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      一株產(chǎn)阿魏酸酯酶絲狀真菌的分離鑒定及其粗酶性質(zhì)研究

      2014-07-12 05:43:04胡泓宇周燕燕陳靜侯運(yùn)華
      生物技術(shù)通報(bào) 2014年7期
      關(guān)鍵詞:孢霉鏈格絲狀

      胡泓宇 周燕燕 陳靜 侯運(yùn)華

      (齊魯工業(yè)大學(xué)食品與生物工程學(xué)院,濟(jì)南 250353)

      阿魏酸酯酶(EC 3.1.1.73,feruloyl esterase,F(xiàn)AE)又稱(chēng)肉桂酸酯酶或肉桂酰酯酶,可以水解阿魏酸、二聚阿魏酸形成的酯鍵,將阿魏酸釋放出來(lái),屬于羧酸酯水解酶亞類(lèi)[1]。該酶可以協(xié)同木聚糖酶、纖維素酶和木質(zhì)素酶最大程度降解植物細(xì)胞壁[2]。因此,阿魏酸酯酶在食品、醫(yī)藥、造紙、飼料加工、生物合成及能源開(kāi)發(fā)等諸多領(lǐng)域都有著巨大的應(yīng)用潛能。

      產(chǎn)生阿魏酸酯酶的來(lái)源極其廣泛,在微生物、植物和動(dòng)物中均有發(fā)現(xiàn),其中以細(xì)菌和絲 狀真菌的來(lái)源為主。產(chǎn)阿魏酸酯酶的細(xì)菌多為厭氧營(yíng)養(yǎng)型,不利于大規(guī)模工業(yè)化生產(chǎn),因此關(guān)于絲狀真菌產(chǎn)阿魏酸酯酶的研究就顯得十分重要[2,3]。絲狀真菌產(chǎn)阿魏酸酯酶的研究主要集中在曲霉屬,以黑曲霉研究得最為清楚。通常絲狀真菌產(chǎn)阿魏酸酯酶活力較低,如de Vries等[4]報(bào)道重組黑曲霉和塔賓曲霉產(chǎn)阿魏酸酯酶活力分別為7.71 U/mL和3.16 U/mL。關(guān)于側(cè)孢霉和黑曲霉生產(chǎn)阿魏酸酯酶研究比較多。側(cè)孢霉液態(tài)發(fā)酵酶活達(dá)到2.0 mU/mL,固態(tài)發(fā)酵酶活達(dá)到156 mU/g[5]。阿魏酸酯酶活力低下限制了其在工業(yè)中的實(shí)際應(yīng)用。

      鏈隔孢屬真菌是引起農(nóng)作物病害的重要致病真菌之一,屬于絲孢綱絲孢目。對(duì)該類(lèi)真菌的研究主要集中在致病機(jī)理和生物防治方面[6],該菌產(chǎn)生阿魏酸酯酶的報(bào)道較少[7]。多數(shù)絲狀真菌產(chǎn)阿魏酸酯酶已經(jīng)被國(guó)外酶制劑公司申請(qǐng)專(zhuān)利,要進(jìn)行工業(yè)化應(yīng)用就需要篩選新的產(chǎn)酶菌株?;诖耍驹囼?yàn)通過(guò)對(duì)腐爛木質(zhì)纖維的土壤樣品中分離的產(chǎn)阿魏酸酯酶絲狀真菌進(jìn)行篩選,得到1株產(chǎn)阿魏酸酯酶活性高的菌株,對(duì)該菌株進(jìn)行了菌種形態(tài)和分子生物學(xué)鑒定,并對(duì)其所產(chǎn)阿魏酸酯酶的粗酶性質(zhì)進(jìn)行了初步研究。

      1 材料與方法

      1.1 材料

      1.1.1 樣品材料 土樣采集自山東濟(jì)南長(zhǎng)清周邊含有腐爛木質(zhì)纖維(5-15 cm)的土壤。

      1.1.2 化學(xué)試劑 對(duì)硝基苯酚、阿魏酸乙酯購(gòu)自Sigma公司。凝膠回收試劑盒、pUM-T載體購(gòu)自百泰克生物技術(shù)公司。T4DNA連接酶購(gòu)自TaKaRa公司,Taq DNA聚合酶、pfuDNA聚合酶為Bioteke公司的產(chǎn)品,DNA凝膠回收試劑盒購(gòu)自Sangon公司;阿魏酸對(duì)硝基苯酚酯根據(jù)文獻(xiàn)一步法合成[8];其他常規(guī)試劑為國(guó)產(chǎn)分析純。

