓1 500 V、外源DNA濃度5.0 mg/L的條件下,取處于不同階段(OD600 nm為0.2~1.5)的酵母YPH 500感受態(tài)細(xì)胞80 μL進(jìn)行電轉(zhuǎn)化。通過(guò)統(tǒng)計(jì)發(fā)現(xiàn),不同階段的感受態(tài)細(xì)胞對(duì)轉(zhuǎn)化率的影響差異較大,在對(duì)數(shù)初期和對(duì)數(shù)末期效率較低,是由于在初期菌量較少,外源DNA進(jìn)入細(xì)胞的概率較小,而在對(duì)數(shù)末期其細(xì)胞壁較為致密不利于電穿孔。所以酵母菌生長(zhǎng)狀態(tài)主要受2個(gè)因素控制,即細(xì)胞數(shù)和細(xì)胞壁的結(jié)構(gòu)。其中OD600 nm為1.3時(shí)的酵母YPH 500細(xì)胞電轉(zhuǎn)化率最高,達(dá)到19.5×102轉(zhuǎn)化子數(shù)/μg DNA(圖3)。

      2.4 外源DNA濃度對(duì)酵母電轉(zhuǎn)化效果的影響

      在電壓為1 500 V,感受態(tài)細(xì)胞OD600 nm為1.1,用量為80 μL的條件下,分別加入不同濃度的外源DNA進(jìn)行電轉(zhuǎn)化。結(jié)果如圖4所示,當(dāng)外源DNA濃度在7.5 mg/L時(shí)轉(zhuǎn)化率最高,但在2.5~10.0 mg/L 的范圍內(nèi)其轉(zhuǎn)化率差異較小。當(dāng)外源DNA濃度較少時(shí),有效電擊會(huì)減少[6],而當(dāng)量多時(shí)反應(yīng)原理尚未弄清。有研究者猜想[7]可能是由于DNA較多時(shí),會(huì)對(duì)細(xì)胞表面點(diǎn)位造成影響或者是由于堵塞轉(zhuǎn)化孔道所致。當(dāng)外源DNA量低于2.5 mg/L或高于10.0 mg/L時(shí)其轉(zhuǎn)化率明顯下降。本試驗(yàn)中,外源DNA在一定范圍內(nèi)(2.5~10.0 mg/L)酵母電轉(zhuǎn)化率變化不大,而超出此范圍,轉(zhuǎn)化率則明顯減少。

      2.5 電場(chǎng)強(qiáng)度對(duì)酵母電轉(zhuǎn)化效果的影響

      采用1 mm寬度的電轉(zhuǎn)化杯,在OD600 nm為1.1的感受態(tài)細(xì)胞,用量為80 μL,外源DNA 濃度5.0 mg/L的條件下,分別施以不同的電壓進(jìn)行電轉(zhuǎn)化,結(jié)果如圖5所示。在不同電壓下酵母轉(zhuǎn)化率差異較大,其中在電場(chǎng)強(qiáng)度為1 500 V時(shí)轉(zhuǎn)化率最高,1 800 V時(shí)次之,當(dāng)電場(chǎng)強(qiáng)度大于1 800 V時(shí),會(huì)造成細(xì)胞形成難以自愈的較大孔道,細(xì)胞內(nèi)大分子容易溢出,造成細(xì)胞死亡,轉(zhuǎn)化率下降。而當(dāng)電場(chǎng)強(qiáng)度過(guò)小時(shí),在細(xì)胞表面形成的孔道較小,外源DNA難以進(jìn)入,使轉(zhuǎn)化率降低。在本試驗(yàn)中電場(chǎng)強(qiáng)度對(duì)酵母轉(zhuǎn)化率的影響較為明顯,其閾值范圍較?。? 500~1 800 V),超出此范圍,酵母轉(zhuǎn)化率明顯降低。

      2.6 均勻設(shè)計(jì)試驗(yàn)結(jié)果

      為進(jìn)一步探討電場(chǎng)強(qiáng)度、外源DNA濃度、感受態(tài)細(xì)胞狀態(tài)3個(gè)參數(shù)及其交互作用對(duì)酵母電轉(zhuǎn)化率的影響,以轉(zhuǎn)化率為考核指標(biāo)進(jìn)行優(yōu)化試驗(yàn)。優(yōu)化試驗(yàn)結(jié)果見(jiàn)表2。

      利用SPSS 17.0數(shù)據(jù)處理軟件對(duì)試驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行回歸分析處理,得到轉(zhuǎn)化率與各因素的回歸方程為:Y=321.4+46.75X1-32.54X2-12.9X3-26.151X12+103.48X22+1 343.5X32。其中相關(guān)系數(shù)R為0.999 9,F(xiàn)值為987,作F 檢驗(yàn),F(xiàn)>F0.05(8,1)=238.9,回歸方程顯著。將試驗(yàn)中的數(shù)據(jù)通過(guò)回歸方程進(jìn)行預(yù)測(cè),結(jié)果如表3所示,觀測(cè)值與擬合值誤差較小,準(zhǔn)確度高。通過(guò)單因素分析,其通徑系數(shù)為X1(0.827 6)>X3(-0.364 9)>X2(-0.283 4)。在3個(gè)參數(shù)中,感受態(tài)細(xì)胞狀態(tài)對(duì)酵母轉(zhuǎn)化率的影響最大,電場(chǎng)強(qiáng)度次之,外源DNA濃度最小。通過(guò)對(duì)回歸方程進(jìn)行極值分析,發(fā)現(xiàn)酵母感受態(tài)細(xì)胞OD600 nm為1.3,電場(chǎng)強(qiáng)度為1 750 V,外源DNA濃度為7.5 mg/L時(shí)可得到較高的電轉(zhuǎn)化效率,約為24×102轉(zhuǎn)化子數(shù)/μg DNA。

      3 小結(jié)與討論

      本試驗(yàn)通過(guò)電場(chǎng)強(qiáng)度、外源DNA濃度、感受態(tài)細(xì)胞狀態(tài)進(jìn)行單因素試驗(yàn),發(fā)現(xiàn)各因素對(duì)酵母電轉(zhuǎn)化率的影響較大,其中酵母感受態(tài)細(xì)胞OD600 nm達(dá)到1.3,電場(chǎng)強(qiáng)度達(dá)1 500~1 800V,DNA濃度達(dá)到7.5 mg/L時(shí)可在各自水平中取得較好的試驗(yàn)結(jié)果。

      對(duì)以上3個(gè)因素進(jìn)行均勻設(shè)計(jì),研究各因素的交互作用對(duì)酵母轉(zhuǎn)化率的影響,發(fā)現(xiàn)3個(gè)因素對(duì)酵母轉(zhuǎn)化率的影響各不相同,感受態(tài)細(xì)胞狀態(tài)影響最大,電場(chǎng)強(qiáng)度次之,外源DNA濃度最小。通過(guò)對(duì)回歸方程的極值運(yùn)算,可預(yù)測(cè)酵母感受態(tài)細(xì)胞OD600 nm達(dá)到1.3,電場(chǎng)強(qiáng)度達(dá)到1 750 V,外源DNA濃度達(dá)到7.5 mg/L時(shí)可得到較高的電轉(zhuǎn)化效率。本研究結(jié)果表明電轉(zhuǎn)化效率的條件優(yōu)化利用均勻設(shè)計(jì)試驗(yàn)簡(jiǎn)單、可信度較高。如果加入其他條件的研究,將大大降低試驗(yàn)組數(shù),節(jié)省試驗(yàn)材料。

      參考文獻(xiàn):

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      [2] 方開泰.均勻設(shè)計(jì)與均勻設(shè)計(jì)表[M].北京:科學(xué)出版社,1994. 13-17.

      [3] 劉秀蓮,王宇光,雷祿旺. 海洋紅酵母電轉(zhuǎn)化條件的研究[J].生命科學(xué)研究,2008,12(2):136-140.

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      [7] HICKS J B, HINNEN A, FINK G P. Properties of Yeast Transformation[M]. New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press,1978.

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