      1.1.3 培養(yǎng)基 富集培養(yǎng)基:馬鈴薯蔗糖瓊脂培養(yǎng)基(PDA)[9],0.1% 阿魏酸乙酯(溶于N,N-二甲基甲酰胺溶液,過(guò)濾除菌)。

      篩選培養(yǎng)基:(NH4)2SO42.5%,KH2PO40.2%,MgSO40.6%,CaC120.07%,酵母粉0.5%,0.02%TritonX-100,瓊脂1.5%。每個(gè)平板倒20 mL篩選培養(yǎng)基,立即加300 μL 的10%(W/V)阿魏酸乙酯中,立即搖勻,直至呈現(xiàn)云霧狀。28℃培養(yǎng)4 d,觀察菌落周?chē)袩o(wú)透明圈。

      發(fā)酵培養(yǎng)基:麥麩汁 10%,NH4NO30.28%,KH2PO40.2%,MgSO4.7H2O 0.08%,NaNO30.31%,pH 5.5。

      1.2 方法

      1.2.1 產(chǎn)阿魏酸酯酶菌株的篩選 準(zhǔn)確稱(chēng)取1 g土樣,加入100 mL含有無(wú)菌玻璃珠的生理鹽水中,振蕩培養(yǎng)2 h,即為土壤浸提液。取1 mL浸提液液接種于富集培養(yǎng)基中進(jìn)行培養(yǎng),置于28℃下200 r/min搖床培養(yǎng)2 d。梯度稀釋?zhuān)?0-1-10-6)培養(yǎng)物,各稀釋度取100 μL涂布于PDA平板上,28℃培養(yǎng)4 d,觀察平板,菌落周?chē)霈F(xiàn)透明圈的即為具有產(chǎn)阿魏酸酯酶能力的菌株。挑取有透明圈的菌落于5 mL生理鹽水試管中,制備孢子懸浮液,梯度稀釋后涂布在PDA平板培養(yǎng)基上培養(yǎng)至出現(xiàn)單菌落。重復(fù)3次后的單菌落認(rèn)為是純化的菌株。根據(jù)透明圈直徑大小進(jìn)行初篩,通過(guò)初篩的菌株液體培養(yǎng)后測(cè)上清阿魏酸酯酶活進(jìn)行復(fù)篩。

      1.2.2 菌株的形態(tài)觀察 按照《真菌鑒定手冊(cè)》,將純化的菌株在PDA培養(yǎng)基上培養(yǎng)7 d,觀察菌落外觀形態(tài)和菌絲生長(zhǎng)情況;顯微鏡高倍鏡下觀察菌絲體和分生孢子的形態(tài)。

      1.2.3 菌株的18S rDNA和ITS分子鑒定 將菌株斜面孢子接種于PDA液體培養(yǎng)基中,30℃培養(yǎng)72 h,過(guò)濾收集菌絲體,采用液氮研磨法[10]提取其染色體DNA。

      待測(cè)菌株的18S rDNA基因是以染色體DNA為模板,在18S rDNA通用引物(EF3和EF4)的介導(dǎo)下,采用PCR進(jìn)行擴(kuò)增。通用引物的序列如下:

      EF3:5'-TCCTCTAAATGGT-GACCAAGTTTG-3',

      EF4:5'-GGAAGGG[G/A] TG-TATTTATTAG-3'。

      PCR擴(kuò)增程序:94℃ 5 min;94℃ 30 s,47℃ 30 s,72℃ 1 min 40 s,28個(gè)循環(huán);72℃ 10 min。

      待測(cè)菌株的ITS序列是在通用引物(ITS4和ITS86)的介導(dǎo)下,采用PCR進(jìn)行擴(kuò)增。通用引物的序列如下:

      ITS4:5'-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3',

      ITS86:5'-GTGAATCATCGAATCTTTGAAC-3'。

      PCR擴(kuò)增程序除了退火溫度為50℃外,其余步驟與18S rDNA的相同。

      將18S rDNA和ITS PCR產(chǎn)物于0.8%瓊脂糖凝膠中電泳檢查擴(kuò)增結(jié)果。按照DNA凝膠回收試劑盒說(shuō)明書(shū)回收PCR產(chǎn)物,然后委托濟(jì)南力戈生物公司直接進(jìn)行測(cè)序。

      1.2.4 序列同源性分析及系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的構(gòu)建 測(cè)序后將序列提交NCBI GenBank進(jìn)行序列同源性分析,并利用Mega5.2軟件[11]進(jìn)行18S rDNA基因的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的構(gòu)建。

      1.2.5 阿魏酸酯酶粗酶液的制備及酶活測(cè)定 取1 mL發(fā)酵液于4℃,10 000 r/min離心10 min,上清液即為粗酶液。阿魏酸酯酶的酶活測(cè)定方法采用分光光度法[12]測(cè)定,將反應(yīng)條件下,每分鐘降解阿魏酸對(duì)硝基苯酚酯生成1 μmol對(duì)硝基苯酚所需的酶量定義為一個(gè)酶活力單位U。

      1.2.6 溫度和pH對(duì)阿魏酸酯酶粗酶液活性的影響

      1.2.6.1 粗酶液最適溫度及溫度穩(wěn)定性 分別在不同溫度下(30-70℃)測(cè)定阿魏酸酯酶活性。以最高酶活為100%,計(jì)算其他溫度下的相對(duì)酶活,繪制溫度—相對(duì)酶活曲線(xiàn)。將粗酶液分別置于45、55和65℃保溫60 min,測(cè)定殘余酶活性,繪制不同溫度下相對(duì)酶活—溫育時(shí)間曲線(xiàn)。

      1.2.6.2 粗酶液最適pH及pH穩(wěn)定性 將粗酶液在不同pH(pH3.0-7.5)條件下測(cè)阿魏酸酯酶的活性。與溫度類(lèi)似,繪制相對(duì)酶活隨pH變化的曲線(xiàn)。將粗酶液用不同pH值緩沖液(pH3.5-7.5的0.1 mol/L磷酸鈉緩沖液)稀釋?zhuān)?5℃下保溫1 h,測(cè)定殘余酶活。以其中酶活性最高者為100%,其他pH值下與該酶活的比值為該pH值下的相對(duì)酶活,繪制相對(duì)酶活—pH曲線(xiàn)。

      2 結(jié)果

      2.1 產(chǎn)阿魏酸酯酶絲狀真菌的篩選

      利用平板透明圈法,從含有腐爛木質(zhì)纖維的土壤中篩選分離到37株絲狀真菌,其中1株透明圈直徑較大,將其編號(hào)為HA4087,如圖1。該菌株在發(fā)酵培養(yǎng)基中培養(yǎng)5 d后收集上清,測(cè)得發(fā)酵液上清中阿魏酸酯酶活性為86 mU/mL。

      圖1 菌株HA4087在篩選平板上形成的透明圈(背面)

      2.2 產(chǎn)阿魏酸酯酶絲狀真菌的鑒定

      2.2.1 菌株形態(tài)結(jié)構(gòu)觀察 菌株HA4087生長(zhǎng)迅速,菌絲蔓延速度快,在PDA培養(yǎng)基上28℃ 培養(yǎng)4 d后,即可鋪滿(mǎn)整個(gè)平板。生長(zhǎng)初期菌絲為白色絨毛狀,后期菌絲為灰黑色,菌落高聳突起,呈棉絨狀。該菌在生長(zhǎng)過(guò)程中向培養(yǎng)基中分泌色素,因此平板背面呈藍(lán)黑色(圖1)。對(duì)HA4087的菌絲體和分生孢子結(jié)構(gòu)進(jìn)行了顯微觀察,結(jié)果如圖2所示。該菌株的菌絲透明,有隔膜。菌絲頂端形成分生孢子。分生孢子卵形,具有典型橫隔膜,呈磚格狀分隔(圖2-B),根據(jù)分生孢子的形態(tài)特征初步認(rèn)為該菌屬于鏈格孢菌。

      圖2 菌株HA4087的菌絲和分生孢子形態(tài)(16×40)

      2.2.2 菌株分子鑒定 對(duì)菌株HA4087分別進(jìn)行18S rDNA和ITS序列的克隆,結(jié)果如圖3所示。從圖3中可以看出PCR產(chǎn)物擴(kuò)增條帶單一且明亮,產(chǎn)物大小與預(yù)期吻合,初步表明18S rDNA和ITS序列已經(jīng)克隆得到。PCR產(chǎn)物回收后,進(jìn)行序列測(cè)定,測(cè)序(結(jié)果省略)顯示18S rDNA基因和ITS序列的PCR產(chǎn)物長(zhǎng)度分別為1 561 bp 和783 bp。兩個(gè)基因序列已經(jīng)提交NCBI GenBank,編號(hào)分別為KF962959和KF962960。

      圖3 菌株HA4087 18S rDNA(A)和ITS PCR(B)擴(kuò)增電泳圖

      將克隆的18S rDNA基因序列輸入 GenBank 進(jìn)行BLAST分析,結(jié)果顯示其與Alternariasp.的相似性最高,達(dá)100%,初步鑒定其為鏈格孢屬。并與其他同源性高的菌株進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的構(gòu)建,結(jié)果如圖4所示。HA4087 與Alternaria alternata的相似性達(dá) 99%,結(jié)合該菌的形態(tài)特征確定該菌屬于鏈格孢屬。

      將克隆的ITS序列進(jìn)行BLAST分析,結(jié)果顯示其與A. alternata的相似性為100%。結(jié)合該菌的形態(tài)特征及18S rDNA序列,確定所分離的菌株為互隔交鏈格孢霉。

      圖4 菌株HA4087的18S rDNA基因序列系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)

      2.3 粗酶的酶學(xué)性質(zhì)

      2.3.1 溫度對(duì)酶活力和穩(wěn)定性的影響 分別在30-70℃測(cè)定粗酶液的活力,結(jié)果見(jiàn)圖5。結(jié)果顯示,菌株HA4087阿魏酸酯酶最適反應(yīng)溫度為55℃,在50-60℃的范圍內(nèi)催化活性較高。將酶液在45-65℃之間保存一定時(shí)間,測(cè)定殘余酶活,結(jié)果(圖6)表明,溫度為45℃時(shí),該酶穩(wěn)定,處理60 min后,剩余酶活仍能達(dá)到93.7%;當(dāng)溫度為55℃時(shí),處理30 min后剩余酶活為90.1%,隨著溫育時(shí)間的延長(zhǎng),剩余酶活力下降較快;當(dāng)溫度達(dá)65℃時(shí),保溫10 min,剩余酶活力僅為16.8%。

      圖5 溫度對(duì)酶活力的影響

      圖6 溫度對(duì)粗酶液穩(wěn)定性的影響

      2.3.2 pH值對(duì)酶活力和穩(wěn)定性的影響 粗酶液在不同pH下測(cè)定酶活力,以pH作出相對(duì)酶活力曲線(xiàn),結(jié)果(圖7)表明,菌株HA4087阿魏酸酯酶的最適反應(yīng)pH值為5.5。在pH5.0-7.0的范圍內(nèi),酶活力保持較高水平(80%以上)。將酶液于pH3.5-7.5中溫育60 min后測(cè)定剩余酶活力,結(jié)果(圖8)表明,該酶在pH4.5-6.5的范圍內(nèi)穩(wěn)定,殘余酶活接近85%。

      圖7 pH值對(duì)酶活力的影響

      圖8 pH值對(duì)酶穩(wěn)定性的影響

      2.4 互隔交鏈格孢霉阿魏酸酯酶與其他絲狀真菌產(chǎn)酶性質(zhì)的比較

      本研究將互隔交鏈格孢霉的阿魏酸酯酶性質(zhì)和黑曲霉、米曲霉、土曲霉和腐質(zhì)霉所產(chǎn)生的酶進(jìn)行了酶學(xué)性質(zhì)的比較(表1)。表1顯示,酶活高低次序是黑曲霉>腐質(zhì)霉>互隔交鏈格孢霉>米曲霉和土曲霉。互隔交鏈格孢霉的活力為86 mU/mL,比土曲霉和米曲霉的活力稍高,具有較強(qiáng)的酶活力。測(cè)定的酶活和Xiao等[7]報(bào)道的酶活一致。后續(xù)通過(guò)對(duì)培養(yǎng)基組成和發(fā)酵條件的優(yōu)化及對(duì)出發(fā)菌株誘變還能較大幅度提高酶的產(chǎn)量。酶的熱穩(wěn)定試驗(yàn)顯示HA4087菌株產(chǎn)生的酶具有良好的熱穩(wěn)定性,當(dāng)在55℃溫育30 min仍能保留90%以上的酶活,該特性有助于在飼料工業(yè)中的應(yīng)用開(kāi)發(fā)。pH穩(wěn)定性和其他來(lái)源的酶相比顯得稍弱,后續(xù)可以通過(guò)定向進(jìn)化來(lái)提高pH穩(wěn)定性。

      表1 不同菌株產(chǎn)生的阿魏酸酯酶A的性質(zhì)比較

      3 討論

      阿魏酸酯酶是半纖維水解酶系中關(guān)鍵的一員,屬于輔助酶,能夠協(xié)同木聚糖酶和纖維素酶更好水解相應(yīng)的基質(zhì)[16,17]。本研究分離得到1株高產(chǎn)阿魏酸酯酶的互隔交鏈孢霉HA4087,對(duì)該菌株所產(chǎn)阿魏酸酯酶的粗酶性質(zhì)進(jìn)行了初步研究。結(jié)果表明該菌株產(chǎn)生的阿魏酸酯酶活性較強(qiáng),并具有良好的熱穩(wěn)定性。這些特征表明互隔交鏈格孢菌所產(chǎn)的阿魏酸酯酶具有重要的應(yīng)用價(jià)值。對(duì)其阿魏酸酯酶酶學(xué)性質(zhì)的測(cè)定將有助于該酶實(shí)際應(yīng)用參數(shù)的確定和優(yōu)化,尤其是對(duì)后續(xù)開(kāi)展該菌阿魏酸酯酶的定向進(jìn)化和高效分泌表達(dá)的研究提供了前提和參考。

      對(duì)互隔交鏈格孢霉HA4087的阿魏酸酯酶和其他絲狀真菌來(lái)源的酶進(jìn)行了性質(zhì)比較顯示該酶具有較好的應(yīng)用前景。不同絲狀真菌產(chǎn)生的阿魏酸酯酶產(chǎn)量和酶學(xué)性質(zhì)的不同可能是由目的基因轉(zhuǎn)錄強(qiáng)度、mRNA穩(wěn)定性、分泌強(qiáng)弱、蛋白一級(jí)結(jié)構(gòu)和翻譯后糖基化修飾等造成[16,17]。令人疑惑的是,黑曲霉、黃曲霉和米曲霉的基因和蛋白序列的相似性達(dá)90%,但是酶活差異較大。此外,暗色孢屬真菌產(chǎn)阿魏酸酯酶的產(chǎn)生與其在植物組織中的強(qiáng)烈的蔓延性具有一定的相關(guān)性,這可能也是該菌株產(chǎn)阿魏酸酯酶活高于其他常規(guī)絲狀真菌的活性。因此對(duì)其阿魏酸酯酶的研究不僅能為阿魏酸酯酶家族增加新的試驗(yàn)材料,還能加深暗色真菌侵染植物機(jī)制的理解。

      4 結(jié)論

      本試驗(yàn)從含有腐爛木質(zhì)纖維的土壤中篩選分離得到1株高產(chǎn)阿魏酸酯酶的絲狀真菌HA4087,經(jīng)傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)和分子生物學(xué)鑒定為互隔交鏈孢霉。該菌株所產(chǎn)阿魏酸酯酶活力為86 mU/mL,最適反應(yīng)溫度為55℃,最適pH值為5.5;在55℃保溫30 min后酶活力仍為90%以上;在pH4.5-6.5范圍內(nèi)穩(wěn)定性較好,酶活仍為85%以上。

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